Qui, viene proposto un nuovo metodo per seguire longitudinalmente la dinamica e il turnover del sistema mitocondriale in un astrocita in coltura. A differenza di un approccio time-lapse su un gruppo fisso di cellule o una singola cellula alla volta (più spesso usato in letteratura)24,25, i ricercatori possono seguire l'evoluzione del sistema mitocondriale per diversi giorni sulle stesse singole cellule. A differenza dell'imaging dal vivo a singolo pozzo in cui sono richiesti alti livelli di esposizione alla luce e la selezione di molte singole cellule è meno fattibile, il metodo proposto sfrutta la capacità di questo microscopio di visualizzare diverse cellule in diverse aree di un pozzo e di tornare a quelle stesse cellule in vari punti temporali per ricrearle. Grazie alla normalizzazione a una linea di base effettuata per ogni criterio misurato su ciascuna cellula di interesse, tiene conto della complessità del sistema mitocondriale e indaga l'effetto del trattamento su ciascuna cellula rispetto alla propria immagine basale. La capacità del microscopio di eseguire autonomamente questo tipo di imaging su un massimo di 16 pozzetti alla volta (imaging di 5 cellule per pozzetto) consente di tenere adeguatamente conto dell'eterogeneità del sistema mitocondriale durante l'analisi senza la variabilità sperimentale che deriva dall'imaging di varie condizioni in giorni diversi.
La qualità delle colture, i livelli di infezioni virali che esprimono il biosensore LV-G1-MitoTimer, il tipo di microscopio e gli obiettivi, e la selezione di cellule adatte sono variabili critiche che devono rimanere il più coerenti possibile in questo protocollo. Le densità cellulari, il tipo di vettore e i titoli virali possono essere adattati in base alla domanda. Sebbene il lavoro precedente dimostri che l'espressione di LV-G1-MitoTimer non ha conseguenze deleterie per la funzione e la dinamica mitocondriale21,22,26,27,è essenziale verificare che la concentrazione non sia tossica per le cellule (ad esempio, controllando bene il numero totale di cellule in controllo). Poiché viene utilizzato un singolo piano focale, gli astrociti dovrebbero essere: (1) il più piatti possibile, (2) isolati da altre cellule marcate (per semplificare l'analisi in caso di spostamento nel piatto) e (3) in possesso di alti livelli di fluorescenza. Poiché le cellule in coltura possono essere altamente variabili nella morfologia, il sistema mitocondriale può essere altamente eterogeneo. In questo contesto, l'analisi dei ROI (e non dell'intera cellula) compensa alcune regioni problematiche, come le regioni perinucleari, e diminuisce la variabilità. È essenziale fare la linea di base su cellule relativamente simili e campionare il maggior numero possibile di cellule. Di conseguenza, i microscopi di acquisizione e analisi ad alto contenuto sono ideali. Durante questo monitoraggio longitudinale, è anche importante non sovraesporre le cellule alla luce per evitare lo sbiancamento del biosensore.
Questo metodo di imaging non è privo di complessità e, in tutto il protocollo, sono incluse diverse note, che tengono conto della risoluzione dei problemi eseguita durante i test precedenti con il microscopio. Ad esempio, la scelta del rivestimento della piastra utilizzato dipende dal test previsto, ma sono state incluse raccomandazioni per le scelte più adatte per le colture primarie di astrociti. Inoltre, l'acquisizione dell'immagine deve essere eseguita su almeno 5 cellule per condizione a causa della variabilità intercellulare. Più specificamente, alcune cellule selezionate al basale dell'imaging moriranno, alcune si sposteranno fuori dal frame dell'area di acquisizione dell'immagine assegnata e alcune cambieranno la loro morfologia, rendendo i mitocondri molto difficili da individuare in analisi. L'imaging di molte cellule fin dall'inizio aumenta la probabilità di un campione abbastanza grande di cellule da analizzare alla fine dell'esperimento. Oltre agli aspetti più complessi di questa tecnica di imaging, ci sono alcune limitazioni assolute per quanto riguarda chi può beneficiare di questo tipo di imaging e analisi. Per sfruttare appieno l'automatizzazione dell'acquisizione delle immagini, il microscopio utilizzato deve avere un sistema di messa a fuoco automatica in grado di gestire la velocità degli intervalli di tempo tra le immagini (cioè ogni 3 s in questo protocollo) e in grado di concentrarsi costantemente sulla cella in questione prima che ogni immagine venga scattata. Inoltre, senza il software JOBS, che automatizza l'intero processo di acquisizione delle immagini, questo metodo diventa arduo e potenzialmente impossibile a seconda del numero di celle da fotografare in quanto richiederebbe la ricerca manuale e l'imaging di ogni cella nel momento appropriato. Infine, questo metodo di imaging non è immune al problema del fotosbiancamento. Per questo motivo, come con qualsiasi metodo di acquisizione a lungo termine, è importante scegliere marcatori fluorescenti meno suscettibili al fotosbiancamento e personalizzare l'acquisizione delle immagini per evitare il più possibile questo problema.
Questa tecnica differisce dalle altre attualmente utilizzate in modo cruciale. A differenza di altri studi time-lapse, questa tecnica non richiede l'imaging sulla stessa posizione nel pozzo per tutto il tempo, né richiede il movimento manuale della piastra per visualizzare altre aree. Ciò consente ai ricercatori di visualizzare molte cellule in molte condizioni in un lasso di tempo di 24 ore. Di conseguenza, la capacità di eseguire questa imaging e analisi su molte cellule in ciascun pozzo fornisce le stesse informazioni sulla popolazione che si otterrebbero studiando ampiamente un ampio gruppo di cellule, fornendo inoltre misure specifiche da ciascuna cellula fotografata. Mentre alcune specificità di questo metodo potrebbero non applicarsi ad altri metodi di acquisizione delle immagini (descritti sopra), i benefici superano le complicazioni con il tipo di analisi possibile dopo l'acquisizione. Questa tecnica consente ai ricercatori di vedere le esatte ramificazioni di vari trattamenti sul sistema mitocondriale e, di conseguenza, sugli astrociti in coltura.
Inoltre, questo metodo è altamente personalizzabile per molte diverse domande scientifiche riguardanti il comportamento mitocondriale e i ruoli in contesti specifici. Qui il protocollo delineato si occupa specificamente degli astrociti in coltura. Tuttavia, molti altri tipi di cellule possono essere utilizzati e i trattamenti che possono essere testati sono limitati solo dalle domande oggetto di indagine. Questo tipo di imaging ha il potenziale per far progredire la conoscenza collettiva e la comprensione del comportamento mitocondriale, dei meccanismi sottostanti che portano alla disfunzione mitocondriale e degli effetti di molte patologie sulle dinamiche innate presenti in diversi tipi di cellule.