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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Questo protocollo presenta un saggio di assorbimento di aminoacidi radiomarcato, utile per valutare il consumo di aminoacidi sia nelle cellule primarie che nelle ossa isolate.
Lo sviluppo osseo e l'omeostasi dipendono dalla differenziazione e dall'attività degli osteoblasti che formano l'osso. La differenziazione degli osteoblasti è caratterizzata sequenzialmente dalla proliferazione seguita dalla sintesi proteica e, infine, dalla secrezione della matrice ossea. La proliferazione e la sintesi proteica richiedono un costante apporto di aminoacidi. Nonostante questo, si sa molto poco sul consumo di aminoacidi negli osteoblasti. Qui descriviamo un protocollo molto sensibile progettato per misurare il consumo di aminoacidi utilizzando aminoacidi radiomarcati. Questo metodo è ottimizzato per quantificare i cambiamenti nell'assorbimento degli aminoacidi associati alla proliferazione o alla differenziazione degli osteoblasti, ai trattamenti farmacologici o dei fattori di crescita o a varie manipolazioni genetiche. È importante sottolineare che questo metodo può essere utilizzato in modo intercambiabile per quantificare il consumo di aminoacidi in linee cellulari in coltura o cellule primarie in vitro o in alberi ossei isolati ex vivo. Infine, il nostro metodo può essere facilmente adattato per misurare il trasporto di uno qualsiasi degli amminoacidi, nonché del glucosio e di altri nutrienti radiomarcati.
Gli amminoacidi sono composti organici che contengono un gruppo funzionale amminico (-NH2) e carbossilico (-COOH) con una catena laterale variabile specifica per ciascun amminoacido. In generale, gli amminoacidi sono ben noti come costituenti di base delle proteine. Più recentemente, sono stati chiariti nuovi usi e funzioni degli amminoacidi. Ad esempio, i singoli amminoacidi possono essere metabolizzati per generare metaboliti intermedi che contribuiscono alla bioenergetica, funzionano come cofattori enzimatici, regolano le specie reattive dell'ossigeno o sono usati per sintetizzare altri amminoacidi 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10 . Molti studi dimostrano che il metabolismo degli aminoacidi è fondamentale per la pluripotenza, la proliferazione e la differenziazione cellulare in vari contesti 3,6,11,12,13,14,15,16,17.
Gli osteoblasti sono cellule secretorie che producono e secernono la matrice ossea extracellulare ricca di collagene di tipo 1. Per sostenere alti tassi di sintesi proteica durante la formazione ossea, gli osteoblasti richiedono un apporto costante di aminoacidi. Per soddisfare questa domanda, gli osteoblasti devono acquisire attivamente aminoacidi. Coerentemente con questo, studi recenti rivelano l'importanza dell'assorbimento e del metabolismo degli aminoacidi nell'attività degli osteoblasti e nella formazione ossea 15,16,17,18,19,20.
Gli osteoblasti acquisiscono aminoacidi cellulari da tre fonti principali: ambiente extracellulare, degradazione intracellulare delle proteine e biosintesi de novo degli aminoacidi. Questo protocollo si concentrerà sulla valutazione dell'assorbimento di aminoacidi dall'ambiente extracellulare. I metodi più comuni per misurare l'assorbimento di aminoacidi si basano su amminoacidi radiomarcati (ad esempio, 3H o 14C) o marcati con isotopi pesanti (ad esempio, 13C). I saggi di isotopomeri pesanti possono analizzare l'assorbimento degli amminoacidi e il metabolismo in modo più approfondito e sicuro, ma richiedono più tempo e richiedono più giorni per essere completati poiché ci vuole un giorno per preparare e derivatizzare i campioni e più giorni per analizzare sullo spettrometro di massa a seconda del numero di campioni21,22. In confronto, i saggi di assorbimento degli aminoacidi radiomarcati non sono informativi sul metabolismo a valle, ma sono economici e relativamente veloci, potendo essere completati entro 2-3 ore dall'inizio dell'esperimento23,24. Qui, descriviamo un protocollo di base facilmente modificabile progettato per valutare l'assorbimento di aminoacidi radiomarcati in cellule primarie in coltura o linee cellulari in vitro o singoli alberi ossei ex vivo. L'applicazione di questi due protocolli può essere estesa ad altri aminoacidi radiomarcati e ad altri tipi cellulari e tessuti associati all'osso.
Tutte le procedure sui topi descritte nel presente documento sono state approvate dai comitati di studi sugli animali presso l'Università del Texas Southwestern Medical Center di Dallas. Il protocollo sulle radiazioni è stato approvato dal Comitato consultivo per la sicurezza delle radiazioni presso l'Università del Texas Southwestern Medical Center di Dallas.
1. Assorbimento di aminoacidi nelle cellule (Protocollo I)
2. Assorbimento di aminoacidi nei tessuti ossei appena isolati (Protocollo II)
Il trasporto di aminoacidi è regolato da molti trasportatori di aminoacidi legati alla membrana che sono stati classificati in sistemi di trasporto distinti basati su numerose caratteristiche, tra cui la specificità del substrato, la cinetica e la dipendenza da ioni e pH25. Ad esempio, l'assorbimento di glutammina può essere mediato dai sistemi di trasporto Na+-dipendenti A, ASC, γ+L e N o dal sistema Na+-indipendente L. I sistemi Na+-dipendenti si distinguono per la capacità di sostituire Li+ con Na+ (Sistema N) o sensibilità all'analogo amminoacido acido 2-(metilammino)isobutirrico (MeAIB) (Sistema A). Lo scopo di questo esperimento era quello di definire la quantità di consumo di glutammina attribuibile a ciascun sistema di trasporto. L'assorbimento di glutammina L-[3,4-3 H] è stato misurato in cellule ST2 confluenti in KRH normale contenente 120 mM NaCl, KRH libero Na+ contenente 120 mM cloruro di colina, KRH normale contenente 5 mM MeAIB o KRH libero Na+ contenente 120 mM LiCl. La radioattività totale (conteggi al minuto) è stata normalizzata al numero di cellule. La rimozione di Na+ ha portato a una riduzione del 90% dell'assorbimento di glutammina. Ciò ha indicato che il Sistema L rappresenta il 10% dell'assorbimento di glutammina mentre il 90% dell'assorbimento di glutammina è Na+ dipendente nelle cellule ST2 (Figura 2). La presenza di Li+ ha aumentato l'assorbimento di glutammina solo del 2% rispetto alla condizione libera da Na+, mentre 5 mM MEAIB non hanno influenzato l'assorbimento di glutammina. Questi dati indicano che la maggior parte dell'assorbimento di glutammina è mediato dai sistemi ASC e γ + L, mentre il sistema N e il sistema A sono responsabili rispettivamente di circa il 2% e lo 0% dell'assorbimento di glutammina Na+-dipendente.
Abbiamo modificato il protocollo I per caratterizzare l'assorbimento di aminoacidi nei fusti ossei ex vivo. In questo esperimento abbiamo seguito il protocollo II per caratterizzare la cinetica di assorbimento dell'arginina in ossa lunghe isolate da topi di 3 giorni (p3). Per fare questo, abbiamo prima sezionato entrambi gli omeri dai topi p3. Le epifisi sono state rimosse e il midollo è stato filato e ogni omero è stato pesato per la normalizzazione. L'omero controlaterale è stato designato come un controllo negativo ed è stato bollito per uccidere l'attività cellulare. Gli omeri sperimentali e bolliti sono stati quindi incubati con 4μCi/mL L-[2,3,4-3 H]-arginina radiomarcati per un massimo di 2 ore. L'assorbimento di arginina è aumentato in modo lineare nel corso di questo esperimento (Figura 3A). Per confronto, l'omeri bollito non ha mostrato un aumento dinamico dell'assorbimento di arginina in questo esperimento, ma piuttosto aveva una radioattività basale attribuita all'adsorbimento della sonda nella matrice ossea. L'assorbimento normalizzato e corretto di arginina è mostrato nella Figura 3B.

Figura 1: Flusso di lavoro dei saggi di assorbimento degli aminoacidi radiomarcati. Panoramica schematica dei saggi di captazione aminoacidica in vitro (Protocollo I) e in ossa ex vivo (Protocollo II). Fare clic qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura.

Figura 2: Proprietà cinetiche dell'assorbimento di L-[3,4-3 H]-glutammina in ST2 in vitro. (A) Saggi di assorbimento di L-[3,4-3 H]-glutammina eseguiti in presenza (+) o assenza (-) di sodio (Na+), MeAIB o litio (Li+) nelle cellule ST2. (B) Percentuale dei contributi stimati del sistema A, N, L o ASC e γ + L all'assorbimento di glutammina. Fare clic qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura.

Figura 3: Assorbimento ex vivo di L-[2,3,4-3 H]-arginina negli omeri neonatali. (A) Assorbimento di L-[2,3,4-3 H]-arginina eseguito nel corso di un tempo di 2 ore in umeri vivi e bolliti isolati da topi C57BL/6 di 3giorni. (B) Assorbimento normalizzato di L-[2,3,4-3 H]-arginina con umeri bolliti. Fare clic qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura.
Gli autori non hanno rivelazioni.
Questo protocollo presenta un saggio di assorbimento di aminoacidi radiomarcato, utile per valutare il consumo di aminoacidi sia nelle cellule primarie che nelle ossa isolate.
Il laboratorio Karner è supportato dalle sovvenzioni R01 del National Institute of Health (AR076325 e AR071967) a C.M.K.
| 0,25% tripsina | Gibco | 25200 | |
| Piastra a 12 pozzetti | Corning | 3513 | |
| Siringa da 1 mL | 309628 | di precisione BD | |
| 30G Ago | di precisione BD | 305106 | |
| Arginina Monocloridrato L-[2,3,4-3H]-, 1mCi | PerkinElmer | NET1123001MC | |
| Contatore a scintillazione Beckman LS6500 | |||
| Cloruro di calcio | Sigma | C1016 | |
| Cloruro di colina | Sigma | C7077 | |
| Soluzione D-(+)-glucosio | Sigma | G8769 | |
| Strumento | di dissezione | Pinze, forbici, scapel | |
| DPBS | Gibco | 14190 | |
| Acido etilendiamminotetraacetico | Sigma | E9884 | |
| HEPES(1M) | Gibco | 15630 | |
| L-[3,4-3H(N)]-Glutammina | PerkinElmer | NET551250UC | |
| Fiale di scintilazione liquida | Sigma | Z190535 | |
| Soluzione di cloruro di litio, 8M | Sigma | L7026 | |
| Cloruro di magnesio | Sigma | M8266 | |
| MEM&alfa; | Gibco | 12561 | |
| Provetta per microcentrifuga, 15mL | Biotix | 89511-256 | |
| NP-40 | Sigma | 492016 | |
| Cloruro di potassio | Sigma | P3911 | |
| Bicarbonato di sodio | Sigma | S6014 | |
| Cloruro di sodio | Sigma | S9888 | |
| Desossicolato di sodio | Sigma | D6750 | |
| Sodio dodecil solfato | Sigma | 436143 | |
| Sonicator | Sonic& Materiali | VCX130 | |
| Tris Base | Sigma | 648311 | |
| Ultima Gold (Soluzione di scintillazione) | PerkinElmer | Acido 6013329 | |
| &alfa;-(Metilammino)isobutirrico | Sigma | M2383 |