Questo articolo descrive un flusso di lavoro di tecniche impiegate per testare nuovi potenziali mediatori di metastasi del melanoma e i loro meccanismi d'azione.
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Articolo metodologico
Questo articolo descrive un flusso di lavoro di tecniche impiegate per testare nuovi potenziali mediatori di metastasi del melanoma e i loro meccanismi d'azione.
Le metastasi sono un processo complesso, che richiede alle cellule di superare barriere che sono solo modellate in modo incompleto da saggi in vitro . È stato stabilito un flusso di lavoro sistematico utilizzando modelli in vivo robusti e riproducibili e metodi standardizzati per identificare nuovi attori nelle metastasi del melanoma. Questo approccio consente l'inferenza dei dati in specifiche fasi sperimentali per caratterizzare con precisione il ruolo di un gene nelle metastasi. I modelli vengono stabiliti introducendo cellule di melanoma geneticamente modificate tramite iniezioni intracardiache, intradermiche o sottocutanee nei topi, seguite dal monitoraggio con imaging seriale in vivo . Una volta raggiunti gli endpoint prestabiliti, i tumori primari e/o gli organi portatori di metastasi vengono prelevati ed elaborati per varie analisi. Le cellule tumorali possono essere ordinate e sottoposte a una qualsiasi delle diverse piattaforme "omiche", incluso il sequenziamento dell'RNA a singola cellula. Gli organi vengono sottoposti ad imaging e analisi immunoistopatologiche per quantificare il carico complessivo delle metastasi e mappare la loro specifica posizione anatomica. Questa pipeline ottimizzata, compresi i protocolli standardizzati per l'attecchimento, il monitoraggio, la raccolta dei tessuti, l'elaborazione e l'analisi, può essere adottata per colture derivate dal paziente, a breve termine e linee cellulari umane e murine consolidate di vari tipi di cancro solido.
L'elevata mortalità associata al melanoma metastatico combinata con una crescente incidenza di melanoma in tutto il mondo1 (un aumento stimato del 7,86% entro il 2025) richiede nuovi approcci terapeutici. I progressi nella scoperta del target dipendono da modelli riproducibili di metastasi, un processo altamente complesso. Durante le fasi della cascata metastatica, le cellule di melanoma devono superare innumerevoli barriere per raggiungere l'evasione del sistema immunitario e la colonizzazione di tessuti distanti2. La resilienza e l'adattabilità delle cellule di melanoma derivano da una moltitudine di fattori, tra cui i....
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NOTA: Le procedure animali coinvolte nel seguente protocollo sono state approvate dal New York University Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC). Tutte le procedure sono condotte in strutture approvate dall'Association for Assessment and Accreditation of Laboratory Animal Care International (AAALAC). La Figura 1 illustra l'approccio sperimentale generale.
1. Colture a breve termine di melanoma derivate dal paziente (STCs)
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Le figure seguenti illustrano come il flusso di lavoro descritto è stato applicato per l'identificazione di nuovi driver di metastasi del melanoma. La Figura 2 riassume i risultati di uno studio pubblicato in cui sono stati studiati gli effetti del silenziamento della fucosiltransferasi FUT8 nelle metastasi del melanoma in vivo 26. In breve, l'analisi dei dati glicemici dei pazienti umani (ottenuti da array di lectine) e il profilo trascrittomico hanno rivela.......
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Lo scopo di questo rapporto tecnico è quello di offrire un flusso di lavoro standardizzato, dall'alto verso il basso per lo studio di potenziali attori nelle metastasi del melanoma. Poiché gli esperimenti in vivo possono essere costosi e dispendiosi in termini di tempo, le strategie per massimizzare l'efficienza e aumentare il valore delle informazioni ottenute sono fondamentali.
È imperativo utilizzare approcci complementari per incrociare i risultati all'interno dello stesso esperim.......
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Gli autori non hanno conflitti di interesse da dichiarare.
Ringraziamo la Division of Advanced Research Technologies (DART) della NYU Langone Health, e in particolare, il Experimental Pathology Research Laboratory, il Genome Technology Center, il Cytometry and Cell Sorting Laboratory, Pre-Clinical Imaging Core, che sono parzialmente supportati dal Perlmutter Cancer Center Support Grant NIH/NCI 5P30CA016087. Ringraziamo il NYU Interdisciplinary Melanoma Cooperative Group (PI: Dr. Iman Osman) per aver fornito l'accesso alle colture a breve termine di melanoma derivate dal paziente + (10-230BM e 12-273BM), che sono state ottenute attraverso protocolli approvati dall'IRB (Universal Consent study #s16-00122 e Interdisci....
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| Nome | Azienda | Numero di catalogo | Commenti |
|---|---|---|---|
| #15 Lama Scapel | WPI | 500242 | Per procedure chirurgiche |
| #3 Scapel Handle | WPI | 500236 | Per procedure chirurgiche |
| 1 mL di siringa di tubercolina, punta scorrevole | BD | 309626 | Iniezioni |
| Siringa da 10 mL, punta a slittamento | BD | 301029 | Perfusione |
| 10% Formalina Tamponata | di sodio EK Industries | 4499-20L | Per perfusione/fissativo tissutale |
| 15 mL | Corning conico | 430052 | Colture cellulari |
| 15 mL Provette coniche da centrifuga in polipropilene | Falcon | 352196 | Coltura cellulare |
| 200 Proof Ethanol | Deacon Labs | 04-355-223 | Istologia |
| 22G - Ago da 22 mm | BD | 305156 | Perfusione |
| 4-0 Vicryl Suture | Ethicon | J464G | Sutura |
| 4% fosfato di Carson tamponato paraformaldeide | EMS | 15733-10 | Per perfusione/fissativo tissutale |
| 40µ m | Corning | 431750 | Lavorazione dei tessuti |
| 5-0 Sutura assorbibile | Ethicon | 6542000 | Chiusura |
| 50 mL Conico | Corning | 430828 | Colture cellulari |
| 50mL Provette coniche da centrifuga in polipropilene Falcon | 352070 | Coltura cellulare | |
| 7-0 Sutura in seta | FST | 18020-70 | Legatura |
| 70µ m | Corning | 431751 | Lavorazione dei tessuti |
| Supporti di montaggio anti-sbiadimento | Vector Labs | H-1000-10 | Approssimatore di immunofluorescenza |
| che applica pinze, 10 cm | WPI | 14189 | Per procedure microchirurgiche |
| Avance | Bruker | 3 HD | NMR Console |
| Biospec 7030 | Bruker | 7030 | Micro MRI |
| BSA | Bioreg | A941 | NuMA Colorazione |
| Pinza per sutura Castroviejo, punte dritte Piattaforma di legatura da 5,5 mm, 11 cm | WPI | WP5025501 | Per procedure microchirurgiche |
| Barattolo di colorazione Coplin | Bel-Art | F44208-1000 | Istologia |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9542-1MG | Immunofluorescenza |
| dCas9-KRAB | Addgene | 110820 | Manipolazione genetica |
| DNase I | NEB | M0303L | Elaborazione dei tessuti |
| DPBS | Corning | 21-030-CM | Lavorazione dei tessuti |
| Lama a bordo singolo non rivestita extra affilata | GEM | 62-0167 | Lavorazione dei tessuti |
| Substrato della matrice extracellulare | Corning | 354234 | considerare il fattore di crescita ridotto (come alternativa |
| FBS | Cytiva | SH30910.03 | Coltura cellulare |
| Fiji Immagine J | Fiji Immagine J | Software | Immunofluorescenza |
| Capra anti-coniglio HRP coniugato multimero | Thermo Fisher | A16104 | NuMA Siero di capra colorante |
| Gibco | PCN5000 | Immunofluorescenza | |
| HBSS | Corning | 21-020-CV | Lavorazione dei tessuti |
| Ematossilina | Richard-Allan Scientific | 7231 | Istologia |
| Illumina III | PerkinElmer | CLS136334 | BLI Instrument |
| Siringa da insulina 28G - ago da 8 mm | BD | 329424 | Iniezioni |
| Siringa da insulina 31G - ago da 6 mm. | BD | 326730 | Iniezioni Pinze |
| iris, 10,2 cm, curva completa, seghettate | WPI | 504478 | Per perfusione e procedure chirurgiche |
| Isoflurano USP | Covetrus | 11695067772 | Anestesia |
| Gioiellieri #7 Pinze Titanio 11 cm 0,07 x 0,01 mm Punta | WPI | WP6570 | Per procedure microchirurgiche |
| Ketamina HCl 100mg/mL | Mylan Ind. | 1049007 | Anestesia |
| lentiCRISPRv2 | Addgene | 98290 | Manipolazione genetica |
| Lycopersicon Esculentum (Pomodoro) Lectina, DyLight 649 | Invitrogen | L32472 | Marcatore di cellule endoteliali vascolari |
| MEM aminoacidi non essenziali X 100 | Corning | 25-025-CI | Colture cellulari |
| Forbici Metzenbaum | WPI | 503269 Per chirurgia procedure | |
| Unità di microiniezione | KOPF | 5000 | Iniezioni intracardiache |
| NaCl | Fisher | S25877 | Colorazione NuMA |
| Ago 30G x 25mm | BD | 305128 | Ago per iniezione intracardiaca |
| 33G x 15mm | Hamilton | 7747-01 | iniezione intracarotidea |
| , Castroviejo, 14cm, con blocco, 1,2mm Ganasce seghettate | WPI | 14137-G | Per procedure microchirurgiche |
| NOD. Topi Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJ | The Jackson Laboratory | 005557 | topi Murine model |
| NU/J | The Jackson Laboratory | 002019 | Modello murino |
| Nuclear Mitotic Apparatus Protein polyclonal rabbit anti-human | Abcam | 97585 | NuMA Colorazione |
| Penicillina-Streptomicina 10000U/mL | Gibco | 15140122 | Coltura cellulare |
| Percoll | GE | 0891-01 | soluzione di separazione della densità |
| Guanti chirurgici classici PI Cardinal | Health | 2D72PT75X | Chirurgia |
| pLKO Tet-On | Addgene | 21915 | Manipolazione genetica |
| Povidone-Iodio 10% Soluzione | Medline | MDS093943 | Chirurgia |
| Gocce di proparacaina 0,5% | Akorn Pharma | AX0501 | Anestetico locale oftalmico |
| Puralube Petrolatum Unguento oftalmico | Dechra | 83592 | anestesia |
| Lame a doppio taglio | EMS | 72000 | Rasatura e Vibrotomo Brain Slicing |
| Reflex 9mm EZ Clip | Braintree | EZC- KIT | Chiusura ferita |
| RPMI 1640 | Corning | 10-040-CM | Forbici per colture cellulari |
| , molla 10,5 cm Str, lame da 8 mm | WPI | 501235 | Per procedure microchirurgiche |
| Microtomo a lama vibrante semiautomatico | Leica | VT1200 | Brain Slice Immunofluorescenza |
| Sistema di vaporizzazione per anestesia a canale singolo | Kent Scientific | VetFlo-1210S | anestesia |
| Sistema di camere da tavolo Smartbox e soffiatore di scarico | EZ Systems | TT4000 | Eutanasia CO2 |
| Telo monouso fenestrato sterile | Medline | NON21002 | Chirurgia |
| Cultori chirurgici Aurora sterili non rinforzati con maniche a scomparsa | Medline | DYNJP2715 | |
| Surgery T25 Flask | Corning | 430639 | Coltura cellulare |
| Tris | Corning | 46-031-CM | Colorazione NuMA |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100-500ML | Troutman in immunofluorescenza |
| , 10 cm, modello G curvo, punta da 0,52 mm con piattaforma di legatura | WPI | WP505210 | Per procedure microchirurgiche |
| Clip per vasi 10G Pressione 5x 0,8 mm Ganasce, 5/confezione | WPI | 15911 | Per procedure microchirurgiche |
| Visiopharm | Visiopharm Visiopharm | Software di quantificazione della colorazione NuMA | |
| Xilasina 100mg/mL | Akorn Pharma | 59399-111-50 | Anestesia |
| Xilene | Fisher | X3P-1GAL | Istologia |
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