Magnaporthe oryzae, il fungo esplosione del riso, infetta un assortimento di colture di cereali, tra cui orzo, grano e riso1. Questo agente patogeno causa malattie devastanti e rappresenta una minaccia mondiale per queste preziose colture, causando la perdita completa del raccolto se non controllato. Molti laboratori in tutto il mondo si concentrano sulla malattia dell'esplosione del riso a causa della sua minaccia globale e dei suoi attributi come modello eccellente per le interazioni pianta-fungo2. È stato completamente sequenziato e la genetica del suo ciclo infettivo, in particolare gli eventi precoci, è stata stabilita 3,4. Il ciclo vitale inizia con una spora che germina su una superficie fogliare, formando la struttura di penetrazione specializzata chiamata appressorio. L'appressorio penetra nel tessuto fogliare e l'infezione continua con lo sviluppo di lesioni che iniziano il processo di sporulazione e diffondono la malattia4. Prevenire uno qualsiasi di questi eventi precoci inibirebbe drasticamente questa malattia devastante. Di conseguenza, la maggior parte della ricerca attuale sulla malattia blastica si è concentrata sulle prime fasi dell'infezione, dai conidi germinati che formano un appressorio allo sviluppo delle ife invasive e del complesso interfacciale biotrofico (BIC)5.
La grande quantità di ricerche sulla malattia blastica è stata condotta nel riso, anche se M. oryzae è un patogeno significativo per una varietà di colture, e ceppi di recente evoluzione stanno emergendo come una minaccia globale per il grano6. Mentre il riso è una delle prime tre colture di base utilizzate per nutrire la popolazione, insieme a grano e mais, l'orzo è il quarto cereale in termini di alimentazione per il bestiame e produzione di birra7. Con la crescita dell'industria della birra artigianale, cresce anche il valore economico dell'orzo. Ci sono diversi vantaggi nell'utilizzare M. oryzae e orzo come patosistema per studiare la malattia blastica. In primo luogo, ci sono ceppi di M. oryzae che infettano solo l'orzo, così come ceppi che possono infettare più specie di erba. Ad esempio, 4091-5-8 infetta principalmente solo l'orzo, mentre Guy11 e 70-15 possono infettare sia l'orzo che il riso8. Questi ceppi sono geneticamente simili e il processo di infezione è paragonabile9. In secondo luogo, in condizioni standard di laboratorio e di serra, l'orzo è più facile da coltivare, in quanto non ha i complicati requisiti del riso (controllo conciso della temperatura, alta umidità, spettri di luce specifici). Ci sono anche sfide di imaging con il riso a causa dell'idrofobicità della superficie fogliare, che l'orzo non mostra10.
Questo protocollo presenta un metodo semplice per isolare e utilizzare efficacemente guaine per foglie d'orzo per l'analisi microscopica di più stadi di infezione, utilizzando comuni forniture di laboratorio e uno smartphone per la raccolta dei dati. Questo metodo per il test della guaina delle foglie d'orzo è adattabile per i laboratori di tutto il mondo in quanto richiede forniture minime e tuttavia fornisce un quadro chiaro dell'interazione microscopica tra l'agente patogeno e le prime cellule che infetta. Mentre i saggi di patogenicità, come l'inoculazione di spray o goccioline, possono fornire una visione macro della capacità del patogeno di formare lesioni, questo test consente al ricercatore di visualizzare fasi specifiche dell'infezione precoce, dagli eventi di pre-penetrazione alla colonizzazione delle cellule epidermiche. Inoltre, i ricercatori possono facilmente confrontare l'infezione con il fungo di tipo selvatico con l'infezione con un mutante ridotto in virulenza.