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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Qui, presentiamo un protocollo per eseguire l'imaging del calcio a due fotoni nel prosencefalo dorsale di zebrafish adulto.
Il pesce zebra adulto (Danio rerio) mostra un ricco repertorio di comportamenti per lo studio delle funzioni cognitive. Hanno anche un cervello in miniatura che può essere utilizzato per misurare le attività nelle regioni del cervello attraverso metodi di imaging ottico. Tuttavia, i rapporti sulla registrazione dell'attività cerebrale nel comportamento del pesce zebra adulto sono stati scarsi. Il presente studio descrive le procedure per eseguire l'imaging del calcio a due fotoni nel prosencefalo dorsale di zebrafish adulti. Ci concentriamo sulle misure per impedire al pesce zebra adulto di muovere la testa, il che fornisce stabilità che consente la scansione laser dell'attività cerebrale. Gli animali con la testa trattenuta possono muovere liberamente le parti del corpo e respirare senza aiuti. La procedura mira a ridurre i tempi dell'intervento chirurgico di poggiatesta, ridurre al minimo il movimento cerebrale e massimizzare il numero di neuroni registrati. Qui viene descritta anche una configurazione per presentare un ambiente visivo immersivo durante l'imaging del calcio, che può essere utilizzata per studiare i correlati neurali alla base dei comportamenti attivati visivamente.
L'imaging a fluorescenza del calcio con indicatori geneticamente codificati o coloranti sintetici è stato un potente metodo per misurare l'attività neuronale negli animali comportamentali, inclusi primati non umani, roditori, uccelli einsetti. L'attività di centinaia di cellule, fino a circa 800 μm sotto la superficie cerebrale, può essere misurata simultaneamente utilizzando l'imaging multi-fotone 2,3. L'attività di specifici tipi cellulari può anche essere misurata esprimendo indicatori di calcio in popolazioni neuronali geneticamente definite. L'applicazione del metodo di imaging per modelli di piccoli vertebrati apre nuove possibilità nel campo del calcolo neuronale in tutte le regioni del cervello.
I pesci zebra sono un sistema modello ampiamente utilizzato nella ricerca neuroscientifica. Le larve di pesce zebra a circa 6 giorni dopo la fecondazione sono state utilizzate per l'imaging del calcio a causa del loro cervello in miniatura e del corpo trasparente4. I giovani pesci zebra (3-4 settimane di vita) sono utilizzati anche per studiare i meccanismi neurali alla base delle vie sensomotorie 5,6. Tuttavia, il livello massimo di prestazione per i comportamenti complessi, compreso l'apprendimento associativo e i comportamenti sociali, viene raggiunto a un'età più avanzatadi 7,8 anni. Pertanto, è necessario un protocollo affidabile per studiare molteplici funzioni cognitive nel cervello del pesce zebra adulto utilizzando metodi di imaging. Mentre la larva di zebrafish e il pesce zebra giovane possono essere incorporati nell'agarosio per l'imaging in vivo, il pesce zebra adulto di 2 mesi o più soffre di ipossia in tali condizioni e sono fisicamente troppo forti per essere trattenuti dall'agarosio. Pertanto, è necessaria una procedura chirurgica per stabilizzare il cervello e consentire all'animale di respirare liberamente attraverso le branchie.
Qui, descriviamo un protocollo di poggiatesta che prevede un nuovo design di una singola barra per la testa. Il tempo di intervento ridotto di 25 minuti è due volte più veloce rispetto al metodoprecedente 9. Descriviamo anche il design della camera di registrazione (serbatoio semi-esagonale), lo stadio di testa e un meccanismo di bloccaggio rapido per combinare le due parti9. Infine, viene anche descritta la configurazione per presentare uno stimolo visivo immersivo per studiare l'attività cerebrale e i comportamenti attivati visivamente. Nel complesso, le procedure qui descritte possono essere utilizzate per eseguire l'imaging del calcio a due fotoni in popolazioni cellulari geneticamente definite in un pesce zebra adulto con la testa trattenuta, consentendo lo studio delle attività cerebrali durante vari paradigmi comportamentali.
Tutte le procedure sugli animali sono state approvate ed eseguite in conformità con le linee guida del Comitato Istituzionale per la Cura e l'Uso degli Animali dell'Academia Sinica. I dettagli degli strumenti di ricerca sono disponibili nella Tabella dei materiali.
1. Preparazione della camera di registrazione

Figura 1: Strumenti necessari per l'intervento chirurgico del poggiatesta. (A) Il meccanismo di bloccaggio rapido tra la piastra circolare del tavolino di testa e la piastra di base all'interno del serbatoio semiesagonale. I file CAD (Computer-Aided Design) delle parti personalizzate sono disponibili nei file supplementari 1-4. (B) Poggiatesta a forma di Ω per il poggiatesta. (C) Il micromanipolatore a tre assi utilizzato per posizionare la barra di testa sul sito di attacco. Riquadro: orientamento della barra di testa nell'argilla. (D) Cannone per trattenere il pesce durante l'intervento chirurgico. Riquadro: orientamento dei pesci all'interno del cannone. (E) Modulo di caricamento del pesce e micromanipolatore utilizzato per caricare il pesce sul palco di testa. Riquadro: orientamento dei pesci all'interno del modulo. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
2. Chirurgia del poggiatesta

Figura 2: Passaggi chiave durante l'intervento chirurgico di poggiatesta . (A) Composizione della capsula all'interno del cannone. (B) Siti di attacco sul cranio (rosso). Le frecce rosse specificano i siti dei vasi sanguigni. (C) In alto: barra della testa attaccata al teschio del pesce. Fondo: pesce caricato sul palco di testa. (D) Tagli necessari per rimuovere la pelle sopra il prosencefalo. I numeri indicano la sequenza di taglio. Evitare la rimozione della pelle nel sito contrassegnato (punta di freccia) per evitare il sanguinamento dell'animale. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
3. Imaging a due fotoni

Figura 3: Configurazione per eseguire l'imaging del calcio, la registrazione del comportamento e la visualizzazione dello stimolo visivo. (A) Tre proiettori presentano uno stimolo visivo sulle pareti della vasca semiesagonale. Le luci IR laterali vengono utilizzate per illuminare il corpo del pesce zebra. (B) Posizionamento della lente dell'obiettivo. A sinistra: vista frontale. A destra: vista laterale. La distanza tra l'obiettivo 16x e la regione cerebrale bersaglio è di circa 2,5 mm. (C) Esempio di immagine a due fotoni. A sinistra: massima proiezione dell'intero prosencefalo dorsale in Tg[neuroD:GCaMP6f]. A destra: immagine ingrandita per rivelare i neuroni in più regioni del cervello. Riquadro: un ingrandimento maggiore da una diversa regione del cervello. Le immagini sono medie di 10 s di dati registrati a 5Hz. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Il protocollo si compone di due parti: l'intervento chirurgico del poggiatesta e l'imaging a due fotoni delle attività neuronali nel prosencefalo. Il successo dell'intervento chirurgico è definito dalla sopravvivenza dell'animale e dalla stabilità del poggiatesta. Il tasso di sopravvivenza può essere notevolmente migliorato dalla frequente perfusione della soluzione TMS allo 0,01% attraverso la bocca durante l'intervento chirurgico. I pesci dovrebbero riprendersi dall'anestesia e respirare attivamente entro 1-2 minuti dopo essere stati immersi nell'acqua dell'acquario. L'imaging del calcio a due fotoni consente la registrazione dell'attività dei singoli neuroni nel prosencefalo dorsale a una profondità fino a 200 μm dalla superficie cerebrale attraverso crani intatti (~40 μm di spessore). Questo intervallo di imaging copre più zone del telencefalo dorsale (D), tra cui la zona mediale (Dm), la parte rostrale della zona centrale (rDc), la parte caudale della zona centrale (cDc) e la zona laterale (Dl). Insieme costituiscono il 30% del telencefalo nel pesce zebra adulto (Fig. 3C). Con l'imaging volumetrico che utilizza l'attuatore piezoelettrico, in genere registriamo l'attività di 150 neuroni in Dl o cDc e 300 neuroni in Dm e rDc in Tg[neuroD:GCaMP6f]10. La registrazione comportamentale simultanea viene eseguita durante l'imaging cerebrale, che consente l'identificazione dei correlati neuronali degli output motori (Figura 4).
Durante l'imaging a due fotoni, i movimenti della coda non dovrebbero indurre un artefatto di movimento visibile nell'immagine. Un movimento piccolo (<1 μm) e transitorio può essere osservato durante le difficoltà estreme. Questi movimenti sono in genere reversibili, quindi l'imaging può essere continuato in seguito. Osserviamo anche una lenta deriva (<1 μm min-1) nelle direzioni laterale e assiale9. Per prevenire la perdita di neuroni dovuta alla deriva assiale del campione, in genere limitiamo la nostra sessione di imaging a 10 minuti. Il fotosbiancamento dell'indicatore di calcio non deve essere osservato dopo una sessione di imaging di 10 minuti con la potenza laser specificata.

Figura 4: Tracciamento del comportamento e modello di attività neurale nel pesce zebra adulto. (A) Un fotogramma di esempio di registrazione del comportamento da parte della telecamera (vista ventrale). (B) Attività dei neuroni del prosencefalo (ΔF/F, nero) e intensità del movimento della coda (blu). L'intensità del movimento della coda è stata quantificata dalla media della differenza assoluta in termini di pixel tra fotogrammi video successivi. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
File supplementare 1: Disegno della piastra di base. Fare clic qui per scaricare il file.
Fascicolo supplementare 2: Disegno della piastra circolare. Fare clic qui per scaricare il file.
Fascicolo supplementare 3: Progettazione del serbatoio semiesagonale. Fare clic qui per scaricare il file.
File supplementare 4: Progettazione della barra di testa. Fare clic qui per scaricare il file.
Tabella supplementare 1: Dettagli sulla risoluzione dei problemi. Fare clic qui per scaricare il file.
Gli autori dichiarano di non avere interessi finanziari concorrenti.
Qui, presentiamo un protocollo per eseguire l'imaging del calcio a due fotoni nel prosencefalo dorsale di zebrafish adulto.
Questo lavoro è stato sostenuto dall'Istituto di Biologia Molecolare, dall'Academia Sinica e dal Consiglio Nazionale per la Scienza e la Tecnologia di Taiwan. L'officina meccanica dell'Istituto di Fisica dell'Academia Sinica ha contribuito alla fabbricazione di parti progettate su misura. Vogliamo anche ringraziare P. Argast (Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research, Basilea, Svizzera) per la progettazione del meccanismo di bloccaggio rapido dello stadio di testa.
| Scheda di acquisizione | MBF Bioscience | Vidrio vDAQ | Microscopio |
| Pellicola per retroproiezione | Kimoto | Diland Schermo - GSK | presenta stimolo visivo |
| Filtro passa-banda (510/80 nm) | Chroma | ET510/80m | |
| Microscopio Piastra di base per il serbatoio semi-esagonale | su misura | vedi file supplementari | camera di registrazione |
| Fotocamera filtro (< 875 nm) | Edmund optics | #86-106 | Registrazione del comportamento |
| Filtro della fotocamera (>700 nm) | Edmund optics | #43-949 | Registrazione del comportamento |
| Obiettivo della telecamera | Thorlabs | MVL50M23 | Registrazione del comportamento |
| Chameleon Vision-S | Coherent | Vision-S | Laser |
| Piastra circolare per il palco della testa | su misura | vedi file | supplementaricamera di registrazione |
| Controllore per attuatore piezoelettrico | Physik Instrumente | E-665. Microscopio CR | |
| Amplificatore di corrente | Thorlabs | TIA60 | Microscopio |
| Elitedent Q-6 | Rolence Enterprise | Q-6 | Chirurgia: Lampada UV |
| Filtro di emissione 510/80 nm | Chroma | ET510/80m | Microscopio |
| Barra della testa | su misura | vedi file supplementari | camera di registrazione |
| Luce infrarossa | Thorlabs | M810L3 | Registrazione del comportamento |
| Proiettore LED | AAXA | P2B LED Pico Il proiettore | presenta uno stimolo visivo |
| Fazzoletto di carta umido (Kimwipe) | Kimtech Science | 34155 | Chirurgia: tessuto di carta umido |
| Tavolino per campioni XY motorizzato | Zaber | X-LRM050 | Microscopio |
| Filtri a densità neutra (50% di trasmissione) | Thorlabs | NE203B | presenta lo stimolo visivo |
| Ø Supporto per Perno 1/2" | ThorLabs | PH1.5V | Chirurgia: tubo cavo per cannone |
| Ø Post ottico in acciaio inossidabile da 1/2" | ThorLabs | TR150/M | Chirurgia: modulo di caricamento dei pesci |
| Obiettivo 16x, 0,8NA | Microscopio Nikon | CF175 | Argilla |
| da modellazione a base di olio | Argilla Ly Hsin Clay | C4086 | Chirurgia: supporto per barra della testa |
| Adesivo ottico | Norland Products | NOA68 | Chirurgia: colla polimerizzabile UV |
| Tubo fotomoltiplicatore | Hamamatsu | H11706P-40 | Microscopio |
| Attuatore piezoelettrico | Physik Instrumente | P-725.4CA PIFOC | Microscopio |
| Pockels Cell | Conoptics | M350-80-LA-BK-02 | Microscopio |
| Red Wratten filter (> 600 nm) | Edmund | optics#53-699 | Present Stimolus |
| Visual Scan System | INSS | RGE-02 | Microscopio |
| Morsetto ad angolo retto per Ø 1/2" Post | ThorLabs | RA90/M | Chirurgia: modulo di carico del pesce |
| Morsetto rotante per Ø 1/2" Post | ThorLabs | SWC/M | Chirurgia: modulo di caricamento dei pesci |
| ScanImage | MBF Bioscience | Versione base | Microscopio |
| Vasca semi-esagonale | su misura | vedi file supplementari | camera di registrazione |
| Super-Bond C& B Kit | Sun Medical Co. | Super-Bond C& B | Chirurgia: cemento dentale |
| Tricaina metanesolfonato | Sigma Aldrich | E10521 | Chirurgia: anestesia |
| Telecamera USB | FLIR | BFS-U3-13Y3M-C | Registrazione del comportamento |
| Vetbond | 3M | 1469SB | Chirurgia: colla tissutale |