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Il cancro alla prostata (PC) è il 2° tumore più frequente negli uomini e la 5° causa di morte in tutto il mondo1. Il trattamento e la prognosi del paziente dipendono dalla stadiazione e dal grado (punteggio di Gleason) del tumore, come evidenziato dai tassi di sopravvivenza a 5 anni più elevati dei tumori localizzati e di basso grado (grado 6 di Gleason) (99%) rispetto ai tumori di Gleason di alto grado e metastatici (31%)2.
La recidiva locale di PC e il fallimento del trattamento sono stati collegati alla caratteristica elevata eterogeneità genetica intratumorale di questo tumore di tipo3. Inoltre, la PC è considerata una malattia multifocale con diversi focolai tumorali che presentano diverse caratteristiche morfologiche, istologiche e molecolari4, che possono originare indipendentemente o derivare da un antenato comune delle cellule tumorali5. Studi precedenti hanno dimostrato che l'evoluzione del tumore differisce tra i pazienti in base a specifici driver genetici che possono promuovere metastasi o confinare la linea cellulare alla prostata5. Pertanto, la caratterizzazione molecolare dei diversi focolai tumorali è fondamentale non solo per fornire una diagnosi e una prognosi più accurate, ma anche per personalizzare un trattamento efficace e personalizzato per il paziente.
In questo contesto, la ricerca biomedica e gli approcci multi-omici integrativi stanno offrendo opportunità senza precedenti per classificare i tumori in diversi sottotipi, identificare biomarcatori diagnostici e prognostici e scoprire marcatori correlati alla risposta al trattamento. Inoltre, questi approcci contribuiscono a una migliore comprensione della biologia di questa malattia 6,7. I campioni biologici, siano essi tessuti o biofluidi, possono essere analizzati utilizzando varie piattaforme multi-omiche (genomica, trascrittomica, proteomica, metabolomica, ecc.) per scoprire le caratteristiche biologiche alla base della fisiopatologia del cancro, affrontando così le attuali limitazioni legate all'eterogeneità genetica e fenotipica6. Tuttavia, è importante considerare che la qualità dei dati derivati dagli studi omici dipende dalla qualità dei campioni raccolti dai tumori, dalla loro accurata caratterizzazione e dalla successiva elaborazione e conservazione8.
In questo contesto, l'ottenimento di tessuto PC fresco per la ricerca presenta una sfida metodologica a causa della difficoltà di successo del campionamento del tumore9. I metodi precedenti prevedevano il campionamento casuale dopo la prostatectomia radicale, producendo scarsi risultati10. Tuttavia, gli approcci più recenti incorporano protocolli mirati basati sia sulla risonanza magnetica (MRI) che sui dati della biopsia, con conseguente miglioramento dell'efficacia nella raccolta di campioni tumorali11.
D'altra parte, anche la caratterizzazione istopatologica dei campioni prima della loro conservazione senza alterazioni tissutali significative rappresenta una sfida interessante. Di conseguenza, in molti casi, la determinazione istopatologica dei campioni viene eseguita dopo la loro analisi (ad esempio, analisi metabolomica HR 1H NMR)12. Questa pratica comporta spese inutili, dispendio di tempo e la perdita di un numero significativo di campioni che vengono eventualmente esclusi dall'analisi (ad esempio, campioni che, a seguito di analisi istopatologiche, risultano non essere campioni tumorali). In altri casi, la caratterizzazione istopatologica dei campioni viene eseguita prima della loro analisi. In effetti, alcuni studi precedenti hanno tentato di standardizzare i metodi per fornire campioni di ricerca rappresentativi di alta qualità da campioni di prostatectomia radicale per la genomica e la metabolomica13,14. Tuttavia, l'efficienza del campionamento è significativamente più elevata se eseguito da sezioni già confermate istologicamente (88%) che distruggono il tessuto, rispetto a quando eseguito da sezioni non confermate (45%)1.
Qui, viene presentata una nuova metodologia per superare queste limitazioni, con l'obiettivo di ottenere campioni di PC freschi e ben caratterizzati prima della conservazione nella Biobanca. Questo metodo è stato sviluppato attraverso sforzi di collaborazione tra diversi servizi clinici (Urologia, Patologia e Biobanca dell'Ospedale La Fe). È importante sottolineare che le biobanche svolgono un ruolo essenziale nella raccolta, elaborazione, conservazione e conservazione di campioni biologici, garantendo al contempo l'alta qualità dei campioni e dei dati, nonché il rispetto dei requisiti etici e legali 8,15,16.