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Research Article
Marina Cunquero1, Maria Marsal1, Gustavo Castro-Olvera1, Steven T. Walston2, F. Taygun Duvan2, José Gabriel Macias-Montero3, Carles Puigdengoles3, Mokhtar Chmeissani3, Jose A. Garrido2,4, Pablo Loza-Alvarez1
1Institut de Ciències Fotòniques (ICFO),The Barcelona Institute of Science and Technology, 2Catalan Institute of Nanoscience and Nanotechnology (ICN2), CSIC and BIST,Campus UAB, 3Institut de Física d'Altes Energies (IFAE),The Barcelona Institute of Science and Technology, Campus UAB, 4Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA)
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Le protesi retiniche hanno la capacità di generare percezioni visive. Per far progredire lo sviluppo di nuove protesi, sono necessari metodi ex vivo per testare i dispositivi prima dell'impianto. Questo articolo fornisce un protocollo completo per studiare l'attività del calcio nello strato di cellule gangliari retiniche quando sottoposto a stimolazione elettrica.
Le distrofie retiniche sono una delle principali cause di cecità in tutto il mondo. Sono in corso ampi sforzi per sviluppare protesi retiniche avanzate in grado di bypassare le cellule fotorecettrici sensibili alla luce compromesse nella retina degenerata, con l'obiettivo di ripristinare parzialmente la vista inducendo percezioni visive. Una strada comune di indagine riguarda la progettazione e la produzione di dispositivi impiantabili con una struttura fisica flessibile, che ospita un numero elevato di elettrodi. Ciò consente la generazione efficiente e precisa di percezioni visive. Tuttavia, con ogni progresso tecnologico, sorge la necessità di un metodo ex vivo affidabile e gestibile per verificare la funzionalità del dispositivo prima di passare agli esperimenti in vivo , in cui entrano in gioco fattori che vanno oltre le prestazioni del dispositivo. Questo articolo presenta un protocollo completo per lo studio dell'attività del calcio nello strato di cellule gangliari retiniche (GCL) dopo la stimolazione elettrica. In particolare, vengono delineati i seguenti passaggi: (1) marcatura fluorescente della retina di ratto utilizzando indicatori di calcio geneticamente codificati, (2) cattura del segnale di fluorescenza utilizzando un microscopio a fluorescenza invertito applicando modelli distinti di stimolazione elettrica e (3) estrazione e analisi delle tracce di calcio da singole cellule all'interno del GCL. Seguendo questa procedura, i ricercatori possono testare in modo efficiente nuovi protocolli di stimolazione prima di condurre esperimenti in vivo .
La retina contiene fotorecettori, che sono cellule responsabili del rilevamento della luce. Catturano i fotoni e li convertono in impulsi nervosi. Questi impulsi vengono poi elaborati all'interno della retina e trasmessi alla corteccia visiva, con conseguente formazione di un'immagine visiva1. La Retinite Pigmentosa (RP) e la Degenerazione Maculare Legata all'Età (AMD) sono malattie degenerative caratterizzate dalla progressiva perdita dei fotorecettori. Queste retinopatie sono tra le principali cause di cecità in tutto il mondo1, colpendo milioni di individui e avendo conseguenze mediche, personali e socioeconomiche significative per i pazienti, i sistemi sanitari e la società nel suo complesso. Inoltre, con l'invecchiamento della popolazione, si prevede che i casi di AMD aumenteranno del 15% entro il 20502.
Attualmente, sono in corso numerosi sforzi di ricerca per ripristinare la vista nei pazienti affetti da queste condizioni3. Un approccio promettente è l'uso di protesi retiniche, che si sono dimostrate efficaci nel ripristinare parzialmente la vista 4,5. Questi dispositivi catturano la luce dalla scena visiva e la convertono in impulsi elettrici. Questi impulsi vengono erogati attraverso elettrodi all'interno di un array di microelettrodi (MEA) impiantato nell'occhio, stimolando i neuroni sopravvissuti e bypassando la funzione dei fotorecettori persi. Le cellule gangliari retiniche attivate (RGC) trasmettono l'output al cervello, dove viene interpretato come percezione visiva. Tuttavia, i principali limiti degli impianti attuali risiedono nella risoluzione dell'interfaccia elettrodo-tessuto6 e nella stimolazione non selettiva di diversi tipi di cellule. Pertanto, per ottimizzare la progettazione di nuovi dispositivi impiantabili per un ripristino della vista più efficiente, è fondamentale comprendere come possono essere sviluppati paradigmi di stimolazione per attivare selettivamente le cellule in prossimità degli elettrodi.
L'imaging del calcio è una tecnica ampiamente utilizzata per lo studio dell'attività neurale, che offre diversi vantaggi rispetto ai metodi non ottici 7,8. In primo luogo, fornisce una risoluzione cellulare e subcellulare. In secondo luogo, i marcatori del calcio possono colpire specifici tipi di cellule. In terzo luogo, consente il monitoraggio a lungo termine e, in quarto luogo, consente l'osservazione di intere popolazioni cellulari distinguendo tra cellule attive e inattive. Questo metodo fornisce prove indirette dell'attività cellulare con una risoluzione temporale nell'ordine di centinaia di millisecondi. Gli indicatori fluorescenti di calcio geneticamente codificati, come i sensori GCaMP, subiscono un cambiamento conformazionale quando si legano al calcio, con conseguente aumento della fluorescenza9. I vettori virali adeno-associati ricombinanti (AAV) sono un mezzo efficace per trasdurre le cellule retiniche con GCaMP10.
Questo protocollo presenta un metodo efficiente che utilizza l'imaging del calcio per testare i protocolli di stimolazione degli impianti retinici. In particolare, ci concentriamo sul tessuto retinico di ratto ex vivo e forniamo istruzioni dettagliate passo dopo passo, dall'acquisizione del campione all'analisi dei dati. Offrendo questa guida completa, i ricercatori di vari background possono intraprendere con sicurezza la sperimentazione della stimolazione elettrica.
Tutte le procedure per gli animali sono state condotte in conformità con le linee guida standard per l'etica degli animali (Direttiva delle Comunità Europee 86/609/UE) e approvate dai comitati etici locali per gli animali. Per il presente studio sono stati utilizzati ratti Long Evans di 8 settimane. Gli animali sono stati ottenuti da una fonte commerciale (vedi Tabella dei materiali).
1. Preparazione del supporto e montaggio piatto
2. Etichettatura GCL e montaggio piatto della retina di ratto
NOTA: Questo metodo di marcatura non differenzia le RGC dalle cellule amacrine spostate. Se si desidera una marcatura selettiva delle RGC, prendere in considerazione l'utilizzo di AAV con promotori specifici per RGC11 e/o la marcatura retrograda attraverso il nervo ottico12. Per discriminare tra le classi di RGC ON- e OFF-center, classificare le RGC in base alla loro risposta alla luce13,14 e utilizzare versioni più recenti di indicatori di calcio geneticamente codificati che offrono una maggiore sensibilità e la capacità di misurare i singoli potenziali d'azione15.
3. Imaging del calcio ex vivo dopo stimolazione elettrica
NOTA: In questo lavoro, è stato utilizzato un MEA proof-of-concept per la sperimentazione ex vivo . I MEA personalizzati sono stati fabbricati con elettrodi porosi a base di grafene di 25 μm di diametro su vetro borosilicato di 500 μm di spessore con tracce di Ti/Au e successivamente isolati con nitruro di silicio e fotoresistSU-8 12. Tuttavia, i metodi di imaging del calcio sono validi indipendentemente dal materiale dell'elettrodo utilizzato per la stimolazione.
4. Analisi dei dati
Il protocollo descritto in questo studio si basa sugli studi di imaging a fluorescenza e stimolazione elettrica condotti da Weitz et al.12. Il protocollo è costituito da tre parti principali: (1) marcatura fluorescente del GCL e montaggio piatto della retina sul MEA (Figura 1-sinistra), (2) visualizzazione dell'attività del calcio nel GCL durante la stimolazione elettrica (Figura 1-centrale) e (3) estrazione, elaborazione e interpretazione dei dati di imaging (Figura 1-destra).
Innanzitutto, come illustrato nella Figura 1 a sinistra, i ratti Long Evans vengono iniettati per via intravitrea con AAV2-CAG-GCaMP5G prima della sessione di imaging. L'espressione virale ottimale per questo vettore si verifica da 2 a 3 settimane dopo l'iniezione12,18. Dopo aver anestetizzato completamente l'animale, viene praticato un foro pilota utilizzando un ago da 30 G, quindi 5 μL di AAV2-CAG-GCaMP5G vengono iniettati lentamente nel vitreo utilizzando un ago smussato da 36 G collegato a una siringa di precisione per prevenire il reflusso. Durante l'espressione virale, viene utilizzato un sistema di imaging retinico in vivo per valutare le condizioni della retina dopo l'intervento chirurgico, con immagini OCT che forniscono una visualizzazione dettagliata degli strati retinici. Una volta raggiunta l'espressione genica, la retina viene accuratamente estratta dall'oculare utilizzando uno stereomicroscopio e strumenti di dissezione ad alta precisione. Da questo punto in poi, il tessuto viene manipolato in mezzi ossigenati per preservare il campione. La retina asportata, con il GCL rivolto verso l'alto, viene quindi montata su una piattaforma progettata per il montaggio piatto per garantire la stabilità e impedire il galleggiamento del campione. Il campione viene montato sulla superficie MEA con il GCL rivolto verso gli elettrodi.
Successivamente, il MEA viene montato sulla sua scheda di interfaccia su un microscopio a fluorescenza invertito (Figura 1 al centro). Il campione retinico viene perfuso con mezzi ossigenati a 33 °C utilizzando un sistema di perfusione. Il campione può essere mantenuto in questa configurazione per diverse ore. Viene programmato lo schema di stimolazione desiderato e le immagini vengono acquisite a una velocità di 10 fotogrammi al secondo. Si consiglia di denominare i film in base ai parametri di stimolazione elettrica applicati. L'acquisizione dell'immagine dovrebbe iniziare prima dell'inizio della stimolazione per ottenere alcuni fotogrammi di base senza stimolazione, che serviranno come controllo negativo.
Infine, come illustrato nella Figura 1 a destra, i dati vengono estratti dalle immagini time-lapse segmentando i somi cellulari. Gli effetti del fotosbiancamento vengono corretti adattando i dati e vengono identificate le cellule reattive. Le cellule responsive sono definite come quelle con picchi di fluorescenza durante la stimolazione che superano la loro linea di base di 2,5 volte. Se una cellula risponde a tre dei cinque impulsi di stimolazione, è considerata reattiva a quello specifico treno di stimolazione.

Figura 1: Panoramica dello studio. Illustrazione schematica del protocollo per l'etichettatura fluorescente (a sinistra) del GCL della retina e il montaggio del campione, (al centro) la preparazione per le registrazioni ex vivo con stimolazione elettrica fornita da un MEA e (a destra) l'analisi dei dati di imaging del calcio per classificare le cellule responsive. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Retina iniettata intravitreale
L'incidenza di complicanze associate alle iniezioni intravitreali è molto bassa. Tuttavia, ci sono alcune complicazioni che possono derivare dall'intervento stesso, indipendentemente dal componente iniettato. Queste complicanze includono la formazione della cataratta, l'emorragia vitreale, l'aumento della pressione intraoculare e l'endoftalmite23. Per determinare se queste complicazioni sono causate dall'intervento chirurgico, l'animale deve essere sottoposto a valutazione prima della procedura utilizzando la funduscopia e l'OCT. Tre giorni dopo l'iniezione, gli animali devono essere seguiti. Nella Figura 2A-D, viene mostrata la retina di un animale sano a cui è stata iniettata l'iniezione. Dopo due settimane dall'iniezione, le RGC iniziano ad esprimere fluorescenza, che può essere visualizzata utilizzando la fundoscopia a fluorescenza (Figura 2B,C). Le immagini OCT forniscono una visualizzazione dettagliata della disposizione e dello spessore degli strati retinici (Figura 2D), offrendo una risoluzione più elevata rispetto alla funduscopia, in particolare quando si valuta il distacco della retina. Una volta che la retina è montata in piano e fotografata utilizzando un microscopio a fluorescenza invertita, diventa possibile distinguere le cellule e i fasci di assoni. A differenza di altri indicatori di calcio, l'indicatore GCaMP è limitato al citoplasma7 e la fluorescenza è esclusa dal nucleo (Figura 2E).

Figura 2: Immagini rappresentative della retina iniettata intravitreale. (A) Fundoscopia, (B) fundoscopia a fluorescenza, (C) ingrandimento della fundoscopia a fluorescenza, (D) immagine OCT e (E) immagine a epifluorescenza della retina asportata montata su un MEA personalizzato con elettrodi a base di grafene su vetro borosilicato di 500 μm di spessore. In (E), le linee nere corrispondono alle tracce Ti/Au. Barre graduate: 115 μm (D) e 100 μm (E). Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Elettrodi e contatto GCL
Al fine di evocare risposte neurali in modo efficace, è fondamentale assicurarsi che la retina piatta sia a stretto contatto con la superficie del MEA. Un modo semplice per verificarlo è confermare visivamente se le celle e gli elettrodi si trovano sullo stesso piano focale (Figura 3A). Se le celle non si trovano sullo stesso piano focale degli elettrodi (Figura 3B), indica che il contatto non è ottimale, il che si tradurrà in una stimolazione meno efficace.

Figura 3: Elettrodi e contatto GCL. (A) Celle ed elettrodo (asterisco) sullo stesso piano focale. (B) Cellule ed elettrodi che non si trovano sullo stesso piano focale, indicando un contatto non ottimale per la stimolazione elettrica in quell'area. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Imaging del calcio ex vivo su stimolazione elettrica fornita da un MEA
I dati risultanti dall'imaging del calcio consistono in immagini time-lapse che monitorano l'attività neurale di centinaia di cellule in risposta alla stimolazione elettrica. Gli stimoli soprasoglia causano un afflusso di calcio nei somi cellulari, con conseguente improvviso cambiamento nell'intensità della fluorescenza (Video 1). Questo protocollo consente di determinare se un elettrodo, MEA e/o un algoritmo di stimolazione suscitano la risposta desiderata nel tessuto neurale. Le dimensioni e il passo degli elettrodi sul MEA, così come la proporzione di tessuto studiato, determineranno l'ingrandimento obiettivo appropriato da scegliere. Tipicamente, per gli studi di stimolazione a singolo elettrodo con diametri compresi tra 5 μm e 100 μm, è adatto un ingrandimento dell'obiettivo 20-25x (Figura 4A), che fornisce un FOV di circa 600 μm x 600 μm. Per gli esperimenti che prevedono la stimolazione con elettrodi multipli, può essere necessario un ingrandimento dell'obiettivo 4-10x per valutare un'area più ampia di circa 2 mm x 2 mm. Le cellule reattive possono essere facilmente identificate generando una proiezione dell'immagine con deviazione standard del filmato time-lapse (Figura 4B e Video 1).

Figura 4: Imaging del calcio del GCL con stimolazione elettrica fornita da un elettrodo di 25 μm di diametro. (A) Proiezione massima di un filmato time-lapse di 60 s e (B) proiezione a deviazione standard che raffigura chiaramente le cellule che rispondono agli stimoli elettrici da un elettrodo poroso a base di grafene di 25 μm di diametro. L'elettrodo stimolante è indicato con un asterisco. Barra graduata: 50 μm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Analisi della dinamica del calcio nel tempo dopo stimolazione controllata
Per ogni soma cellulare identificato, i valori medi di intensità sono stati estratti nel tempo. La Figura 5A mostra le tracce di calcio corrette per il fotosbiancamento dalle cellule responsive. In questo esempio, cinque raffiche di treni di impulsi bifasici (prima catodica, 40 cicli, durata 1 ms, ampiezza 2 μA) sono stati erogati ogni 10 s (indicati da linee nere) durante un'acquisizione di immagini di 60 s. All'interno di un dato esperimento, vengono applicati gli stessi cinque treni di impulsi per testare la coerenza della risposta. I fotogrammi catturati durante i periodi di non stimolazione (evidenziati in rosso) vengono utilizzati per eseguire un adattamento lineare, correggendo l'effetto di fotosbiancamento.
Una volta identificate le cellule rispondenti e note le loro coordinate (x,y) rispetto all'elettrodo stimolante, si può esaminare la relazione tra la corrente necessaria per attivare le celle e la distanza dall'elettrodo stimolante (Figura 5B). Come previsto, le celle situate più vicino all'elettrodo stimolante richiedono valori di corrente più bassi per evocare una risposta.

Figura 5: Rappresentazione delle risposte evocate elettricamente. (A) Tracce di calcio di soma cellulari dopo 5 raffiche di treni di impulsi (bifasici, catodici, 40 cicli, durata 1 ms, ampiezza 2 μA) ogni 10 s (linee nere) durante un'acquisizione di immagini di 60 s. Vengono mostrati i periodi non stimolanti (fotogrammi evidenziati in rosso) e stimolanti (fotogrammi evidenziati in giallo). Le tracce che superano di 2,5 volte il segnale basale (quadrato medio dei periodi non stimolanti) sono considerate risposte evocate. Le cellule che rispondono in tre dei cinque periodi di stimolazione sono classificate come cellule che rispondono. (B) Mappa di distribuzione dell'attività del calcio che mostra l'elettrodo stimolante (cerchio delineato nero) e le cellule (cerchio delineato in grigio). Il codice colore rappresenta l'ampiezza minima dell'impulso necessaria per evocare una risposta cellulare. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Video 1: Imaging del calcio del GCL con stimolazione elettrica fornita da un elettrodo di 25 μm di diametro. Il video mostra le differenze nell'intensità della fluorescenza dovute alla stimolazione elettrica di un elettrodo poroso a base di grafene di 25 μm di diametro. Il lato sinistro mostra il filmato originale e il lato destro mostra la proiezione della deviazione standard in cui le cellule rispondenti possono essere facilmente identificate. Barra graduata: 50 μm. Clicca qui per scaricare questo video.
Gli autori non hanno informazioni da aggiungere al manoscritto.
Le protesi retiniche hanno la capacità di generare percezioni visive. Per far progredire lo sviluppo di nuove protesi, sono necessari metodi ex vivo per testare i dispositivi prima dell'impianto. Questo articolo fornisce un protocollo completo per studiare l'attività del calcio nello strato di cellule gangliari retiniche quando sottoposto a stimolazione elettrica.
Siamo grati a Merche Rivas, Angel Sandoval, Jesús Planagumà, Jordi Cortés, Sandra Ortonobés Lara e Alina Hirschmann (ICFO-Institut de Ciències Fotòniques) per il loro supporto tecnico, ad Anna Duarri (VHIR, Istituto di Ricerca Vall d'Hebron) del gruppo di ricerca oftalmologica per il loro supporto con le iniezioni intravitreali e l'imaging retinico in vivo .
Gli enti finanziatori che hanno sostenuto questo lavoro sono: Fundació CELLEX; Fundació Mir-Puig; Programma del Ministerio de Economía y Competitividad - Severo Ochoa per i centri di eccellenza in R&S (CEX2019-000910-S, [MCIN/AEI/10.13039/501100011033]); Generalitat de Catalunya attraverso il programma CERCA; Laserlab-Europe (EU-H2020 GA n. 871124); Fondazione La Caixa (LCF/HR19/52160003); Fondo Sociale Europeo (PRE2020-095721, M.C.).
| 20x NA 0,75 S Obiettivo per aria fluorescente | Nikon | CFI Super Fluor 20X-3,5 | |
| cm Piatto per coltura cellulare | Nunc | 12-565-90-30 | |
| G ago | VWR | 613-5373-36 | |
| G ago smussato | World Precision Instruments | NF36BL-2-6 | |
| cm Piatto per coltura cellulare | Nunc | 12-565-94-AAV2-CAG-GCaMP5G||
| Vector Biolabs | - | ||
| Ames' Medium | Sigma Aldrich | A1420-Blade | |
| Swann-morton | 0308-Fotocamera | ||
| Hamamatsu | ORCA Flash v4.0-Carbogen | ||
| Air liquide | - | ||
| Forcipe-curva | - | - | - |
| Molla fine forbice | FST | 91501-09-FITC | |
| cubo filtro | Nikon | serie | Standard-Lampada |
| fluorescente | Nikon | C-HGFI-Stereomicroscopio | |
| fluorescente | Nikon | SMZ25-HBSS | |
| Capricorno | HBSS-1A-ImageJ | ||
| /FIJI | NIH | v1.50i-Sistema | |
| di imaging retinico in vivo | Phoenix Research Laboratories | Micron III-Microscopio | |
| a fluorescenza invertita | Nikon | Eclipse | |
| Ti-Isofluorane | Arrane Baxter Laboratories | - | - |
| Long-Evans rat | Janvier | - | - |
| MATLAB (Versione R2021b) | Mathworks | - | - |
| Filtri per terreni | Merckmillipore | ||
| SCGPS02RE-Methocel 2% | Omni Vision | - | - |
| Microelectrode array (MEA) | - | Su misura | |
| NaHCO3 | Thermofisher | 42427-Penicillina | |
| /Streptomicina 100x | Thermofisher | 15140122 | - |
| Fenilefrina | Alcon Cusí Laboratories | 653437.3 | 100 mg/mL |
| Pipetta in plastica | VWR | 612-1793-Membrana | |
| porosa | Merckmillipore | ||
| #JVWP01300-Siringa di precisione | World Precision Instruments | 10 &; l | .Nanofil-Prescaina |
| Llorens-Ossibuprocaina | cloridrato (2 mg/mL), anestetico locale | ||
| Maschera nasale per ratti | Xenotec | XRK-RA-Piccola | |
| pinza curva | Bbraun | AESCBD311R-Forbici-a | |
| molla | FST | 15040-11-Stereomicroscopio | |
| Zeiss | Stemi 2000-Pinza | ||
| dritta | FST | 11252-20-Filamento | |
| sutura | Vitrex Medical | 4328 | Nilon monofilamento, 7/0, DS12 |
| Tobradex | Alcon Cusí | Laboratori-Tobramicina (3 mg/mL) e desametasone (1 mg/mL) | |
| Tropicamide | Alcon Cusí Laboratories | 653486 | 10 mg/mL |
| Lavatrice | Thorlabs | W8S038 | - |