Questo protocollo semplifica la produzione di vettori retrovirali e la trasduzione delle cellule T murine, facilitando la generazione efficiente di cellule CAR-T di topo.
Articolo metodologico
Questo protocollo semplifica la produzione di vettori retrovirali e la trasduzione delle cellule T murine, facilitando la generazione efficiente di cellule CAR-T di topo.
Le terapie cellulari ingegnerizzate che utilizzano cellule T del recettore chimerico dell'antigene (CAR)-T hanno raggiunto una notevole efficacia in individui con neoplasie ematologiche e sono attualmente in fase di sviluppo per il trattamento di diversi tumori solidi. Finora, la valutazione preliminare di nuovi prodotti a base di cellule CAR-T ha avuto luogo prevalentemente in modelli tumorali xenotrapiantati utilizzando topi immunodeficienti. Questo approccio è stato scelto per facilitare il successo dell'attecchimento delle cellule CAR-T umane in ambito sperimentale. Tuttavia, i modelli murini singetici, in cui i tumori e le cellule CAR-T derivano dallo stesso ceppo murino, consentono di valutare le nuove tecnologie CAR nel contesto di un sistema immunitario funzionale e di un microambiente tumorale completo (TME). Il protocollo qui descritto mira a semplificare il processo di generazione di cellule CAR-T di topo presentando metodi standardizzati per la trasduzione retrovirale e la coltura di cellule T ex vivo . I metodi descritti in questo protocollo possono essere applicati ad altri costrutti CAR oltre a quelli utilizzati in questo studio per consentire la valutazione di routine di nuove tecnologie CAR in sistemi immuno-competenti.
Le terapie adottive con cellule T che esprimono recettori chimerici dell'antigene (CAR) hanno rivoluzionato il campo dell'immunoterapia del cancro sfruttando la potenza del sistema immunitario adattativo per colpire ed eliminare in modo specifico le cellule tumorali positive all'antigene1. Mentre il successo delle terapie cellulari CAR-T mirate alle neoplasie a cellule B è stato clinicamente convalidato, gli studi preclinici eseguiti su modelli animali rimangono vitali per lo sviluppo di nuove CAR mirate ai tumori solidi. Tuttavia, finora è stata dimostrata un'efficacia clinica limitata nelle indicazioni per i tumori solidi e sta diventando sempre più evidente che i singoli modelli preclinici non predicono con precisione la farmacodinamica e l'efficacia clinica di un farmaco vivente 2,3. Pertanto, i ricercatori hanno iniziato ad espandere lo studio preclinico dei prodotti a base di cellule CAR-T per includere valutazioni parallele in modelli xenotrapianti e singenici di tumori umani e murini, rispettivamente.
A differenza dei modelli di xenotrapianto, in cui i tumori umani e le cellule T vengono innestati in topi immunodeficienti, i modelli singenici consentono di esaminare le risposte delle cellule CAR-T nel contesto di un sistema immunitario funzionale. In particolare, i topi immunocompetenti portatori di tumori singenici forniscono un sistema per studiare l'interazione tra le cellule T trasferite adottivamente e gli ambienti specifici del contesto, compresi i macrofagi associati al tumore (TAM) e le cellule T regolatorie (Treg) note per sopprimere la funzione delle cellule T nel microambiente tumorale (TME)4,5,6. Inoltre, i modelli singenici offrono un'ulteriore piattaforma per valutare la tossicità on-target, off-tumor e l'interazione delle cellule CAR-T con i fattori dell'ospite che possono portare a tossicità aggiuntive, tra cui la sindrome da rilascio di citochine7.
Nonostante questi vantaggi, il numero di studi singenici sulle cellule CAR-T rimane limitato. In particolare, i modelli singenici richiedono l'ingegnerizzazione autologa di cellule CAR-T dello stesso ceppo murino e quindi presentano un'ulteriore sfida a causa della mancanza di una metodologia per un'efficiente trasduzione delle cellule T murine e l'espansione ex vivo 2,8. Questo protocollo delinea i metodi per ottenere un'espressione stabile di CAR attraverso la produzione di vettori retrovirali e la trasduzione ottimizzata delle cellule T. Uno schema dell'intero processo è mostrato nella Figura 1. L'uso di questo approccio dimostra un'efficiente trasduzione retrovirale delle cellule CAR-T murine e il raggiungimento di un'elevata espressione di CAR senza la necessità di concentrazione virale attraverso l'ultracentrifugazione. Vengono discusse le strategie per modificare la specificità dell'antigene del costrutto CAR in aggiunta alla co-espressione di ulteriori transgeni.
Tutte le procedure sugli animali sono state eseguite con l'approvazione dell'Institutional Animal Care and Use Committee (Columbia University, protocolli AC-AABQ5551 e AC-AAAZ4470) utilizzando topi femmine BALB/c o CF57BL/6 di 6-8 settimane di peso compreso tra 20 e 25 g. Gli animali sono stati ottenuti da una fonte commerciale (vedi Tabella dei materiali). Questo protocollo è strutturato intorno ai "giorni post-attivazione" delle cellule T murine e la produzione virale inizia il giorno -2. Il retrovirus può essere conservato a -80 °C dopo la produzione iniziale e, per l'uso futuro di questo protocollo, si può iniziare con la fase 2, l'isolamento e l'attivazione delle cellule T il giorno 0.
1. Produzione di vettori retrovirali
NOTA: I prodotti virali sono stati resi difettosi di replicazione dalla separazione dei geni di impacchettamento in due plasmidi separati (vedi Tabella dei materiali), riducendo notevolmente la probabilità di eventi di ricombinazione e di produzione involontaria di virus competente per la replicazione.
2. Isolamento delle cellule T murine
3. Trasduzione delle cellule T murine
Il protocollo qui descritto mira a standardizzare il processo di trasduzione delle cellule T murine per la generazione di cellule CAR-T di topo. La Figura 1 fornisce una descrizione dettagliata dei passaggi necessari. Il processo inizia con la produzione di vettori retrovirali attraverso la co-trasfezione di componenti virali in cellule Phoenix Eco. La Figura 2 fornisce un'immagine della densità ottimale delle celle Phoenix Eco il giorno della trasfezione. Le cellule T isolate vengono quindi attivate 24 ore dopo la trasfezione, o "Giorno 0" di questo protocollo, in preparazione alla trasduzione il Giorno 1. Dopo la trasduzione, le cellule CAR-T vengono coltivate in presenza di IL-7 e IL-15 umane ricombinanti per ottenere una sufficiente espansione della piega preservando le popolazioni di memoria delle cellule staminali.
L'uso del kit di isolamento delle cellule T murine raccomandato (vedere la Tabella dei materiali) con questo protocollo produce una purezza delle cellule T del <98% prima della trasduzione, come determinato dalla citometria a flusso (Figura 3A). Inoltre, è possibile ottenere tassi di espressione CAR riproducibili del 65%-75% utilizzando questo protocollo e il vettore retrovirale pMSCV modificato per esprimere il costrutto CAR da un promotore PGK (Figura 3B,C). La determinazione del titolo retrovirale rivela titoli fino a ~2 x 107 TU/mL e un'espressione di CAR del 74% con 1/3 del surnatante virale raccolto dopo la co-trasfezione di pMSCV con pCL-Eco (Figura supplementare 1).
Infine, la coltura ex vivo con 10 ng/mL di IL-7 e IL-15 porta a un'espansione di circa 15 volte, con conseguente ~150 x 106 cellule T entro il giorno 10 post-attivazione da una singola milza (Figura 3D). La coltura con IL-7 e IL-15 porta a frequenze comparabili delle cellule T CD8+ e CD4+ (Figura 3E) e a popolazioni di memoria di cellule staminali preservate determinate dall'espressione di CD62L+CD44- dopo 10 giorni di coltura ex vivo (Figura 3F).

Figura 1: Panoramica del protocollo. Pannello superiore: una panoramica schematica della sequenza temporale del protocollo. Pannello inferiore: istruzioni passo-passo per la produzione di vettori retrovirali e la trasduzione delle cellule T di topo. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Densità cellulare ottimale per la trasfezione. Immagine al microscopio in campo chiaro di cellule Phoenix Eco alla densità ottimale prima della trasfezione con pMSCV e pCL-Eco. Catturato con un obiettivo 10x. Barra della scala = 200 μm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: Produzione di cellule CAR-T murine e coltura ex vivo. (A) Grafico di citometria a flusso che mostra la frequenza delle cellule BALB/c CD3+ dopo l'isolamento delle cellule T murine. (B) Rappresentazione schematica del vettore retrovirale pMSCV utilizzato per l'espressione di GFP-CAR in cellule T murine. (C) Istogrammi di citometria a flusso che dimostrano l'espressione di superficie CAR su cellule T di topo dopo incubazione con sfGFP purificato. UT, non trasdotto. (D) Espansione della piega delle cellule CAR-T entro il giorno 10 post-attivazione e coltura con IL-17 e IL-15 umane ricombinanti. Circa 8 x 106 cellule T murine sono state attivate prima della trasduzione e hanno raggiunto circa 1,28 x 108 entro il giorno 10 post-attivazione. (E) Grafico di citometria a flusso che mostra la frequenza delle cellule CAR-T CD8+ e CD4+ al giorno 10 post-attivazione. (F) Grafico di citometria a flusso che dimostra la frequenza delle popolazioni di memoria delle cellule T CD8+ determinate dall'espressione superficiale di CD62L e CD44. La memoria delle cellule staminali (TSCM) è caratterizzata da CD62L+CD44-, la memoria centrale (MTC) da CD62L+CD44+ e la memoria effettrice (TEM) da CD62L-CD44+. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Tabella 1: Formulazione dei terreni di coltura cellulare. I dettagli della formulazione per i terreni di coltura cellulare utilizzati nel protocollo. Clicca qui per scaricare questa tabella.
Figura 1 supplementare: Espressione di superficie di CAR e titoli retrovirali. (A) Istogrammi di citometria a flusso che mostrano l'espressione di superficie di CAR su cellule T BALB/c dopo incubazione con sfGFP purificato. Il retrovirus è stato generato trasfettando cellule Phoenix Eco con pMSCV_PGK_mGFP28z in combinazione con pCL-Eco e pMD2.G (I), pCL-Eco (II) o da solo (III). Le cellule T sono state trasdotte con retrovirus diluito come indicato. (B) Titoli retrovirali determinati dall'espressione superficiale CAR delle cellule T trasdotte. Le unità di trasduzione (TU)/mL sono state calcolate utilizzando la formula: (N∙F∙D)/V, dove N è il numero di cellule trasdotte (1 x 105), F è la frequenza delle cellule CAR+ , D è il fattore di diluizione e V è il volume di trasduzione in mL (0,2 mL). Fare clic qui per scaricare il file.
File supplementare 1: sequenza vettoriale di espressione pMSCV. La sequenza della CAR GFP28z e delle sequenze fiancheggianti (corsivo) nel vettore di espressione pMSCV, con i siti enzimatici NotI e BamHI evidenziati in blu. Fare clic qui per scaricare il file.
Questo protocollo descrive le fasi e i reagenti necessari per la trasduzione retrovirale delle cellule T murine per generare cellule CAR-T per studi in vivo . L'ottimizzazione delle condizioni di trasduzione retrovirale consente di ottenere una robusta espressione di CAR senza la necessità di concentrazione virale attraverso l'ultracentrifugazione o reagenti aggiuntivi. Tuttavia, ci sono diverse modifiche che possono essere applicate a questa metodologia.
Mentre questo protocollo descrive l'esempio di generazione di una CAR specifica per la GFP, questi metodi possono essere adattati per generare cellule CAR-T di topo che hanno come bersaglio qualsiasi antigene extracellulare di interesse. Il vettore retrovirale pMSCV_PGK utilizzato in questo studio consente il rilascio efficiente della sequenza di nanocorpi specifici per GFP mediante digestione enzimatica con NotI e BamHI e può essere sostituito con un dominio di riconoscimento dell'antigene definito dall'utente come un scFv, un nanocorpo o un dominio di legame al ligando (File supplementare 1). Per facilitare la valutazione dell'espressione alternativa di CAR, si raccomanda di progettare CAR con un tag epitopo N-terminale, come i tag Myc (EQKLISEEDL) o Flag (DYKDDDDK), che possono essere rilevati utilizzando anticorpi coniugati con fluorescenza12. Inoltre, il presente studio dimostra la produzione di un singolo transgene; tuttavia, l'incorporazione di peptidi auto-scindenti (sequenze 2A) o siti di ingresso dei ribosomi interni (IRES) consentirebbe la co-produzione di più transgeni, comprese tecnologie aggiuntive per migliorare la funzione delle cellule T in vivo 8,13,14.
Sebbene questo protocollo sia stato sviluppato per eliminare la necessità di apparecchiature specializzate omettendo l'ultracentrifugazione (24.000 x g, 2 h, 4 °C), vale la pena notare che la concentrazione del surnatante virale può raggiungere titoli virali più elevati e ridurre il volume di virus necessario per raggiungere un'elevata espressione di CAR8. Questo protocollo semplifica ulteriormente la produzione di vettori retrovirali ottenendo titoli virali elevati in modo riproducibile (~2 x 107 TU/mL) e un'espressione CAR costante senza la necessità di determinare il titolo virale prima dell'uso. Tuttavia, oltre a facilitare la standardizzazione, la determinazione del titolo virale prima della trasduzione delle cellule T può anche aumentare la vitalità delle cellule T riducendo la potenziale tossicità causata da concentrazioni virali inutilmente elevate10,15.
L'integrazione con IL-7 e IL-15 è raccomandata per promuovere l'espansione delle cellule T e preservare le popolazioni di memoria delle cellule T; tuttavia, l'IL-2 umana ricombinante può essere utilizzata come alternativa per ridurre il numero di reagenti necessari per la coltura ex vivo 16,17,18,19. Ciononostante, i metodi per la generazione di cellule CAR-T qui descritti rimangono limitati dall'espansione relativamente scarsa delle cellule T murine. Tuttavia, le misure per migliorare la vitalità delle cellule T discusse sopra potrebbero essere ulteriormente migliorate includendo supplementi aggiuntivi e 2-ME nel terreno di coltura mTCM durante tutto il processo di trasduzione20. Sebbene queste modifiche possano migliorare l'espansione delle cellule T da 15 volte a 20 volte20, possono comportare una minore efficienza di trasduzione e una ridotta espressione di CAR.
In definitiva, la produzione di cellule CAR-T murine consente lo sviluppo di modelli singenici per valutare la funzione delle cellule CAR-T all'interno di un sistema immunitario intatto, facilitando una valutazione specifica del contesto della loro potenza, durata e sicurezza. Mentre i modelli nei topi immunodeficienti consentono importanti studi preclinici di un prodotto a base di cellule T umane mirato a un antigene tumorale umano. La combinazione di questi sistemi modello complementari sarà indispensabile per comprendere la complessità della biologia cellulare CAR-T, ottimizzare nuovi progetti CAR e, infine, tradurre i risultati preclinici in terapie cliniche efficaci.
Non sono stati dichiarati conflitti di interesse.
Si ringrazia L. Brockmann per la revisione critica del manoscritto. Questo lavoro è stato supportato da NIH 1R01EB030352 e UL1 TR001873.
| Nome | Azienda | Numero di catalogo | Commenti |
|---|---|---|---|
| 0,45 μ m filtri | MilliporeSigma | SLHVR33RS | |
| siringa da 1 mL | Fisher Scientific | 14-955-450 | |
| Provette per microcentrifuga da 1,5 mL | Fisher Scientific | 05-408-135 | |
| Siringa da 10 mL | BD | 14-823-16E | |
| 100 μ m colino | Corning | 07-201-432 | |
| piastre per colture cellulari trattate TC da 15 cm | ThermoFisher Scientific | ||
| provette coniche da 15 mL | Falcon | 14-959-70C | |
| 40 μ m filtro | Corning | 07-201-430 | |
| Provette coniche da 50 mL | Falcon | 14-959-49A | |
| 70 μ m filtro | Corning | 07-201-431 | |
| Citometro a flusso Attune NxT | ThermoFisher Scientific | ||
| BALB/C, 6-8 settimane | Jackson Laboratory | 651 | |
| B-Mercaptoetanolo | Gibco | 21985023 | |
| Albumina Sierica Bovina | GOLDBIO | A-420-500 | |
| DMEM Medium | Gibco | 11965092 | |
| soluzione salina tamponata con fosfato di Dulbecco (PBS), senza calcio e magnesio | Magnete Gibco | 14-190-250 | |
| DynaMag-2 | Magnete Invitrogen | 12-321-D | |
| EasySep | Stemcell Technologies | 18000 | |
| EasySep | Stem cell Technologies | 19851 | |
| tampone FACS | BD | BDB554657 | |
| Siero fetale bovino (FBS) | Corning | MT35011CV | |
| GlutaMAX | Gibco | 35-050-061 | |
| G-Rex6 | Wilson Wolf | 80240M | |
| Soluzione tampone HEPES | Gibco | 15-630-080 | |
| IL-15 ricombinante umano | Miltenyi Biotec | 130-095-765 | |
| IL-2 ricombinante umano | Miltenyi Biotec | 130-097-748 | |
| IL-7 ricombinante umano | Miltenyi Biotec | 130-095-363 | |
| Lipofectamine 3000 | Invitrogen | L3000008 | |
| MEM Soluzione di aminoacidi non essenziali | Gibco | 11140-050 | |
| Topo Anti-CD3 BV421 | Biolegend | 100228 | |
| Topo Anti-CD3/CD28 Dynabeads | Gibco | 11-453-D | |
| Topo Anti-CD4 BV605 | BD | 563151 | |
| Topo Anti-CD44 APC | Biolegend | 103011 | |
| Mouse Anti-CD62L PE-Cy7 | Tonbo | SKU 60-0621-U025 | |
| Topo Anti-CD8 APC-Cy7 | Tonbo | SKU 25-0081-U025 | |
| Nikon Ti2 con fotocamera Prime 95B | Nikon | ||
| Piastre a 24 pozzetti non trattate | CytoOne | CC7672-7524 | |
| Opti-MEM | Gibco | 31-985-062 | |
| pCL-Eco | Addgene | #12371 | |
| Soluzione di penicillina/streptomicina | Gibco | 15-070-063 | |
| Phoenix Eco cells | ATCC | CRL-3214 | |
| pMDG.2 | Addgene | #12259 | |
| pMSCV_PGK_GFP28z | N/A | Prodotto da R.LV. | |
| SFGFP | Purificato n/A | Prodotto da R.LV. | |
| RetroNectina ('reagente di trasduzione') | Takara Bio | T100B | |
| RPMI 1640 | Gibco | 21875 | |
| Pipetta sierologica 10 mL | Fisher Scientific | 13-678-11E | |
| Pipetta sierologica 25 mL | Fisher Scientific | 13-678-11 | |
| Pipetta sierologica 5 mL | Fisher Scientific | 13-678-11D | |
| Piruvato di sodio | Gibco | 11-360-070 | |
| piastre a 24 pozzetti trattate con TC | Corning | 08-772-1 | |
| Tripan blu | Gibco | 15-250-061 |