La matrice extracellulare (ECM) è un componente dinamico e multifunzionale dei tessuti che svolge un ruolo centrale nella regolazione del comportamento e dello sviluppo cellulare. Essendo una rete complessa, fornisce supporto strutturale, ligandi adesivi cellulari1 e immagazzinamento di fattori di crescita e citochine che regolano la segnalazione cellulare. Ad esempio, durante la guarigione delle ferite, la MEC funge da impalcatura per le cellule in migrazione e da serbatoio di fattori di crescita coinvolti nella riparazione dei tessuti2. Allo stesso modo, la disregolazione nella MEC può portare ad un aumento della gravità di varie malattie come la fibrosi e il cancro 3,4. Durante lo sviluppo embrionale, la MEC guida la morfogenesi dei tessuti. Ad esempio, nello sviluppo del cuore, i componenti della MEC svolgono un ruolo nella creazione della corretta architettura e funzione del tessuto cardiaco5. Oltre un decennio di ricerca ha dimostrato che la rigidità del microambienteda sola 6,7 può controllare la specifica del lignaggio delle cellule staminali. Pertanto, non sorprende che durante la differenziazione cellulare in vitro, la ECM influenzi il destino delle cellule staminali fornendo segnali per la differenziazione.
Gli organoidi possono essere generati da cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC). Per generare con successo gli organoidi è necessario partire da una linea iPSC correttamente caratterizzata. Tuttavia, la mancanza di segnali fisiologici nei materiali classici per colture cellulari ostacola l'efficiente differenziazione delle iPSC e la generazione di organoidi. Inoltre, recenti ricerche hanno sottolineato l'importanza della composizione della matrice extracellulare (ECM), delle interazioni tra le cellule e la ECM8, nonché dei segnali meccanici e geometrici 9,10,11 nel contesto dell'espansione e del differenziamento degli organoidi12. L'avanzamento della tecnologia degli organoidi attraverso il miglioramento della riproducibilità comporterà l'incorporazione di segnali fisici e chimici specifici del tessuto.
Gli organoidi mirano a ricapitolare il tessuto nativo all'interno di un microambiente fisiologicamente simile. La scelta di un sistema ECM che imiti fedelmente l'ECM del tessuto nativo è fondamentale per ottenere una rilevanza fisiologica per quanto riguarda il comportamento, la funzione e la risposta delle cellule agli stimoli13. La scelta dei componenti della ECM può influenzare la differenziazione delle cellule staminali in tipi cellulari specifici all'interno dell'organoide. Diverse proteine della ECM e le loro combinazioni possono fornire indizi che guidano il destino cellulare14. Ad esempio, gli studi hanno dimostrato che l'utilizzo di componenti specifici della MEC può promuovere la differenziazione delle cellule staminali intestinali in tipi di cellule intestinali mature, dando vita a organoidi intestinali fisiologicamente rilevanti15. Sebbene gli organoidi siano uno strumento prezioso durante la modellazione delle malattie e i test farmacologici, la selezione di un sistema ECM appropriato è fondamentale per questa applicazione. Un sistema ECM appropriato può migliorare l'accuratezza della modellazione della malattia creando un microambiente che assomiglia al tessuto interessato16. Inoltre, la MEC tessuto-specifica può aiutare a generare organoidi che ricapitolano meglio i fenotipi associati alla malattia e le risposte ai farmaci17. L'ottimizzazione del sistema ECM utilizzato nella differenziazione degli organoidi è fondamentale per ottenere i risultati di differenziazione desiderati.
I sistemi di membrane basali disponibili in commercio derivati da fonti animali di ECM (ad esempio, Matrigel, Cultrex) e idrogel privo di xeno (ad esempio, VitroGel) sono ampiamente utilizzati nella ricerca su iPSC e organoidi. Le aziende che li commercializzano e i ricercatori che li utilizzano hanno elaborato molte istruzioni per i loro prodotti e applicazioni specifici nel corso degli anni. Molte di queste istruzioni sono servite come guida per la generazione di questo protocollo. Inoltre, i benefici e le battute d'arresto associati alle loro proprietà intrinseche sono stati notati individualmente da molti 18,19,20,21. Tuttavia, non esiste un flusso di lavoro sistematico che guidi la selezione dei sistemi ottimali per il lavoro con iPSC e organoidi. In questo caso, viene fornito un flusso di lavoro per valutare sistematicamente l'equivalenza dei sistemi ECM provenienti da varie fonti per il lavoro con iPSC e organoidi. Questo è uno studio comparativo del mantenimento di due diverse linee di iPSC umane (hiPSC) e della generazione di organoidi intestinali umani (hIO) in quattro diverse matrici: Matrigel (Matrix 1-AB), Geltrex (Matrix 2-AB), Cultrex (Matrix 3-AB) e VitroGel (Matrix 4-XF). Per la coltura di organoidi, sono state utilizzate quattro versioni di VitroGel a matrice priva di xeno precedentemente ottimizzate per la coltura di organoidi: ORGANOID 1 (Matrix 4-O1), ORGANOID 2 (Matrix 4-O2), ORGANOID 3 (Matrix 4-O3), ORGANOID 4 (Matrix 4-O4). Inoltre, sono state utilizzate matrici di origine animale ottimizzate per organoidi: Matrigel High Concentration (Matrix 1-ABO) e Cultrex Type 2 (Matrix 3-ABO). Sono stati utilizzati terreni di coltura di cellule staminali disponibili in commercio (mTeSR Plus) e kit di differenziazione degli organoidi (STEMdiff intestinal organoid kit). Questo protocollo combina le istruzioni individuali dei produttori dei prodotti con le esperienze di laboratorio per guidare il lettore verso un'ottimizzazione di successo dell'ECM per il loro specifico lavoro iPSC e organoide. Nel complesso, questo protocollo e i risultati rappresentativi sottolineano l'importanza di selezionare il microambiente ottimale per il lavoro sulle cellule staminali e la differenziazione degli organoidi.