Articolo metodologico

Perfusione epatica di ratto e isolamento degli epatociti primari: una vecchia procedura cruciale per la coltura di organoidi 3D all'avanguardia

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DOI:

10.3791/66857

22 novembre 2024

In questo articolo

Sommario

Questo protocollo presenta una tecnica ottimizzata di perfusione epatica della collagenasi in due fasi in un modello di ratto e mostra l'uso di epatociti isolati per la coltura in vitro a lungo termine di organoidi 3D.

Abstract

Gli epatociti primari sono uno strumento comunemente usato per gli studi in vitro correlati al fegato. Tuttavia, il mantenimento di queste cellule è sempre stato una sfida a causa della rapida perdita di morfologia, vitalità e funzionalità in coltura. Un approccio recente alla coltura a lungo termine è la generazione di organoidi tridimensionali (3D), uno strumento in vitro in grado di ricapitolare i tessuti in un piatto basato sulla meravigliosa capacità del fegato di rigenerarsi. I protocolli pubblicati sono stati progettati per ottenere organoidi 3D funzionali a lungo termine da epatociti adulti primari (Hep-Org). Lo strumento all'avanguardia per organoidi 3D richiede la capacità di isolare le cellule dal tessuto adulto e questo passaggio iniziale è fondamentale per un risultato finale di alta qualità. La perfusione collagenasi a due stadi, introdotta negli anni '70, è ancora una procedura valida per ottenere singoli epatociti. Il presente articolo si propone di descrivere tutte le fasi cruciali della procedura chirurgica, ottimizzando così la procedura di isolamento degli epatociti primari nel modello di ratto. Inoltre, particolare attenzione è rivolta alle linee guida PREPARE per aumentare la probabilità di successo delle procedure e garantire risultati di alta qualità. Un protocollo dettagliato consente ai ricercatori di accelerare e ottimizzare il lavoro a valle per stabilire organoidi 3D da epatociti di ratto adulti primari. Rispetto agli epatociti 2D, gli Hep-Org erano ancora vitali e in proliferazione attiva al giorno 15, dimostrando un potenziale a lungo termine.

Introduzione

Gli epatociti primari sono uno strumento importante e ampiamente utilizzato per gli studi in vitro correlati al fegato. Tuttavia, la loro espansione e manutenzione sono state storicamente impegnative, poiché perdono morfologia e funzionalità dopo pochi giorni nella coltura1. La coltura 2D è una condizione limitante, in particolare, per gli epatociti che hanno una forma poligonale e una struttura polarizzata con membrane apicali e basolaterali differenziate. Infatti, l'adesione degli epatociti alla piastra interferisce con la loro normale attività perché porta ad un citoscheletro piatto con interazione limitata tra le cellule e tra le cellule e la matrice extracellulare (ECM), riducendo la polarizzazione e le vie di segnalazione coinvolte2.

Per aggirare i limiti di questo metodo, Dunn e colleghi3 hanno prima utilizzato il doppio strato di collagene. Questo metodo di coltura, noto come "metodo della coltura a sandwich", si basa sulla semina di epatociti primari tra i due strati della matrice. Questo metodo presenta molti vantaggi, tra cui la coltura a lungo termine, il mantenimento della morfologia poligonale e le attività trascrizionali paragonabili a quelle degli epatociti appena isolati4. Un metodo simile, basato sullo stesso principio, dove il sottofondo è composto da Matrigel mentre la sovrapposizione di collagene, ha evidenziato la presenza di una rete canalicolare ben consolidata5.

Nonostante l'affidabilità del metodo della coltura a sandwich per la crescita degli epatociti, il presente lavoro non vede l'ora di mettere a punto una coltura di organoidi 3D, uno strumento in vitro utilizzato per ricapitolare i tessuti in un piatto e formare un potenziale ponte verso la medicina personalizzata, consentendo la generazione di intuizioni biologiche specifiche per la malattia, l'identificazione di bersagli molecolari, la sperimentazione di farmaci, la creazione di biobanche e l'apertura di nuovi orizzonti per tecnologie innovative come l'organ-on-chip6. Gli epatociti primari sono stati incorporati in goccioline di matrice emisferica note come "cupole" per consentire una robusta crescita di organoidi all'interno delle cupole e per garantire il flusso dei fattori solubili, tra cui il fattore di crescita degli epatociti (HGF) e il fattore di crescita epidermico (EGF), dal terreno di coltura. Questi fattori di crescita attivano direttamente le vie di segnalazione per garantire la sopravvivenza degli epatociti7. Gli organoidi epatici sono solitamente ottenuti da cellule staminali/progenitrici isolate da stadi embrionali o da ratti adulti, topi, fegato umano (e anche cani e gatti)8. Anche se la conformazione 3D migliora la differenziazione delle cellule staminali in epatociti adulti, questo strumento manca ancora della maturità del tessuto primario originale9. Per ovviare a questo problema, nel 2018, due diversi gruppi 9,10 hanno pubblicato contemporaneamente un protocollo per ottenere una coltura a lungo termine di organoidi epatici 3D a partire da epatociti primari di topo adulti (denominati Hep-Org). I loro protocolli ricapitolano la risposta al danno proliferativo della rigenerazione epatica, sviluppando epatociti con un alto livello di citochine infiammatorie come si verifica dopo l'epatectomia parziale. Infatti, gli studi di cui sopra dimostrano che gli epatociti possono passare a uno stato duttale dopo una lesione12 o quando la proliferazione dei colangiociti è soppressa13. La loro capacità bipotente consente la plasticità cellulare, che è importante per strutture complesse come gli organoidi. Pertanto, questi protocolli superano il problema dell'incapacità di espandere gli epatociti primari in vitro.

Lo strumento all'avanguardia per organoidi 3D richiede la capacità di isolare le cellule dal tessuto adulto e questo passaggio iniziale è fondamentale per un risultato finale di alta qualità. Mentre la preparazione di organoidi 3D potrebbe essere considerata una tecnica recente e in via di sviluppo (perché la definizione di organoide è stata coniata da Lancaster14 e Huch15 solo dieci anni fa), la perfusione di collagenasi in due fasi è una vecchia procedura introdotta da Seglen negli anni '7016. Concentrandosi sulle più recenti pubblicazioni nel campo, i protocolli di Ng17 e Shen18 potrebbero essere considerati il gold standard per l'esecuzione della procedura nei ratti, mentre quelli di Cabral19 e Charni-Natan20 per i topi. Non è insolito che i ricercatori si concentrino sulla scelta della migliore matrice extracellulare (ECM) e dei migliori fattori di crescita per sviluppare organoidi 3D, ma si imbattono in fallimenti come procedure chirurgiche improprie, bassa vitalità e resa degli epatociti o alti livelli di contaminazione batterica. Questi problemi allungano gli esperimenti a valle e aumentano il numero di animali necessari per gli esperimenti successivi. Al contrario, se le procedure chirurgiche e di isolamento sono ben impostate, l'elevato numero di epatociti vitali ottenuti consente di preparare un numero enorme di organoidi, limitando così l'uso di animali. Il presente protocollo affronta principalmente questi problemi utilizzando soluzioni commerciali e ottimizzando una precisa incannulazione della vena porta che garantisce fasi ottimali di perfusione e digestione con il fegato in situ.

Al fine di migliorare la qualità, la riproducibilità e la traducibilità della nostra ricerca sugli animali, abbiamo esaminato attentamente le linee guida PREPARE: Pianificazione della ricerca e delle procedure sperimentali sugli animali: Raccomandazioni per l'eccellenza21. Queste linee guida per la rendicontazione cercano di aumentare le probabilità di successo attraverso la pianificazione e rappresentano un passo importante nell'attuazione delle 3R di Russel e Burch (sostituzione, riduzione e perfezionamento). Le linee guida di PREPARE coprono 15 argomenti principali che dovrebbero essere affrontati in base a ogni singolo progetto di ricerca. Descriveremo gli argomenti su cui ci siamo concentrati durante la pianificazione e la preparazione del progetto.

Il presente lavoro si propone di descrivere, in un protocollo esaustivo, dettagliato e consequenziale, le fasi cruciali dell'intervento chirurgico nel modello di ratto per consentire ai ricercatori di velocizzare e ottimizzare il lavoro a valle. Quando ci siamo avvicinati a questi protocolli all'inizio, abbiamo riscontrato problemi di contaminazione batterica, bassa efficienza della digestione epatica, bassa resa di epatociti primari e bassa vitalità degli epatociti che possono facilmente influire sul successo della tecnica. Mostrando come affrontare e risolvere le caratteristiche critiche, questo protocollo ha ottimizzato la procedura per l'isolamento primario degli epatociti di ratto. La perfusione epatica di ratto e il successivo isolamento primario degli epatociti adulti sono i principali passaggi preliminari per diverse applicazioni. In particolare, questo protocollo è adatto a tutte le procedure che richiedono una buona resa di epatociti adulti di alta qualità e alta vitalità. I risultati del protocollo sono appropriati per stabilire modelli in vitro per studiare la fisiologia e la patologia epatica.

Protocollo

Tutte le procedure e la stabulazione degli animali sono state condotte secondo le linee guida della legge italiana e della direttiva della Comunità Europea. Il protocollo sperimentale è stato approvato dal Comitato per la Cura degli Animali e dal Ministero della Salute (autorizzazione n° 321/2022-PR) ai sensi dell'art.31 del decreto 26/2014.

1. Preparazione per la procedura con gli animali

NOTA: Fare riferimento alla Tabella 1 per la composizione del mezzo e del tampone e alla Tabella dei materiali per i dettagli commerciali.

  1. Scaldare il bagnomaria a 42 °C e poi mettere il tampone di perfusione e 1x PBS nel bagnomaria per circa 20 minuti.
    NOTA: A causa della sensibilità enzimatica, il tampone di digestione viene riscaldato solo quando la procedura di perfusione è stata avviata con successo. Durante la procedura di perfusione, mantenere le soluzioni nel bagnomaria.
  2. Metti il mezzo completo di William e PBS + 3% P/S sul ghiaccio.
  3. Preparare la pompa peristaltica e collegare il tubo con il flacone di vetro e la trappola per bolle, entrambi riempiti con tampone di perfusione.
  4. Durante l'adescamento della pompa, riempire il tubo con un tampone di perfusione caldo per rimuovere l'aria e lavare l'etanolo residuo (bassa velocità della pompa). Questo passaggio è importante anche per verificare il corretto funzionamento della pompa e l'eventuale perdita del tubo.

2. Preparazione per l'isolamento degli epatociti

  1. Durante la procedura su animali, esporre i seguenti strumenti alla luce UV: piastra di Petri 100 mm, filtro cellulare 100 μm, raschietto misura M, pinzette grandi, bicchiere per ghiaccio, vassoio per ghiaccio.

3. Procedura iniziale sull'animale e anestesia

  1. Anestetizzare il ratto adulto (250-350 g di peso corporeo; 10-12 settimane di età) mediante iniezione intraperitoneale di una miscela di anestetici (concentrazione finale per xilazina: 22,5 mg/kg; per ketamina: 112,5 mg/kg; volume finale approssimativo: 0,8-1,0 ml).
  2. Monitora la profondità dell'anestesia pizzicando le dita dei piedi fino a quando il ratto non risponde più agli stimoli nocivi. Di solito ci vogliono 5 minuti. La dose di anestetico garantisce un'anestesia chirurgica profonda che riduce al minimo il rischio di sofferenza o angoscia durante la procedura
    NOTA: Il dissanguamento è il metodo secondario di eutanasia dei ratti utilizzato in questo esperimento e garantisce che l'animale sia stato soppresso in modo efficace.
  3. Radere l'addome e pulirlo con etanolo al 70% per ridurre la contaminazione batterica durante l'intervento.
    NOTA: Questo è un intervento chirurgico non di sopravvivenza, quindi l'asepsi completa non viene mantenuta.
  4. Posiziona il ratto al centro del vassoio di dissezione e fissa gli arti con gli aghi.
  5. Fai un'incisione a forma di U attraverso la pelle e il muscolo dal centro del basso addome alla gabbia toracica, blocca la pelle e piegala fino alla testa, esponendo l'intestino.
  6. Spostare con cautela l'intestino sul lato sinistro dell'animale, fuori dalla cavità addominale, ed esporre la vena porta epatica e la vena cava.
  7. Con le pinze passare un filo di cotone sotto la vena porta e preparare 2 nodi, a 1 cm l'uno dall'altro, che circondano la vena stessa.
    NOTA: Un filo nero è più facile da visualizzare.
  8. Iniettare 100-150 UI di eparina disciolta in 1x PBS (volume totale 300 μL) nella vena cava per prevenire la coagulazione del sangue.

4. Incannulamento e perfusione epatica

  1. Accendere la pompa a bassa velocità (flusso inferiore a 1 ml/min).
  2. Inserire l'angiocath da 18 g nella vena porta a livello del filo con un angolo piatto rispetto alla vena.
  3. Rimuovere manualmente l'ago interno per lasciare la cannula nella vena. Il sangue scorrerà al suo interno, riempiendo il tappo ed evitando bolle d'aria intrappolate nel passaggio successivo.
  4. Mentre il tampone di perfusione scorre nel tubo, collegare la cannula premendo il pulsante C all'estremità di uscita utilizzando un connettore Luer lock.
  5. A questo punto, fare i nodi, uno intorno al catetere all'interno della vena e uno intorno al catetere, prima di entrare nella vena per stabilizzare il tubo nella giusta posizione.
  6. Tagliare la vena cava per far uscire il sangue. Assicurarsi che il fegato inizi a gonfiarsi e sbiancare rapidamente (secondi) in 2-3 secondi. Ciò conferma che il tampone di perfusione scorre correttamente attraverso il fegato.
    NOTA: Se alcuni lobi rimangono rossi, l'atleta è posizionato troppo in profondità. Se ci sono solo macchie rosse, picchiettare leggermente sul fegato può aiutare la perfusione nei punti specifici. Versare un po' di PBS 1x sull'addome aperto per aiutare a spostare il sangue e verificare la presenza di perdite.
  7. Aumentare lentamente il flusso della pompa a 10 ml/min e mantenerlo per almeno 10 minuti per consentire la pulizia del fegato dal sangue.
  8. Durante la perfusione, esercitare pressione sulla vena cava con un batuffolo di cotone a intervalli di 10 secondi: assicurarsi che il fegato si gonfi al momento del serraggio e si rilassi al rilascio. Ripetere periodicamente la pressione (5-10 volte) e verificare la presenza di gonfiore e rilassamento del fegato.
    NOTA: Questo passaggio funge da punto di controllo cruciale per convalidare visibilmente la perfusione. È stato essenziale per garantire un'elevata vitalità degli epatociti e massimizzare la resa finale. Verificando attivamente questo processo, il tampone può raggiungere efficacemente tutte le parti del sistema vascolare epatico, cosa che la sola eliminazione passiva del sangue non sarebbe in grado di raggiungere.

5. Digestione del fegato

  1. Dopo la perfusione, passare al tampone di digestione preriscaldato senza interrompere il flusso ed evitando bolle d'aria nel tubo.
    NOTA: La riduzione temporanea del flusso può aiutare a eseguire questo passaggio. Il tampone di digestione include il rosso fenolo, che facilita la visualizzazione del passaggio dal tampone di perfusione al tampone di digestione.
  2. Aumentare la velocità della pompa a 20 ml/min e premere periodicamente con il tampone per il gonfiore e il rilassamento del fegato.
  3. Dopo questo passaggio (della durata di circa 15 minuti), assicurarsi che il fegato diventi sempre più pastoso. A questo punto, l'ago può essere rimosso e la pompa si ferma.
  4. Poiché la capsula epatica è fragile dopo la digestione, sezionare delicatamente e con attenzione il fegato: afferrare il tessuto connettivo centrale tra i lobi con una pinza. Taglia tutte le connessioni con altri organi e solleva il fegato.
  5. Lavare il fegato, immergendolo nella soluzione pre-raffreddata PBS + 3% P/S per alcuni secondi. Quindi, mettilo nel tubo contenente il terreno completo di William pre-raffreddato.
    NOTA: Il dissanguamento e la morte assicurano la perfusione attraverso la vena cava. La conferma della morte dell'animale arriva dallo pneumotorace indotto nel momento in cui il fegato viene espiantato e il diaframma viene completamente sezionato e, dopo l'ispezione, la respirazione e il battito cardiaco non sono più funzionali.

6. Purificazione degli epatociti

  1. Sotto la cappa biologica, trasferire il fegato nella capsula di Petri da 100 mm con i 15 mL di terreno freddo William's complete su una vaschetta piena di ghiaccio.
  2. Premere energicamente l'organo con il raschietto per rilasciare le cellule nel terreno.
    NOTA: Se la fase di digestione viene eseguita correttamente, il rilascio delle cellule dovrebbe essere facile e non richiedere molta pressione sul fegato. Non tagliare il fegato a pezzi; Lascialo intatto. Mantenere il fegato immerso nel terreno migliora il rilascio cellulare.
  3. Raccogliere le cellule contenenti terreno e filtrarle con il filtro da 100 μm trasferendole in una provetta conica sterile. La filtrazione consente la rimozione dei tessuti connettivi e dei frammenti di tessuto non digeriti.
  4. Versare circa 15 ml di terreno freddo di William sul fegato schiacciato nella capsula di Petri per aiutare a rilasciare più cellule. Ripetere i passaggi 6.2 e 6.3.
  5. Ripetere il punto 6.4 almeno una volta, fino a quando tutte le celle sono state rilasciate. Se necessario, dividere il fluido in tubi più conici e utilizzare più filtri da 100 μm.
    NOTA: Dopo che gli epatociti sono stati rilasciati e prima del filtraggio, il terreno dovrebbe apparire opaco a causa della presenza degli epatociti. Il fegato rimanente dovrebbe apparire fibroso e verrà scartato.
  6. Centrifugare il terreno filtrato contenente cellule epatiche a 50 x g per 3 minuti a 4 °C con un freno a bassa velocità.
    NOTA: Gli epatociti sono più densi di altre cellule epatiche. A causa della bassa forza di centrifugazione, solo gli epatociti saranno nel pellet, mentre le altre cellule rimarranno nel surnatante.
  7. Scartare il surnatante senza disturbare il pellet della cella. Aggiungere delicatamente circa 40 mL di terreno completo ghiacciato di William nella provetta e pipettare lentamente su e giù 2 o 3 volte per risospendere il pellet cellulare.
    NOTA: Il pellet della cella deve essere risospeso con cura per evitare di danneggiare le celle.
  8. Centrifugare a 50 x g per 3 min a 4 °C.
    NOTA: Per i primi tentativi, contare le cellule vitali con un saggio 1:10 di blu di tripano dopo la seconda centrifugazione prima di procedere con le fasi successive. In questo modo si evitano sprechi di terreno e tempo se tutte le celle sono morte.
  9. Scartare il surnatante e risospendere il pellet cellulare in 25 mL di terreno completo di William ghiacciato.
  10. Aggiungere 25 mL di soluzione con gradiente di densità al 90% nella provetta e mescolare delicatamente.
    NOTA: Una soluzione a gradiente di densità separa gli epatociti vitali dagli epatociti morti e dai detriti cellulari in base alla loro densità.
  11. Centrifugare a 200 x g per 10 min a 4 °C. Sul fondo della provetta deve essere ottenuto un pellet visibile, corrispondente agli epatociti vitali, e uno strato chiaro sulla parte superiore del gradiente composto da epatociti morti.
    NOTA: Se non c'è pellet, provare a mescolare nuovamente la soluzione agitando e ripetere la centrifugazione.
  12. Aspirare lo strato di cellule morte dalla parte superiore del gradiente e lasciare 1-2 ml di terreno con il pellet.
  13. Risospendere il pellet in 30-40 mL di terreno completo di William.
    NOTA: Per l'intera procedura, utilizzare solo pipette sierologiche da 25 mL. Pipette di diametro più piccolo possono ridurre la vitalità degli epatociti. Tutti i passaggi devono essere eseguiti su ghiaccio per mantenere i +4°C.
  14. Centrifugare a 200 x g per 10 min a 4°C, quindi aspirare il surnatante.

7. Coltura di epatociti e raccolta di RNA

  1. Aggiungere una quantità appropriata di terreno per il conteggio delle cellule. Conta la vitalità delle cellule con il blu di tripano 1:10.
  2. Coltura di epatociti 2D
    1. Piastre di cellule alla concentrazione di 500.000 cellule/pozzetto di piastra a 6 pozzetti su una piastra cellulare rivestita di collagene con terreno completo di William preriscaldato.
    2. Collocare la coltura cellulare in un incubatore umidificato con il 95% di aria e il 5% di CO2 a 37 °C.
    3. Dopo 4 ore, cambiare il mezzo con il nuovo mezzo completo di William preriscaldato.
    4. Conservare le cellule nell'incubatore. Cambia il mezzo ogni giorno.
    5. Raccogliere gli epatociti primari in un reagente per l'estrazione dell'RNA prima della piastratura (giorno 0) e nei giorni da 1 a 3 della coltura.
    6. Estrarre l'RNA secondo il protocollo del produttore e trascriverlo in cDNA per la valutazione dei geni marcatori epatici mediante RT-qPCR. L'elenco dei primer è presentato nella Tabella 2.
  3. Per la coltura 3D a lungo termine degli epatociti:
    1. Risospendere le cellule nella matrice pura fredda alla concentrazione di 1.000-10.000 cellule in 20 μL.
      NOTA: Cerca di evitare di creare bolle di matrice.
    2. Utilizzando puntali per pipette pre-raffreddati, piastra le goccioline cellulari contenenti matrice in una piastra di coltura cellulare pre-riscaldata.
    3. Capovolgere la piastra e lasciarla nell'incubatore per colture cellulari per 20-30 minuti.
    4. Alza il volume e aggiungi il terreno di coltura 3D a lungo termine preriscaldato e il terreno di coltura specifico secondo il lavoro di Peng22. Conservare le cellule nell'incubatore.
    5. Cambiare il terreno epatocitario 3D a lungo termine ogni 2-3 giorni.
    6. Almeno dopo 14 giorni di coltura, gli Hep-Org vengono separati dalla matrice e gli Hep-Org vitali vengono valutati mediante il test di proliferazione del blu di tripano e dell'EdU e fatti passare secondo il lavoro di Peng.

Risultati

Al termine delle procedure di set-up (fase 6.13), abbiamo ottenuto una resa cellulare fino a 1 x 108 cellule per isolamento dal fegato di circa 300 g di un ratto. La vitalità cellulare tra il 78% e il 97% è stata stabilita mediante la conta del blu di tripano.

Come già descritto in studi precedenti 1,18,19, gli epatociti primari in coltura perdono la loro morfologia, le funzioni specifiche del fegato e muoiono entro pochi giorni.

E' ben noto in letteratura23,24 che gli epatociti adulti primari perdono rapidamente la morfologia cuboidale-esagonale, si trasformano in una forma "fibroblastica" nel giro di pochi giorni e muoiono. La Figura 1 illustra le varie fasi: a 4 ore dalla placcatura su una piastra rivestita di collagene, gli epatociti aderiscono alla superficie, si diffondono in un tipico monostrato che mostra una morfologia cuboidale, i bordi delle cellule sono definiti, le giunzioni tra le cellule sono lineari e la superficie delle cellule appare liscia (Figura 1A). Il giorno 1, gli epatociti primari acquisiscono la loro tipica forma esagonale e le goccioline lipidiche diventano visibili (Figura 1B). Nei giorni 2-3, le goccioline lipidiche aumentano (Figura 1C-1D), mentre nei giorni 4-5, le cellule accumulano fibre di stress di actina (Figura 1E-F). Abbiamo anche valutato la percentuale di cellule vitali in coltura 2D primaria dal giorno 1 al giorno 5 e l'abbiamo confrontata con la vitalità prima della piastratura al giorno 0 (Figura 2). È possibile osservare una drastica riduzione della vitalità già nei primi giorni di coltura, raggiungendo il 49,5% (DS 12,7) il giorno 1, che scende al 45,2% (DS 18,2) il giorno 2 e al 33,5% (DS 0,77) il giorno 3. La percentuale di cellule vitali al giorno 4 è già del 16,9% (DS 5,4), mentre al giorno 5 raggiunge il 9,1% (DS 0,38). Pertanto, è evidente che la perdita di morfologia accompagna una rapida e progressiva morte cellulare degli epatociti adulti in coltura 2D.

Gli epatociti isolati, prima della placcatura (giorno 0), hanno mostrato un'elevata espressione di mRNA dei geni marcatori epatici (ABCD3, ALB, KRT18, PCK1, SERPIN, TDO2) valutati mediante RT-qPCR (Figura 3). Tutti i geni analizzati mostrano una diminuzione dell'espressione dipendente dal tempo della coltura già al giorno 1 in coltura. I livelli di espressione dell'mRNA evidenziano la perdita funzionale e di vitalità degli epatociti primari durante il tempo.

Gli epatociti isolati sono stati piastrati in goccioline di matrice 3D e le strutture cellulari di organoidi 3D sono state seguite nel tempo. Il giorno 1 della coltura, i singoli epatociti sono sospesi nelle goccioline della matrice (Figura 4A). La concentrazione cellulare viene mantenuta intenzionalmente bassa per fornire agli epatociti ampio spazio per crescere. Inoltre, questo ci permette di seguire visivamente la crescita degli organoidi. Gli epatociti primari hanno mostrato divisione cellulare nei primi giorni di coltura (Figura 4C). Inoltre, mentre il Giorno 0 gli Hep-Org sono stati misurati a 30 μm, il Giorno 2 gli Hep-Org hanno quasi raddoppiato le loro dimensioni, sottolineando la crescita dimensionale che è stata mantenuta fino al Giorno 15 (33,08 μm il Giorno 1; 64,86 μm il Giorno 2; 45,06 μm il Giorno 5; 55,19 μm il Giorno 7; 51,93 μm il Giorno 10; 62,90 μm il Fay 15). Per quanto riguarda la forma degli Hep-Org, mentre il giorno 1 erano di forma rotonda, hanno raggiunto la "forma del grappolo d'uva" (tipica degli organoidi epatici) nei giorni successivi.

Gli epatociti piastrati in una matrice 3D rimangono vivi in coltura per settimane, mostrando una vitalità del 23% ±10% dopo 15 giorni utilizzando il test del blu di tripano (Figura 4B, prima riga). Per convalidare la proliferazione di Hep-Org di ratto, il giorno 15 è stato eseguito un test EdU (Figura 4D). Tuttavia, la colorazione di Hoechst ha mostrato un numero elevato di cellule singole piuttosto che di Hep-Org, era presente un'attività proliferativa degli epatociti (cellule verdi), anche se l'incorporazione di EdU era bassa (9% ± 7%) (Figura 4B, seconda riga).

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Figura 1: Coltura 2D di epatociti primari su piastre rivestite di collagene nel tempo. Le immagini sono state scattate con ingrandimento 20x con (A) microscopia a contrasto di fase a 4 ore dopo la placcatura, (B) Giorno 1, (C) Giorno 2, (D) Giorno 3, (E) Giorno 4, (F) Giorno 5. In ogni immagine è riportata una barra di scala corrispondente a 50 μm. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

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Figura 2: Cellule primarie vitali in coltura 2D su piastre rivestite di collagene. Il grafico mostra la percentuale di cellule vitali dal Giorno 1 al Giorno 5, rispetto alle cellule vitali piastrate il Giorno 0, considerata come 100%. I risultati sono riportati come repliche singole, media e SD di 3 diversi esperimenti (* valore p ≤ 0,05; ** valore p ≤ 0,005). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

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Figura 3: Espressione dell'mRNA dei marcatori epatici misurata mediante RT-qPCR negli epatociti primari. I risultati sono stati normalizzati su β-actina e/o GAPDH (geni housekeeping) e sono espressi come relativi agli epatociti primari raccolti prima della placcatura al giorno 0, considerati come 1. I risultati sono riportati come media ± SD di almeno 3 diversi esperimenti (**+ valore p ≤ 0,001). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

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Figura 4: Coltura 3D di epatociti in goccioline di matrice nel tempo. (A) Epatociti isolati placcati in goccioline di matrice per Hep-Org a lungo termine: nell'immagine, le goccioline di matrice sono visibili sulla superficie del pozzetto (cerchio rosso = una gocciolina). (B) Percentuale di cellule vitali da parte del blu di tripano e di cellule proliferative da parte dell'EdU al giorno 15 prima del passaggio. La quantificazione delle cellule positive EdU è stata eseguita dal software ImageJ2. I risultati sono riportati in percentuale come Media±SD di almeno 3 diversi esperimenti. (C) Immagini a contrasto di fase della coltura 3D di Hep-Org di ratto in diversi giorni di crescita in coltura 3D: giorno 1, 2, 5, 7, 10, 15. Ingrandimento dell'immagine 20X. In ogni immagine è riportata una barra di scala corrispondente a 50 μm. (D) Saggio di incorporazione EdU di Hep-Org di ratto il giorno 15. Ingrandimento dell'immagine 20X. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Tabella 1: Buffer e composizione dei media. La tabella riporta il nome e i componenti (con la loro concentrazione finale) di tutti i tamponi e dei mezzi cellulari utilizzati nel protocollo. Clicca qui per scaricare questa tabella.

Tabella 2: Elenco dei primer per ratti. La tabella riporta l'elenco dei primer utilizzati per gli esperimenti di RT-qPCR. Clicca qui per scaricare questa tabella.

Discussione

Gli organoidi 3D sono una frontiera per la medicina personalizzata e consentono una coltura di epatociti a lungo termine. La qualità di questa tecnica innovativa richiede una buona resa di epatociti primari vitali e una perfusione epatica e un isolamento degli epatociti ben eseguiti. Questa vecchia procedura è ancora ampiamente utilizzata; Tuttavia, comprende diversi passaggi che possono essere impegnativi. Avvicinandoci alla procedura, abbiamo riscontrato problemi critici come la contaminazione batterica, la bassa efficienza della digestione epatica, la bassa resa di epatociti primari e la bassa vitalità degli epatociti, che possono facilmente influire sul successo della tecnica. Partendo dai protocolli golden standard17,18, qui evidenziamo come superare problemi comuni, chiariamo i passaggi più critici nell'isolamento primario degli epatociti di ratto e riassumiamo le punte sparse che possono facilmente influenzare il successo della tecnica nel modello di ratto. Sebbene la procedura di perfusione epatica sia piuttosto impegnativa e richieda una precisa competenza da parte dell'operatore, garantisce risultati di alta qualità in termini di resa, integrità, vitalità e funzionalità degli epatociti primari. Queste caratteristiche sono essenziali per le fasi successive.

Durante la pianificazione del progetto, abbiamo preso in attenta considerazione la checklist21 delle linee guida PREPARE. Particolare attenzione è stata rivolta alla letteratura passata, confrontando diversi lavori precedenti ed entrando in contatto con alcuni degli autori (checklist delle linee guida PREPARE _topic A1). Lo strumento dell'organoide stesso è un modo importante per ridurre il numero di animali, poiché le cellule possono essere propagate in coltura per un massimo di 7 mesi (lista di controllo delle linee guida PREPARE _topic A3). Attraverso il dialogo con il personale della struttura per animali, abbiamo selezionato un tecnico esperto che ha fornito assistenza nella procedura e ha contribuito ad evitare l'uso di animali da esperimento in eccedenza (checklist delle linee guida PREPARE _topic B5). È stata ottenuta un'appropriata pompa peristaltica necessaria per condurre la perfusione epatica (lista di controllo delle linee guida PREPARE _topic B6).

Le pubblicazioni di Ng17 e Shen18 sono le più recenti che descrivono la procedura nei ratti. Le principali questioni affrontate dal presente protocollo, non affrontate dai precedenti, riguardano l'utilizzo di soluzioni commerciali e l'ottimizzazione di una precisa incannulazione della vena porta che assicuri fasi ottimali di perfusione e digestione mantenendo il fegato in situ. Mentre i protocolli di Shen18 e Ng17 utilizzavano soluzioni fatte in casa, il nostro protocollo si basa su soluzioni commerciali di perfusione e digestione per ridurre la variabilità nella preparazione del tampone. Un eccesso di concentrazione dell'enzima digest potrebbe essere aggressivo nei confronti degli epatociti e influenzare la loro qualità e vitalitàdelle cellule 25. L'utilizzo di soluzioni commerciali è fondamentale per migliorare la riproducibilità del protocollo, garantendo la standardizzazione. Inoltre, il protocollo eseguito da Ng17 può essere impegnativo a causa della necessità di rimuovere il fegato prima della fase di digestione. Il nostro protocollo si basa sulla perfusione e digestione del fegato senza rimuoverlo fino a quando non sono state eseguite entrambe le fasi, questo semplifica la procedura. In termini di resa e vitalità cellulare, i risultati del nostro protocollo sono paragonabili a quelli dei lavori precedenti.

La pulizia e la disinfezione dei tubi di perfusione, prima e dopo la procedura, insieme alla disinfezione della pelle prima di iniziare l'intervento, sono molto importanti per limitare la contaminazione batterica. Inoltre, l'asciugatura completa del tubo dopo la pulizia con etanolo e il successivo lavaggio con il terreno è fondamentale per aumentare la vitalità delle cellule. Infatti, anche una singola iniezione di etanolo iniettata nel fegato causerebbe la morte cellulare durante la procedura.

La temperatura della soluzione iniettata è importante, ma deve essere considerata anche la sensibilità dell'enzima collagenasi alla temperatura. Per questo motivo, abbiamo preriscaldato il tampone di perfusione a 42 °C prima di iniziare la procedura chirurgica, mentre abbiamo messo il tampone di digestione nel bagno di riscaldamento solo durante la fase di perfusione. L'aggiunta di una trappola per bolle al tubo a monte del catetere impedisce alle bolle fuoriuscite di raggiungere il catetere e all'aria di entrare nel fegato quando la soluzione di perfusione si esaurisce17.

La composizione del tampone, la pressione di perfusione e la portata devono rientrare nell'intervallo appropriato17. Abbiamo sperimentato che la bassa pressione e la bassa portata causano una bassa resa e influenzano negativamente la vitalità delle cellule, poiché il tampone non può raggiungere i piccoli vasi. D'altra parte, la portata non deve essere troppo elevata per mantenere intatta la capsula di Glisson. Poiché l'integrità dell'adesione cellulare richiede Ca2+ 18, il tampone di perfusione è una soluzione priva di Ca2+ contenente EDTA per attaccare i ponti contenenti calcio tra le cellule, quindi è essenziale per rimuovere il calcio e lavare via il sangue dal fegato. Il tempo di perfusione di 8-15 minuti con una velocità di flusso di 10 mL/min è fondamentale per consentire a tutte le cellule di essere raggiunte dalla soluzione priva di EDTA, Ca2+. Una perfusione non ottimale potrebbe portare a una digestione ridotta.

Il tampone di digestione contiene Ca2+, poiché la collagenasi che digerisce la matrice di collagene è Ca2+ dipendente. La velocità di flusso del tampone di digestione deve essere mantenuta ad almeno 20 mL/min e il tempo dipende dalla capacità della collagenasi. Nel caso del tampone di digestione specifico che utilizziamo, dobbiamo perfondere 15 minuti per un volume finale di 300 ml di soluzione. Se la digestione è incompleta, le giunzioni cellula-cellula vengono mantenute e la successiva pressione meccanica danneggerà le cellule, riducendo la vitalità. L'aumento lento della velocità di flusso contribuisce alla riduzione dell'impatto stressante della perfusione sulle cellule. Durante l'intervento, ci siamo concentrati sul clampaggio transitorio della vena cava inferiore e sul conseguente gonfiore epatico: questo passaggio ha migliorato significativamente sia l'efficienza della digestione che il recupero cellulare. Alla fine della digestione, il fegato dovrebbe apparire marrone chiaro e morbido. Al termine della resezione epatica, il lavaggio del fegato isolato in PBS +3% P/S riduce il titolo batterico e aiuta a evitare la contaminazione nella parte successiva della procedura.

Per le fasi di isolamento degli epatociti sotto il cappuccio biologico, l'uso di pipette sierologiche da 25 mL evita la riduzione della vitalità degli epatociti con pipette di diametro inferiore. Abbiamo aggiunto un passaggio opzionale per aumentare la resa dell'epatocita primario, che consiste nel versare il terreno completo di William sul fegato frantumato per ripetere il passaggio di raschiatura sotto il cofano. Questo passaggio viene eseguito dopo il filtraggio del terreno rilasciato dalle cellule dal fegato isolato e aiuta a pulire il Petri e recuperare più cellule dalla capsula epatica. Se è necessario applicare un'alta pressione per spostare gli epatociti attraverso i filtri, la vitalità cellulare sarà bassa19.

L'incapacità degli epatociti di essere coltivati in 2D per più di 2 giorni ci ha portato a trovare un modello di coltura alternativo a lungo termine. Un modello adatto per coltivare gli epatociti per un tempo più lungo è l'Hep-Org adulta. Rispetto agli epatociti 2D, gli Hep-Org sono risultati ancora vitali e in proliferazione attiva al giorno 15, dimostrando un potenziale a lungo termine.

La perfusione epatica di ratto e il successivo isolamento primario degli epatociti adulti sono i principali passaggi preliminari per diverse applicazioni. Sebbene la riproducibilità possa essere un limite della tecnica poiché la procedura coinvolge molti passaggi e variabili, prestare attenzione alla descrizione visiva della procedura aiuta a replicare il metodo con un alto tasso di successo. Evidenziando le fasi critiche e mostrando come affrontarle, questo protocollo ottimizza la procedura per l'isolamento primario degli epatociti di ratto e i risultati sono appropriati per stabilire modelli in vitro , come la generazione Hep-Orgs, al fine di studiare la fisiologia e la patologia epatica.

Dichiarazioni

Tutti gli autori hanno segnalato tutti i conflitti di interesse.

Ringraziamenti

Ringraziamo il Dott. Davide Selvestrel e il Prof. Giovanni Sorrentino del SorrentinoLab dell'Università di Trieste per averci aiutato a eseguire il saggio di proliferazione dell'EdU. Il lavoro è stato sostenuto da un grant ad hoc della Banca d'Italia e da contributi FIF intramurali.

Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
A83-01- Inibitore ALK5 IVDoppia Elica T3031
B27Thermofisher Scientific0080085SA
CFX Connect Sistema di rilevamento PCR in tempo reale   Kit di imaging Bio-Rad
CHIR99021Twin HelixT2310
Click EdU Alexa 488Thermofisher ScientificC10499
Collagene, tipo I, soluzione da coda di rattoMerckC3867-1VL
Desametasone MerckD4902
EGFMerck E9644
Siero fetale bovino (FBS)EurocloneECS0180L
GELTREX LDEV FREE RGF BMEThermofisher ScientificA1413202
Eparina sodica 25000 UI/5 mlB. Braun Melsungen AGB01AB01
HGFPeprotech  100-39 ore
Soluzione di insulina-transferrina-selenio 100x Thermofisher Scientific 41400045
Soluzione di L-GlutamminaEurocloneECB3000D
Digerito Fegato Medium Thermofisher Scientific  17703-034
Perfusione epatica MediaThermofisher Scientific 17701038
integratore di N2Thermofisher Scientific17502048
N-acetilcisteinaMerckA9165
NicotinamideMerck N-0636
Aminoacidi non essenzialiMerckM7145
NormocinAurogeneant-nr-1
tampone PBS 1XPanReac AppliChemA0964,9050
Soluzione di penicillina-streptomicina 100xEurocloneECB3001D
PercollSanta Cruzsc-296039A
Pompa peristalticaIsmatec™  MS-4/12 Reglo Pompa
TNFaPeprotech  300-01A
Reagente TRITubo MerckT9424
 Ismatec™    ID.2,79mm
Williams' E Medium, senza glutamminaThermofisher Scientific31415029
Y27632Twin HelixT1725
Digitale

Riferimenti

  1. Heslop, J. A., et al. Mechanistic evaluation of primary human hepatocyte culture using global proteomic analysis reveals a selective dedifferentiation profile. Arch Toxicol. 91 (1), 439-452 (2017).
  2. Ietto, G., et al. Multicellular liver organoids: Generation and importance of diverse specialized cellular components. Cells. 12 (10), 1429(2023).
  3. Dunn, J. C., Tompkins, R. G., Yarmush, M. L. Hepatocytes in collagen sandwich: evidence for transcriptional and translational regulation. J Cell Biol. 116 (4), 1043-1053 (1992).
  4. Keemink, J., Oorts, M., Annaert, P. Primary Hepatocytes in sandwich culture. Methods in Mol Biol (Clifton, N.J). 1250, 175-188 (2015).
  5. Kaur, I., et al. Primary hepatocyte isolation and cultures: Technical aspects, challenges and advancements. Bioengineering (Basel, Switzerland). 10 (2), 131(2023).
  6. Thompson, W. L., Takebe, T. Human liver model systems in a dish. Dev Growth Differ. 63 (1), 47-58 (2021).
  7. Takebe, T., Wells, J. M. Organoids by design. Science (New York, N.Y.). 364 (6444), 956-959 (2019).
  8. Nantasanti, S., de Bruin, A., Rothuizen, J., Penning, L. C., Schotanus, B. A. Concise review: organoids are a powerful tool for the study of liver disease and personalized treatment design in humans and animals. Stem Cells Transl Med. 5 (3), 325-330 (2016).
  9. Raju, R., et al. In vitro pluripotent stem cell differentiation to hepatocyte ceases further maturation at an equivalent stage of e15 in mouse embryonic liver development. Stem Cells Dev. 27 (13), 910-921 (2018).
  10. Peng, W. C., et al. Inflammatory cytokine TNFalpha promotes the long-term expansion of primary hepatocytes in 3D culture. Cell. 175 (6), 1607-1619.e15 (2018).
  11. Hu, H., et al. Long-term expansion of functional mouse and human hepatocytes as 3d organoids. Cell. 175 (6), 1591-1606.e19 (2018).
  12. Michalopoulos, G. K., Bowen, W. C., Mulè, K., Lopez-Talavera, J. C., Mars, W. Hepatocytes undergo phenotypic transformation to biliary epithelium in organoid cultures. Hepatology (Baltimore, Md). 36 (2), 278-283 (2002).
  13. Schaub, J. R., et al. De novo formation of the biliary system by TGFβ-mediated hepatocyte transdifferentiation. Nature. 557 (7704), 247-251 (2018).
  14. Lancaster, M. A., Knoblich, J. A. Organogenesis in a dish: modeling development and disease using organoid technologies. Science (New York, N.Y.). 345 (6194), 1247125(2014).
  15. Huch, M., Koo, B. -K. Modeling mouse and human development using organoid cultures. Development (Cambridge, England). 142 (18), 3113-3125 (2015).
  16. Seglen, P. O. Preparation of isolated rat liver cells. Methods in Cell Biol. 13, 29-83 (1976).
  17. Ng, I. C., et al. Isolation of primary rat hepatocytes with multiparameter perfusion control. J Vis Exp. (170), e62289(2021).
  18. Shen, L., Hillebrand, A., Wang, D. Q. -H., Liu, M. Isolation and primary culture of rat hepatic cells. J Vis Exp. (64), e3917(2012).
  19. Cabral, F., et al. Purification of hepatocytes and sinusoidal endothelial cells from mouse liver perfusion. J Vis Exp. (132), e56993(2018).
  20. Charni-Natan, M., Goldstein, I. Protocol for primary mouse hepatocyte isolation. STAR protoc. 1 (2), 100086(2020).
  21. Smith, A. J., Clutton, R. E., Lilley, E., Hansen, K. E. A., Brattelid, T. PREPARE: Guidelines for planning animal research and testing. Lab Anim. 52 (2), 135-141 (2018).
  22. Kluiver, T. A., Kraaier, L. J., Peng, W. C. Long-term expansion of murine primary hepatocyte organoids. Methods in Molecular Biol (Clifton, N.J). 2544, 1-13 (2022).
  23. Shulman, M., Nahmias, Y. Long-term culture and coculture of primary rat and human hepatocytes. Methods in Molecular Biol (Clifton, N.J). 945, 287-302 (2013).
  24. Knobeloch, D., et al. Human hepatocytes: isolation, culture, and quality procedures. Methods in Molecular Biol (Clifton, N.J). 806, 99-120 (2012).
  25. Queral, A. E., DeAngelo, A. B., Garrett, C. T. Effect of different collagenases on the isolation of viable hepatocytes from rat liver. Anal Biochem. 138 (1), 235-237 (1984).

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