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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Per studiare la risposta immunitaria ai disturbi cerebrali, un approccio comune consiste nell'analizzare i cambiamenti nelle cellule immunitarie. Qui, vengono forniti due protocolli semplici ed efficaci per isolare le cellule immunitarie dal tessuto cerebrale murino e dal midollo osseo del cranio.
Prove crescenti indicano che la risposta immunitaria innescata da disturbi cerebrali (ad esempio, ischemia cerebrale ed encefalomielite autoimmune) si verifica non solo nel cervello, ma anche nel cranio. Un passo fondamentale verso l'analisi dei cambiamenti nelle popolazioni di cellule immunitarie sia nel cervello che nel midollo osseo del cranio dopo un danno cerebrale (ad esempio, ictus) è ottenere un numero sufficiente di cellule immunitarie di alta qualità per le analisi a valle. Qui, vengono forniti due protocolli ottimizzati per isolare le cellule immunitarie dal cervello e dal midollo osseo del cranio. I vantaggi di entrambi i protocolli si riflettono nella loro semplicità, velocità ed efficacia nel produrre una grande quantità di cellule immunitarie vitali. Queste cellule possono essere adatte per una vasta gamma di applicazioni a valle, come lo smistamento cellulare, la citometria a flusso e l'analisi trascrittomica. Per dimostrare l'efficacia dei protocolli, sono stati eseguiti esperimenti di immunofenotipizzazione su cervelli colpiti da ictus e midollo osseo cranio cerebrale normale utilizzando l'analisi della citometria a flusso, e i risultati sono stati allineati con i risultati degli studi pubblicati.
Il cervello, il fulcro centrale del sistema nervoso, è protetto dal cranio. Sotto il cranio ci sono tre strati di tessuto connettivo noti come meningi: la dura madre, l'aracnoide e la pia madre. Il liquido cerebrospinale (CSF) circola nello spazio subaracnoideo tra l'aracnoide e la pia madre, ammortizzando il cervello e rimuovendo anche i rifiuti attraverso il sistema glinfatico 1,2. Insieme, questa architettura unica fornisce un ambiente sicuro e di supporto che mantiene la stabilità del cervello e lo protegge da potenziali lesioni.
Il cervello è stato a lungo considerato immuno-privilegiato. Tuttavia, questa nozione è stata parzialmente abbandonata poiché prove crescenti indicano che, oltre alle microglia residenti nel parenchima, i bordi del cervello, compreso il plesso coroideo e le meningi, ospitano una vasta gamma di cellule immunitarie3. Queste cellule svolgono un ruolo fondamentale nel mantenimento dell'omeostasi, nella sorveglianza della salute del cervello e nell'avvio della risposta immunitaria alle lesioni cerebrali. In particolare, recenti scoperte indicano che il cranio è coinvolto nell'immunità delle meningi e può contribuire alla risposta immunitaria nel cervello dopo una lesione. Nel 2018, Herisson et al. hanno fatto una scoperta fondamentale dei canali vascolari diretti che collegano il midollo osseo del cranio alle meningi, stabilendo così un percorso anatomico per la migrazione dei leucociti 4,5. Successivamente, Cugurra et al. hanno dimostrato che molte cellule mieloidi (ad esempio, monociti e neutrofili) e le cellule B nelle meningi non originano dal sangue6. Utilizzando tecniche come il trapianto di lembo osseo calvario e regimi di irradiazione selettiva, gli autori hanno fornito prove convincenti che il midollo osseo del cranio funge da fonte locale per le cellule mieloidi nelle meningi e per il parenchima del SNC dopo una lesione del SNC6. Inoltre, un altro studio ha proposto che le cellule B meningee siano costantemente fornite dal midollo osseo del cranio7. Più recentemente, una nuova struttura, chiamata uscita della cuffia aracnoidea (ACE), è stata identificata come una porta diretta tra la dura madre e il cervello per il traffico di cellule immunitarie8.
Questi interessanti risultati hanno importanti implicazioni per l'origine dell'infiltrazione delle cellule immunitarie nel cervello danneggiato (ad esempio, dopo un ictus ischemico). Un ampio corpus di prove ha indicato che dopo l'ictus, molte cellule immunitarie si infiltrano nel cervello, contribuendo sia al danno cerebrale acuto che al recupero cerebrale cronico. L'idea convenzionale è che queste cellule siano leucociti circolanti nel sangue che si infiltrano nel cervello, il che è in gran parte facilitato dal danno alla barriera emato-encefalica indotto dall'ictus. Tuttavia, questa nozione è stata messa in discussione. In uno studio, le cellule immunitarie nel cranio e nella tibia dei topi sono state etichettate in modo diverso e, a 6 ore dall'ictus, è stata riscontrata una diminuzione significativamente maggiore dei neutrofili e dei monociti nel cranio rispetto all'ictus. La tibia e altri neutrofili derivati dal cranio erano presenti nel cervello ischemico. Questi dati suggeriscono che nella fase acuta di ictus, i neutrofili nel cervello ischemico originano principalmente dal midollo osseo del cranio4. È interessante notare che il liquido cerebrospinale può guidare questa migrazione. Infatti, due recenti rapporti hanno dimostrato che il liquido cerebrospinale può trasmettere direttamente segnali di segnalazione dal cervello al midollo osseo del cranio attraverso i canali del cranio e istruire la migrazione cellulare e l'emopoiesi nel midollo osseo del cranio dopo una lesione del SNC 9,10.
Alla luce di queste recenti scoperte, è diventato importante analizzare i cambiamenti nelle cellule immunitarie sia nel cervello che nel midollo osseo del cranio, quando si studia la risposta immunitaria ai disturbi cerebrali. In tali indagini, è necessario un numero sufficiente di cellule immunitarie di alta qualità per le analisi a valle come lo smistamento cellulare, l'analisi della citometria a flusso e il sequenziamento dell'RNA a singola cellula (scRNA-seq). Qui, l'obiettivo generale è quello di presentare due procedure ottimizzate per la preparazione di sospensioni unicellulari dal tessuto cerebrale e dal midollo osseo del cranio. È importante notare che la calvaria (osso frontale, osso occipitale e ossa parietali) del cranio viene tipicamente utilizzata per estrarre il midollo osseo e questo midollo osseo è specificamente indicato come midollo osseo del cranio in questo studio.
Il protocollo è stato approvato dal Duke Institute Animal Care and Use Committee (IACUC). Nel presente studio sono stati utilizzati topi maschi C57Bl/6 (3-4 mesi; 22-28 g). I dettagli dei reagenti e delle attrezzature utilizzate sono elencati nella Tabella dei Materiali.
1. Sospensione di una singola cellula dal cervello di topo
NOTA: La Figura 1 illustra la panoramica del protocollo di isolamento delle cellule cerebrali.
2. Preparazione di una sospensione unicellulare di midollo osseo da calvaria di topo
NOTA: La Figura 2 illustra la panoramica della procedura di isolamento del midollo osseo del cranio.
Per preparare le cellule immunitarie dal tessuto cerebrale del topo, il protocollo produce generalmente cellule con un'elevata vitalità (84,1% ± 2,3% [media ± SD]). Circa il 70%-80% di queste cellule sono CD45 positive. Nel cervello di topo normale, quasi tutte le cellule CD45+ sono microglia (CD45LowCD11b+), come previsto. Questo protocollo è stato utilizzato in laboratorio per varie applicazioni, tra cui l'analisi della citometria a flusso, la selezione cellulare attivata dalla fluorescenza (FACS) e l'analisi scRNA-seq. Ad esempio, è stata condotta un'analisi di citometria a flusso in un modello di ictus (Figura 3). I topi sono stati sottoposti a un modello di ictus transitorio, occlusione dell'arteria cerebrale media del filamento di 30 minuti (MCAO)14. Il terzo giorno dopo l'ictus, le cellule sono state preparate da cervelli di topo e colorate con marcatori comuni della superficie delle cellule immunitarie. La strategia di gating è illustrata nella Figura 3A. Coerentemente con la ricerca precedente13,15, è stato osservato un marcato aumento delle celluleCD45 High nell'emisfero omolaterale (Figura 3B,C), indicando l'infiltrazione della cellula immunitaria nel cervello.
Per il protocollo del midollo osseo del cranio, è stata costantemente raggiunta una resa sostanziale di cellule del midollo osseo del cranio (circa 2 x 106 cellule) con un'eccellente vitalità (93,8% ± 1,8% [media ± DS]). Come previsto, la maggior parte di queste cellule sono CD45 positive. Per illustrare l'utilità di questo protocollo, è stato condotto uno studio comparativo per caratterizzare la composizione delle cellule immunitarie sia nel midollo osseo del femore che nel midollo osseo del cranio di topi naïve (Figura 4). Come illustrato nei grafici rappresentativi, la composizione delle cellule immunitarie era simile tra il femore e il midollo osseo del cranio (Figura 4A, B). È interessante notare che la frequenza dei neutrofili sembra essere più alta nel femore che nell'osso del cranio (Figura 4C). Tuttavia, questo risultato richiede un'ulteriore convalida, poiché la dimensione del campione era piccola per questo studio pilota.

Figura 1: Panoramica del protocollo di isolamento delle cellule cerebrali. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Il protocollo di isolamento delle cellule del midollo osseo del cranio. (A) Panoramica della procedura. (B) Il modello raccomandato per il taglio del cranio. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: Analisi rappresentativa della citometria a flusso delle cellule immunitarie nel cervello dell'ictus. (A) Un esempio della strategia di gating. I grafici raffigurano le seguenti popolazioni di cellule immunitarie: microglia (CD45LowCD11b+), cellule NK (CD45HighNK1.1+), neutrofili (CD45HighLy6G+), cellule T (CD45HighCD11b-CD3+) e cellule B (CD45HighCD11b-CD19+). Questo esempio rappresenta un'analisi delle cellule immunitarie cerebrali nell'emisfero omolaterale il giorno 3 dopo l'ictus. (B,C) Infiltrazione di cellule immunitarie nel cervello dell'ictus. I giovani topi maschi sono stati sottoposti a occlusione transitoria dell'arteria cerebrale media (MCAO). Il giorno 3, i cervelli sono stati raccolti e divisi in emisferi sinistro (controlaterale) e destro (omolaterale). Le cellule cerebrali sono state preparate secondo il protocollo descritto e quindi sottoposte ad analisi di citometria a flusso. Grafici rappresentativi illustrano un aumento delle cellule immunitarie infiltranti nell'emisfero omolaterale (CD45High cells; B). I dati quantitativi sono riportati nei grafici a barre (C). Il numero di cellule è stato calcolato in base alla conta cellulare e al volume registrati nei dati della citometria a flusso. I dati sono presentati come media ± SEM. *p < 0,05. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: Analisi rappresentativa della citometria a flusso delle cellule del midollo osseo del cranio. Per il confronto, è stata inclusa l'analisi delle cellule del midollo osseo del femore. I grafici raffigurano le seguenti popolazioni di cellule immunitarie: cellule NK (CD45+NK1.1+), neutrofili (CD45+CD11b+Ly6G+), cellule T (CD45+CD11b-CD3+) e cellule B (CD45+CD11b-CD19+). (A) Grafici rappresentativi per il midollo osseo del femore. (B) Grafici rappresentativi del midollo osseo del cranio. (C) Confronto della composizione delle cellule immunitarie tra femore e midollo osseo del cranio. I dati sono presentati come media ± SEM. *p < 0,05. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Nessuno.
Per studiare la risposta immunitaria ai disturbi cerebrali, un approccio comune consiste nell'analizzare i cambiamenti nelle cellule immunitarie. Qui, vengono forniti due protocolli semplici ed efficaci per isolare le cellule immunitarie dal tessuto cerebrale murino e dal midollo osseo del cranio.
Ringraziamo Kathy Gage per il suo eccellente contributo editoriale. Le figure illustrative sono state create con BioRender.com. Questo studio è stato supportato da fondi del Dipartimento di Anestesiologia (Duke University Medical Center) e da sovvenzioni NIH NS099590, HL157354 e NS127163.
| Provette per microcentrifuga da 0,5 mL | VWR | 76332-066 | |
| Provette per microcentrifuga da 1,5 mL | VWR | 76332-068 | |
| Provette coniche da 15 mL | Thermo Fisher Scientific | 339651 | |
| 18 G x 1 pollice BD PrecisionGlide Needle | BD Biosciences | 305195 | |
| 1x HBSS | Gibco | 14175-095 | |
| Provette coniche da 50 mL | Thermo Fisher Scientific 339653 | ||
| Micropiastra con fondo a V a 96 pozzetti | SARSTEDT | 82.1583 | |
| Citometro a flusso AURORA | Cytek bioscience | ||
| BSA | Fisher | BP9706-100 | |
| CD11b-AF594 | BioLegend | 101254 | diluizione 1:500 |
| CD19-BV785 | BioLegend | 115543 | diluizione 1:500 |
| CD19-FITC | BioLegend | 115506 | diluizione 1:500 |
| CD3-APC | BioLegend | 100312 | diluizione 1:500 |
| CD3-PE | BioLegend | 100206 | diluizione 1:500 |
| CD45-Alex 700 | BioLegend | 103128 | diluizione 1:500 |
| CD45-BV421 | Biolegend | 103133 | diluizione 1:500 |
| Filtro cellulare 70 um | Avantor | 732-2758 | |
| Pinze per medicazione | V. Mueller | NL1410 | |
| EDTA | Invitrogen | 15575-038 | |
| Fc Block | Biolegend | 101320 | Diluizione 1:100 |
| Pinze | Roboz | RS-5047 | |
| LIVE/DEAD Kit di colorazione per cellule morte blu fissabile | Thermo Fisher Scientific | N7167 | Diluizione 1:500 |
| Ly6G-BV421 | BioLegend | 127628 | 1:500 diluizione |
| Ly6G-PerCp-cy5.5 | BioLegend | 127615 | diluizione 1:500 |
| NK1.1-APC-cy7 | BioLegend | 108723 | diluizione 1:500 |
| Percoll (mezzo gradiente di densità) | Cytiva | 17089101 | |
| Soluzione salina tampone fosfato (10x) | Gibco | 70011-044 | |
| Tampone di lisi RBC (10x) | BioLegend | 420302 | |
| Forbici | SKLAR | 64-1250 | |
| WHEATON Dounce Tissue, 15 mL Formato | DWK Life Sciences | 357544 |