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Questo protocollo descrive in dettaglio due sistemi AAV e modelli murini per studiare l'espressione ectopica di Neurod1 nel contesto di un modello di ictus corticale ET-1 lieve-moderato. Una serie di passaggi critici relativi all'ictus ET-1 sono importanti da considerare per la riproducibilità e la consistenza della lesione. I fori di fresatura devono essere praticati con cura senza forare la dura madre per evitare lesioni chirurgiche involontarie. È importante utilizzare punti di riferimento coerenti, in questo caso bregma, per garantire una regione di interesse simile (corteccia sensomotoria in questo studio). Ciò è particolarmente importante per gli studi che utilizzano valutazioni comportamentali poiché la posizione e le dimensioni della lesione influenzeranno i risultati funzionali 13,22,25,27. Ancora più importante, la velocità di iniezione di ET-1 e la pressione applicata dal chirurgo sulla siringa devono essere coerenti per ottenere risultati riproducibili. Da notare che l'ago della siringa può ostruirsi e deve essere pulito tra gli animali per garantire un'erogazione ET-1 accurata. Durante l'analisi cellulare del tessuto, se non si osserva una lesione da ictus, è probabile che l'ago si sia intasato durante l'intervento chirurgico. Se il problema persiste, procurati un nuovo lotto di endotelina-1 dal produttore, poiché in passato sono stati osservati problemi di potenza dipendente dal lotto.
Le fasi della procedura chirurgica per la somministrazione di AAV sono simili a quelle del protocollo di induzione dell'ictus ET-1. Pertanto, le considerazioni di cui sopra sono fondamentali. Inoltre, il titolo virale e il volume dell'AAV devono essere coerenti per garantire che l'efficienza di trasduzione possa essere confrontata tra i gruppi. In questo protocollo, sono stati somministrati 1 x 109 GC/μL di AAV per lo studio acuto e 1 x 1010 GC/μL di AAV per lo studio cronico. È fondamentale selezionare una dose virale sufficientemente bassa da ridurre al minimo l'errata espressione artefatta, pur essendo sufficientemente alta da garantire una trasduzione cellulare sufficiente, consentendo il rilevamento delle differenze tra i gruppi sperimentali. L'intervallo di dose virale ottimale per tali studi è stato determinato essere 107-10 10 GC/μL13,24. Titoli più elevati di AAV non solo provocano un'ampia marcatura dei neuroni nel gruppo di controllo, ma hanno anche dimostrato di indurre astrocitosi, interrompere la barriera emato-encefalica e sovraregolare le risposte infiammatorie 28,29. Gli studi che indagano la somministrazione del fattore di trascrizione mediata da virus dopo l'ictus hanno utilizzato diversi siti di somministrazione per le iniezioni di AAV. Uno studio ha descritto il successo dell'etichettatura delle cellule trasdotte utilizzando una singola iniezione di AAV nel sito13 della lesione dell'ictus. Altri studi si concentrano su una o tre aree intorno all'area dell'infarto30. In questo caso, l'AAV è stato somministrato in tre posizioni, con un'iniezione alle coordinate del sito dell'iniezione ET-1 e 2 intorno al sito della lesione (un'iniezione a 1,0 mm anteriormente e un'iniezione a 1,0 mm posteriormente) con l'obiettivo di trasdurre gli astrociti reattivi nel bordo gliale perilesionale9. Durante l'analisi cellulare dei tessuti, se non si osservano o si osservano pochissime cellule fluorescenti (1-10 cellule/sezione), l'ago potrebbe essersi ostruito durante l'iniezione o l'AAV è stato congelato e scongelato troppe volte, portando all'inattivazione del virus.
L'efficienza della trasduzione è stata esaminata in momenti diversi nel modello di ictus lieve-moderato e i risultati dimostrano che un numero significativamente maggiore di neuroni viene marcato nei cervelli trattati con Neurod1 sia nei momenti subacuti che cronici post-ictus. Il lavoro mostrato qui è il primo a dimostrare la trasduzione di Neurod1 nella fase cronica post-ictus e rivela neuroni che esprimono ectopicamente Neurod1 fino a 8 settimane dopo l'ictus. Mentre i risultati che un aumento del numero di neuroni trasdotti sono stati osservati in cervelli danneggiati da ictus che hanno ricevuto Neurod1 rispetto ai vettori di controllo sono coerenti con il ruolo di Neurod1 nella conversione di AtN, l'interpretazione dei risultati cellulari richiede una solida conoscenza dei limiti del paradigma sperimentale. La stragrande maggioranza degli studi pubblicati che indagano la conversione di AtN utilizzano GFAP come promotore poiché GFAP è sovraregolato negli astrociti reattivi nelle malattie neurodegenerative, incluso l'ictus 4,31. Tuttavia, è stato dimostrato che una bassa espressione di GFAP si verifica anche nei neuroni32. Ciò è coerente con i risultati qui riportati in cui una percentuale di cellule trasdotte nel gruppo di controllo (Stroke-Cre) sono neuroni preesistenti32. In particolare, i gruppi di controllo Stroke-Cre in questo protocollo hanno mostrato un'etichettatura del 18,43 +/- 3,03% e del 53,05 +/- 5,028% delle cellule NeuN+Reporter+, che rappresenta l'etichettatura dei neuroni preesistenti, indicando l'espressione guidata dal promotore GFAP nei neuroni. Infatti, l'espressione mirata di Neurod1 dipende da una serie di fattori, tra cui il tropismo virale. È stato dimostrato che AAV5 trasduce neuroni con diversa efficienza in diverse regioni del cervello, inclusa la corteccia sensomotoria, indicando che i sierotipi AAV hanno un tropismo cellulare regionale, che deve essere considerato negli studi che inducono l'espressione ectopica dei fattori di trascrizione31,33. Anche i ceppi di topo possono influenzare la trasduzione dell'AAV14,34. Uno studio che ha confrontato la trasduzione dell'AAV nello striato di topi wild-type (C57BL/6J) e FVB/N ha rilevato un tropismo cellulare variabile e un'efficienza di trasduzione nei due ceppi34.
Un vantaggio del sistema Cre-Flex è che può essere utilizzato per la marcatura a lungo termine in topi wild-type, il che può ridurre il problema dell'espressione non specifica di Cre presente nelle linee di topo Cre-reporter15,35. Uno svantaggio del sistema Cre-Flex è che l'espressione del transgene Cre-indipendente può verificarsi a causa dello 0,1%-0,8% delle particelle virali che hanno ricombinato i siti LoxP durante la produzione virale36. Questi risultati evidenziano l'importanza degli esperimenti di tracciamento del lignaggio, ad esempio la pre-marcatura degli astrociti prima della somministrazione di AAV utilizzando la linea murina Aldh1l1-CreERT2, per garantire che la conversione di AtN non sia sovrastimata quando si riportano le conclusioni15. Gli studi hanno suggerito che l'attivazione del promotore umano della GFAP (come utilizzato in questi studi) attraverso la cis-regolazione da parte di geni a valle (come Neurod1) può provocare l'espressione di GFAP nei neuroni endogeni, portando a un numero più elevato di neuroni marcati nel gruppo di trattamento15,32. Insieme, questi studi e i risultati qui riportati evidenziano l'importanza degli esperimenti di tracciamento del lignaggio, ad esempio, la pre-marcatura di astrociti o neuroni prima della somministrazione di AAV, per differenziare tra neuroni preesistenti ed endogeni durante l'analisi15.
Nel considerare i prossimi passi che potrebbero ridurre la trasduzione neuronale, sarebbero utili diversi sierotipi di AAV e/o l'uso di un promotore astrocitario-specifico meno promiscuo19. Un numero crescente di segnalazioni che descrivono l'eterogeneità degli astrociti può avere un ulteriore impatto sulla specificità dell'espressione genica se diverse sottopopolazioni di astrociti sono più suscettibili alla conversione di AtN in generale 37,38,39,40.
Anche l'età degli animali utilizzati nei modelli preclinici di lesioni o malattie è una considerazione importante che può introdurre esiti variabili. Ad esempio, nel caso del neurotrauma, l'età può influenzare la reattività degli astrociti, il che influenzerebbe i risultati dello studio per la conversione AtN41. Inoltre, le linee reporter cre-inducibili possono perdere la specificità di espressione nel tempo, il che può influire sulle misure di esito42. Ad oggi, la riprogrammazione negli animali più anziani non è stata studiata in modo completo43.
Il protocollo descrive la somministrazione di AAV in 2 fasi post-ictus: (1) la fase subacuta (a 7 giorni) e (2) la fase cronica (a 21 giorni) post-ictus ischemico. L'espressione ectopica di Neurod1 in un modello di ictus cronico non è stata esaminata; Quindi, l'osservazione che un numero significativamente maggiore di neuroni viene marcato in questa fase avanzata ha importanti implicazioni per gli studi futuri volti a promuovere il recupero dall'ictus nell'ictus cronico. Gli studi che esaminano il potenziale dell'espressione ectopica di Neurod1 per migliorare gli esiti dell'ictus dovranno incorporare valutazioni comportamentali, poiché gli esiti funzionali dopo l'ictus sono le misure di successo clinicamente più rilevanti per un intervento terapeutico 13,22,25,27.
Attualmente non sono disponibili trattamenti per i pazienti affetti da disabilità indotte da ictus nelle fasi subacute e croniche post-ictus, ad eccezione della riabilitazione, che ha un beneficio limitato. È stato dimostrato che l'espressione forzata dei geni neurogeni bHLH nella glia migliora gli esiti funzionali post-ictus22,30. I risultati sono coerenti con gli studi di riprogrammazione di AtN che dimostrano che l'espressione ectopica di Neurod1 aumenta la trasduzione neuronale a 3 e 7 settimane dopo la somministrazione di AAV rispetto ai topi che ricevono il vettore di controllo. Ancora più importante, diversi articoli hanno delineato raccomandazioni per i controlli dello studio, la progettazione e le interpretazioni nel campo della riprogrammazione AtN 17,18,19,22. A tal fine, questo protocollo ha descritto sistemi AAV e modelli murini per l'espressione ectopica di fattori di trascrizione dopo ictus, che possono essere utilizzati per informare e far avanzare ulteriori indagini sui meccanismi cellulari alla base delle osservazioni.