Principi attivi e obiettivi d'azione delle pillole Xiaoyao
Effettuando una ricerca nel database TCMSP e lo screening secondo i criteri di biodisponibilità orale (OB) ≥ 30% e proprietà farmaco-simili (DL) ≥ 0,18, è stata riscontrata l'esistenza di 125 principi attivi nelle pillole Xiaoyao. Tra questi, gli ingredienti 6, 4, 9, 13, 2, 6, 83 e 2 provenivano rispettivamente da Paeonia lactiflora bianca, Atractylodes macrocephala, Menthae herba, Chaihu, Angelica sinensis, Poria cocos, liquirizia e zenzero. Alcuni dei principi attivi sono riportati nella Tabella 1. Inoltre, dal database TCMSP sono stati ottenuti un totale di 879 target di principi attivi efficaci e 232 target sono rimasti dopo la conversione dell'ID e l'eliminazione dei valori duplicati.
Analisi di rete della MTC - Principio attivo - Bersaglio intersecante - Malattia
Diversi database sono stati cercati utilizzando la parola chiave osteoporosi per i geni associati alla malattia. Nel database GeneCards, 1692 geni sono stati ottenuti dopo il filtraggio secondo il punteggio di rilevanza ≥1. Un totale di 35 geni sono stati ottenuti nel database OMIM. C'erano 3, 33 e 386 geni nei database PharmGkb, TTD e DrugBank, rispettivamente. Successivamente, l'intersezione dei risultati di queste cinque banche dati è stata utilizzata per ulteriori analisi (Figura 1A). Uno dei geni che è stato rappresentato in quattro database era CALCR. Un totale di 102 geni intersecanti sono stati ottenuti dopo aver combinato i geni correlati alla malattia e aver preso l'intersezione con il bersaglio del farmaco (Figura 1B). Sulla base delle interazioni tra i bersagli della malattia e i principi attivi del farmaco, è stata costruita una rete di farmaci che intersecano il bersaglio della malattia con il software Cytoscape. Di conseguenza, sono state ottenute relazioni tra i componenti del farmaco e la regolazione polimorfica delle scansioni geniche correlate alla malattia (Figura 2A).
Nel database String, le interazioni proteiche sono state analizzate all'intersezione dei geni malattia e dei bersagli farmacologici per ottenere i loro diagrammi di rete di interazione (Figura 2B), e questi sono stati poi sottoposti a screening per le proteine più centrali (Figura 2C-D). I risultati hanno mostrato le interazioni più forti tra FOS, ESR1, MAPK3, TP53, MAPK1 e STAT3 tra i geni della malattia e i bersagli farmacologici (Figura 2E).
Analisi della funzione GO e dell'arricchimento della via KEGG
L'analisi dell'arricchimento OB ha mostrato un totale di 2177 voci, tra cui 1990 voci di processo biologico (BP), 58 voci di componenti cellulari (CC) e 129 voci di funzioni molecolari (MF). Nella BP, i geni si concentravano principalmente sulla risposta ai livelli di nutrienti, sulla risposta allo stress ossidativo e sulla risposta cellulare allo stress ossidativo. La MF si è concentrata sul legame del fattore di trascrizione legante il DNA, sul legame del fattore di trascrizione legante il DNA specifico per l'RNA polimerasi II, sull'attività del recettore nucleare, sull'attività del fattore di trascrizione attivato dal ligando e sull'attività delle citochine (Figura 3A-B).
Nell'analisi dell'arricchimento della via KEGG, sono state ottenute un totale di 168 vie di segnalazione correlate, e le più significative sono state la via di segnalazione AGE-RAGE, la via di segnalazione IL-17, la via di segnalazione TNF, la via di segnalazione HIF-1 e la differenziazione cellulare Th17 (Figura 3C-D). Si suggerisce che le pillole Xiaoyao possano esercitare effetti terapeutici sulla PMOM in diversi modi. L'infiammazione è fortemente associata all'osteoporosi e può essere accelerata dalla menopausa e l'IL-17 è un importante fattore infiammatorio7. Pertanto, il prossimo piano è quello di esplorare se le pillole Xiaoyao potrebbero trattare l'osteoporosi da una prospettiva infiammatoria rispetto all'IL-17.
Cambiamenti strutturali nel tessuto osseo prima e dopo la rimozione del tessuto ovarico
La colorazione HE ha mostrato che nei femori dei topi Sham, le trabecole erano disposte strettamente, con buona continuità, piccoli spazi tra le trabecole, fratture rare e dimensioni normali della cavità del midollo osseo. Rispetto al gruppo Sham, i femori del gruppo OVX erano scarsamente disposti, con gravi fratture delle trabecole, continuità interrotta e una cavità midollare marcatamente allargata, che mostrava alterazioni tipiche dell'osteoporosia (Figura 4A).
Confronto micro-CT tra i gruppi
I femori dei topi del gruppo OVX mostravano un reticolo trabecolare incompleto, una cavità midollare parzialmente vuota e un assottigliamento della corteccia ossea rispetto a quelli dei topi del gruppo Sham. Il gruppo di topi Sham ha mostrato un'abbondanza di trabecole, una buona continuità e un restringimento della cavità midollare nei loro femori (Figura 4B).
Effetti comportamentali delle pillole Xiaoyao sui topi
Durante il periodo di studio, ad eccezione del gruppo OVX, tutti i topi degli altri gruppi avevano migliori abitudini di vita, colore normale dei capelli, elevata mobilità e buona salute. L'urina e le feci di ciascun topo sono tornate alla normalità entro 1 settimana dopo il trattamento con le pillole Xiaoyao. Non ci sono stati morsi, infezioni della ferita, ostruzione gastrointestinale, distacco della sutura, necrosi cutanea dell'incisione o morte di nessuno dei topi. I topi del gruppo OVX erano inclini alla caduta dei capelli, all'oscuramento del colore dei capelli, alla mobilità ridotta, ai riflessi più lunghi, all'aumento dell'escrezione e alla diminuzione del mangiare e del bere.
Colorazione HE di sezioni patologiche di topi dopo intervento farmacologico
Nel gruppo Sham, il tessuto femorale era denso, reticolare e sistemato regolarmente. Le dimensioni e la continuità della cavità midollare erano normali e la spaziatura tra le trabecole ossee adiacenti era relativamente piccola. Rispetto al gruppo Sham, la corteccia femorale e l'osso spongioso nel gruppo OVX mostravano difetti evidenti, diminuzione delle trabecole, aumento delle lacune, continuità interrotta, assottigliamento della struttura, allargamento della cavità midollare e assottigliamento della corteccia ossea. Rispetto al gruppo OVX, le trabecole femorali dei topi nei gruppi trattati con farmaci (basse e alte dosi) apparivano strutturalmente intatte, con spaziatura ridotta, maggiore connettività, cavità del midollo osseo ristrette e strutture più dense (Figura 5A).
Rilevamento di indici di imaging nei topi dopo un intervento farmacologico
Rispetto al gruppo Sham, i femori dei topi del gruppo OVX avevano trabecole ossee rade e rotte e corteccia ossea assottigliata. Rispetto al gruppo OVX, i topi nel gruppo delle pillole Xiaoyao ad alto dosaggio avevano meno trabecole ossee fratturate, reticolazione ripristinata e un grado significativo di riduzione parziale della cavità del midollo osseo. Tuttavia, i topi trattati con pillole Xiaoyao a basso dosaggio avevano ancora trabecole ossee fratturate, sebbene ci fosse un aumento delle trabecole ossee e una riduzione della cavità del midollo osseo. La struttura trabecolare delle trabecole ossee del gruppo operato con sham ha mostrato maggiore continuità e completezza (Figura 5B).
Risultati immunoistochimici dei tessuti nei gruppi dopo l'intervento farmacologico
Act1 e IL-6 sono proteine chiave nella via di segnalazione di IL-17 e ALP e COL-1 sono geni osteogenici. L'espressione delle proteine ALP, COL-1, IL-6, IL-17 e Act1 porta alla formazione di granuli marrone chiaro o gialli sul tessuto osseo. I risultati dell'immunoistochimica hanno mostrato che i valori medi di densità ottica di ALP e COL-1 nel gruppo farmaco erano superiori a quelli del gruppo OVX dopo il trattamento con pillole di Xiaoyao e la differenza era statisticamente significativa (p < 0,05). I valori medi di densità ottica di IL-17, Act1 e IL-6 nel gruppo farmaco erano inferiori a quelli del gruppo OVX e la differenza era statisticamente significativa (p < 0,05; Figura 6). Le pillole di Xiaoyao hanno invertito il declino di ALP e COL-1 causato dall'ovariectomia, diminuendo l'espressione di diverse proteine chiave IL-17, IL-6 e Act1 nella via di segnalazione IL-17, il che suggerisce che il farmaco può esercitare i suoi effetti terapeutici attraverso questa via.

Figura 1: Analisi della rete dell'intersezione tra i principi attivi della fitoterapia cinese e i geni correlati alla malattia. (A) L'intersezione di geni correlati alla malattia, ottenuti dai database GeneCards, OMIM, PharmGkb, TTD e DrugBank. Questi sono rappresentati dai colori blu, rosso, verde, giallo e marrone con 1692, 35, 3, 33 e 386 geni, rispettivamente. L'intersezione è costituita dai geni associati alla malattia nei cinque database e la parte sovrapposta indica il numero di geni intersecanti in ciascun database. (B) Vengono mostrati i bersagli farmacologici (con il colore blu che indica questo set di dati, ovvero l'insieme di geni bersaglio ad azione farmacologica raccolti nel database TCMSP dopo la trasformazione dell'ID e la rimozione dei duplicati) e i geni correlati alla malattia (con il colore rosso che indica questo set di dati, che contiene tutti i geni dei cinque database sopra menzionati). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Interazione dei principi attivi della MTC con le reti di regolazione genica correlate alla malattia e le proteine core. (A) La rete di regolazione dei principi attivi e dei geni correlati alla malattia nella MTC mostra le relazioni di regolazione genica corrispondenti a ciascun ingrediente attivo nelle pillole Xiaoyao, con ogni ingrediente collegato al gene che regola. (B) I risultati dell'analisi dell'interazione proteina-proteina di geni intersecanti in STRING (i nodi della rete rappresentano proteine, gli Edge rappresentano associazioni proteina-proteina e collegamenti multipli indicano interazioni multiple tra due proteine). (C-E) Le interazioni proteiche ottenute da String sono state sottoposte a screening più volte. (C) La rete di interazione proteica è stata ottenuta dopo il primo screening e la parte evidenziata è la sua porzione centrale. (D) Il risultato del secondo screening e la parte evidenziata è la parte centrale. (E) La rete di interazione proteica più centrale nella rete di interazione proteica. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: Analisi dell'arricchimento GO e KEGG. (A-B) I risultati dell'analisi dell'arricchimento OB dei geni intersecanti sono divisi in 3 voci, Processo biologico (BP), Componente cellulare (CC) e Funzione molecolare (MF), e ogni voce mostra solo i primi 10 geni arricchiti in modo più significativo. (C-D) I risultati dell'analisi dell'arricchimento KEGG dei geni intersecanti (che mostrano i primi 30 più significativamente arricchiti). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: Definizione e valutazione del modello di topi ovariectomizzati. (A) Confronto della morfologia ossea metafisaria tra i gruppi operati con sham e quelli ovariectomizzati (10x). Nel gruppo OVX, le fratture trabecolari erano gravi, la continuità era interrotta e la cavità del midollo osseo era significativamente ingrandita, mentre nel gruppo sham, le fratture trabecolari erano rare e la cavità del midollo osseo era di dimensioni normali. (B) Scansioni micro-TC del femore nei gruppi operati con sham e ovariectomizzati. Nel gruppo OVX, la rete trabecolare era incompleta e la cavità del midollo osseo era parzialmente vuota. Nel gruppo Sham, le trabecole erano abbondanti e continue e la cavità del midollo osseo era stretta. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 5: Dosaggio HE e micro-CT dopo il trattamento con le pillole Xiaoyao. (A) Colorazione HE (10x) delle sezioni del femore dei topi in ciascun gruppo dopo il trattamento con le pillole Xiaoyao. Nel gruppo OVX, le trabecole ossee erano ridotte, la continuità era interrotta, la struttura era rada e la cavità midollare era allargata. Nel gruppo Sham, le trabecole ossee avevano una buona continuità, il tessuto femorale era strutturalmente denso e la cavità midollare era normale. Rispetto al gruppo OVX, le trabecole ossee nel gruppo farmacologico apparivano strutturalmente intatte, con una maggiore connettività, una ridotta cavità midollare e una struttura più densa rispetto al gruppo modello. (B) Confronto della micro-CT dei femori dei topi in ciascun gruppo dopo il trattamento con pillole Xiaoyao. Le trabecole ossee nei femori dei topi del gruppo ovariectomizzato erano rade e rotte, mentre il gruppo Sham aveva trabecole più continue e intatte. Rispetto al gruppo ovariectomizzato, i topi nel gruppo trattato con farmaci ad alte dosi avevano meno trabecole ossee rotte, struttura reticolare ripristinata e cavità del midollo osseo parzialmente ridotta, mentre gli animali nel gruppo con farmaci a basso dosaggio avevano più trabecole ossee e ridotta cavità del midollo osseo, ma le trabecole ossee rotte sono rimaste. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 6: Immunoistochimica per rilevare l'effetto delle pillole Xiaoyao sulla via di segnalazione IL-17 e sull'espressione della proteina genica marcatore osteogenico nei topi osteoporotici (40x). Le reazioni positive per la presenza di proteine ALP, COL-1, IL-6 e IL-17 e Act1 si sono manifestate con la comparsa di granuli marrone chiaro o gialli sul tessuto osseo. L'espressione di ALP e COL-1 nel gruppo farmaco era superiore a quella del gruppo OVX (p < 0,05). L'espressione di IL-17, Act1 e IL-6 nel gruppo farmaco era inferiore a quella nel gruppo OVX (p < 0,05). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
| Nome della medicina tradizionale cinese | ID molecolare | Nome della molecola |
| Paeonia lactiflora bianca | MOL001918 | paeoniflorgenone |
| Paeonia lactiflora bianca | MOL000211 | Mairin |
| Atractylodes macrocephala | MOL000022 | 14-acetil-12-senenecioil-2E,8Z,10E-atractylentriol |
| Atractylodes macrocephala | MOL000049 | 3β-acetossiacitractilone |
| Menthae Herba | MOL000471 | aloe-emodina |
| Menthae Herba | MOL005190 | eriodictyol |
| Chai Hu | MOL000354 | di isoramnetina |
| Chai Hu | MOL013187 | Cubebin |
| Angelica sinensis | MOL000449 | Stigmasterolo |
| Angelica sinensis | MOL000358 | beta-sitosterolo |
| Poria cocos | MOL000282 | ergosta-7,22E-dien-3beta-olo |
| Poria cocos | MOL000283 | Perossido di ergosterolo |
| Liquirizia | MOL002311 | Glicirolo |
| Liquirizia | MOL004990 | 7,2',4'-triidrossi - 5-metossi-3 - arilcumarina |
| Zenzero fresco | MOL006129 | 6-metilgingdiacetato2 |
| Zenzero fresco | MOL001771 | Poriferast-5-en-3beta-olo |
Tabella 1: Principi attivi in medicinali cinesi selezionati. La prima colonna elenca i nomi delle medicine tradizionali cinesi, la seconda colonna è l'ID del principio attivo della medicina cinese e la terza colonna è il nome del principio attivo nella medicina cinese.
File di codifica supplementare 1: nome dell'erba, ingrediente e codice di unione dell'ID di destinazione. Clicca qui per scaricare questo file.
File di codifica supplementare 2: Conversione dell'ID bersaglio del farmaco. Clicca qui per scaricare questo file.
File di codifica supplementare 3: File per l'analisi della rete. Clicca qui per scaricare questo file.
File di codifica supplementare 4: Conversione da simbolo a ID genico. Clicca qui per scaricare questo file.
File di codifica supplementare 5: Analisi dell'arricchimento GO. Clicca qui per scaricare questo file.
File di codifica supplementare 6: Analisi dell'arricchimento KEGG. Clicca qui per scaricare questo file.