Il presente rapporto descrive la procedura di esecuzione dell'imaging PET in vivo del topo con gli stampi BCAM e l'analisi dei dati con lo strumento SaaS automatizzato. Vengono fornite istruzioni dettagliate sulla preparazione del mouse, l'acquisizione delle immagini e l'elaborazione dei dati. Questo flusso di lavoro di automazione ha anche prodotto dati coerenti con l'analisi manuale. Di seguito sono evidenziate alcune considerazioni tecniche chiave.
Sebbene un tumore non sia uno degli organi definiti dall'OPM, un passaggio critico in questo protocollo è il corretto impianto di tumori sottocutanei per garantire in definitiva l'allineamento ottimale di tutti gli organi di topo all'interno della cavità corporea e BCAM. L'OPM può produrre dati accurati solo quando la colonna vertebrale di un topo è relativamente diritta e gli organi interni sono posizionati in modo neutro. Tumori eccessivamente grandi o fuori posto potrebbero influenzare la postura del topo e premere nella sua cavità corporea, spostando così gli organi interni. Questo cambiamento, a sua volta, distorcerà l'analisi quantitativa risultante dall'algoritmo OPM. Altri hanno riportato l'impatto di una colonna vertebrale non dritta sull'allineamento degli organi interni utilizzando varie modalità di imaging e algoritmi di segmentazione13,14. Pertanto, è fondamentale utilizzare il modello per guidare l'impianto del tumore e monitorare attentamente la crescita del tumore per garantire che i tumori siano posizionati correttamente e nell'intervallo di dimensioni ideali.
Un'altra area di possibile deviazione è la selezione di un BCAM di dimensioni adeguate. I BCAM sono creati in integrali da 2 g, con un intervallo di 18-26 g. Tuttavia, poiché i topi con composizioni corporee diverse (ad esempio, più muscoli contro più grasso) possono avere lo stesso peso corporeo ma dimensioni fisiche diverse, è importante scegliere il BCAM più adatto utilizzando il loro peso corporeo come riferimento generale. Sali o scendi di livello per tentativi ed errori e tieni presente che il corretto allineamento è fondamentale. La scelta di un BCAM troppo grande farà sì che gli organi interni del topo "affondino" più vicino al fondo del letto, il che influirà in particolare sull'accuratezza dell'analisi per gli organi dorsali come i reni e la colonna vertebrale. Al contrario, posizionare un topo in BCAM troppo piccolo potrebbe premere sulle cavità del corpo, inclinare il posizionamento degli organi e potenzialmente causare difficoltà respiratorie. L'uso del nastro adesivo per garantire che gli arti siano fissati sulle piattaforme delle zampe aiuterà con l'installazione e il posizionamento.
Sebbene questo flusso di lavoro riportato consenta un'analisi standardizzata e automatizzata delle immagini PET, vale la pena sottolineare che l'attuale OPM è costruito sulla base del ceppo di topo immunocompetente C57BL/6 e di topi sani. Altri ceppi e condizioni di salute dei topi possono presentare diverse caratteristiche anatomiche che richiedono ulteriori regolazioni, ottimizzazioni e convalida dell'algoritmo. Ad esempio, i ceppi immunodeficienti come NSG o NCG hanno milze più piccole. Allo stesso modo, i topi portatori di impianti tumorali ortotopici possono avere dimensioni, forme e posizioni diverse degli organi interni a seconda del loro stato di malattia. Un'altra limitazione di questo flusso di lavoro è la produttività complessiva durante la fase di acquisizione di un esperimento. Ciò è dovuto principalmente al tempo aggiuntivo necessario per impostare correttamente un mouse nel BCAM. La formazione e la pratica potrebbero aumentare l'efficienza dell'operatore nel corretto posizionamento. L'aggiunta di una seconda docking station può anche aumentare la produttività complessiva, in cui un dock può servire per la configurazione BCAM e l'altro può servire per rimuovere un mouse in una gabbia di recupero. Tuttavia, anche con l'aumento del tempo necessario per la configurazione della BCAM prima della scansione, l'investimento in termini di tempo si ripaga risparmiando tempo sul lato dell'analisi dei dati. Ad esempio, nel presente studio, l'OPM ha impiegato meno di 10 minuti per analizzare dieci immagini (con 4 ROI), mentre un analista di grande esperienza ha impiegato 3-4 ore per segmentare e analizzare manualmente lo stesso set di immagini e ROI. Un analista inesperto richiederebbe ancora più tempo per l'analisi manuale. La piattaforma SaaS consente l'analisi di scansioni PET in grandi lotti, dove l'analisi completa della biodistribuzione in vivo può essere completata in pochi minuti dopo il caricamento dei dati. Si tratta di una funzionalità estremamente utile quando si gestiscono grandi quantità di dati provenienti da più gruppi e/o in diversi punti temporali, come illustrato di seguito.
La segmentazione manuale degli organi per un singolo soggetto può richiedere molto tempo e di solito richiede una significativa formazione iniziale dell'operatore. Anche con un'adeguata formazione, le analisi manuali si scontrano inevitabilmente con variabilità interoperatorie, che possono distorcere i risultati quantitativi15,16. Al contrario, la segmentazione automatizzata e l'analisi dei dati possono determinare in modo accurato ed efficiente la biodistribuzione complessiva di un radiotracciante ed eliminare le variabilità radicate nelle operazioni umane. Tali vantaggi dell'automazione sono stati osservati sia nell'analisi delle immagini cliniche che nello spazio preclinico. Ad esempio, Sluis et al. hanno dimostrato che una singola scansione richiedeva 4 ore per segmentare gli organi di interesse rispetto ai 30 minuti dei metodi basati su cloud di intelligenza artificiale17. Un altro studio di Nazari et al. ha anche riportato che l'analisi basata su algoritmi del fegato e dei reni ha dimostrato risultati accurati entro il 7,0% rispetto a due fisici medici umani18. I dati nella Figura 4 hanno anche mostrato chiaramente l'affidabilità del flusso di lavoro di analisi dell'imaging PET basato su SaaS e che l'analisi automatizzata ha prodotto risultati coerenti rispetto all'analisi manuale.
In sintesi, questo articolo illustra il flusso di lavoro dell'utilizzo degli stampi BCAM per facilitare l'acquisizione standardizzata di immagini PET/CT precliniche e l'analisi automatizzata dei dati PET abilitata per SaaS. È dimostrato che questa tecnologia di piattaforma è relativamente semplice da utilizzare e che la qualità dei dati generati dall'automazione è coerente con l'analisi manuale, ma vanta notevoli vantaggi in termini di risparmio di tempo. Pertanto, questo flusso di lavoro può far risparmiare ai ricercatori centinaia di ore di tempo per l'analisi dei dati e aiutare a standardizzare e ridurre la variabilità tra gli operatori. Questa procedura può aiutare nello sviluppo di una moltitudine di composti farmacologici attraverso modalità e indicazioni. In particolare, le modalità di grandi molecole come gli anticorpi terapeutici, gli attivatori di cellule immunitarie anticorpali bi-specifici, i coniugati anticorpo-farmaco e persino le nanoparticelle possono essere facilmente marcate con radiometalli (ad esempio, Zr-89, Cu-64) per consentire la valutazione della biodistribuzione mediata dall'imaging PET19,20. Allo stesso modo, questa tecnologia di piattaforma può aiutare a determinare la dosimetria di nuove terapie radio nei topi21. L'applicazione di questa procedura sarà un grande valore aggiunto per lo sviluppo di farmaci.