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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Il presente protocollo descrive un nuovo metodo per evitare la contaminazione del sangue nel liquido di lavaggio nasale murino (NLF). Poiché questo metodo garantisce la raccolta dell'NLF senza contaminazione del sangue, consente rilevamenti più accurati dei componenti immunologici e di vari agenti patogeni respiratori.
I campioni delle vie aeree superiori, tra cui il liquido di lavaggio nasale (NLF) e i tamponi nasali, sono utili per rilevare agenti patogeni, inclusi virus e batteri, che possono causare malattie respiratorie. La NLF è stata utilizzata per esaminare i componenti cellulari e umorali del sistema respiratorio, ad esempio per valutare l'induzione dell'immunoglobulina (Ig) A in seguito alle vaccinazioni della mucosa. Nei roditori sperimentali, i campioni di NLF possono essere raccolti per via trans-faringea o trans-tracheale. Sebbene sia stato riportato che la via transfaringea è più efficiente nella raccolta dei campioni di NLF rispetto alla via trans-tracheale, i campioni di NLF raccolti per via transfaringea erano spesso contaminati da sangue, influenzando i livelli di contenuto cellulare e umorale nei campioni originali di NLF. Pertanto, questo studio mirava a stabilire un nuovo metodo di raccolta NLF nei topi sperimentali per ridurre al minimo la contaminazione del sangue. In breve, prima che la mascella inferiore del topo fosse separata, venivano messi dei batuffoli di cotone in bocca per assorbire il sangue. Quando l'emorragia è stata fermata, i campioni NLF sono stati raccolti inserendo una micropipetta nella coana e lavandoli due volte con 200 μL di soluzione salina tamponata con fosfato (volume finale: 400 μL/topo). Per rilevare la contaminazione del sangue, è stato utilizzato un test forense del luminol semplice e sensibile che rileva l'emoglobina. Il test del luminol ha dimostrato che la contaminazione del sangue era rilevabile nei campioni NLF raccolti con il metodo convenzionale (senza batuffoli di cotone), ma non in quelli raccolti con il nuovo metodo (con batuffoli di cotone). A causa della contaminazione del sangue, le concentrazioni totali di IgA e IgG nei campioni NLF erano più elevate nel metodo convenzionale rispetto al nuovo metodo; è noto che il sangue contiene livelli molto più elevati di IgA e IgG rispetto all'NLF. Pertanto, questo metodo unico può essere utilizzato come metodo semplice e sensibile per raccogliere campioni di NLF da topi sperimentali per prevenire la contaminazione del sangue.
Sia nella ricerca clinica che in quella di base, i metodi di raccolta dei campioni appropriati sono fondamentali per valutare i risultati. La lavanda nasale è una tecnica di irrigazione utilizzata per analizzare le componenti cellulari e umorali delle vie respiratorie 1,2,3. Clinicamente, il liquido di lavaggio nasale (NLF) è stato utilizzato come campione non invasivo efficace per la scoperta di biomarcatori, con diversi studi a sostegno del suo uso in varie malattie respiratorie, tra cui sinusite, fibrosi cistica e disturbi respiratori generali 4,5,6,7. Negli animali da esperimento, l'NLF è stato utilizzato anche per studiare modelli di malattie respiratorie, tra cui l'influenza, la malattia da coronavirus-2019 (COVID-19) e la malattia allergica 3,8,9. Questo metodo è ampiamente utilizzato per determinare i principali biomarcatori infiammatori, come le cellule polimorfonucleate e le citochine, che vengono spesso esaminate come indicatori di risposte ad allergeni, asma e infezioni respiratorie 10,11,12. Più recentemente, per studiare l'efficacia e la sicurezza di potenziali candidati vaccini intranasali, i campioni di NLF sono stati spesso raccolti da animali da esperimento e i livelli di patogeno e immunoglobulina (Ig) nei campioni di NLF sono stati quantificati come indicatori13.
Nei topi sperimentali, l'NLF può essere raccolto utilizzando il metodo trans-faringeo o trans-tracheale. Nel metodo trans-faringeo, la testa murina, compresa la regione palatofaringea, è stata separata dalla laringe, quindi un catetere è stato inserito attraverso l'apertura faringea nella coana per iniettare soluzione salina tamponata con fosfato (PBS) e raccogliere NLF dalla narice14. Il metodo trans-tracheale ha ottenuto l'accesso al tratto respiratorio attraverso la trachea senza recidere la testa e l'NLF è stato raccolto dalla narice, riducendo al minimo il rischio di contaminazione del sangue. Sebbene questi due metodi primari siano stati impiegati per la raccolta di NLF nei topi sperimentali, entrambi i metodi convenzionali hanno i loro limiti. È stato dimostrato che il metodo trans-tracheale produce quantità inferiori di NLF rispetto al metodo trans-faringeo a causa della fuoriuscita di liquido di lavaggio trans-tracheale nella cavità orale. Lo studio precedente ha dimostrato che, dopo l'iniezione di PBS, i volumi di fluido recuperati nella NLF erano rispettivamente del 70%-80% e del 90%-100% nei metodi trans-tracheale e trans-faringeo. Sebbene il metodo trans-faringeo possa essere considerato migliore con quantità maggiori di NLF rispetto al metodo trans-tracheale, la contaminazione del sangue durante la procedura era inevitabile in una certa misura14,15. Allo stesso modo, diversi studi hanno riportato che i campioni di NLF erano spesso contaminati da alti livelli di proteine sieriche del sangue 16,17,18. Ciò può interferire con il rilevamento e la quantificazione di biomarcatori specifici per NLF per le malattie respiratorie19. Ciò può anche influenzare le concentrazioni di Ig, in particolare IgA e IgG, nei campioni di NLF poiché il sangue contiene quantità maggiori di IgA e IgG rispetto all'NLF.
Per affrontare queste sfide, questo studio mirava a stabilire un metodo transfaringeo unico, semplice e affidabile per la raccolta di campioni di NLF da topi sperimentali, massimizzando la resa del campione e riducendo al minimo la contaminazione del sangue. Durante i processi sperimentali, i batuffoli di cotone sono stati inseriti nella bocca del topo per inibire la contaminazione del sangue, quindi è stato iniettato il PBS per raccogliere campioni di NLF dalla narice. I livelli di contaminazione ematica nell'NLF sono stati determinati utilizzando una tecnica forense, la chemiluminescenza a base di luminolo, che consente la semi-quantificazione dei livelli di emoglobina (Hb) nei campioni di NLF; la reazione del luminol nell'NLF raccolto con il nuovo metodo è risultata negativa. Pertanto, l'attuale nuovo metodo può migliorare la qualità del campione NLF per vari esperimenti biologici, come i saggi di immunoassorbimento enzimatico anticorpale (ELISA), i profili delle citochine, le determinazioni immunologiche e mediche dei biomarcatori e i modelli di malattia respiratoria murina.
Tutte le procedure sperimentali sono state approvate dall'Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) della Facoltà di Medicina dell'Università di Kindai ed eseguite secondo i criteri delineati dal National Institutes of Health (NIH)20. In questo studio sono stati utilizzati topi maschi C57BL/6 di 4 mesi. Le informazioni sui reagenti e sulle attrezzature utilizzate in questo studio sono elencate nella Tabella dei materiali.
1. Raccolta NLF
2. Rilevamento della contaminazione ematica mediante chemiluminescenza del luminol
3. Quantificazione di IgA e IgG mediante ELISA
Utilizzando il metodo convenzionale o innovativo, i campioni di NLF sono stati raccolti da topi C57BL/6 attraverso la via transfaringea. Come mostrato nella Figura 1, i campioni NLF raccolti con il metodo convenzionale erano leggermente sfumati di rosa (Figura 1A); i campioni di NLF raccolti con il nuovo metodo erano chiari (Figura 1B). Poiché la differenza sembrava derivare dalla contaminazione del sangue nei campioni NLF con il metodo convenzionale, la contaminazione del sangue nei campioni NLF è stata esaminata utilizzando una reazione con luminol. Come mostrato nella Figura 2, la chemiluminescenza nei campioni NLF raccolti con il metodo convenzionale era positiva, indicando una contaminazione del sangue (Figura 2A). D'altra parte, la chemiluminescenza nei campioni NLF raccolti con il nuovo metodo era negativa (Figura 2B). Per negare plausibili tendenze emorragiche nei topi, è stato raccolto anche il liquido di lavaggio broncoalveolare (BALF) utilizzando il metodo trans-tracheale standard; il campione BALF non presentava alcuna contaminazione ematica. Questi risultati hanno dimostrato che il nuovo metodo di raccolta NLF era superiore a quello convenzionale.
Per determinare se la contaminazione ematica nei campioni di NLF potesse influenzare le concentrazioni di IgA e IgG, i livelli di IgA e IgG nei sieri e NLF sono stati quantificati mediante ELISA. Come mostrato nella Figura 3, i livelli sierici di IgA e IgG erano simili tra i due metodi; le concentrazioni di IgA (Figura 3A) e IgG (Figura 3B) erano molto più alte nei sieri che nella NLF. I livelli di IgA nei campioni NLF tendevano ad essere più bassi nel nuovo metodo rispetto al metodo convenzionale (P < 0,1, t-test di Student); le concentrazioni di IgG nei campioni NLF erano significativamente più basse nel nuovo metodo rispetto al metodo convenzionale (P < 0,05, t-test di Student). Pertanto, la contaminazione del sangue con il metodo convenzionale sembrava produrre concentrazioni di anticorpi IgA e IgG imprecise nei campioni NLF; Il nuovo metodo era più preciso del metodo convenzionale.

Figura 1: Raccolta del liquido di lavaggio nasale (NLF) con il metodo convenzionale o innovativo. (A) Nel metodo convenzionale, l'NLF è stato contaminato con sangue e il colore del campione di NLF è diventato rosa pallido. (B) Nel nuovo metodo, non c'era contaminazione ematica nella NLF. (A,B) In entrambi i gruppi, il liquido di lavaggio broncoalveolare (BALF) raccolto per via trans-tracheale era chiaro. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Contaminazione del sangue rilevata dalla reazione con luminol. (A,B) Due μL di campioni NLF e BALF sono stati aggiunti in una piastra a 96 pozzetti e miscelati con 100 μL di una soluzione di luminol diluita. Il segnale di chemiluminescenza blu-bianco è stato rilevato nel campione di NLF contaminato raccolto con il metodo convenzionale (A), ma non rilevabile nel campione di NLF raccolto con il nuovo metodo (B). I campioni di sangue e BALF sono stati utilizzati rispettivamente come controlli positivi e negativi. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: Quantificazione delle concentrazioni di IgA e IgG in campioni di siero, NLF e BALF mediante saggi di immunoassorbimento enzimatico (ELISA). (A,B) L'NLF è stato raccolto dai topi utilizzando il metodo convenzionale (barra aperta) e il nuovo metodo (barra chiusa); anche il siero e il BALF sono stati raccolti dagli stessi topi. Le concentrazioni di IgA e IgG sono state quantificate mediante ELISA. I campioni di siero avevano livelli molto più elevati di IgA e IgG rispetto ai campioni NLF e BALF. Nella NLF, le concentrazioni di IgA tendevano ad essere più basse e le concentrazioni di IgG erano significativamente più basse nel nuovo metodo rispetto al metodo convenzionale (IgA, P < 0,1; IgG, P < 0,05, test t di Student). I risultati sono la media + l'errore standard della media di sei topi per gruppo. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Il presente protocollo descrive un nuovo metodo per evitare la contaminazione del sangue nel liquido di lavaggio nasale murino (NLF). Poiché questo metodo garantisce la raccolta dell'NLF senza contaminazione del sangue, consente rilevamenti più accurati dei componenti immunologici e di vari agenti patogeni respiratori.
Ringraziamo Seiichi Omura, Ph.D., Cong Thanh Nguyen, M.D., Ph.D., Kota Moriguchi, M.D., Ph.D., Reona Shiro, M.D., e Sandesh Rimal, M.S., Dipartimento di Microbiologia, Facoltà di Medicina dell'Università di Kindai, e Hirotaka Ebina, Ph.D., Shinya Okamura, Ph.D., e Yasuo Yoshioka, Ph.D., Virus Vaccine Group (Gruppo di vaccini antivirali), BIKEN Innovative Vaccine Research Alliance Laboratories, Istituto di ricerca per le malattie microbiche, Università di Osaka, per utili discussioni. Esprimiamo anche la nostra gratitudine ai membri del Life Science Research Institute, Kindai University, per la loro eccellente assistenza tecnica. Questo lavoro è stato sostenuto dal Ministero dell'Istruzione, della Cultura, dello Sport, della Scienza e della Tecnologia, Giappone, attraverso la borsa di studio Monbukagakusho (MEXT, 2021-2025) (IA), la sovvenzione in aiuto per la ricerca scientifica KAKENHI della Società giapponese per la promozione della scienza (JSPS) JP23K06493 (FS), JP21K07287/JP24K10500 (AMP) e JP22K18378/JP24K10163 (IT) e la sovvenzione per il miglioramento della ricerca dell'Università Kindai KD2406 (FS) e KD2506 (IT).
| Ago per fissazione animale | Natsume Seisakusho Co., Ltd., Tokyo, Giappone | KN-358-A | Abbiamo fissato un topo con aghi per la fissazione animale. Acciaio inossidabile; lunghezza totale, 23 mm; e punta dell'ago, 15 mm. |
| BD OptEIATM Set di reagenti per substrato TMB | BD Biosciences, San Diego, CA, USA | 555214 | Abbiamo aggiunto 100 μ L di soluzione di substrato TMB per pozzetto. |
| Campana di vetro | NA | NA Abbiamo | usato una campana di vetro per l'anestesia. |
| Piastre a 96 pozzetti trasparenti a fondo piatto non sterili | ThermoFisher Scientific, Rochester, NY, USA | 442404 | Abbiamo utilizzato piastre a 96 pozzetti Clear Flat-Bottom Immuno Nonsterile con trattamento superficiale MaxiSorp per saggi di immunoassorbimento enzimatico. |
| Batuffolo di cotone | Sansho Co., Ltd., Tokyo, Giappone | 94-1951 | Abbiamo usato batuffoli di cotone per evitare la contaminazione del sangue. Il diametro dei batuffoli di cotone era di 7 mm. |
| Siero fetale bovino | Sigma-Aldrich Co., St. Louis, MO, USA | 172012-500 ML | Abbiamo aggiunto il 10% di siero fetale bovino al diluente del saggio. |
| Forcipe (Micro pinzette per esperimenti di ricerca, punta curva) | Sansho Co., Ltd., Tokyo, Giappone | 91-1506 | Abbiamo usato le pinze per la dissezione. Modello, HSC 551-10; e su tutta la lunghezza, 105 mm. |
| Forcipe (pinzette di precisione) | Sansho Co., Ltd., Tokyo, Giappone | 91-2772 | Abbiamo usato il forcipe per la dissezione. Modello, HSC 607-12; tutta la lunghezza complessiva, 120 mm; e diametro della punta, 0,3 mm. |
| Capra Anti-Topo IgA-UNLB | SouthernBiotech, Birmingham, AL, USA | 1040-01 | Abbiamo rivestito Clear-Flat-Bottom Immuno Nonsterile 96-Well Plates con 100 μ L/pozzetto (20 ng/pozzetto) di immunoglobulina A totale. |
| Isoflurano | Viatris Inc., Canonsburg, PA, USA | NA | Abbiamo usato l'isoflurano per l'anestesia. |
| Set di reagenti per la retrazione del luminol | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation, Osaka, Giappone | 124-06511 | Abbiamo utilizzato un set di reagenti per la reazione del luminol per rilevare l'emoglobina nei campioni NLF. |
| Microtube | Watson Co., Ltd., Tokyo, Giappone | 131-7155C | Abbiamo utilizzato microprovette per la raccolta di NLF e BALF (microprovette da 1,5 mL con tappo di bloccaggio, fondo rotondo, tappo soft touch). |
| Milli-Q acqua | Merck KGaA, Darmstadt, Germania | Milli-Q Direct 8 | Abbiamo utilizzato l'acqua MilliQ per realizzare una soluzione di rezione in luminol. |
| Mini-Shaker PSU-2T | Biosan Ltd., Riga, Lettonia | PSU-2T | Abbiamo agitato piastre a 96 pozzetti utilizzando il Mini-Shaler PSU-2T. |
| Ceppo di topo | CLEA Japan, Inc., Tokyo, Giappone | NA | abbiamo usato topi maschi C57BL/6 di 4 mesi. |
| Nunc MicroWell 96-Well, Nunclon Delta-Treatated, Micropiastra a fondo piatto | Thermo Fisher Scientific Nunc A/S . Kamstrupvej,Roskilde, Danimarca | 136101 | Per il test del luminol abbiamo utilizzato la micropiastra NuncTM MicroWellTM 96-Well, Nunclon con trattamento Delta, a fondo piatto. |
| AffiniAffiniPure F(ab')2 Frammento di capra IgG anti-topo, F(ab')2 Frammento specifico (reazione crociata minima alle proteine del siero umano, bovino e cavallo) | Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc., West Grove, PA, USA | 115-036-072 | Abbiamo aggiunto 100 μ L del frammento AffiniPure F(ab')2 coniugato con perossidasi anti-topo IgG di capra, F(ab')2 frammento specifico, come anticorpo di rilevamento (diluizione di 10.000 volte) per ciascun pozzetto. |
| Soluzione salina tamponata con fosfato | Sigma-Aldrich Co., St. Louis, MO, USA | D8537-500ML | Abbiamo utilizzato la soluzione salina tamponata con fosfato di Dulbecco (modificata senza cloruro di calcio e cloruro di magnesio, liquida, filtrata in modo sterile, adatta per la coltura cellulare) per la raccolta di NLF e BALF. |
| Pipetta | Watson Co., Ltd., Tokyo, Giappone | NA | Abbiamo usato un 200-μ L. pipetta per lavaggio nasale. |
| Puntale per pipetta | Watson Co., Ltd., Tokyo, Giappone | NA | Abbiamo usato un 200-μ L punta per pipetta multifit per lavaggio nasale. |
| Poliossietilene(20) Monolaurato di sorbitano (Tween 20) | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation, Osaka, Giappone | 167-11515 | Abbiamo aggiunto lo 0,05% di Tween 20 al tampone di lavaggio e lo 0,2% di Tween 20 al diluente del saggio. |
| Anticorpo IgG (reattività x minima) di capra purificata | BioLegend, San Diego, CA, USA | 405301 | Abbiamo rivestito piastre a 96 pozzetti Clear Flat-Bottom Immuno Nonsterile con 100 μ L/pozzetto (10 ng/pozzetto) di immunoglobulina totale G. |
| Forbici piccole, a doppia punta | Sansho Co., Ltd., Tokyo, Giappone | 91-7005 | Abbiamo usato le forbici per la dissezione. Modello, S-4A; e complessivamente tutta la lunghezza, 115 mm. |
| Acido solforico | Wako Pure Chemical Industries, Ltd, Tokyo, Giappone | 192-04755 | Abbiamo aggiunto 50 μ L di acido solforico 2 N a ciascun pozzetto per fermare la reazione. |
| Catetere endovenoso Surflo | Terumo Corporation, Tokyo, Giappone | SR-FS2032 | Abbiamo utilizzato un catetere endovenoso surflo e iniettato PBS nella trachea per il lavaggio broncoalveolare. Catetere, 20G; lunghezza del catetere, 32 mm; diametro interno del catetere, 0,80 mm; diametro esterno del catetere, 1,1 mm; e needel interno, 22G. |
| Forbici diritte chirurgiche | Sansho Co., Ltd., Tokyo, Giappone | 91-7004 | Abbiamo usato le forbici per la dissezione. Modello, S-3B; e su tutta la lunghezza, 120 mm. |
| Piastra chirurgica | Natsume Seisakusho Co., Ltd., Tokyo, Giappone | KN-321-B | Abbiamo usato un pannello di sughero per la dissezione. Profondità, 20 cm; larghezza, 15 cm; e altezza 3 cm. |
| Lettore di micropiastre multimodale ibrido Synergy H1 | Agilent Technologies, Inc., Santa Clara, CA, USA | NA | Abbiamo misurato l'assorbanza dei campioni a 450 nm, utilizzando il lettore di micropiastre multimodale ibrido Synergy H1. |
| Siringa | Terumo Corporation, Tokyo, Giappone | SS-01T | Abbiamo utilizzato una siringa da 1 ml per il prelievo di sangue dal cuore. |
| Filettatura | Niccho Kogyo Co., Ltd. Tokyo Giappone | NA | Abbiamo legato un catetere con un filo per garantire il corretto posizionamento durante la procedura. |