Coltura di cellule PC12
La linea cellulare PC12 è stata propagata nel terreno di crescita del Roswell Park Memorial Institute 1640 (RPMI-1640) contenente il 10% di siero fetale bovino (FBS) e l'1% di penicillina/streptomicina, con manutenzione ordinaria in condizioni di coltura standard (37 °C, 5% CO2 atmosfera umidificata). Per le procedure sperimentali, le cellule aderenti sono state piastrate su recipienti di coltura e lasciate proliferare fino a raggiungere monostrati quasi confluenti (circa il 90% di copertura superficiale). La dissociazione cellulare è stata ottenuta attraverso un trattamento enzimatico con una soluzione di tripsina-EDTA allo 0,25%, seguita da tre cicli successivi di subcoltura per garantire la stabilità della popolazione. Le cellule trattate sono state successivamente assegnate per applicazioni sperimentali a valle e valutazioni analitiche.
Saggi di vitalità cellulare
La vitalità cellulare è stata valutata per valutare la citotossicità dell'emina e della locostatina sulle cellule PC12, seguendo le istruzioni fornite dal produttore del kit di analisi. Le cellule PC12 sono state seminate uniformemente in piastre a 96 pozzetti e coltivate con emina o locostatina per 24 ore. Dopo il lavaggio con soluzione salina tamponata con fosfato (PBS), le cellule sono state incubate in terreno RPMI-1640 contenente una soluzione salina di tetrazolio al 10% per 90 minuti a 37 °C. I valori di densità ottica (OD) sono stati quindi misurati a 450 nm utilizzando un lettore di micropiastre.
Reazione a catena quantitativa a trascrizione inversa della polimerasi (RT-qPCR)
L'RNA totale è stato estratto dalle cellule PC12 utilizzando il reagente di estrazione dell'RNA. In primo luogo, il campione è stato omogeneizzato nel reagente di estrazione, garantendo una lisi completa. Alla miscela è stato aggiunto cloroformio, agitato energicamente e centrifugato per separare le fasi (12.000 × g, 15 min, 4 °C). La fase acquosa contenente l'RNA è stata raccolta e l'RNA è stato precipitato aggiungendo isopropanolo (fase acquosa: iPrOH = 1:1) e incubando a temperatura ambiente. La centrifugazione è stata eseguita per pellettare l'RNA (12.000 × g, 10 min, 4 °C), è stato aggiunto 1 mL di etanolo al 70% per rimuovere le impurità e, infine, il pellet di RNA è stato sciolto in acqua priva di RNasi per la conservazione a -80 °C. I modelli di DNA complementare (cDNA) sono stati generati mediante trascrizione inversa con l'RT Master Mix. I modelli risultanti sono stati quindi diluiti con un rapporto 1:5 e sottoposti a PCR quantitativa in tempo reale su uno strumento di PCR in tempo reale. Ogni campione è stato amplificato in triplice copia ed è stata calcolata la media della quantità relativa di prodotto della PCR. I primer utilizzati sono elencati nella Tabella 1, con la β-actina che funge da gene per la pulizia. La concentrazione relativa di mRNA è stata determinata utilizzando la formula E = 2−ΔΔCt e il valore del ciclo di soglia critica (CT) è stato registrato per ciascuna reazione.
Saggi intracellulari delle specie reattive dell'ossigeno (ROS) e dell'idroperossido lipidico (LPO)
I livelli di ROS e LPO sono stati misurati utilizzando la citometria a flusso. Le cellule PC12 sono state trattate con emina (80 μM), locostatina (5 μM) e ML385 (5 μM) per 24 ore e lavate 3 volte con PBS in piatti. Le cellule sono state poi incubate a 37 °C con CO2 al 5% per 40 minuti in presenza di 2',7'-diclorodiidrofluoresceina diacetato (DCFH-DA), una sonda ROS, e BODIPY 581/591 C11, una sonda LPO. Dopo i lavaggi PBS per rimuovere le sonde in eccesso, l'intensità della fluorescenza è stata misurata mediante citometria a flusso. È stata applicata una strategia di gating coerente su tutti i campioni: in primo luogo, le celle sono state gated su FSC-A rispetto a SSC-A per escludere i detriti, quindi le singole cellule sono state selezionate tramite gating FSC-A rispetto a FSC-H. Le cellule non colorate e le cellule trattate con la sola emina sono state utilizzate come controlli negativi e positivi per stabilire la compensazione della fluorescenza e i gate. I dati sono stati analizzati utilizzando il software collegato.
Estrazione proteica e western blot
Estrazione totale delle proteine
Il surnatante delle cellule PC12 trattate è stato scartato, seguito da tre lavaggi con PBS ghiacciato. Le cellule sono state raccolte utilizzando la tripsina e centrifugate a 200 × g per 5 minuti. Dopo aver rimosso il surnatante, il pellet cellulare è stato omogeneizzato in tampone di lisi RIPA (Radio-Immunoprecipitation Assay) a freddo contenente il 10% di inibitore della proteasi e il 10% di inibitore della fosfatasi. Dopo un'incubazione di 30 minuti su ghiaccio, il lisato è stato centrifugato a 12.000 × g per 15 minuti a 4 °C. Il surnatante limpido è stato miscelato con il tampone di carico (4:1) e riscaldato a 95 °C per 5 minuti per denaturare le proteine. I campioni di proteine sono stati conservati a -80 °C per un uso successivo.
Analisi del western blot
Le proteine sono state separate mediante SDS-PAGE utilizzando un gel di impilamento e un gel risolutivo, con campioni caricati in pozzetti. L'elettroforesi è stata eseguita a 80 V per il gel di impilamento e a 120 V per il gel risolutivo. Le proteine sono state trasferite su una membrana di fluoruro di polivinilidene (PVDF) (pre-attivata in metanolo per 1 minuto) utilizzando un sistema di trasferimento a una corrente costante di 300 mA per 1-2 ore. La membrana è stata bloccata con latte scremato al 5% in TBST per 2 ore a temperatura ambiente per evitare legami aspecifici. Dopo tre lavaggi con TBST (10 minuti ciascuno), la membrana è stata incubata per una notte a 4 °C con i seguenti anticorpi primari diluiti in TBST: Coniglio anti-ACSL4 (1:1.000), Coniglio anti-GPX4 (1:1.000), Coniglio anti-HO-1 (1:2.000), Coniglio anti-NRF2 (1:1.000), Coniglio anti-RKIP (1:1.500) e Topo anti-β-actina (1:5.000). La membrana è stata lavata per 3 x 10 minuti con TBST e incubata con anticorpi secondari coniugati con HRP per 2 ore a temperatura ambiente: IgG anti-topo di capra marcate con HRP (1:1.000), IgG anti-coniglio marcate con HRP (1:1.000). Dopo ulteriori lavaggi TBST per 3 x 5 minuti, i segnali proteici sono stati visualizzati utilizzando un kit ECL Western Blot e quantificati utilizzando il software ImageJ.
Colorazione in immunofluorescenza
Le cellule sono state seminate su vetrini coprioggetti pre-posizionati in piastre di coltura e lasciati aderire. Dopo i trattamenti sperimentali, il surnatante è stato scartato e le cellule sono state lavate 3 volte con PBS. Le cellule sono state fissate con paraformaldeide al 4% (PFA) per 15 minuti a temperatura ambiente, seguite da tre lavaggi PBS. Successivamente, le cellule sono state permeabilizzate con Triton X-100 allo 0,1% per 10 minuti a temperatura ambiente e lavate 3 volte con PBS. Il legame aspecifico è stato bloccato mediante incubazione con albumina sierica bovina (BSA) al 3% per 30 minuti a temperatura ambiente. Gli anticorpi primari sono stati applicati durante la notte a 4 °C: Coniglio anti-HO-1 (1:500), Coniglio anti-NRF2 (1:500). Dopo tre lavaggi PBS il giorno successivo, le cellule sono state incubate con anticorpi secondari fluorescenti al buio per 1 ora a temperatura ambiente: Alexa Fluor 488-marcato con Goat Anti-Rabbit IgG (1:500). Dopo i lavaggi finali, i campioni sono stati montati con un terreno di montaggio contenente 4',6-diamidino-2'-fenilindolo (DAPI) per la controcolorazione nucleare. Le immagini sono state acquisite utilizzando un microscopio a scansione laser confocale.
Analisi statistica
I dati di misurazione sono stati espressi come media ± deviazione standard (S.D.). Per l'analisi sono stati prelevati dati quantitativi che rappresentano i risultati di tre saggi replicati indipendenti. Per i confronti tra due gruppi, è stato applicato un t-test, mentre un'analisi della varianza a una via (ANOVA) è stata utilizzata per i confronti tra più gruppi, seguita dal test post hoc di Tukey per i confronti multipli. Un valore p < 0,05 è stato considerato statisticamente significativo.