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Il gene TP53, che codifica per la proteina soppressrice tumorale p53, è mutato in circa il 50% dei tumoriumani 1,2. Tali mutazioni non solo aboliscono le funzioni soppressive tumorali di p53 ma, in alcune varianti hotspot, promuovono anche la formazione di aggregati simili aprioni 3,4. Queste forme aggregate di p53 mutanti acquisiscono frequentemente proprietà di guadagno di funzione, inclusa una maggiore resistenza alle terapieantitumorali 5,6. Pertanto, identificare quali mutazioni dei punti caldi p53 sono soggette all'aggregazione è fondamentale per guidare lo sviluppo di strategie terapeutiche efficaci nei tumori mutantip53 7,8.
Nei nostri studi precedenti, abbiamo osservato che mutazioni specifiche p53 nel carcinoma squamoso della testa e del collo (HNSCC) e nelle linee cellulari del cancro al seno mostrano forti segnali di colorazione con Tioflavina T (ThT), indicando la presenza di proteine aggregate. Il ThT è un colorante benzotiazolo che si lega specificamente a strutture amiloidi ricche di β fogli, produendo una fluorescenza aumentata al momento del legame9. Ad esempio, la linea cellulare Detroit 562 HNSCC, che porta la mutazione p53 R175H, ha mostrato forti segnali di fluorescenzaThT 10. Analogamente, altre due linee cellulari HNSCC, TW01 e HONE-1, entrambe con la mutazione p53 R280T, hanno mostrato una marcata colorazioneThT 11. In questi casi, i segnali ThT colocalizzati con p53, supportando la presenza aggregata di p53 10,11.
Nelle cellule di cancro al seno, MDA-MB-231 (mutazione p53 R280K) e T47D (mutazione p53 L194F) hanno mostrato anch'esse una forte colorazione ThT con chiara co-localizzazione p53/ThT 12. Al contrario, le cellule MCF7, che esprimono p53 di tipo selvatico, e le cellule MDA-MB-468 (mutazione p53 R273H) hanno mostrato entrambe solo segnali ThTdeboli 12. Analogamente, le cellule OECM-1 HNSCC con la mutazione p53 V173L hanno mostrato bassi livelli di colorazioneThT 10.
Rispetto ad altri metodi di rilevamento per aggregazione proteica - come i saggi filtri trappolato, la microscopia elettronica a trasmissione (TEM) o l'immunocolorazione con anticorpi specifici per aggregato - l'analisi della fluorescenza ThT offre diversi vantaggi. È non distruttivo, rapido e applicabile sia a cellule vive che fisse senza un elaborato esteso. Sebbene i saggi filtranti catturi efficacemente aggregati insolubili, richiedono una denaturazione severa e sono inadatti all'uso con cellulevive 13. TEM fornisce una visualizzazione diretta della morfologia delle fibrille ma è laborioso e a bassorendimento 14. L'immunocolorazione aggregata specifica consente la rilevazione in situ usando anticorpi dipendenti dalla conformazione, anche se la disponibilità e la specificità degli anticorpi possono esserelimitanti 15. Al contrario, la fluorescenza ThT - specialmente se combinata con la lettura multipunto delle lastre - offre un approccio semplice, quantitativo e spazialmente affidabile per rilevare strutture ricche di fogli di β o simili all'amiloide.
Anche le considerazioni pratiche sono fondamentali per la riproducibilità. La fluorescenza del ThT correla linearmente con la concentrazione amiloide su un ampio intervallo di concentrazione (0,2-500 μM), e il segnale di picco si raggiunge tipicamente a 20-50 μM, a seconda della proteina—anche se l'autofluorescenza del ThT può emergere a ≥5 μM, e concentrazioni più elevate possono influenzare la cinetica diaggregazione 16. Pertanto, si raccomanda generalmente una concentrazione operativa di ThT intorno a 10-20 μM per bilanciare la sensibilità minimizzando i potenziali effetti sui processi diaggregazione 16. Nel nostro protocollo, lo stock 1.000x di ThT (12. mM) viene diluito 1:1.000 per ottenere una concentrazione operativa di circa 12. μM, che rientra in questo intervallo raccomandato.
ThT si lega preferenzialmente alle strutture amiloidi ricche di β fogli, caratteristiche delle fibrille amiloidi. Questa specificità deriva dall'interazione del colorante con l'architettura cross-β delle fibrille amiloidi, dove le superfici formate dai filamenti di β forniscono siti di legame per ThT. Di conseguenza, il ThT potrebbe non rilevare efficacemente altri aggregati mal piegati o non amiloidi che non presentano questa struttura ricca difoglio di β 17. Pertanto, sebbene ThT sia uno strumento prezioso per identificare fibrille amiloidi, è consigliabile utilizzare metodi di validazione complementari - come la co-localizzazione con l'immunofluorescenza p53 o approcci biofisici - per verificare l'identità e la specificità degli aggregatirilevati 10,18.
Gli studi di previsione strutturale suggeriscono che la mutazione p53 V157F adotta una conformazione più incline all'aggregazione rispetto alla proteinaselvatica 19. In questo studio, abbiamo confrontato i segnali di fluorescenza ThT tra le cellule di cancro al seno Hs578T, che ospitano la mutazione p53 V157F, propensa all'aggregazione, e le cellule MCF7 che esprimono p53 di tipo selvatico. Utilizzando un saggio di colorazione ThT basato su lettore di lastre multipunto, abbiamo cercato di valutare la propensione all'aggregazione di p53 V157F rispetto al tipo selvatico p53.