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Stabilità e distribuzione della temperatura del blocco
Durante lo sviluppo di questo protocollo, abbiamo testato la linearità e la stabilità temporale della temperatura all'interno del blocco. Dopo aver attivato il sistema di raffreddamento e il riscaldatore, il tempo di inizializzazione del blocco è di circa un'ora, durante la quale la maggior parte degli otto sensori di temperatura distribuiti equamente raggiunge la temperatura obiettivo e poi rimane costante dopo un overshoot (Figura 13A). Dopo questo periodo, le temperature registrate dagli otto sensori confermano una distribuzione lineare perfetta della temperatura lungo il blocco di alluminio (Figura 13B).

Figura 13: Linearità e stabilità temporale all'interno del blocco gradiente di temperatura. (A) Stabilità temporale delle temperature all'interno del blocco durante il periodo di incubazione, e (B) temperatura registrata dai sensori al momento di inizio dell'incubazione. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Temperatura del blocco e temperatura del suolo
Abbiamo testato il tempo necessario affinché il campione di suolo all'interno del blocco raggiunga la temperatura registrata dagli otto sensori (Figura 14). In questo studio, abbiamo misurato la temperatura dei campioni di suolo in otto diverse posizioni all'interno del blocco, situate vicino ai sensori. I sensori, posizionati all'interno del blocco, erano pre-stabilizzati alla temperatura bersaglio. Seguendo il protocollo sopra descritto, una volta che le temperature del blocco erano stabili, i campioni di terreno venivano inseriti all'interno del blocco. Per questo test, abbiamo utilizzato sensori aggiuntivi separati dal blocco. Abbiamo usato 15 g di terreno, assicurandoci che la sonda sensore fosse a pieno contatto con il terreno. I campioni di suolo sono stati lasciati senza tappo e la temperatura è stata registrata ogni minuto per un totale di 30 minuti. Durante questo test, il blocco fu leggermente chiuso per minimizzare la variazione di temperatura e riprodurre il più possibile le condizioni reali di utilizzo (completamente chiuso). Abbiamo scoperto che ci vogliono circa 12 minuti perché i campioni di suolo si stabilizzino alla temperatura desiderata. Abbiamo ritenuto accettabile questo tempo di stabilizzazione, dato che le incubazioni durano almeno 3,5 ore. Inoltre, abbiamo valutato la linearità della temperatura del suolo dopo 12 minuti di incubazione a blocchi. I risultati indicano che le temperature del suolo mostrano una relazione lineare, strettamente allineata con la linearità osservata negli otto sensori (Figura 15).

Figura 14: Temperatura del suolo registrata incubata a diverse temperature. I campioni A, B, C e D sono stati incubati in fiale posizionate vicino ai sensori corrispondenti (vedi Figura 10 per riferimento). La temperatura del suolo veniva registrata tramite una termocoppia inserita direttamente nei campioni di suolo. Le temperature specifiche monitorate da ciascun sensore sono le seguenti: (A) Sensore 1 (S1) a 4,1 °C, (B) Sensore 2 (S2) a 12,5 °C, (C) Sensore 3 (S3) a 20,1 °C, (D) Sensore 4 (S4) a 28,1 °C, (E) Sensore 5 (S5) a 36,1 °C, (F) Sensore 6 (S6) a 43,8 °C, (G) Sensore 7 (S7) a 51,9 °C, e (H) Sensore 8 (S8) a 60 °C. Dopo aver inserito i campioni di terreno nel blocco, ci vogliono circa 12 minuti per raggiungere la temperatura obiettivo. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 15: Forte correlazione lineare tra temperatura del suolo e temperatura del sensore. Quattro fiale con terra sono state posizionate vicino agli otto sensori nelle posizioni di blocco A, B, C e D. La temperatura del suolo veniva registrata tramite una termocoppia inserita direttamente nei campioni di suolo. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Interazione temperatura-umidità
C'è un'inevitabile interazione tra temperatura e umidità che deve essere valutata durante il periodo di incubazione. Ad esempio, le alte temperature possono accelerare l'evaporazione, mentre le basse temperature possono causare la condensazione dell'acqua. Per questo test, abbiamo utilizzato quattro campioni di suolo selezionati casualmente con diverse texture (Tabella Supplementare 2). Secondo il protocollo, ogni campione di suolo è stato posizionato nella stessa posizione del blocco su tutte e 22 le temperature. I risultati mostrano che dopo un tempo medio di incubazione di 3,5 ore, temperature più elevate comportano una maggiore perdita di umidità rispetto a temperature più basse, indipendentemente dalla consistenza del suolo (Figura 16). I suoli incubati a 60 °C hanno perso in media il 12% dell'acqua totale aggiunta, mentre i suoli incubati a 4,1 °C hanno perso in media solo l'1,88% dell'acqua totale aggiunta. Ciò significa che durante le 3,5 ore di incubazione a blocchi, i suoli sono stati mantenuti in condizioni ottimali di umidità, tra il 50% e il 60% di capacità di ritenzione d'acqua, indipendentemente dalla temperatura diincubazione 44,45 (Figura supplementare 6).

Figura 16: Perdita relativa di umidità del suolo durante l'incubazione a blocchi in quattro diversi campioni. La perdita di umidità è stata calcolata in relazione alla quantità totale di acqua aggiunta per aggiustare il WHC. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Misurazioni della concentrazione diCO2
Per testare l'accuratezza e la precisione dell'analizzatore di gas, abbiamo effettuato quattro misurazioni di un gas di riferimento certificato (413 ± 5 ppm CO2), per le quali l'analizzatore ha registrato 413,71 ± 0,60 (ppm CO2, media ± SD). Ciò confermò l'elevata accuratezza e precisione delle misurazioni diCO2 registrate dall'analizzatore di gas. Inoltre, per rispettare le specifiche del produttore, dovrebbe essere effettuato un test annuale con un gas di riferimento certificato.
In considerazione del tempo di ritardo causato dalla linea di iniezione e dal kit di riduzione del flusso verso l'analizzatore di gas, sono stati effettuati molteplici test per determinare il tempo ottimale di misurazione. I risultati mostrano che la linea di iniezione causa un ritardo di circa cinque secondi. In questa configurazione, il tempo di misurazione ideale è di 20 s, consentendo un tempo sufficiente per riempire l'unità di rilevamento CO2 e raggiungere un equilibrio per 5 s (Figura 17). Dato che il kit di riduzione del flusso misura a una velocità di 1,17 mL/s, questo tempo di misurazione corrisponde al campionamento del 39% del contenuto d'aria nelle fiale da 60 mL. Inoltre, abbiamo osservato che quando l'analizzatore di gas viene utilizzato come sistema chiuso, si verifica una caduta di pressione. Questa diminuzione si verifica durante l'intervallo di un secondo in cui non c'è iniezione d'aria mentre l'ago viene estratto dalla fiala. Per tenere conto di questa diminuzione di pressione durante l'elaborazione dei dati, abbiamo escluso i valori diCO2 leggermente inferiori (tra il 3% e il 5%) rispetto al valore precedente o successivo.

Figura 17: Tempo ottimale di misurazione per un singolo campione di suolo incubato a tre diverse temperature. Questo grafico mostra il tempo di iniezione ed estrazione dell'ago, l'equilibrio diCO2 per 5 s e la caduta di pressione associata al periodo di tempo selezionato. Incubation_ID mostra la posizione del blocco (C) e le posizioni delle fiale (5, 10 e 15). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Test del protocollo completo
Per valutare la funzionalità e la riproducibilità del protocollo, abbiamo incubato due campioni diversi, ciascuno con quattro repliche tecniche, su 22 temperature discrete che variavano da 4 °C a 60 °C. Questi campioni di suolo sono stati scelti per dimostrare il tipo di dati generati con questa configurazione e le sue prestazioni. Le caratteristiche specifiche del campione si trovano nella Tabella Supplementare 2. Il blocco gradiente di temperatura cattura in modo affidabile le velocità di respirazione del suolo dei diversi campioni di terreno in ogni punto di temperatura, permettendoci di visualizzare la curva di risposta alla temperatura. Inoltre, le curve di risposta alla temperatura risultanti per tutte le repliche erano quasi identiche, come riflesso dalla piccola deviazione standard attorno alle velocità medie di respirazione su tutte le temperature (Figura 18). Questi risultati dimostrano un'elevata riproducibilità e confermano la precisione del protocollo.

Figura 18: Tassi rappresentativi di decomposizione SOM (Rs) per due suoli, ciascuno misurato con quattro repliche tecniche incubate lungo l'intero gradiente di temperatura. I punti rappresentano la media delle frequenze respiratorie a ciascuna temperatura, e le barre di errore indicano la deviazione standard tra repliche tecniche. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Fu eseguito un secondo test per dimostrare l'applicabilità scientifica del protocollo. Abbiamo misurato i tassi di respirazione del suolo lungo l'intero gradiente di temperatura e adattato i dati utilizzando il modello di Arrhenius o MMRT (Figura 19). Questi campioni di suolo sono stati scelti per dimostrare le prestazioni del sistema a confronto con curve di risposta alla temperatura (le caratteristiche del campione sono fornite nella Tabella Supplementare 2). I risultati mostrano che i dati raccolti con il blocco del gradiente di temperatura possono essere ulteriormente analizzati testando diverse teorie sulla sensibilità alla temperatura dei tassi di decomposizione SOM. Tuttavia, emergono sfide quando si lavora con terreno fresco in qualsiasi esperimento. Durante i 10 giorni di periodo pre-incubazione, abbiamo osservato comunità fungine crescere all'interno di alcune fiale nei campioni di suolo oltre il set di campioni rappresentativi. Nonostante i nostri sforzi per rimuovere con cura le comunità fungine senza disturbare il suolo, questa crescita ha influenzato i risultati di alcuni campioni (Figura 20). Di conseguenza, abbiamo deciso di scartare i campioni interessati rimuovendo l'intero campione, non solo le singole fiale colpite dalla crescita fungina.

Figura 19: Risultati rappresentativi e velocità di respirazione (R) di quattro diversi campioni di suolo incubati nel blocco del gradiente di temperatura. La linea rossa rappresenta l'adattamento di Arrhenius (A,B), e la linea blu rappresenta l'adattamento MMRT (C,D). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 20: Modelli di frequenza respiratoria per alcuni campioni colpiti dalla crescita fungina. Questi risultati sono esempi di (A,B) due campioni contaminati che sono stati esclusi da ulteriori analisi. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura supplementare 1: Circuito base NO/NC. "C" può anche essere etichettato come "COM" per Comune. Clicca qui per scaricare questo File.
Figura supplementare 2: Pannello di controllo del sistema di raffreddamento. Clicca qui per scaricare questo File.
Figura supplementare 3: Interruttore del sistema e indicatore luminoso. (A) Interruttore del sistema di controllo del blocco a gradiente di temperatura; e (B) luce verde che indica che i sensori e il sistema di riscaldamento sono ACCESI. Clicca qui per scaricare questo File.
Figura supplementare 4: Controllo del blocco del riscaldatore a gradiente di temperatura nell'interfaccia online. Clicca qui per scaricare questo File.
Figura supplementare 5: Sezione diagnostica dell'analizzatore di gas. Tutto è verde significa che lo strumento è pronto per le misurazioni. Clicca qui per scaricare questo File.
Figura supplementare 6: Capacità di ritenzione d'acqua dei suoli incubati a diverse temperature, misurazioni registrate dopo 3,5 ore di incubazione a blocchi. Clicca qui per scaricare questo File.
Fascicolo supplementare 1: Istruzioni dettagliate per il cablaggio. Clicca qui per scaricare questo File.
Tabella supplementare 1: Elenco dei materiali con la quantità richiesta. Clicca qui per scaricare questo File.
Tabella supplementare 2: Caratteristiche dei campioni di suolo utilizzati per il test di perdita di umidità e protocollo completo. Questi campioni sono stati scelti per dimostrare la funzionalità del protocollo. La classificazione delle texture segue il sistema USDA, con grossolane, argilla, limo e sabbia espressi in percentuali. OC si riferisce al contenuto di carbonio organico (g C·kg-1 suolo), il pH è stato misurato in acqua, e CaCO3 rappresenta il contenuto di carbonato di calcio (g·kg-1 suolo). Clicca qui per scaricare questo File.