Tutte le procedure descritte sono state eseguite in conformità con le linee guida etiche delle normative nazionali svizzere per la ricerca animale. Prima di iniziare l'esperimento, Hydra dovrebbe essere nutrita normalmente, 3 volte a settimana, per almeno 2 settimane. L'Idra usata per gli esperimenti dovrebbe esseresana 12, senza organi sessuali e senza germogliare. Anche l'Idra recentemente gemmata e riconoscibile per la sua lunghezza più corta rispetto alle altre Idre della colonia, dovrebbe essere evitata.
1. Preparazione degli sferoidi dell'Idra (Figura 1)
- Inizia preparando un piatto con mezzo di dissociazione (DM; per la ricetta vedi Tabella 1). Il DM dovrebbe essere a temperatura ambiente per l'esperimento.
- Prepara il resto dello spazio di lavoro: posiziona il coperchio di una piastra di coltura cellulare da 10 cm sotto lo stereoscopio e riempila con uno strato di mezzo Hydra (HM; per la ricetta vedi Tabella 1). Il piatto di coltura cellulare stesso può essere utilizzato per raccogliere tessuto Hydra residuo. Infine, raccogli l'Idra e mettila in un piatto vicino allo stereoscopio.
- Usa una pipetta Pasteur in vetro per spostare un'Idra sul coperchio sotto lo stereoscopio. Si consiglia di smussare le pipette Pasteur. Per ottenere questo risultato, tieni rapidamente la punta in fiamme.
- Spesso, l'Idra galleggia sulla superficie del mezzo; ripipetta l'Idra finché non affonda sul fondo del coperchio.
- Divide l'Idra in due creando un unico taglio retto tra le regioni del corpo B2 e B3 (Figura 1A,B). Sii coerente nella parte del corpo da cui sono stati tagliati gli sferoidi, poiché questo influenza fortemente il comportamento degli sferoidi.
NOTA: Se non è necessario tagliare una parte specifica del corpo, usa sferoidi dal centro dell'asse del corpo. Per gli animali con un fenotipo forte (ad esempio, animali con molte teste ectopiche), cerca le regioni del corpo che più assomigliano al centro dell'asse corporeo.
- Aspetta che l'Idra sia completamente rilassata dopo il taglio. Se necessario, ripipetta le parti galleggianti del corpo per farle affondare di nuovo.
- Una volta che il tessuto diviso si è rilassato, l'estremità tagliata del tessuto rimarrà gonfia. Fai un secondo taglio dove termina il gonfiore per generare un anello di tessuto (Figura 1C). Gli anelli di tessuto possono essere tagliati da ciascuna delle metà dell'Idra .
- Rimuovi le restanti estremità della testa e dei piedi dal coperchio. Queste parti del corpo rimanenti possono essere lasciate a rigenerarsi. Una volta che l'Idra si è rigenerata correttamente e è stata nutrita per almeno 2 settimane, potrà essere riutilizzata per altri esperimenti.
- Taglia gli anelli del tessuto. Taglia gli anelli aperti in più pezzi di tessuto (Figura 1D). Punta a pezzi di tessuto rettangolari di ~100-150 μm per ~300-500 μm.
NOTA: Il numero di pezzi che possono essere tagliati per anello è variabile. Ad esempio, le Idre della ceppa 105 sono tipicamente molto più sottili delle Idre della ceppa AEP. Se un anello di tessuto è troppo piccolo per generare due pezzi di tessuto adeguati, ritaglia l'anello aperto per ottenere un pezzo di tessuto di dimensioni appropriate e scarta l'altro pezzo più piccolo.
- Sposta i pezzi di tessuto nel DM a temperatura ambiente. Minimizza la quantità di HM che viene spostata insieme ai pezzi di tessuto.
- Lascia che gli sferoidi si pieghino in DM per 3-4 ore. Valuta se gli sferoidi si sono piegati correttamente. Gli sferoidi piegati con successo dovrebbero avere una forma arrotondata e essere completamente coperti dall'ectoderma (Figura 2A-D).
NOTA: Se più della metà degli sferoidi non si è ancora ripiegata con successo, lascia gli sferoidi in DM per altri 30 minuti.
- Seleziona sferoidi piegati con diametro di 250-350 μm (Figura 2E-H). Evita gli sferoidi contaminati da materiali esogeni come le fibre plastiche. Sposta gli sferoidi selezionati su HM prima di montarli.
NOTA: Se l'esperimento sarà eseguito in un mezzo integrato (ad esempio, trattamento farmacologico), spostare immediatamente gli sferoidi in questo mezzo invece. Tieni presente che una volta che gli sferoidi vengono spostati nella HM, inizieranno a oscillare.

Figura 1: Preparazione degli sferoidi idri . (A) Schema che mostra la generazione degli sferoidi dell'Idra . Gli sferoidi rompono la simmetria ristabilendo un organizzatore Wnt3+ che guida la formazione, l'allungamento e la differenziazione degli assi. (B) Il primo taglio viene effettuato a metà corpo, al confine tra le regioni B2 e B3, come indicato in (A). (C) Ogni metà risultante viene tagliata nuovamente appena sotto la regione gonfia. (D) Gli anelli di tessuto prodotti vengono poi tagliati e divisi in 2-4 pezzi di tessuto a seconda della dimensione dell'anello. Barre di scala: 250 μm. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
| Medium | Composizione | Temperatura di stoccaggio |
| Mezzo di dissociazione (DM) | 3,6 mM di KCl, 6 mM di CaCl2, 1,2 mM di MgSO4, 6 mM di citrato di sodio, 6 mM di piruvato di sodio, 4 mM di glucosio e 12,5 mM di TES (pH 6,9) | 4 °C |
| Medio idra (HM) | 1 mM CaCl2, 0,2 mM NaHCO3, 0,02 mM KCl, 0,02 mM MgCl2 e 0,2 mM tris-HCl (pH 7,4) | Temperatura ambiente |
Tabella 1: Composizioni multimediali e archiviazione.

Figura 2: Panoramica degli sferoidi non spiegati e piegati. (A-D) Gli sferoidi non piegati sono disposti dal meno piegato al quasi completamente piegato. Gli sferoidi non ripiegati sono riconosciuti da una regione in cui l'ectoderma non copre l'endoderma (indicato da punte di freccia blu). (E) Esempio di uno sferoide troppo piccolo. (F-G) Sferoidi piegati di dimensioni ottimali (250-350 μm). (H) Esempio di uno sferoide troppo grande. Le immagini sono state acquisite su una piastra d'imaging a 4 pozzi con fondo di vetro utilizzando il microscopio ibrido Revolve di Echo (RVL2-K), utilizzando la modalità invertita con un obiettivo 4.0x e una telecamera a luce a trasmissione (a colori). Barre di scala: 250 μm. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
2. Strategie di montaggio
NOTA: La combinazione tra la disposizione del microscopio e il design sperimentale determina la strategia di montaggio più adatta per un esperimento. Qui descriviamo una varietà di tecniche di montaggio che possono essere utilizzate per applicazioni diverse.
- Montaggio in pozzi di agarosio (Figura 3A)
- Prepara l'1% di agarosio in HM bollendo la miscela finché l'agarosio non si è completamente dissolto.
NOTA: Una scorta di agarosio all'1% può essere preparata in anticipo e conservata in una bottiglia di vetro ben chiusa per 1 mese. Consigliamo di non riscaldare l'agarosio più di 5 volte. Tuttavia, i pozzi di agarosio dovrebbero essere preparati il giorno dell'esperimento.
- Mentre l'agarosio è ancora liquido, ricopri completamente il fondo di una lastra di imaging a 4 pozzi con uno strato spesso 2 mm.
NOTA: Anche altre lastre di imaging possono essere adatte a seconda dell'impianto di imaging e del numero di condizioni da testare. Per gli esperimenti con un trattamento, assicurati di compensare l'agarosio. Le sostanze chimiche termostabili possono essere miscelate direttamente nell'agarosio. Prepara una soluzione di agarosio al 2% e, dopo la bollitura, mescolala con una soluzione 2x della sostanza chimica desiderata. Copri l'agarosio con una soluzione 1x come al solito. Se la sostanza non è termostabile, si regola la concentrazione della sostanza tenendo conto del volume di agarosio nella lastra di imaging e si utilizza questa soluzione per coprire l'agarosio.
- Lascia che l'agarosio si solidifici completamente. Poi, crea pozzi nell'agarosio. Lasciare almeno 10 mm di agaroso tra ciascuno dei pozzi per garantirne l'integrità strutturale.
- Mentre tenete premuto lo stantuffo, spingete la punta di una pipetta P1000 nell'agarosio finché non tocca il fondo della piastra di immagini.
NOTA: La dimensione dei pozzi di agarosio può essere regolata, ad esempio, usando una punta di dimensioni diverse o un timbro. È importante che i campioni abbiano abbastanza spazio per muoversi.
- Tieni la pipetta dritta verso l'alto e a filo con il fondo della piastra di immagini. Poi, muovi e ruota la punta della pipetta per tagliare l'agarosio.
- Rilascia lo sturalavandini della pipetta e contemporaneamente rimuovi lentamente la punta dall'agarosio spostandola dritta verso l'alto.
- Ripeti il processo di produzione di pozzi finché non sono stati creati abbastanza pozzi. Se la pipetta viene rimossa troppo rapidamente o l'agarosio non viene completamente tagliato prima della rimozione, un po' di agarosio rimarrà sul fondo del pozzo. Evita di usare questi pozzi perché influenzeranno la qualità dell'imaging.
- Copri l'agarosio con uno strato sottile di HM. Per evitare l'evaporazione del mezzo, si utilizza una piastra di imaging con coperchio.
- Rilascia eventuali bolle d'aria che potrebbero essersi formate nei pozzi di agarosio toccando le bolle d'aria con una punta di pipetta P20.
- Sposta gli sferoidi dell'Idra uno per uno nella piastra d'immagini. Se uno sferoide non cade immediatamente in un pozzo, dirige lo sferoide nella direzione del pozzo spingendolo delicatamente con la pipetta.
NOTA: Due sferoidi possono finire nello stesso pozzo. Rimuovi entrambi gli sferoidi tramite aspirazione e riprova a montarli. Tieni presente che la riaspirazione degli sferoidi può causare danni agli sferoidi e/o al pozzo dell'agarosio. Se succede, continua a usare diversi pozzi e nuovi sferoidi.
- Immagini i campioni con un microscopio rovesciato (Figura 4A).
- Montaggio nei pozzi FEP (Figura 3B)
- Prepara pipette di vetro personalizzate che verranno utilizzate per rimuovere le bolle d'aria dai pozzi FEP (Figura Supplementare 1).
- Riscalda una pipetta Pasteur di vetro con la fiamma in un punto che permetta comunque di tenere l'estremità della punta. Continua a ruotare la pipetta per riscaldarla in modo uniforme.
- Quando il vetro inizia ad ammorbidirsi, allunga rapidamente la punta della pipetta mentre la togli dalla fiamma.
- Rompi l'area diradata per creare una nuova punta di pipetta di circa 0,4-0,5 mm. Tocca rapidamente la punta della pipetta nella fiamma per attenuarla; Assicurati che questo non chiuda la pipetta.
- Riscalda la pipetta Pasteur di vetro nel punto in cui si allarga. Non ruotare la pipetta, ma spostarla fuori dalla fiamma quando la punta della pipetta inizia ad affondare. Tieni la pipetta orizzontalmente finché non si è indurita a forma di L.
- Creare camere FEP termoformando a vuoto con lamina FEP su stampi di alluminiopersonalizzati 6. Le dimensioni degli stampi possono essere adattate per adattarsi a diverse dimensioni di campioni o camere da microscopio. Per gli sferoidi Idra , i pozzi con diametro di 0,5 mm sono i più adatti.
- Taglia la lamina FEP in fogli di 15 x 15 cm. Fissa la lamina FEP all'interno della termoformatrice e scaldala per 8 minuti.
- Metti gli stampi in alluminio sotto la carta stagnola. Sotto vuoto, forma la lamina intorno agli stampi per 30 secondi.
- Taglia manualmente le camere dalla lamina FEP termoformata.
- Rendi la camera FEP priva di polvere usando aria compressa. Riempi la camera FEP con HM.
NOTA: Tipicamente, le camere FEP non hanno un coperchio. Questo significa che parte del mezzo evaporerà durante l'acquisizione delle imagingi. Se l'evaporazione del mezzo causerà problemi, progetta una camera che possa essere chiusa
- Rilascia le bolle d'aria dai pozzi usando le pipette di vetro già preparate. Usa un movimento di raccolta per spingere la bolla d'aria fuori dal pozzo con la punta della pipetta.
- Una volta che tutti i pozzi sono liberi dalle bolle, sposta gli sferoidi dell'Idra uno per uno nella camera FEP. Se uno sferoide non cade in un pozzo, spingilo dentro con una pipetta.
NOTA: Se due sferidi cadono nello stesso pozzo, rimuovi entrambi tramite aspirazione di pipetta e rimontali. Il design dei pozzi FEP determinerà quale tipo di microscopio utilizzare per l'imaging. In generale, sono adatti microscopi con uno o più obiettivi di rilevamento posizionati orizzontalmente (Figura 4B).
- Montaggio con agarosio incorporato nei capillari di vetro (Figura 3C)
- Prepara agarosio a basso punto di fusione all'1% in HM bollendo la miscela finché l'agarosio a basso punto di fusione non si è completamente dissolto. Sposta 1 mL di agarosio liquido in un tubo per microcentrifuga.
NOTA: Una scorta di agarosio a basso punto di fusione all'1% può essere preparata in anticipo e conservata in una bottiglia di vetro ben chiusa per 1 mese. Se necessario, l'agarosio può essere mantenuto in stato liquido mantenendolo a 37 °C. Tuttavia, non riscaldare attivamente l'agarosio non appena vengono aggiunti i campioni. Considera di integrare l'agarosio con un trattamento (vedi Protocollo step 2.1.2) o con perline fluorescenti in questo passaggio. Le perline possono essere utilizzate per la ricostruzione multiview.
- Sposta 2-4 sferoidi nell'agarosio. Inserire completamente una biella del pistone in un capillare di vetro; La biella del pistone dovrebbe adattarsi perfettamente.
- Inserire l'estremità del capillare nell'agaroso e, tirando lentamente verso l'alto la biella del pistone, tirare l'agarosio verso l'alto nel capillare. Inizia ad aspirare un po' di agarosio senza sferoidi, poi senza fermarti, carica gli sferoidi incorporati nell'agarosio nel capillare.
NOTA: Per ottenere i migliori risultati di imaging, i singoli sferoidi devono essere ben separati e posizionati alla base della colonna dell'agarosio (Figura 3C).
- Togli il capillare dall'agaroso e pulisci l'esterno con carta velina. Tenere il capillare orizzontale e ruotarlo finché l'agarosio non si sarà indurito; Questo aiuterà a mantenere gli sferoidi al centro della colonna dell'agarosio.
- Posiziona i capillari pieni di agarosio in HM per mantenere idratati i campioni. I campioni montati in capillari di vetro devono essere fotografiati con un microscopio con uno o più obiettivi di rilevamento posizionati orizzontalmente (Figura 4C).

Figura 3: Montaggio degli sferoidi Hydra per immagini dal vivo. (A) Pozzi d'agaroso con (due camere centrali) e senza (camere esterne) sferidi. (B) Sferoidi montati nei pozzi FEP. (C) Sferoidi incastonati nell'agaroso e montati in un capillare di vetro. Per l'imaging, la colonna di agarosio viene leggermente spinta fuori dal capillare di vetro. Pertanto, gli sferoidi dovrebbero essere posizionati vicino alla base della colonna di agarosio (punte di freccia verdi), pur rimanendo ben separati. Gli sferoidi situati troppo lontani dal fondo (punta di freccia rossa) non possono essere visualizzati efficacemente. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: Diagrammi schematici di sistemi di imaging adatti alle strategie di montaggio descritte. (A) Sferoidi montati in pozzi di agarosio e fotografiati su un microscopio confocale a disco rotante rovesciato. (B) Sferoidi montati in una camera FEP e fotografiati utilizzando un microscopio a fluorescenza a foglio luminoso adatto per l'imagingmulti-pozzo 6. Per chiarezza, il secondo obiettivo di rilevamento, posizionato di fronte all'obiettivo di rilevamento 1, non viene mostrato. (C) Uno sferoide incorporato nell'agarosio e montato in un capillare di vetro per la microscopia a foglio luminoso utilizzando un microscopio con una configurazione alternativa rispetto a (B). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
3. Microscopia confocale a disco rotante
- Immagini i campioni su un microscopio rovesciato dotato di un'unità a disco rotante. Imposta la temperatura della camera del microscopio a 18-21 °C. Se il microscopio non può essere raffreddato, raffredda invece la stanza.
- Scegli un obiettivo con un campo visivo che copra l'intero campione. Per i campioni montati in pozzi di agarosio, il campo visivo dovrebbe idealmente coprire l'intero pozzo.
NOTA: L'uso di un obiettivo asciutto è preferito, specialmente per i dataset time-lapse con più campioni.
- Metti il portacampioni nel palco del microscopio. Accendi la luce trasmessa e imposta il tempo di esposizione.
- Seleziona la lunghezza d'onda del laser, la potenza del laser e il tempo di esposizione per i fluorofori presenti nel campione. Seleziona una combinazione di potenza laser e tempo di esposizione il più basso possibile per ridurre il rischio di fototossicità ma abbastanza alto da ottenere un buon rapporto segnale-rumore.
NOTA: I campioni vivi possono muoversi significativamente durante l'imaging. Quando possibile, eseguire l'acquisizione simultanea di fluorescenza e luce trasmessa, o fluorescenza a doppio laser, utilizzando due telecamere. Se vengono visualizzati più di due canali, si dà priorità all'acquisizione simultanea dei canali dove la sovrapposizione precisa è più importante.
- Trova tutti i campioni e impostali come più posizioni di imaging. Per ogni campione, si crea uno stack z che inizia dal piano più vicino all'obiettivo e termina nel primo piano fuori fuoco. Per gli sferoidi Idra è consigliata una dimensione di passo di 2 μm.
NOTA: La creazione di uno z-stack non è sempre necessaria. Ad esempio, esaminando il comportamento oscillatorio degli sferoidi idra in rigenerazione, un singolo piano focalizzato sul piano equatoriale dei campioni è sufficiente. Quando i campioni di Hydra saranno sprofondati correttamente sul fondo del pozzo di agarosio e sarà stato scelto un obiettivo appropriato, questo aereo dovrebbe trovarsi entro la distanza di lavoro dell'obiettivo.
- Imposta i parametri del time-lapse. Un tempo di 60-70 ore con immagini ogni 10 minuti è adatto per visualizzare la rigenerazione completa degli sferoidi di Hydra . Inizia a fare l'imaging.
4. Microscopia a fluorescenza a foglio luminoso
- Immagini i campioni con un microscopio a foglio luminoso con obiettivi di rilevamento posizionati orizzontalmente.
- Prima di iniziare, allinea la lastra luminosa creata dagli obiettivi di illuminazione. Imposta la temperatura della camera del microscopio a 18-21 °C. Se il microscopio non può essere raffreddato, raffredda invece la stanza.
- Scegli un obiettivo di rilevamento che possa inserire l'intero campione nel suo campo visivo. Quando i campioni hanno spazio per muoversi, scegli un obiettivo di rilevamento che lo consenta.
- Metti il portacampioni nel microscopio. Se i campioni sono montati in un capillare di vetro, spingi il pistone verso il basso finché i campioni non sono fuori dal vetro per visualizzare solo attraverso l'agarosio (Figura 3C).
- Impostare le impostazioni del microscopio per luce trasmessa, fluorescenza, posizioni multiple e time-lapse come descritto nella sezione 3 (microscopia confocale a disco rotante).
- Se il microscopio non è dotato di obiettivi di rilevamento multipli, impostare la rilevazione multiview per rilevare il campione da più angolazioni. Quando più della metà del campione può essere rilevata all'interno di uno z-stack, bastano due viste separate da un angolo di 180°. In alternativa, usa da tre a cinque punteggi.
- Configurare pile z con una dimensione di passo appropriata, per gli sferoidi Hydra è consigliata una dimensione di passo di 2 μm. La z-stack dovrebbe coprire completamente il campione. Quando si effettuano immagini di campioni che si muovono liberamente nei pozzi FEP, si crea uno z-stack che copre l'intero pozzo. Inizia a fare l'imaging.