La Figura 6 offre una panoramica del flusso di lavoro del saggio DIO1-SK e dei principali passaggi di standardizzazione necessari per stabilire con successo il metodo in laboratorio. Il flusso di lavoro (Figura 6A) riassume le fasi sequenziali del saggio, inclusa l'uso di microsomi epatici umani, l'incubazione con item di test e controlli, l'estrazione dello ioduro tramite separazione a scambio ionico e la quantificazione colorimetrica dello ioduro tramite la reazione di Sandell–Kolthoff (SK). La Figura 6B evidenzia la strategia di standardizzazione che sostiene prestazioni robuste e risultati validi, inclusi (i) la standardizzazione della reazione SK, (ii) il test dell'attività microsomica specifica per lotto, (iii) la valutazione della solubilità e il test di interferenza, (iv) un saggio di misurazione della distanza e (v) l'aggiustamento delle concentrazioni degli elementi di prova basandosi sulla prima esecuzione valida del saggio.
Un elemento centrale di questa strategia è il test microsomale specifico per lotto, poiché i lotti di microsomi epatici umani possono differire sostanzialmente nell'attività di deiodinazione rT3, rendendo necessario determinare una concentrazione enzimatica appropriata per ogni nuovo lotto prima dei test di routine delle sostanze.
Questa strategia di test a stadi è fondamentale per l'implementazione: solo dopo che le prestazioni di base del saggio (controlli, comportamento di reazione SK e attività dei microsomi) sono state verificate e le condizioni del test sono state standardizzate possono essere attese a produrre profili di inibizione validi e interpretabili.

Figura 6: Flusso di lavoro e passaggi di standardizzazione del test SK DIO1. (A) Il flusso di lavoro illustra l'uso dei microsomi epatici umani, la configurazione della piastra a 96 pozzi, l'incubazione con item di prova e controlli, l'estrazione dello ioduro e la quantificazione colorimetrica tramite la reazione SK. Ogni passaggio è rappresentato in sequenza per evidenziare le fasi principali del saggio. (B) I passaggi di standardizzazione includono la standardizzazione della reazione di Sandell-Kolthoff, il test di attività microsomica specifica per lotto, la valutazione della solubilità e il test di interferenza, il test di misurazione della distanza e l'aggiustamento delle concentrazioni degli elementi di prova basandosi sulla prima esecuzione valida del saggio. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Basandosi sul flusso di lavoro e sul quadro di standardizzazione mostrato nella Figura 6, la Figura 7 illustra come i laboratori determinino una concentrazione microsomale proteica appropriata (e diluizione post-scambio ionico) per ottenere un intervallo dinamico sufficiente mantenendo al contempo una risposta di inibizione sigmoidale per l'inibitore di riferimento. Nella Figura 7A, la ΔOD21min-BG aumenta con l'aumento della proteina microsomica e dipende dalla diluizione post-scambio ionico (non diluita, 1:2, 1:4). La diluizione che produce il più alto ΔOD21min-BG mantenendo una risposta sigmoidale viene selezionata per gli esperimenti successivi (esempio mostrato: diluizione 1:2). Nella Figura 7B, le curve di inibizione 6-PTU vengono confrontate tra quantità microsomiche di proteine per identificare la concentrazione proteica più bassa che comunque produce una curva sigmoidale (esempio mostrato: 5 μg di proteina/pozzo), bilanciando così sensibilità con il fondo.
È importante sottolineare che questo passaggio di ottimizzazione deve essere eseguito da ciascun laboratorio durante l'implementazione del metodo, poiché la concentrazione proteica richiesta dipende dall'attività del lotto microsomico utilizzato, rendendo necessaria la standardizzazione specifica per lotto della concentrazione enzimatica.

Figura 7: Attività microsomica e inibizione da 6-PTU. (A) Il grafico mostra l'aumento dell'attività mentre il segnale di Sandell-Kolthoff corretto sul fondo (BG) (ΔOD 21 min n-BG) con quantità crescenti di proteina microsomica per pozzo (log10[μg proteina/pozzo]), testato a diluizioni non diluite, 1:2 e 1:4. La diluizione più alta con il valoreΔOD 21 min–BG più alto, così come con una forma sigmoide, sarà utilizzata per esperimenti futuri. In questo caso, si tratta della diluizione 1:2. (B) Curva concentrazione-risposta dell'inibitore di riferimento 6-propil-2-tiouracilo (6-PTU) che mostra l'attività di rilascio di iodio (IRA in %) tracciata rispetto a log10[concentrazione (M)] a diversi carichi proteici microsomici (5, 7,5 e 10 μg proteina/pozzo). I valori IRA sono normalizzati al controllo del solvente. I punti dati di entrambi i grafici rappresentano la media ± SD di tre repliche tecniche (pozzi) per condizione da un test rappresentativo di attività microsomica. Le curve sono state regolate tramite regressione non lineare utilizzando un modello logistico a quattro parametri ("pendenza variabile") (inibitore vs. risposta). La concentrazione proteica più piccola con curva sigmoidale sarà utilizzata per esperimenti futuri; In questo caso, 5 μg/pozzo. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Una volta completati i passaggi di flusso di lavoro e standardizzazione (Figura 6) e stabilita una concentrazione microsomica appropriata per il lotto di microsomi selezionato (Figura 7), i parametri principali del test sono in atto per procedere con i test di routine delle sostanze. In questa fase, gli elementi di prova possono essere valutati insieme al set di controllo della lastra (elemento di riferimento, controllo del solvente e controlli positivi/negativi) nel formato standardizzato della piastra a piatta, consentendo una normalizzazione robusta e un'interpretazione coerente dei profili di inibizione.
La Figura 8 dimostra la discriminazione del saggio basata sul comportamento concentrazione–risposta nell'attività di rilascio di ioduro (IRA). L'inibitore di riferimento 6-PTU (Figura 8A) mostra una diminuzione dell'IRA dipendente dalla concentrazione, fornendo il profilo di inibizione sigmoidale atteso, come previsto per la verifica delle prestazioni del saggio. L'acido tannico (Figura 8B) mostra un profilo inibitorio comparabile a quello dell'inibitore di riferimento (inibizione massima > 90%) nelle condizioni mostrate. Le tre concentrazioni più alte della sostanza testata hanno mostrato valori IRA negativi. I valori IRA <0% non riflettono un 'rilascio negativo di iodio' biologicamente significativo, ma derivano dalla procedura di calcolo (sottrazione di fondo e normalizzazione al controllo del solvente), che può propagare piccole fluttuazioni nel controllo del solvente in valori normalizzati negativi. Di conseguenza, i valori IRA inferiori allo 0% sono considerati equivalenti allo 0% (baseline) per l'interpretazione dei risultati. Il dibutilftalato (Figura 8C) non mostra inibizione (inibizione massima inferiore al 25%) nell'intervallo di concentrazione testato, rappresentando un profilo non inibitore. Insieme, questi profili illustrano che il saggio può differenziare il comportamento inibitorio da quello non inibitorio in condizioni standardizzate. Il sistema di test può anche identificare inibitori parziali, che mostrano livelli massimi di inibizione tra il 25% e il 90% (dati non mostrati). Ulteriori dettagli su come queste sono categorizzate si trovano nella Tabella 5.

Figura 8: Il comportamento dose-risposta del saggio DIO1–SK distingue gli inibitori dai non inibitori. Le curve dose-risposta mostrano l'attività di rilascio di ioduro (IRA in %) rappresentata rispetto alla concentrazione log10 (M) per (A) l'inibitore di riferimento 6-PTU, (B) un inibitore rappresentativo (acido tannico) e (C) un non-inibitore rappresentativo (ftalato di dibutil). I valori IRA sono stati calcolati dopo sottrazione di background e normalizzati al controllo del solvente. I simboli rappresentano la media ± SD (n = 3) di un esperimento indipendente, ciascuno eseguito con tre repliche tecniche (pozzi) per concentrazione. Le curve sono state regolate tramite regressione non lineare utilizzando un modello logistico a quattro parametri ("pendenza variabile") (inibitore vs. risposta). I valori IRA inferiori allo 0% sono considerati equivalenti allo 0% (baseline) per l'interpretazione dei risultati. Questi dati dimostrano che il test fornisce un profilo di inibizione sigmoidale per l'inibitore di riferimento e può confermare se una curva concentrazione-risposta sia inibitoria o non in condizioni standardizzate. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
In un test valido, i controlli con solvente (SC) mostrano una chiara separazione del segnaleΔOD 21 minuti dalla condizione di riferimento completamente inibita (6-PTU, RI-C8). In un dataset di esempio (10 corse indipendenti), ogni piastra includeva n = 9 repliche tecniche per SC e il riferimento completamente inibito (6-PTU a 10−3 M). Tra le lastre, i valori medi SC ΔOD21min della placca variavano da 1,383 a 1,819 (media ± DS: 1,565 ± 0,114), mentre i valori medi ΔODdella placca a 21 minuti per la condizione inibita di 6-PTU variavano da 0,258 a 0,771 (media ± SD: 0,473 ± 0,087). Il calcolo di ΔOD in questo saggio si basa sulla differenza tra OD0min e OD21min, e la validità del saggio è comunemente supportata da una soglia di fattore z di >0,5.
In 10 esecuzioni di test indipendenti, la 6-PTU ha prodotto una curva sigmoidale concentrazione-risposta con valori IC50 variabili da 1,20E-06 M a 5,02E-06 M (media ± SD: 2,74E-06 M ± 1,13E-06 M). I criteri di accettazione per i valori IC50 nell'intervallo di riferimento da 1.00E-06 a 1.00E-05 si basano su dati di precedenti studi di validazione. Tuttavia, i valori di IC50 sono significativamente influenzati dal lotto specifico di microsomi utilizzato e possono mostrare una notevole variabilità. Tuttavia, si prevede che queste variazioni rimangano allo stesso ordine di grandezza.
La qualità del saggio può essere riassunta usando il fattore z′, che riflette sia la finestra del segnale sia la variabilità dei controlli. Nel dataset descritto, sei curve di riferimento erano associate a fattori z′ variabili da 0,544 a 0,774 (media ± SD: 0,658 ± 0,062), coerenti con l'obiettivo di accettazione comunemente usato di z′ > 0,5.
In pratica, le corse subottimali possono essere identificate da deviazioni nel background del saggio e/o dal mancato rispetto dei criteri di accettazione predefiniti. Ad esempio, un alto background nella reazione di Sandell-Kolthoff è indicato quando il diH₂O puro mostra ΔOD > 0,3, il che richiede un'indagine (ad esempio, contaminazione da reagenti o problemi di qualità dell'acqua). Tali aumenti di fondo possono ridurre l'intervallo dinamico del saggio e aumentare la variabilità del controllo, contribuendo così a criteri di accettazione falliti, incluso un fattore z sotto 0,5. I pozzi che mostrano artefatti tecnici evidenti (ad esempio, precipitazioni o decolorazioni anomale) sono esclusi come valori anomali dalla valutazione. Anche i valori anomali determinati tramite test di diagramma a scatola sono esclusi. Se i criteri di accettazione non vengono soddisfatti dopo la rimozione degli outlier, l'esecuzione del saggio è considerata non valida e deve essere ripetuta.
| Reagente/Buffer | Informazioni sulla preparazione |
| Soluzione acida di ammonio e cerio (40 mM (NH4)4Ce(SO4)4*2H2O, 0,5 M H2SO4) (250 mL) | Aggiungi 6,32 g di (NH4)4Ce(SO4)4*2H2O e 125 mL di diH2O in una fiaschetta volumetrica da 250 mL. Aggiungi 125 mL 1 M H2SO4 per raggiungere un volume finale di 250 mL. Conserva a temperatura ambiente fino a 6 mesi. |
| DTT (Aliquote di 1 M) | Aliquota è una soluzione di 1 M DTT in H2O come aliquota di 0,5 mL in tubi microcentrifughe da 1,5 mL e conservata a -20°C per un massimo di 6 mesi. |
| HEPES (50 mM) / EDTA (2,16 mM) tampone (pH 7,0) | Utilizzando una fiaschetta volumetrica da 250 mL, aggiungi 12,5 mL di soluzione 1 M HEPES, 201 mg di acido etilendediaminatetraacetico (EDTA) e riempi fino a 250 mL con diH2O. Conserva a 4°C per un massimo di 3 mesi. |
| Soluzione rT3 ("tubi di miscela di substrato") | Dissolvere rT3 in DMSO fino a una concentrazione finale di 6 mM, aliquotare le rT3 in porzioni da 10 μL in tubi centrifughe da 15 mL e conservarle a -20°C per un massimo di 6 mesi. |
| Soluzione di arsenite di sodio (25 mM NaAsO2, 0,8 M NaCl, 0,5 M H2SO4) (250 ml) | Aggiungi 0,81 g di NaAsO2, 11,7 g di NaCl e 125 mL di diH2O a una fiaschetta volumetrica da 250 mL. Aggiungi 125 mL 1 M H2SO4 per raggiungere un volume finale di 250 mL. Conserva a temperatura ambiente fino a 6 mesi. |
Tabella 1: Preparazione di tamponi e reagenti. Questa tabella dettaglia i passaggi di preparazione e le istruzioni di stoccaggio per tutti i tamponi e le soluzioni stock utilizzate nel test DIO1 SK, inclusi il tampone HEPES/EDTA, la DTT, la soluzione rT3, la soluzione acida di ammonio cerio e la soluzione di arsenite di sodio.
| Nome della diluizione dell'oggetto di riferimento | Concentrazione di diluizione dell'elemento di riferimento [M] | 10% DMSO [μL] | Elemento di riferimento | Concentrazione finale dell'elemento di riferimento nel saggio [M] |
| RI-C8 | 1.00E-02 | 450 | 50 μL di soluzione di stock di riferimento 10-1 M | 1.00E-03 |
| RI-C7 | 1.00E-03 | 450 | 50 μL di RI-C8 | 1.00E-04 |
| RI-C6 | 1.00E-04 | 450 | 50 μL di RI-C7 | 1.00E-05 |
| RI-C5 | 3.16E-05 | 342 | 158 μL di RI-C6 | 3.16E-06 |
| RI-C4 | 1.00E-05 | 450 | 50 μL di RI-C6 | 1.00E-06 |
| RI-C3 | 3.16E-06 | 450 | 50 μL di RI-C5 | 3.16E-07 |
| RI-C2 | 1.00E-06 | 450 | 50 μL di RI-C4 | 1.00E-07 |
| RI-C1 | 1.00E-07 | 450 | 50 μL di RI-C2 | 1.00E-08 |
Tabella 2: Preparazione delle diluizioni degli elementi di riferimento. Questa tabella riassume la preparazione delle diluizioni seriali per l'elemento di riferimento (6-PTU), includendo concentrazioni, volumi di DMSO e concentrazioni finali utilizzate nel saggio.
| Microsoma per pozzo [μg] | diH2O [μL] | Diluizione dei microsomi [μL] | Concentrazione finale di enzima nel saggio [μg/mL] |
| 20 | 780 | 20 μL di soluzione di microsoma da 20 mg/mL | 200 |
| 10 | 400 | 400 μL di diluizione di 20 μg microsoma per pozzo | 100 |
| 5 | 400 | 400 μL di 10 μg di microsoma per diluizione | 50 |
| 2.5 | 400 | 400 μL di 5 μg di microsoma per diluizione | 25 |
| 1.25 | 400 | 400 μL di 2,5 μg di microsoma per diluizione | 12.5 |
| 0.68 | 400 | 400 μL di 1,25 μg di microsoma per diluizione | 6.8 |
Tabella 3: Preparazione delle diluizioni dei microsomi. Questa tabella fornisce lo schema di diluizione per la proteina microsomale per ogni pozzo, inclusi i volumi richiesti di diH₂O e la soluzione di microsoma stock per ottenere le concentrazioni finali di proteine microsomale per il saggio.
| Criteri di accettazione | Valore di soglia suggerito |
| Numerico | |
| IC50 dell'articolo di riferimento [M] | 1*10-05 - 1*10-06 |
| CV del log IC50 stima dell'elemento di riferimento [%] | < 3 |
| Controllo negativo IRA [%] | 80 - 120 |
| Controllo positivo IRA [%] | 20 < |
| Z'-Factor | > 0,5 |
| Binario | |
| Forma dell'oggetto di riferimento (sigmoidale?) | Sì |
| La curva concentrazione-risposta finale dell'item di riferimento è composta da almeno sei concentrazioni da tre repliche | Sì |
| La curva finale concentrazione-risposta dell'item di prova è composta da almeno sei concentrazioni da tre repliche | Sì |
Tabella 4: Criteri di accettazione per il test DIO1 SK. Questa tabella elenca i criteri di accettazione per la validità del saggio come l'intervallo IC₅₀, il coefficiente di variazione, i valori IRA per i controlli, il fattore z e i requisiti per le curve concentrazione-risposta. Le finestre di accettazione sono state derivate da studi di validazione DIO1-SK precedentementeriportati 6, inclusa una valutazione di riproducibilità basata su cinque esecuzioni indipendenti che hanno informato la finestra di riferimento IC₅₀. In un dataset di esempio di 10 run indipendenti, le prestazioni z′-factor variavano da 0,544 a 0,774 (media ± SD: 0,658 ± 0,062), supportando la soglia di accettazione z′ usata qui.
| Categoria (per efficacia) | Sottocategoria (per potenza) | Attività inibitoria | Soglia |
| Categoria 1: inibitore completo | R: Inibitore completo potente | Inibisce completamente l'attività di DIO1 a una concentrazione comparabile all'item di riferimento 6-PTU | Inibizione massima maggiore del 90% e IC50 al limite superiore o inferiore dell'IC50 di 6-PTU |
| B: Inibitore completo debole | Inibisce completamente l'attività di DIO1 a concentrazioni più elevate rispetto all'item di riferimento 6-PTU | Inibizione massima maggiore del 90% e IC50 sopra il range superiore IC50 del 6-PTU |
| Categoria 2: inibitore parziale | - | Nessuna inibizione completa, ma superiore al controllo negativo e solvente | Inibizione massima tra il 25% e il 90% |
| Categoria 3: non inibitore | - | Non inibisce DIO1 (come il controllo negativo e solvente) | Inibizione massima sotto il 25% |
Tabella 5: Classificazione degli elementi di prova basata sulla potenza e l'efficacia dell'inibizione di DIO1. Gli item del test sono suddivisi in tre gruppi di efficacia (pieno, parziale o non inibitore) in base alla massima inibizione dell'attività DIO1. Gli inibitori completi sono ulteriormente sottocategorizzati in base alla potenza, a seconda del loro IC₅₀ rispetto all'item di riferimento 6-PTU.