Questo protocollo descrive un metodo definito a base di idrogel per generare organoidi mammari umani che riproducono caratteristiche chiave della morfogenesi mammaria in un sistema di coltura tridimensionale controllato.
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Articolo metodologico
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Questo protocollo descrive un metodo definito a base di idrogel per generare organoidi mammari umani che riproducono caratteristiche chiave della morfogenesi mammaria in un sistema di coltura tridimensionale controllato.
Lo sviluppo di sistemi modello umani fisiologicamente rilevanti che riproducano l'architettura tissutale e la dinamica dello stato cellulare rimane una sfida importante nello studio dello sviluppo del seno e degli eventi precoci nella carcinogenesi. Le colture bidimensionali convenzionali e molti sistemi tridimensionali non riescono a catturare l'organizzazione strutturale e i segnali microambientali che definiscono la ghiandola mammaria umana. Qui descriviamo un metodo riproducibile per generare organoidi mammari umani tridimensionali a partire da cellule epiteliali primarie incorporate in una matrice idrogel definita composta da collagene di tipo I, laminina, fibronectina e acido ialuronico. Questo sistema supporta la progressione delle singole cellule attraverso fasi chiave della morfogenesi mammaria, inclusa l'espansione dei progenitori, la modellazione epiteliale e la formazione di strutture terminali lobulari simili a unità, nonché l'emergere di un compartimento simile a mesenchima durante un periodo di coltura di 21 giorni. Forniamo un protocollo passo dopo passo per la preparazione dell'idrogel, la semina cellulare e le condizioni di coltura. Il metodo è compatibile con l'imaging ad alto contenuto e l'analisi quantitativa del numero di organoidi, della distribuzione delle dimensioni e della complessità architettonica. Questa piattaforma consente studi meccanicistici sulla plasticità epiteliale e sulle perturbazioni ambientali, fornendo un sistema scalabile e biologicamente rilevante per indagare i primi cambiamenti ai livelli tissutali associati al rischio di cancro al seno.
Comprendere lo sviluppo delle ghiandole mammarie umane e gli eventi precoci che predispongono i tessuti alla trasformazione maligna richiede sistemi sperimentali che riproducano fedelmente l'architettura tissutale, la gerarchia cellulare e la segnalazione microambientale. Sebbene le culture epiteliali bidimensionali abbiano fornito importanti intuizioni meccanicistiche, mancano del contesto strutturale necessario per modellare l'organizzazione epiteliale e lamorfogenesi 1. I sistemi di coltura tridimensionale esistenti, inclusi quelli basati su estratti di membrana basale, hanno fatto avanzare il campo ma rimangono limitati da composizioni variabili, controllo incompleto sui componenti della matrice extracellulare e supporto incoerente dell'architettura tissutaledi ordine superiore 1. Inoltre, molti sistemi organoidi basati su estratti di membrana basale sono vincolati dalla loro incapacità di supportare costantemente l'emergere di un'organizzazione simile atessuto 1. In particolare, molti sistemi si affidano a componenti stromali esogeni piuttosto che a favorire lo sviluppo endogeno di microambienti di supporto, limitando così la loro capacità di modellare le interazioni epiteliali–mesenchemi che sono centrali per lo sviluppo tissutale e le malattie. Queste limitazioni limitano lo studio riproducibile dei processi di sviluppo, della plasticità epiteliale e degli effetti delle perturbazioni ambientali o molecolari sull'organizzazione dei tessuti.
Per affrontare queste limitazioni, abbiamo sviluppato un modello tridimensionale di organoide umano tridimensionale definito a base di idrogel che consente alle cellule epiteliali primarie di generare strutture organizzate all'interno di una matrice extracellularedefinita 2,3,4,5,8. L'idrogel è composto da collagene di tipo I, laminina, fibronectina e acido ialuronico, componenti selezionati in base ai loro ruoli consolidati nello sviluppo delle ghiandole mammari e nella morfogenesi epiteliale. Queste molecole della matrice extracellulare coinvolgono recettori cellulari distinti, tra cui integrine, recettori del dominio discoidinale, CD44 e RHAMM, e sono note per regolare la polarità epiteliale, la morfogenesi ramificata, il mantenimento delle cellule staminali, la meccanotrasduzione e l'organizzazione dei tessuti nella ghiandola mammaria 6,7. Studi precedenti che descrivevano questo sistema idrogel hanno dimostrato che l'incorporazione di questi componenti della matrice extracellulare ha migliorato notevolmente la morfogenesi ductal-lobulare e la maturazione epiteliale rispetto alle condizioni basate solo sul collagene o basate suMatrigel 3,8. Inoltre, le proprietà fisiche di questa formulazione idrogel erano precedentemente caratterizzate dalla microscopia a forza atomica, dimostrando che l'idrogel composito a matrice extracellulare mostrava una rigidità inferiore e un aumento del gonfiore rispetto ai gel a base di collagene (modulo di Young: 256,7 ± 20,0 Pa contro 559,2 ± 204,0 Pa, rispettivamente), coerente con un ambiente matriciale più morbido eidratato 8.
È importante sottolineare che questo modello supporta l'emergere di un compartimento simile a mesenchima che sorge accanto alle strutture epiteliali, fornendo supporto strutturale e di segnalazione endogeno che riflette più da vicino l'organizzazione tissutalenativa 3. La rilevanza fisiologica di questo sistema idrogel è stata valutata tramite confronti diretti con colture organoidi convenzionali basate su Matrigel utilizzando sia analisi morfologiche che trascridemiche. Studi precedenti hanno dimostrato che le colture idrogel supportavano una formazione più organizzata del tessuto ductal-lobulare e una differenziazione multilineage rispetto alle colture basate su Matrigel, preservando al contempo la rispostaormonale 8. Più recentemente, analisi integrate di sequenziamento RNA unicellulare che confrontano organoidi derivati dall'idrogel, organoidi coltivati in Matrigel e tessuto mammario umano primario hanno dimostrato che gli organoidi coltivati in idrogel riproducono più fedelmente la gerarchia epiteliale, la diversità cellulare e le interazioni epiteliali–mesenchimale presenti nel tessuto mammario umanonativo 3. Al contrario, gli organoidi coltivati con Matrigel erano arricchiti per stati basale ibridi proliferattivi e privi di popolazioni simili a stromi, compatibili con l'autoassemblaggio epiteliale piuttosto che con un'organogenesi diretta.
Il protocollo qui descritto fornisce un metodo riproducibile e scalabile per generare organoidi a partire dal tessuto umano primario, con passaggi opzionali per la deplezione e la dissociazione dei fibroblasti verso singole cellule. Poiché questa piattaforma è compatibile con imaging live, imaging ad alto contenuto, analisi morfometrica quantitativa, tracciamento cellulare e studi di perturbazione genetica, può essere integrata con approcci a valle che valutano il numero di organoidi, la dimensione, l'architettura e la dinamica della crescita. Questa piattaforma fornisce quindi un sistema biologicamente rilevante per studiare lo sviluppo del seno umano, la plasticità epiteliale, le interazioni epiteliali-microambiente e le risposte a livello tissutale a perturbazioni dello sviluppo, molecolari o ambientali.
Una panoramica schematica del flusso di lavoro, inclusa la lavorazione dei tessuti, la preparazione dell'idrogel, la coltura organoide, la progressione dello sviluppo e le analisi a valle, è fornita nella Figura 1, mentre morfologie organoidi rappresentative generate tramite questa piattaforma sono mostrate nella Figura 2.

Figura 1. Panoramica del flusso di lavoro di generazione di organoidi a base di idrogel. (A) Diagramma di flusso che riassume il flusso di lavoro del protocollo, inclusa raccolta di tessuti, lavorazione dei tessuti, crioconservazione, recupero e preparazione opzionale delle cellule, preparazione di idrogel, coltura di organoidi, sviluppo di organoidi e applicazioni analitiche a valle. (B) Schema visivo che raffigura le principali fasi del protocollo di generazione organoide a base di idrogel, inclusi l'elaborazione e la preparazione dei tessuti, il recupero e la preparazione opzionale delle cellule, e la preparazione dell'idrogel e la semina degli organoidi. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2. Morfologie organoidi rappresentative generate nel sistema idrogel definito. Immagini rappresentative in campo chiaro di organoidi derivate da diversi tessuti umani coltivati nella matrice di idrogel definita. Gli organoidi mammari generati da singole cellule epiteliali derivate da mamoplastica di riduzione sono stati fotografiati al giorno 21 della coltura. Gli organoidi xenoinnesti derivati dal paziente generati da frammenti tumorali sono stati fotografiati al giorno 16 di coltura. Gli organoidi delle ghiandole salivare generati da frammenti epiteliali sono stati fotografiati al terzo giorno di coltura. Gli organoidi renali generati dai frammenti epiteliali sono stati fotografiati al giorno 17 di coltura. Barre della scala = 50 μm. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
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I tessuti primari che altrimenti sarebbero stati scartati come rifiuti medici dopo l'intervento chirurgico sono stati prelevati in conformità con tutte le leggi pertinenti utilizzando protocolli approvati dai comitati di revisione istituzionale del Maine Medical Center e del Tufts Medical Center. Tutti i tessuti sono stati anonimizzati prima del trasferimento e non sono stati ricondotti a pazienti specifici. Per questo motivo, questa ricerca ha ottenuto lo status di esenzione dal Committee on the Use of Humans as Experimental Subjects presso il Massachusetts Institute of Technology e presso la Tufts University Health Sciences (IRB #13521). Tutti i pazienti iscritti a questo studio hanno firmato un modulo di consenso informato accettando di partecipare allo studio e alla pubblicazione dei risultati.
1. Elaborazione e preparazione dei tessuti
NOTA: Eseguire tutte le procedure che coinvolgono tessuti umani in conformità con le linee guida istituzionali per la biosicurezza e le etiche. Consulta gli schemi del flusso di lavoro mostrati nelle Figure 1A e 1B per una panoramica visiva dei passaggi del protocollo e della preparazione degli organoidi prima di iniziare la procedura.
2. Recupero e preparazione opzionale delle cellule
3. Preparazione dell'idrogel e semina di organoidi


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L'esecuzione con successo di questo protocollo porta alla formazione di strutture organoidi tridimensionali che mostrano una morfologia epiteliale organizzata e caratteristiche architettoniche specifiche per i tessuti. Gli organoidi iniziano a formarsi entro 3–7 giorni dalla semina e continuano a svilupparsi durante il periodo di coltivazione. La precedente caratterizzazione di questo sistema organoide idrogel ha dimostrato la formazione di organoidi riproducibili su più donatori umani p...
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Il protocollo descritto qui consente la generazione riproducibile di organoidi mammari umani tridimensionali all'interno di un microambiente idrogel definito che supporta caratteristiche chiave della morfogenesimammaria 3. Diversi passaggi sono fondamentali per il successo di questo metodo. Innanzitutto, il processamento tissutale e la dissociazione enzimatica devono essere controllati con attenzione per preservare la vitalità epiteliale minimizzando la sovradiges...
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C.K. è cofondatore e consulente di Naveris.
Ringraziamo con gratitudine Karla Murga, Daniela Requena e Megan Maloney del Tufts Biomedical Repository per il supporto tissutale. Questa ricerca è stata supportata dalla Find The Cause Breast Cancer Foundation e dal Tufts CTSI NIH Clinical and Translational Science Award (UM1TR0043, G.R.).
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| Nome | Azienda | Numero di catalogo | Commenti |
|---|---|---|---|
| 15 mL conical tubes | VWR | 89039-664 | Tubi sterili per lavorazione dei tessuti e centrifugazione |
| 40 μm cell strainer | VWR | 732-2757 | Dispositivo di filtrazione per la preparazione di sospensioni di cellule singole |
| 40 μm cell strainer for low volumes | Bel-Art | 136800040 | Dispositivo di filtrazione per la preparazione di sospensioni di cellule singole |
| Automated cell counter | Bio-Rad | 1450102 | Dispositivo utilizzato per contare le cellule e determinare la vitalità |
| Bovine pituitary extract | Thermo Scientific | 13028014 | Supplemento per i media delle cellule epiteliali |
| Cell counting slides | Bio-Rad | 145-0011 | Diapositive a doppia camera utilizzate per il conteggio delle cellule |
| Centrifuge | N/A | N/A | La centrifuga/le centrifughe da banco devono avere una capacità di velocità di almeno 500 x g e la possibilità di accogliere tubi da 15 mL e 1,5 mL. |
| Collagen I | Millipore Sigma | 08-115 | Proteina della matrice extracellulare utilizzata per la formazione dell'idrogel |
| Collagenase A | Sigma-Aldrich | 11088793001 | Enzima utilizzato per la dissociazione dei tessuti |
| Cryovials | Corning | 976171 | Fialette sterili per la conservazione criogenica dei campioni |
| Culture vessels (e.g., chamber slides, multiwell plates) | Corning | 354104 354108 3603 | Piastrelle per la deposizione dell'idrogel e la coltura degli organuli. |
| Dimethyl sulfoxide | Millipore Sigma | 317275 | Crioprotettore utilizzato nel mezzo di congelamento |
| Dispase II | Roche | 4942078001 | Enzima utilizzato per la dissociazione secondaria dei tessuti |
| DNase I | Roche | 10104159001 | Enzima utilizzato durante la dissociazione cellulare. |
| Fetal bovine serum | Gibco | 10437 | Supplemento di siero utilizzato nei mezzi di lavaggio e neutralizzazione |
| Fibronectin | Sigma-Aldrich | F2006 | Componente della matrice extracellulare |
| GlutaMAX | Thermo Scientific | 35050061 | Supplemento per i media delle cellule epiteliali |
| Human epidermal growth factor | Sigma-Aldrich | E9644 | Supplemento per i media delle cellule epiteliali |
| Hydrocortisone | Sigma-Aldrich | H0888 | Supplemento per i media delle cellule epiteliali |
| Hyaluronic acid | Millipore Sigma | 385908 | Componente della matrice extracellulare per la formulazione dell'idrogel |
| Hyaluronidase | Sigma-Aldrich | H3506 | Enzima utilizzato per la dissociazione dei tessuti |
| Incubator | Thermo Scientific | 3598 | Dispositivo utilizzato per l'incubazione dei tessuti |
| Insulin | Sigma-Aldrich | I9278 | Supplemento per i media delle cellule epiteliali |
| Laminin | Gibco | 23017-015 | Componente della matrice extracellulare |
| Mammary epithelial basal medium | Thermo Scientific | M171500 | Mezzo di crescita per le cellule epiteliali |
| Microcentrifuge tubes (1.5 mL) | Thermo Scientific | 3451 | Tubi utilizzati per reazioni a piccolo volume |
| Orbital rotator | Thermo Scientific | 400110 | Rotatore utilizzato per la dispersione dei tessuti durante la dissociazione enzimatica |
| P1000 pipette | Gilson | P1000 | Dispositivo utilizzato per miscelare e trasferire volumi fino a 1.000 μL |
| Penicillin-streptomycin | Thermo Scientific | 15140122 | Supplemento antibiotico per i media delle cellule epiteliali |
| Phosphate-buffered saline | Gibco | 20012-027 | Soluzione tampone utilizzata per il lavaggio e il risciacquo |
| Precision balance | Mettler Toledo | ML303E | Bilancia utilizzata per il pesaggio dei tessuti |
| Serological pipette | Nunc | 170356N | Pipetta utilizzata per la raccolta delle cellule epiteliali non aderenti |
| Sodium hydroxide (1 N) | Fisher Chemical | SS261 | Reattivo utilizzato per la neutralizzazione del collagene |
| Sterile scalpels | Bard-Parker | 372615 | Strumenti utilizzati per il taglio meccanico dei tessuti |
| Trypan blue solution | Gibco | 15250061 | Colorante utilizzato per la valutazione della vitalità cellulare |
| Trypsin (0.25%) | Gibco | 25200056 | Reattivo enzimatico utilizzato per la dissociazione cellulare |
| Water bath (37 °C) | VWR | 10LA | Dispositivo utilizzato per il disgelo controllato dei campioni |
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