Lo studio è stato approvato dal Comitato Etico dell'Ospedale Hefei BOE (numero di approvazione 2021–1) e il consenso informato scritto è stato ottenuto da tutti i partecipanti prima dell'arruolamento.
Pazienti e campioni
Questo studio ha reclutato 135 pazienti con AR (diagnosticata secondo i criteri di classificazione ACR/EULAR del 2010) dal Dipartimento di Reumatologia e Immunologia dell'Ospedale Hefei BOE, 130 pazienti con OA dal Dipartimento di Ortopedia (diagnosticati secondo i criteri diagnostici per l'OA dell'Associazione Medica Cinese del 2018) e 125 controlli sani abbinati per età e sesso provenienti dal centro di medicina preventiva dello stesso ospedale. I partecipanti avevano un'età compresa tra i 30 e gli 80 anni. Ai controlli sani è stato confermato l'assenza di malattie autoimmuni, disturbi articolari e infezioni acute mediante un'analisi approfondita della storia clinica, esame fisico e test di laboratorio. Sono stati esclusi i partecipanti con malattie autoimmuni concomitanti, storia di infezione o trauma nei precedenti 3 mesi, neoplasie oppure in stato di gravidanza o allattamento.
Campionamento e preparazione
È stato prelevato sangue venoso a digiuno da tutti i soggetti dello studio. Dopo coagulazione a temperatura ambiente per 30 minuti, i campioni di siero sono stati isolati mediante centrifugazione a 1500 × g per 15 minuti. Il siero è stato conservato a -80°C fino all'analisi successiva.
Rilevamento di marcatori clinici e sierologici
Per valutare in modo completo lo stato della malattia e l'attività infiammatoria, sono stati misurati biomarcatori clinici e sierologici mediante metodi standardizzati di laboratorio clinico. La VES è stata determinata con il metodo di Westergren per valutare l'infiammazione sistemica aspecifica. La PCR è stata quantificata mediante un saggio immunoturbidimetrico (valore di riferimento normale: <10 mg/L) per valutare la risposta infiammatoria di fase acuta. Il FR è stato misurato mediante saggio immunoenzimatico (ELISA) con un valore di riferimento normale di ≤20 UI/mL. Gli anticorpi anti-CCP sono stati dosati mediante un ELISA di seconda generazione per fornire evidenze sierologiche a supporto della diagnosi di AR.
Linee cellulari e coltura
Le cellule di sinoviociti umani di tipo fibroblastico colpiti da AR (HFLS-RA) sono state coltivate in Dulbecco's Modified Medium (DMEM) integrato con siero bovino fetale (FBS) al 10% e penicillina-streptomicina all'1%. Le cellule sono state mantenute in un incubatore a 37 °C con 5% di CO₂, e sono state utilizzate per tutti gli esperimenti cellule comprese tra il terzo e il sesto passaggio.
Estrazione dell'RNA e RT-PCR quantitativa in tempo reale
L'RNA totale è stato estratto da campioni di siero utilizzando un reagente per l'estrazione dell'RNA. La trascrizione inversa è stata eseguita utilizzando un kit per la sintesi del primo filamento di miRNA per i miRNA e un kit di trascrizione inversa per i geni bersaglio dell'RNA messaggero (mRNA), seguendo le istruzioni del produttore. È stata eseguita una reazione a catena della polimerasi quantitativa in tempo reale (RT-qPCR) utilizzando un sistema di PCR in tempo reale con una miscela master PCR a base di SYBR Green. Il programma termociclico è stato impostato su una pre-denaturazione a 95 °C per 30 s, seguita da 40 cicli di amplificazione (denaturazione a 95 °C per 5 s e annealing/estensione a 60 °C per 30 s). Ogni campione è stato analizzato in triplice replicato. L'RNA nucleare piccolo U6 (U6 snRNA) e la gliceraldeide-3-fosfato deidrogenasi (GAPDH) sono stati utilizzati come geni di riferimento endogeni per la normalizzazione rispettivamente di miRNA e mRNA. Le sequenze dei primer sono state riassunte nella Tabella Supplementare 1. I livelli di espressione relativi di miR-488-3p e dei suoi geni bersaglio sono stati calcolati utilizzando il metodo 2−ΔΔCt. Sono state inoltre analizzate le variazioni nei livelli di mRNA dei geni bersaglio dopo sovraespressione o inibizione di miR-488-3p per verificare le loro relazioni regolatorie.
Trasfezione cellulare
Le cellule HFLS-RA sono state seminate in piastre da 6 pozzetti a una densità di 5 × 105 cellule/pozzetto. Le cellule sono state trasfettate utilizzando un reagente di trasfezione basato su liposomi, seguendo le istruzioni del produttore. I gruppi di trasfezione includevano gruppi di trasfezione singola e gruppi di co-trasfezione. I gruppi di trasfezione singola erano: 1) controllo—cellule non trasfettate; 2) controllo negativo del mimic (NC)—cellule trasfettate con il controllo negativo del mimic di miR-488-3p; 3) mimic di miR-488-3p—cellule trasfettate con il mimic di miR-488-3p; 4) controllo negativo dell'inibitore (NC)—cellule trasfettate con il controllo negativo dell'inibitore di miR-488-3p; 5) inibitore di miR-488-3p—cellule trasfettate con l'inibitore di miR-488-3p. I gruppi di co-trasfezione erano: 1) mimic di miR-488-3p + controllo negativo di sovraespressione (oe-NC)—cellule co-trasfettate con il mimic di miR-488-3p e il controllo negativo dei vettori di sovraespressione di ROCK1; 2) mimic di miR-488-3p + oe-ROCK1—cellule co-trasfettate con il mimic di miR-488-3p e i vettori di sovraespressione di ROCK1. Tutte le sequenze di trasfezione sono state riassunte nella Tabella Supplementare 1. Il vettore di sovraespressione di ROCK1 è stato ottenuto clonando la regione della sequenza codificante (CDS) nel plasmide pcDNA 3.1. Le cellule trasfettate sono state utilizzate per gli esperimenti successivi dopo 48 h dalla trasfezione.
Saggio della funzione cellulare
Saggio di proliferazione cellulare (Kit per il conteggio delle cellule-8 [CCK-8]): Le cellule HFLS-RA trasfettate sono state inoculate in piastre a 96 pozzetti a una densità di 5 × 103 cellule/pozzetto, con tre pozzetti replicati per gruppo. A 0, 24, 48 e 72 h dalla trasfezione, sono stati aggiunti 10 µL di soluzione CCK-8 in ciascun pozzetto, seguiti da un'incubazione a 37 °C per 2 h. L'assorbanza è stata misurata a 450 nm (lunghezza d'onda di rilevamento) e a 630 nm (lunghezza d'onda di riferimento) utilizzando un lettore di micropiastre. Il tasso di proliferazione relativo è stato calcolato utilizzando il tempo 0 h come valore di base.
Rilevamento dell'apoptosi (citometria a flusso): L'apoptosi è stata valutata analizzando con il saggio di apoptosi Annexin V-fluoresceina isotiocianato (FITC)/ioduro di propidio (PI). Le cellule sono state trasfettate con i plasmidi appropriati e quindi raccolte dopo la tripsinizzazione. Il tasso di apoptosi è stato determinato mediante citometria a flusso.
Saggio dei fattori infiammatori (saggio immunoenzimatico [ELISA]): Le cellule HFLS-RA sono state seminate in piastre a 24 pozzetti e trasfettate con il mimico di miR-488-3p, l'inibitore di miR-488-3p o i corrispondenti controlli negativi per 48 h. Le concentrazioni di interleuchina-6 (IL-6), fattore di necrosi tumorale-α (TNF-α) e interleuchina-1β (IL-1β) nei supernatanti cellulari sono state quantificate utilizzando kit ELISA.
Convalida della proteina bersaglio
Previsione del bersaglio: ROCK1 è stato previsto come un bersaglio downstream di miR-488-3p utilizzando il database TargetScan26. Sono stati inoltre identificati i siti di legame previsti tra miR-488-3p e la regione non tradotta 3′ (3′UTR) di ROCK1.
Saggio del gene reporter Dual-Luciferase: L'UTR 3′ di tipo selvaggio o mutante di ROCK1 è stato clonato nel plasmide pGL3. I siti di legame previsti e i siti mutati sono mostrati nella Figura 4. Le cellule HEK-293T sono state co-trasfettate con il mimico o l'inibitore di miR-488-3p insieme ai vettori costruiti27. L'attività della luciferasi è stata misurata 48 h dopo la trasfezione con il mimico o l'inibitore di miR-488-3p.
Immunoprecipitazione dell'RNA (RIP): le cellule HFLS-RA sono state incubate con un anticorpo anti-Argonauta 2 (Ago2) (RRID: AB_2882071, diluizione 1:200) o con un anticorpo di controllo immunoglobulina G (IgG) (RRID: AB_2819160, diluizione 1:5000), seguite dall'estrazione dell'RNA e dalla PCR quantitativa (qPCR) per l'arricchimento dell'mRNA di ROCK1, come descritto in precedenza.
Analisi statistica
Lo studio è stato analizzato statisticamente utilizzando SPSS 23.0 (RRID: SCR_002865) e GraphPad Prism 9.0 (RRID: SCR_002798). I dati delle misurazioni sono stati espressi come media ± deviazione standard (SD). Tutti gli esperimenti sono stati eseguiti con tre replicati biologici, e ciascun replicato biologico è stato analizzato in triplice copia. I dati grezzi sono allegati nel materiale supplementare. I dati sono stati valutati mediante un diagramma di probabilità normale (P-P) prima dei test statistici parametrici. Per confrontare le variabili continue alla baseline (ad esempio, età, indice di massa corporea [BMI], ecc.) è stato utilizzato il test t per campioni indipendenti, mentre per le variabili categoriche (ad esempio, sesso, ecc.) è stato impiegato il test chi-quadrato. I livelli di espressione genica sono stati confrontati mediante il test t per campioni indipendenti. Le variazioni della proliferazione cellulare in diversi punti temporali sono state analizzate mediante analisi della varianza (ANOVA) a misure ripetute, mentre l'ANOVA ad un fattore è stata utilizzata per confrontare i tassi di apoptosi determinati mediante citometria a flusso. L'analisi della correlazione è stata effettuata utilizzando il coefficiente di Spearman (per variabili che non soddisfano la distribuzione normale) e il coefficiente di Pearson (per variabili che soddisfano la distribuzione normale). Le prestazioni diagnostiche sono state valutate mediante l'analisi della curva ROC (caratteristica operativa del ricevitore). Il valore ottimale di cutoff, la sensibilità e la specificità sono stati determinati utilizzando l'indice di Youden massimo. Tutti i test statistici erano a due code, e un valore di p < 0,05 è stato considerato statisticamente significativo.