Tutti gli esperimenti sugli animali sono stati eseguiti in conformità con le linee guida ARRIVE. Lo studio è stato approvato dal Comitato di Revisione Etica di Sichuan Scientist Biotechnology Co., Ltd. (IACUC ISSUE SYST-2024-011). Una cronologia dettagliata dell'esperimento che riassume il disegno dello studio è fornita nella Figura Supplementare 1.
Preparazione e trattamento degli animali
I topi sono stati anestetizzati profondamente mediante inalazione di isoflurano al 2%. In profonda anestesia, il sangue è stato prelevato tramite enucleazione retro-orbitale. Immediatamente dopo il prelievo del sangue, i bulbi oculari sono stati enucleati per l'isolamento del tessuto retinico. Successivamente, è stata eseguita la dislocazione cervicale in profonda anestesia per garantire l'eutanasia. I tessuti del colon sono stati quindi dissecati immediatamente. Gli animali che presentavano eventi avversi sono stati immediatamente rimossi dallo studio e hanno ricevuto le opportune cure veterinarie.
Randomizzazione e cecità
Topi maschi C57BL/6, di 5 settimane di età e del peso compreso tra 20 e 30 grammi, sono stati ospitati in condizioni strettamente controllate, comprese temperatura e umidità. Dopo una settimana di ambientamento, i topi C57BL/6 sono stati assegnati casualmente a tre gruppi (gruppo controllo, gruppo modello e gruppo di intervento) mediante una sequenza di numeri casuali generata al computer. La sequenza di randomizzazione è stata generata da un ricercatore non coinvolto nella manipolazione degli animali né nella valutazione degli esiti.
Per garantire la cecità, tutte le operazioni di cura degli animali, somministrazione dei farmaci e raccolta dei dati sono state eseguite da ricercatori ignari dell'assegnazione ai gruppi. Le assegnazioni codificate ai gruppi sono state rivelate solo al termine di tutti gli esperimenti e delle analisi statistiche. La cecità è stata applicata a: il tecnico che ha effettuato la gavaggio orale; il patologo che ha valutato l'istologia retinica; e l'analista che ha quantificato le bande del Western blot (WB).
Calcolo della dimensione del campione
La dimensione del campione è stata determinata sulla base di un esperimento preliminare volto a valutare il numero di cellule gangliari retiniche (RGC) nelle stesse condizioni sperimentali. Assumendo un livello di significatività bilaterale (α) pari a 0,05 e una potenza statistica (1-β) del 0,80, erano necessari almeno 5 topi per gruppo per rilevare una differenza clinicamente rilevante nel numero di RGC tra il gruppo modello e il gruppo sottoposto all'intervento. Considerando un tasso di abbandono potenziale di circa il 20%, ogni gruppo è stato fissato a 6 topi.
Creazione di animali diabetici
Al gruppo controllo è stata somministrata una dieta standard, mentre ai gruppi di intervento e modello è stata somministrata una dieta ricca di grassi e zuccheri (HFHSD) per un periodo di quattro settimane. Al termine di questo periodo alimentare, i gruppi di intervento e modello hanno ricevuto un'iniezione intraperitoneale con una soluzione al 1% di Streptozotocina (STZ) a un dosaggio di 35 mg/kg17,18,19,20. Dopo settantadue ore dall'iniezione, i topi che presentavano livelli di glucosio nel sangue a digiuno non forzato superiori a 16,7 mmol/L erano considerati modelli di DM indotti con successo e venivano selezionati per ulteriori esperimenti. Gli animali con DM hanno proseguito con la dieta ricca di grassi e zuccheri per ulteriori quattro mesi, mentre il gruppo controllo ha mantenuto la propria dieta standard.
Convalida tassonomica e valutazione della qualità
Gli otto ingredienti presenti nel QMG sono stati validati tassonomicamente utilizzando il Modernized Plant Names Search (MPNS, http://mpns.kew.org/mpns-portal/). La qualità della segnalazione della composizione del QMG è stata valutata mediante lo strumento ConPhYMP.
Metodi di somministrazione
Nel gruppo di intervento, gli animali sono stati trattati per via orale con QMG. QMG è stato acquistato dalla Zhejiang Sansheng Mandi Pharmaceutical Co., Ltd. (Numero cinese di autorizzazione farmaceutica nazionale Z20090036). La sospensione di QMG è stata preparata mescolando uniformemente QMG con acqua distillata. I topi del gruppo di intervento hanno ricevuto la sospensione mediante sondino gastrico, in un volume equivalente a quello dei gruppi modello e di controllo. Il dosaggio è stato calcolato in base alla dose terapeutica clinica singola di 4,5 g per un adulto di 60 kg (dose unitaria standard della formulazione commerciale), utilizzando il metodo di normalizzazione per area della superficie corporea (BSA) raccomandato dalla FDA e da Reagan-Shaw21. Il fattore di conversione tra esseri umani adulti (Km = 37) e topi (Km = 3) è pari a 12,33, ottenendo così una dose per il topo di 0,9 g/kg di peso corporeo. Il gruppo modello e il gruppo di controllo hanno ricevuto un volume equivalente di soluzione salina fisiologica mediante sondino gastrico. Il trattamento è stato effettuato quotidianamente tra le 9:00 e le 11:00 per un periodo consecutivo di 3 mesi.
Osservazione e indicatori di prova
Monitoraggio generale dei segni vitali
I segni vitali generali e gli indicatori fisiologici, inclusi il peso corporeo, i livelli di glucosio nel sangue, il consumo di acqua e cibo, la diuresi, i livelli di attività e il comportamento, la temperatura corporea, nonché lo stato del pelo e della pelle, sono stati osservati e registrati sistematicamente al fine di valutare in modo completo gli interventi terapeutici e rilevare eventuali complicanze.
Osservazione dei cambiamenti morfologici nella retina mediante analisi con colorazione HE
Tutti i campioni sono stati processati mediante un disidratatore automatico utilizzando una serie di soluzioni di etanolo e xilene dopo la fissazione, seguita dall'inclusione in paraffina. Successivamente, sono state effettuate sezioni di 4 µm in paraffina, colorate con ematossilina-eosina e quindi montate con gomma neutra. Le immagini retiniche sono state acquisite mediante uno scanner 3DHISTECH Pannoramic SCAN. L'analisi delle immagini e la misurazione dei dati sono state eseguite con Image-Pro Plus.
Rilevamento di IL-6, TNF-α e IL-1β sieriche mediante analisi ELISA
I campioni di sangue sono stati prelevati mediante enucleazione retro‑orbitale. Il siero è stato separato mediante centrifugazione a 1.000 × g per 15 minuti a 4 °C e conservato a -80 °C fino all'analisi. I livelli sierici di IL‑1β, IL‑6 e TNF‑α sono stati misurati seguendo le procedure standard, compresa l'equilibratura dei reagenti, l'aggiunta del campione, l'incubazione, il lavaggio, l'aggiunta di coniugato e substrato, l'interruzione della reazione, la misurazione della densità ottica e il calcolo della concentrazione in base a una curva standard. La densità ottica è stata letta a 450 nm utilizzando un lettore di microplacche, e le concentrazioni delle citochine sono state calcolate in base alle curve standard.
Rilevamento delle principali proteine regolatrici nella retina e nel colon mediante analisi WB
Sono stati effettuati tre replicati biologici indipendenti su una singola membrana e successivamente sono state ricercate le proteine bersaglio. Tutti i replicati sono stati ottenuti da un singolo gruppo di animali sacrificati contemporaneamente. Quando il peso molecolare di una proteina bersaglio era troppo simile a quello della GAPDH (differenza <5 kDa), le analisi sono state eseguite su membrane distinte per evitare sovrapposizioni di segnale. Ogni membrana è stata sottoposta a sonda esclusivamente per la proteina bersaglio o per la GAPDH al fine di garantire una quantificazione accurata. Sono stati utilizzati i seguenti anticorpi primari: anticorpo policlonale anti-GAPDH policlonale anticorpo (1:5000), anticorpo policlonale anti-CMKLR1 (1:1000), anticorpo policlonale anti-Wnt5a (1:1000), anticorpo policlonale anti-TP53 (1:1000), anticorpo monoclonale anti-AP-1 (1:5000) e anticorpo policlonale anti-PPAR gamma (PPAR-γ) (1:1000). Le proteine totali sono state ottenute mediante lisi cellulare seguita da centrifugazione. Le concentrazioni proteiche sono state determinate utilizzando il saggio BCA. Le proteine estratte sono state separate mediante elettroforesi su gel di SDS-PAGE al 12% e successivamente trasferite su membrane. Le membrane sono state bloccate in TBST contenente il 5% di latte scremato e incubate con gli opportuni anticorpi primari durante la notte a 4 °C. Dopo il lavaggio, le membrane sono state incubate con anticorpi secondari coniugati con HRP anti-coniglio o anti-topo in un rapporto di diluizione di 1:10.000. Infine, le bande proteiche sono state visualizzate e analizzate mediante imaging chemiluminescente. Durante la visualizzazione e l'elaborazione dei dati, le membrane sono state ritagliate orizzontalmente per rimuovere le regioni di peso molecolare non rilevanti, mantenendo tutte le corsie campione senza eliminare le aree intercorrenti tra le corsie. Durante il ritaglio per rimuovere le regioni di gel non rilevanti, potrebbe verificarsi una leggera distorsione ai bordi.
Rilevamento della microbiota intestinale mediante analisi del sequenziamento del 16S rDNA
Campioni fecali freschi sono stati raccolti da ciascun topo prima delle procedure terminali. I topi sono stati posizionati singolarmente in gabbie sterili per 10–15 minuti per consentire la defecazione spontanea. I pellet fecali sono stati immediatamente raccolti con pinze sterili, trasferiti in provette sterili da 1,5 mL, congelati rapidamente in azoto liquido e conservati a -80 °C fino all'estrazione del DNA. Tutte le procedure sono state eseguite in condizioni sterili per minimizzare la contaminazione incrociata. L'intervallo tra defecazione e congelamento è stato mantenuto entro i 10 minuti per garantire l'integrità microbica. I campioni di DNA genomico fecale (gDNA) sono stati purificati utilizzando il kit di estrazione del gDNA fecale, seguiti dall'amplificazione completa del gene 16S rDNA mediante reazione a catena della polimerasi (PCR) con primer universali 8F (5’-AGAGTTTGATCATGGCTCAG-3’) e 1492R (5’-CGGTTACCTTGTTACGACTT-3’). I prodotti della PCR sono stati successivamente analizzati mediante elettroforesi su gel di agarosio, purificati e quantificati per applicazioni successive. Il sequenziamento ad alto rendimento è stato effettuato sul sequenziatore Nanopore GridION. Il processo di analisi dei dati ha incluso la chiamata delle basi, il controllo di qualità dei dati, l'annotazione delle specie, la costruzione dell'albero filogenetico, l'analisi della comunità, l'analisi della diversità alfa e beta e l'analisi delle specie differenzialmente abbondanti e la previsione della funzione della comunità. Diversi strumenti e database, come NanoFilt, Usearch, il linguaggio di programmazione R, Python e il database SILVA, sono stati utilizzati durante l'analisi.
Analisi della correlazione tra l'asse intestino-retina, l'infiammazione sistemica e la microbiota intestinale a più livelli
Per esplorare le potenziali associazioni tra la microbiota intestinale a più livelli e le citochine infiammatorie sieriche e le proteine regolatrici chiave, è stata effettuata un'analisi di correlazione utilizzando la piattaforma Luoning Bio-Cloud. Inizialmente, i dati sull'abbondanza delle specie ai livelli di Regno, Phylum, Classe, Ordine, Famiglia, Genere e Specie sono stati estratti dai risultati del sequenziamento. I fattori fisicochimici, inclusi le citochine infiammatorie sieriche e i livelli di espressione proteica, sono stati raccolti in un file di fattori ambientali. Per garantire l'affidabilità e la visualizzazione delle correlazioni, i dati sono stati normalizzati al fine di eliminare le differenze di scala tra l'abbondanza microbica e le unità di misura cliniche. Sono stati calcolati i coefficienti di correlazione (valori R) e i corrispondenti livelli di significatività (P-valori). I risultati sono stati visualizzati mediante una mappa termica di correlazione, in cui i gradienti di colore indicano l'intensità e la direzione della correlazione (rosso indica correlazione positiva, blu indica correlazione negativa) e gli asterischi (**) indicano la significatività statistica (P < 0,01).
Metodi statistici
Tutte le analisi statistiche e la visualizzazione dei dati sono state eseguite utilizzando GraphPad Prism. Per confrontare le medie, è stato utilizzato il test t per dati che seguivano una distribuzione normale. Nei casi in cui i dati si discostavano dalla normalità, è stato impiegato il test di Kruskal-Wallis. Per valutare le relazioni tra variabili, sono state effettuate analisi di correlazione di Spearman o di Pearson. Tutti i test statistici sono stati condotti come test a due code, con significatività statistica stabilita al valore di 0,05.