La pagina del rapporto genico di FlyBase per spook (spo) viene presentata come esempio per illustrare la selezione di un allele mutante appropriato. spo è uno dei geni "Halloween" che codificano enzimi coinvolti nella biosintesi degli ormoni steroidei21,22 e si è dimostrato che promuove la fusione dei mioblasti23. La sezione "Alleli" della pagina del rapporto genico di spo in FlyBase elenca 12 alleli mutanti di spo riportati in letteratura, di cui quattro sono stati depositati presso il BDSC (Figura 2A) e sono facilmente disponibili. Se un allele desiderato non è disponibile attraverso il BDSC, può essere richiesto direttamente al gruppo di ricerca che ha originariamente descritto la linea mutante.
Tra i quattro alleli mutanti disponibili presso BDSC, spo1 presenta una mutazione di senso errato (G481E), mentre spoMI06810 contiene un'inserzione MiMIC all'interno della sequenza codificante che determina uno spostamento della cornice di lettura all'amminoacido Y341 (Figura 2B,C). Poiché la proteina Spo è composta da 543 amminoacidi, si prevede che spoMI06810 (Y341fs) produca una proteina troncata priva di circa il 40% della sua lunghezza totale ed è pertanto probabile che rappresenti un allele con perdita di funzione marcata. Per questo motivo, spoMI06810 è preferito rispetto a spo1 per l'analisi fenotipica della fusione dei mioblasti.
La fusione dei mioblasti inizia nello stadio embrionale 12 (7,3−9,3 h dopo la deposizione delle uova [AEL]) e si completa prevalentemente entro la fine dello stadio 15 (11,3−13,3 h AEL)24. I fenotipi di fusione vengono pertanto generalmente valutati negli embrioni allo stadio finale 15, quando è stato formato il modello dei muscoli somatici e la maggior parte degli eventi di fusione si è conclusa.
Gli embrioni allo stadio 15 possono essere identificati da due caratteristiche morfologiche prominenti: il completamento della chiusura dorsale e l'acquisizione della tipica morfologia a forma di cuore del midgut (Figura 3A–C)19. Gli embrioni allo stadio 14 possono essere distinti per l'invaginazione cefalica in corso (Figura 3A), mentre gli embrioni allo stadio 15 mostrano il midgut caratteristico a forma di cuore (Figura 3B). Gli embrioni allo stadio 16 possono essere identificati dalla costrizione del midgut e dalla formazione di quattro camere (ciechi gastrici; Figura 3C)19. Inoltre, l'espressione della proteina MHC è non rilevabile negli stadi precedenti, incluso lo stadio 14, ma diventa marcata a partire dallo stadio 15 e negli stadi successivi (Figura 3A–C).
Alla fase embrionale tardiva 15, la muscolatura della parete corporea è completamente organizzata negli embrioni di tipo selvatico (w1118), e la maggior parte dei semi-segmenti addominali mostra un identico schema muscolare stereotipato nella vista laterale (Figura 3B). Questo schema muscolare stereotipato può essere visualizzato utilizzando anticorpi anti-MHC di coniglio o di ratto (Figura 3B,D). Al contrario, un numero minore di fibre muscolari è visibile quando gli embrioni vengono osservati in orientamento dorsale o ventrale (Figura 3E,F). Pertanto, l'acquisizione di immagini degli embrioni in orientamento laterale permette la visualizzazione dell'intera muscolatura della parete corporea e facilita la valutazione dei difetti nella fusione dei mioblasti.
Per esaminare i difetti di fusione dei mioblasti, la muscolatura della parete corporea di embrioni mutanti omozigoti viene acquisita in orientamento laterale. Gli omozigoti mutanti vengono identificati dall'assenza di un marcatore fluorescente bilanciatore, come GFP o YFP. Ad esempio, gli embrioni mutanti omozigoti per spo derivati da genitori spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP sono negativi per GFP, mentre gli embrioni fratelli che portano il bilanciatore esprimono GFP nel mesoderma (Figura 4B,C). Rispetto agli embrioni di tipo selvatico e a quelli fratelli positivi per GFP, gli embrioni mutanti per spo mostrano un difetto di fusione dei mioblasti caratterizzato dalla presenza di numerosi mioblasti competenti per la fusione (FCMs) non fusi (Figura 4A–C).
È degno di nota che nei spo embrioni mutanti si osservano più MCF non fuse in sezioni ottiche più profonde (Z3 e Z4) rispetto alla sezione superficiale (Z1) (Figura 4B). Questa distribuzione rispecchia l'organizzazione spaziale delle cellule fondatrici e delle MCF durante la fusione dei mioblasti embrionali. Le cellule fondatrici e i miotubi in crescita si trovano principalmente nello strato superficiale del mesoderma, mentre le MCF risiedono in strati più profondi prima di migrare verso i miotubi in crescita e fondersi con essi25. Di conseguenza, i mioblasti non fusi sono più abbondanti in sezioni confocali più profonde, in particolare negli embrioni con difetti parziali di fusione. Pertanto, è necessario acquisire z-stack che coprano l'intera profondità della muscolatura della parete corporea per evitare di sottostimare la gravità del fenotipo di fusione.
Sebbene la visualizzazione della muscolatura della parete corporea nel complesso in orientamento laterale permetta la valutazione fenotipica dei difetti di fusione dei mioblasti, un'analisi quantitativa può essere effettuata visualizzando il muscolo DA1 in orientamento dorsale. Negli embrioni di tipo selvatico, il muscolo DA1 è completamente formato e contiene 13,03 ± 0,60 nuclei positivi per Eve (Figura 5A,C). Negli embrioni mutanti per spo, il numero di nuclei positivi per Eve nel muscolo DA1 è ridotto a 8,16 ± 0,54 (Figura 5B,C), indicando un difetto di fusione in cui un numero minore di FCM si fonde con la cellula fondatrice del muscolo DA1. Per una quantificazione costante e riproducibile, i nuclei positivi per Eve nei muscoli DA1 degli stessi emisegmenti addominali (A2−A5) vengono contati e mediati per ogni embrione, utilizzando la media di ciascun embrione come singolo punto dati per l'analisi statistica (Figura 5C).

Figura 1: Flusso di lavoro per l'analisi genetica, fenotipica e quantitativa della fusione dei mioblasti negli embrioni di Drosophila. Il flusso di lavoro comprende la selezione di ceppi mutanti appropriati, raccolta e fissazione degli embrioni, immunomarcatura su preparati interi e montaggio, nonché lo stadio degli embrioni e l'acquisizione delle immagini. Cliccare qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura.

Figura 2: Selezione di alleli mutanti utilizzando FlyBase. (A) Schermata della pagina del rapporto genico di FlyBase per spo. Gli alleli mutanti sono elencati nella sezione “Alleles”. La colonna Stocks (evidenziata) indica il numero di ceppi disponibili, mentre la colonna Refs (evidenziata) indica il numero di riferimenti associati. (B,C) Lesioni molecolari di due alleli mutanti rappresentativi di spo, spo1 (B) e spoMI06810 (C). Cliccare qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura.

Figura 3: Muscolatura embrionale di Drosophila. (A–C) Immagini a contrasto di fase, proiezioni z confocali colorate per MHC e immagini sovrapposte di embrioni di tipo selvatico (WT) agli stadi 14, 15 e 16. L'involuzione della testa è evidente (frecce) nell'embrione allo stadio 14 (A). Un caratteristico intestino medio a forma di cuore (linea tratteggiata) è osservabile nell'embrione allo stadio 15 (B), mentre l'intestino medio è suddiviso in quattro camere distinte (linee tratteggiate) nell'embrione allo stadio 16 (C). L'espressione della proteina MHC non è rilevabile allo stadio 14 (A), ma diventa intensa agli stadi 15 (B) e 16 (C). Gli embrioni sono mostrati in vista laterale, con l'anteriore a sinistra, il posteriore a destra, il lato dorsale in alto e il lato ventrale in basso. Sono indicati gli emisegmenti toracici (T1–T3) e addominali (A1–A8). (D) Immagine confocale della vista laterale della muscolatura in un embrione WT allo stadio 15, visualizzata mediante un anticorpo di ratto anti-MHC. Per le immagini negli altri pannelli è stato utilizzato un anticorpo di coniglio anti-MHC. (E,F) Proiezioni z confocali delle viste dorsale (E) e ventrale (F) della muscolatura in embrioni WT allo stadio 15. Sono visibili meno fibre muscolari nelle orientazioni dorsale e ventrale rispetto a quella laterale. Barra della scala = 50 µm. Cliccare qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura.

Figura 4: Confronto della muscolatura tra embrioni di tipo selvatico e mutanti spo. (A) Immagini rappresentative ottenute mediante z-stack confocale della muscolatura della parete corporea in vista laterale di un embrione WT allo stadio finale 15. La fusione dei mioblasti è completa e non si osservano mioblasti non fusi. La MHC è mostrata in verde. (B) Immagini rappresentative ottenute mediante z-stack confocale della muscolatura della parete corporea in vista laterale di un embrione mutante spo negativo per GFP ottenuto da genitori spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP. L'assenza di fluorescenza GFP (rosso) indica che l'embrione è omozigote per spoMI06810. Le frecce indicano mioblasti non fusi rappresentativi. Un numero maggiore di mioblasti non fusi è osservabile nelle sezioni ottiche più profonde (Z3 e Z4) rispetto alle zone vicine alla superficie dell'embrione (Z1). La MHC è mostrata in verde. (C) Immagini confocali in vista laterale di un embrione fratello positivo per GFP ottenuto dagli stessi genitori spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP. L'espressione mesodermica di GFP (rosso), indotta dal transgene twi>UAS-GFP presente sul balancer TM3, permette di distinguere gli embrioni fratelli positivi per GFP dagli embrioni mutanti spo omozigoti negativi per GFP. La MHC è mostrata in verde. Scala = 20 µm. Cliccare qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura.

Figura 5: Immagini rappresentative di z-stack al microscopio confocale e quantificazione dei muscoli DA1. (A,B) Immagini confocali a z-stack delle viste dorsali di stadio avanzato 15 di WT (A) e spo mutanteB) embrioni marcati con anti-MHC (verde) e anti-Eve (rosso). Sono state acquisite z-sezioni confocali attraverso l'intera profondità del muscolo DA1 positivo per Eve per rilevare tutti i nuclei presenti all'interno del muscolo. I nuclei positivi per Eve appaiono come regioni non colorate all'interno del segnale MHC. Un muscolo DA1 rappresentativo è delimitato da una linea tratteggiata, e i nuclei positivi per Eve all'interno del muscolo DA1 sono numerati. (CQuantificazione dei nuclei positivi per Eve nei muscoli DA1 di WT e spo embrioni mutanti. Per ogni genotipo sono stati quantificati otto embrioni. Ogni punto dati rappresenta il numero medio di nuclei nei muscoli DA1 degli emisegmenti A2–A5 di un singolo embrione. I dati sono presentati come media ± SD (barre rosse). La significatività statistica è stata determinata utilizzando un test t di Student a due code t-test; p < 0,0001. Scala = 20 µm. Cliccare qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura.
| Numero di ceppo BDSC | Genotipo | Scopo |
| 6873 | N1/FM7c, twi>UAS-GFP | L'espressione mesodermica di GFP permette l'identificazione di embrioni mutanti omozigoti negativi per GFP. |
| 6662 | wgGla-1/CyO, twi>UAS-GFP |
| 6663 | DrMio/TM3, twi>UAS-GFP |
| 23229 | baz4/FM7c, Dfd-YFP | L'espressione specifica di YFP nella regione cefalica permette l'identificazione di embrioni mutanti omozigoti negativi per YFP. |
| 23230 | snaSco/ CyO, Dfd-YFP |
| 23232 | Dr1/TM6B, Dfd-YFP |
Tabella 1: ceppi di Drosophila portatori di un gene marcatore fluorescente su cromosomi equilibratori.