Name: Agar-Block Microcosmi per decomposizione controllata tessuti vegetali da Funghi aerobica (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2011-02-03T17:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 34 s
Description: Impara a utilizzare microcosmi agar-block per studiare la biodegradazione del legno da funghi aerobici in condizioni controllate. Questo metodo garantisce risultati riproducibili misurando la perdita di massa e analizzando il ruolo dei substrati esogeni.

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<ol><li>ASTM D1413-07. Standard test method for testing wood preservatives by laboratory soil-block cultures. . <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Annual+Book+of+ASTM+Standards%22">Annual Book of ASTM Standards</a>. , 185-192 (2007).</li>
<li>Bravery, A. F. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBravery%2C+AF+%22A+miniaturized+wood+block+for+the+rapid+evaluation+of+wood+preservative+fungicides%22">A miniaturized wood block for the rapid evaluation of wood preservative fungicides</a>. , International Research Group on Wood Protection (IRG/WP 2113). (1978).</li>
<li>Low, G. A., Young, M. E., Martin, P., Palfreyman, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assessing+the+relationship+between+the+dry+rot+fungus+Serpula+lacrymans+and+selected+forms+of+masonry%5BTitle%5D)+AND+%22Int.+Biodeterior.+Biodegrad%22%5BJournal%5D)">Assessing the relationship between the dry rot fungus Serpula lacrymans and selected forms of masonry.</a> Int. Biodeterior. Biodegrad. 46, 141-150 (2000).</li>
<li>Nicolas, D. Volume I (One/1) - Degradation and Protection of Wood (Syracuse Wood Science Series #5). <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aNicolas%2C+D+%22Wood+Deterioration+and+Its+Prevention+by+Preservative+Treatments%22">Wood Deterioration and Its Prevention by Preservative Treatments</a>. , Syracuse University Press. (1973).</li>
<li>Schilling, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+calcium-based+materials+and+iron+impurities+on+wood+degradation+by+the+brown+rot+fungus+Serpula+lacrymans%5BTitle%5D)+AND+%22Holzforschung%22%5BJournal%5D)">Effects of calcium-based materials and iron impurities on wood degradation by the brown rot fungus Serpula lacrymans.</a> Holzforschung. 64, 93-99 (2010).</li>
</ol>

Nessun conflitto di interessi dichiarati.

Utilizzando il nostro agar-block set-up (Figura 1) lacrymans Serpula cresciuto a diretto contatto con le superfici in gesso e in blocchi di legno (Figura 2), portando a oltre il 60% di perdita di peso nel marrone-decomporsi controllo blocchi di pino (Figura 3 ). Questo soddisfa facilmente l&#39;obiettivo standard ASTM di decadimento&gt; 50% e il coefficiente medio di variazione (C V) nel decadimento in era 0,055 alla settimana 16. Questi dati vengono pubblicati in Schilling 7. Ancora una v...

<table><tbody><tr><td>Piastre di Petri</td><td>Nalge Nunc international</td><td>4014</td><td>25 x 150 mm</td></tr><tr><td>Agar, tipo A</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A4550</td><td></td></tr><tr><td>Nitrato di ammonio, NH&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;NO&lt;sub&gt;3&lt;/sub&gt;</td><td>Millinckrodt</td><td>3436-12</td><td></td></tr><tr><td>Fosfato di potassio, KH&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;PO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;</td><td>JT Baker</td><td>3246-01</td><td></td></tr><tr><td>Solfato di magnesio eptaidrato, MgSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>230391</td><td></td></tr><tr><td>D-(+)-Glucosio</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G8270</td><td>Destrosio</td></tr><tr><td>Acido borico, H&lt;sub&gt;3&lt;/sub&gt;BO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>2549-04</td><td></td></tr><tr><td>Solfato di zinco eptaidrato, ZnSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>8880-12</td><td></td></tr><tr><td>Cloruro manganoso tetraidrato, MnCl&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&amp;#8226;4H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>JT Baker</td><td>2540-04</td><td></td></tr><tr><td>Solfato di rame(II) pentaidrato, CuSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;5H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>209198</td><td></td></tr><tr><td>Molibdato eptammonico tetraidrato, (NH&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;)&lt;sub&gt;6&lt;/sub&gt;Mo&lt;sub&gt;7&lt;/sub&gt;O&lt;sub&gt;24&lt;/sub&gt;&amp;#8226;4H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>431346</td><td></td></tr><tr><td>Cloruro di calcio diidrato, CaCl&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&amp;#8226;2H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>4160-12</td><td></td></tr><tr><td>Cloruro di sodio, NaCl</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>7581-12</td><td></td></tr><tr><td>Solfato ferroso eptaidrato, FeSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;7H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Mallinckrodt Baker Inc.</td><td>5056-12</td><td></td></tr><tr><td>Pipetta automatica</td><td>Drummond Scientific</td><td>4-000-110</td><td>Senza filo&lt;br/&gt;EtOH la superficie</td></tr><tr><td>Pipetta sterile in polistirene da 10 ml</td><td>BD Biosciences</td><td>357551</td><td></td></tr><tr><td>Gutter Guard</td><td>Thermwell Products Co.</td><td>VX620</td><td>Prerisciacquato con sapone&lt;br/&gt;Negozio di ferramenta</td></tr><tr><td>Solfato di calcio emiidrato, CaSO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;&amp;#8226;0,5H&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;O</td><td>Acros Organics</td><td>385355000</td><td></td></tr><tr><td>Foratino per sughero n. 4</td><td>Boekel Scientific</td><td>1601</td><td></td></tr><tr><td>Parafilm &quot;M&quot;</td><td>Pechiney Plastic Packaging</td><td>PM-996</td><td></td></tr></tbody></table>

agar-block microcosmi per decomposizione controllata tessuti vegetali da funghi aerobica

Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi

I due metodi principali per lo studio biodegradazione fungine dei tessuti vegetali lignocellulosiche sono stati sviluppati per i test del legno (suolo-block; agar-block). E &#39;ben accettato che il suolo-block microcosmi rendimenti più elevati tassi di decadimento, meno problemi di umidità, bassa variabilità tra gli studi, e soglie più elevate di tossicità conservante. Suolo-block test è quindi la tecnica più utilizzata ed è stato standardizzato dalla American Society for Testing and Materials (ASTM) (metodo D 1413-07). Il terreno blocco design è inconvenienti, però, utilizzando fonti suolo localmente variabile e nel limitare il controllo delle sostanze nutritive esterna (esogena) ai tessuti in decomposizione. Questi svantaggi sono emersi come un problema per l&#39;applicazione di questo metodo per gli altri, ha come obiettivo la ricerca sempre più popolare. Questi obiettivi includono moderni legnocellulosa degradante per la ricerca per la bioenergia, il collaudo biorisanamento di co-metabolizzata sostanze tossiche, valutando i meccanismi ossidativi e il monitoraggio elementi traslocato lungo le reti ifale. Suolo blocchi non prestano abbastanza controllo in queste applicazioni. Un raffinato agar-block approccio è necessario. Qui usiamo il marciume bruno legno degradanti fungo lacrymans Serpula a degradare legno in agar-blocco microcosmi, con profondo Petri con basso contenuto di calcio agar. Testiamo il ruolo di esogeni gesso su decadimento in una serie temporale, per dimostrare l&#39;utilità e la variabilità attesa. Isolati da una singola scheda rip (taglio longitudinale) sono condizionati, pesato, in autoclave, e introdotto in modo asettico in cima a una rete di plastica. Vaccinazioni fungine sono in ogni faccia del blocco, con esogena gesso aggiunti alle interfacce. Raccolti sono asettiche fino al raccolto finale distruttivo. Questi microcosmi sono progettati per evitare il contatto blocco con agar o pareti piastra di Petri. Condensa è ridotto al minimo durante piatto versa e durante l&#39;incubazione. Infine, l&#39;inoculo / gesso / legno spazio è ridotto al minimo, ma senza permettere contatto. Questi aspetti meno tecnici di agar-block design sono anche le cause più comuni di fallimento e la principale fonte di variabilità tra gli studi. Pubblicazione del video è quindi utile in questo caso, e dimostriamo a bassa variabilità, risultati di alta qualità.

Questo video dimostra un approccio controllato ambiente per studiare la degradazione dei tessuti vegetali lignocellulosici da funghi aerobico. La capacità di controllare le fonti di nutrienti e l&#39;umidità è un vantaggio chiave di agar-block microcosmi, ma l&#39;approccio produce spesso alterne fortune. Ci rivolgiamo insidie ​​critici cedere riproducibile, a bassa variabilità dei risultati.

Agar-Block Microcosmi per decomposizione controllata tessuti vegetali da Funghi aerobica

I due metodi principali per studiare la biodegradazione fungina dei tessuti vegetali lignocellulosici sono stati sviluppati per il collaudo dei preservative per il legno (soil-block; ...

L'obiettivo generale di questa procedura è inoculare un fungo aerobico degradatore del legno in un microcosmo in piastra di Petri in cui l'umidità del legno e i substrati esogeni sono strettamente controllati. Questo viene ottenuto preparando innanzitutto microcosmi con volumi esatti di mezzi noti. Successivamente, il legno da degradare e qualsiasi substrato solido esogeno vengono posizionati sopra una griglia di plastica sulla superficie dell'agar, evitando qualsiasi contatto tra i substrati.Il microcosmo viene quindi inoculato e incubato con il fungo in esame. Al termine dell'incubazione, i blocchetti di legno vengono raccolti per determinare la perdita di massa e per preparare i tessuti da analizzare. In definitiva, si possono ottenere risultati che mostrano il grado di biodegradazione del legno e il ruolo delle fonti esogene di elementi mediante misurazioni della perdita di massa, osservazioni della morfologia del micelio e analisi elementari mirate, come la spettroscopia al plasma accoppiato induttivamente.Ciao, mi chiamo Brooke Jacobson del laboratorio del Dott. Jonathan Schilling del Dipartimento di Ingegneria dei BioProdotti e dei Sistemi Biologici dell'Università del Minne

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Isolamento dei nativi microrganismi del suolo con un potenziale di Breaking Down biodegradabili di pacciamatura film plastici utilizzati in agricoltura

Questo articolo descrive protocolli dettagliati per la fabbricazione di ecosistema di dispositivi (EcoFABs) che permettono studi di piante e interazioni piante-microrganismi in condizioni di laboratorio altamente controllate.

Protocolli di fabbricazione (EcoFAB) di ecosistema per la costruzione degli ecosistemi di laboratorio progettato per studiare le interazioni piante-microrganismi

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Preparazione media per la coltivazione di microrganismi in condizioni rigorosamente anaerobiche/anossiche

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Inoculazione e osservazione di colture micorriziche arbuscolari su sistemi autotrofi a base di polimeri superassorbenti

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Impara a utilizzare microcosmi agar-block per studiare la biodegradazione del legno da funghi aerobici in condizioni controllate. Questo metodo garantisce risultati riproducibili misurando la perdita di massa e analizzando il ruolo dei substrati esogeni.

Agar-Block Microcosmi per decomposizione controllata tessuti vegetali da Funghi aerobica

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