Name: Glicani Imaging in embrioni di zebrafish con marcatura metabolica e Chimica Clicca Bioorthogonal (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2011-06-06T15:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 46 s
Description: Scopri l'imaging dei glicani negli embrioni di zebrafish con marcatura metabolica e chimica click bioortogonale. Questo metodo consente la visualizzazione dinamica in vivo dei glicani fucosilati durante lo sviluppo.

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Questo lavoro è stato in parte sostenuto dal National Institutes of Health (GM093282 di PW; 3U54AI057158-06S1 a RDS) e fondi di avvio di Albert Einstein College of Medicine.

1. Uovo Raccolta e Dechorionation <ol><li> Raccogliere e trasferire le uova di pesce zebra piatto 35 millimetri di Petri, rimuovere l'acqua il più possibile e si aggiunge 1 mg / ml E Pronease nel medio embrione E3 (5 mM NaCl, 0,17 mM KCl, 0,33 mM CaCl 2 · 2H 2 O, 0,33 mM MgSO 4, pH = 7,4) per digerire il corion. </li><li> Dopo 3-5 minuti, unire il piatto in un bicchiere pieno di pesci d'acqua (60 mg "Ocean istantanea" per litro distillata H 2 O), e delicatamente trasferire le uova nel becher e lasciare le uova di "caduta" in acqua. </li><li> Lavare le uova con pesci d'acqua tre volte. La maggior parte delle uova saranno liberati dalla loro corion. </li><li> Utilizzando un incendio lucidato vetro pipetta Pasteur, trasferire le uova dechorionated di agarosio rivestite piastre di Petri riempite con terreno di embrione E3. </li></ol> 2. Microiniezione con un PIL-FucAl <ol><li> Preparare i piatti dopo l'iniezione del protocollo riportato 7. </li><li> Trasferimento uova dechorionated in piatti pieni di iniezione medio embrione E3. </li><li> Preparare l'ago, e caricare con 2 microlitri soluzione iniettabile. Questa soluzione contiene 20 mM PIL FucAl sintetizzato chemoenzymatically 8 e sia Alexa Fluor 594-destrano (5% w / v) come tracciante o rosso fenolo carico colorante (0,1% w / v) in 0,2 M KCl. Come controllo negativo, sostituire il PIL con un PIL-FucAl-fucosio in soluzione iniettabile. </li><li> Rompere l'ago e regolare la pressione di iniezione e la durata per produrre un 1 goccia nL 9. </li><li> Iniettare le uova con 1 nL di entrambe le soluzioni. </li><li> Trasferire le uova in agarosio rivestite piastre di Petri riempite con terreno di embrione E3. </li><li> Incubare le uova a 28 ° C ed eliminare le uova non fecondate entro tre o quattro ore dopo la fecondazione. </li></ol> 3. BTTES-Cu (I)-catalizzata reazione chimica Clicca <ol><li> Quando gli embrioni raggiungono desiderato stadi di sviluppo (ad esempio gastrula tardiva, la segmentazione dei tessuti e larve presto), cappotto alla base di una piastra da 96 pozzetti con agarosio. </li><li> Aggiungere 92 microlitri di media embrione E3 in ogni pozzetto, seguita da aggiunta di 4 microlitri Alexa Fluor-488 azide (da uno stock 2,5 mm H 2 O), 2 microlitri BTTES-CuSO 4 6:01 complesso, e agitare delicatamente per miscelare. </li><li> Trasferimento degli embrioni nel pozzo contenente il reagente chimico clic utilizzando un incendio lucidato vetro pipetta Pasteur. Ogni bene deve contenere meno di cinque embrioni. </li><li> Aggiungere 2,5 microlitri ascorbato di sodio preparata (da uno stock di 100 mm H 2 O) per iniziare l'attacco su 3. Concentrazione finale di ogni reagente: Alexa Fluor-488 azide: 100 mM; CuSO 4: 50 micron; BTTES: 300 mM; ascorbato di sodio: 2,5 mm. </li><li> Dopo 3 minuti, aggiungere 2 microlitri bathocuproine solfonato (50 mM magazzino in H 2 O), un chelante del rame biocompatibile, per placare la reazione poi diluire subito con 100 microlitri di media embrione E3. </li><li> Trasferire gli embrioni per un piatto di vetro di Petri e lavare gli embrioni trattati 2 volte con 15 ml di media embrione E3. </li></ol> 4. Imaging <ol><li> Mettere una goccia di bassissimo punto di fusione agarosio (1,2% (w / v) in un mezzo embrione E3) su un fondo di vetro piatto MatTek pozzetti, e posto un embrione nella goccia di agarosio. </li><li> Posizionare gli embrioni dorsalmente o lateralmente e posizionare il piatto in ghiaccio per 5 minuti a solidificare la goccia di agarosio. Aggiungi medio E3 embrione dolcemente verso il piatto fino a coprire il calo di agarosio. </li><li> Immagini di campo fluorescenza e luminose vengono acquisiti in sequenza usando un microscopio confocale. Tutte le immagini degli embrioni vengono acquisite utilizzando un intervallo di fase 5 micron. Figure compositi sono stati preparati utilizzando il software ImageJ. </li></ol> 5. Rappresentante Risultati La figura 1 mostra il flusso di lavoro della nostra strategia in due fasi di etichettatura. La Figura 2 mostra l'etichettatura di embrioni di zebrafish via BTTES-mediata CuAAC al 9,5 ore dopo la fecondazione (HPF). BTTES è un (triazolylmethyl) ammina tris a base di legante. Accelera CuAAC drammaticamente quando coordinamento con il Cu generato in situ (I), e promuove la reazione di cicloaddizione rapidamente nei sistemi viventi senza tossicità apparente. Subito dopo un 3-minuti di reazione su, siamo in grado di rilevare l'etichettatura robusta degli embrioni trattati PIL FucAl (Figura 2, pannelli a sinistra). Fluorescenza di fondo è rilevato solo per gli embrioni di controllo microiniettati con il PIL-fucosio (Figura 2, pannelli a destra). <img src="/files/ftp_upload/2686/2686fig1.jpg" alt="Figura 1" data-altupdatedat="1787634011000" data-alt="Figura 1"> Figura 1. La strategia di etichettatura glicani fucosylated nello strato avvolgente di embrioni di zebrafish. <img src="/files/ftp_upload/2686/2686fig2.jpg" alt="Figura 2" data-altupdatedat="1787634011000" data-alt="Figura 2"> Figura 2. In imaging in vivo di glicani fucosylated durante l'embriogenesi zebrafish via BTTES-Cu (I)-chimica catalizzata clic. Unicellulare embrioni di zebrafish fase sono microiniettati con una singola dose del PIL-FucAl e ha permesso di sviluppoop a 9,5 HPF. Gli embrioni vengono poi reagito con Alexa Fluor 488-azide catalizzata da BTTES-Cu (I). Gli embrioni vengono esposte reagito usando la microscopia confocale. Intensità massima di z-proiezione immagini di Alexa Fluor 488 fluorescenza (pannello superiore); campo Bright (pannello inferiore). Scala grafica: 100 micron. Risoluzione dei problemi <table border="1"><tbody><tr><td> Problema </td><td> Causa </td><td> Rimedio </td></tr><tr><td> Gli embrioni aspetto malsano </td><td> La soluzione microiniettati contiene contaminanti </td><td> La purezza degli zuccheri nucleotide deve essere superiore all'85%. Controlla la tua fonte. </td></tr><tr><td> Non c'è sull'etichetta dopo la reazione </td><td> Concentrazione di rame è inferiore a 30 micron </td><td> Fare attenzione a non diluire la soluzione di reazione con l'aggiunta di eccesso di media embrione E3 quando si aggiungono gli embrioni, come la velocità di reazione diminuisce in maniera significativa quando la concentrazione di rame è inferiore a 30 micron. </td></tr><tr><td> Gli embrioni muoiono dopo la reazione </td><td> Uso improprio degli embrioni </td><td> Assicurarsi che la pipetta è fuoco lucidato e il recipiente di reazione è rivestita con uno strato molto sottile di 0,5% di agarosio. </td></tr><tr><td> Le immagini appaiono spotty </td><td> I reagenti non sono propriamente mescolati prima di aggiungere gli embrioni </td><td> Seguire l'ordine consigliato di aggiunta dei reagenti, e assicurarsi che i reagenti clicca chimica sono stati opportunamente miscelati prima di aggiungere gli embrioni. </td></tr><tr><td> Le immagini mostrano gli embrioni vengono danneggiati </td><td> Vigorosa agitazione danni degli embrioni durante la reazione </td><td> Agitare delicatamente per meno di 10 secondi una volta gli embrioni sono nella soluzione. </td></tr><tr><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

<ol><li>Laughlin, S. T., Bertozzi, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+the+glycome%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.+S.+A%22%5BJournal%5D)">Imaging the glycome.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 106, 12-17 (2009).</li>
<li>Baskin, J. M., Bertozzi, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bioorthogonal+click+chemistry%3A+Covalent+labeling+in+living+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Qsar+Comb.+Sci%22%5BJournal%5D)">Bioorthogonal click chemistry: Covalent labeling in living systems.</a> Qsar Comb. Sci. 26, 1211-1219 (2007).</li>
<li>Soriano del Amo, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biocompatible+copper%28I%29+catalysts+for+in+vivo+imaging+of+glycans%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Am.+Chem.+Soc%22%5BJournal%5D)">Biocompatible copper(I) catalysts for in vivo imaging of glycans.</a> J. Am. Chem. Soc. 132, 16893-16899 (2010).</li>
<li>Chang, P. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metabolic+labeling+of+sialic+acids+in+living+animals+with+alkynyl+sugars%5BTitle%5D)+AND+%22Angew.+Chem.+Int.+Ed%22%5BJournal%5D)">Metabolic labeling of sialic acids in living animals with alkynyl sugars.</a> Angew. Chem. Int. Ed. 48, 4030-4033 (2009).</li>
<li>Laughlin, S. T., Baskin, J. M., Amacher, S. L., Bertozzi, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vivo+imaging+of+membrane-associated+glycans+in+developing+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">In vivo imaging of membrane-associated glycans in developing zebrafish.</a> Science. 320, 664-667 (2008).</li>
<li>Baskin, J. M., Dehnert, K. W., Laughlin, S. T., Amacher, S. L., Bertozzi, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualizing+enveloping+layer+glycans+during+zebrafish+early+embryogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.+S.+A%22%5BJournal%5D)">Visualizing enveloping layer glycans during zebrafish early embryogenesis.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 107, 10360-10365 (2010).</li>
<li>Kemp, H. A., Carmany-Rampey, A., Moens, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generating+chimeric+zebrafish+embryos+by+transplantation%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Vis.+Exp%22%5BJournal%5D)">Generating chimeric zebrafish embryos by transplantation.</a> J. Vis. Exp. , (2009).</li>
<li>Wang, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemoenzymatic+synthesis+of+GDP-L-fucose+and+the+Lewis+X+glycan+derivatives%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.+S.+A%22%5BJournal%5D)">Chemoenzymatic synthesis of GDP-L-fucose and the Lewis X glycan derivatives.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 106, 16096-16101 (2009).</li>
<li>Rosen, J. N., Sweeney, M. F., Mably, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microinjection+of+zebrafish+embryos+to+analyze+gene+function%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Vis.+Exp%22%5BJournal%5D)">Microinjection of zebrafish embryos to analyze gene function.</a> J. Vis. Exp. , (2009).</li>
<li>Westerfield, M. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aWesterfield%2C+M+%22THE+ZEBRAFISH+BOOK%2C+A+guide+for+the+laboratory+use+of+zebrafish+%28Danio+rerio%29%22">THE ZEBRAFISH BOOK, A guide for the laboratory use of zebrafish (Danio rerio)</a>. , 5th Edition, University of Oregon Press. Eugene. (2007).</li>
<li>Kimmel, C. B., Warga, R. M., Schilling, T. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Origin+and+organization+of+the+zebrafish+fate+map%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Origin and organization of the zebrafish fate map.</a> Development. 108, 581-594 (1990).</li>
</ol>

Nessun conflitto di interessi dichiarati.

<p class="jove_content"&gt; Imaging biomolecole<em&gt; In vivo</em&gt; Fornisce spunti critici della loro attività biologica nel loro ambiente naturale. In questo video, ci dimostrano come l&#39;etichettatura dei glicani fucosylated nello strato avvolgente di embrioni di zebrafish è realizzato da microinjecting unicellulare embrioni stadio con il PIL-FucAl e una seconda fase coniugazione fluoroforo attraverso BTTES-mediata CuAAC biocompatibile<sup&gt; 3</sup&gt;. Etichettatura robusta può essere raggiunto entro 2-3 minuti, e il glicani etichett...

<table border="1"><tbody><tr><td> Nome del reagente </td><td> Azienda </td><td> Numero di catalogo </td></tr><tr><td> Di rame (II) solfato pentaidrato </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 203165 </td></tr><tr><td> Alexa Fluor 488 azide </td><td> Invitrogen </td><td> A10266 </td></tr><tr><td> destrano, Alexa Fluor 594 </td><td> Invitrogen </td><td> D-22913 </td></tr><tr><td> (+)-L-ascorbato di sodio </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> A7631 </td></tr><tr><td> Bathocuproinedisulfonic acido </td><td> Acros Organics </td><td> 164060010 </td></tr><tr><td> Con fondo di vetro piatto micropozzetti </td><td> MatTek </td><td> P35G-1.5-14-C </td></tr></tbody></table>

glicani imaging in embrioni di zebrafish con marcatura metabolica e chimica clicca bioorthogonal

Imaging Glycans in Zebrafish Embryos by Metabolic Labeling and Bioorthogonal Click Chemistry

Glicani di imaging in vivo è stato recentemente attivato utilizzando un bioorthogonal strategia giornalista chimica trattando cellule o degli organismi con monosaccaridi azide-o alchini-tag 1, 2. Il monosaccaridi modificato, elaborato dalla macchina biosintetica glicani, sono incorporati in glicoconiugati superficie cellulare. I tag bioorthogonal azide o alchini quindi consentire coniugazione covalente con sonde fluorescenti per la visualizzazione, oppure con sonde affinità per l&#39;arricchimento e l&#39;analisi glycoproteomic. Questo protocollo descrive le procedure normalmente utilizzate per l&#39;imaging non invasivo di glicani fucosylated in embrioni di zebrafish, tra cui: 1) microiniezione di una cella-embrioni stadio con un PIL-5-alkynylfucose (PIL-FucAl), 2) l&#39;etichettatura glicani fucosylated nello strato avvolgente di embrioni di zebrafish con azide coniugato fluorofori via Cu biocompatibile (I)-catalizzata azide-alchino cicloaddizione (CuAAC), e 3) l&#39;imaging mediante microscopia confocale 3. Il metodo descritto qui può essere facilmente esteso ad altre classi di visualizzare glicani, glicani contenenti ad esempio acido sialico 4 e N-acetilgalattosamina 5, 6, in zebrafish di sviluppo e in altri organismi viventi.

Un click-chimica metodo basato che permette la rapida, etichettatura non invasivo, e robusto di alchini-tagged glicani in embrioni di zebrafish è descritto. Glicani Fucosylated nello strato avvolgente di embrioni di zebrafish in fase di gastrulazione fine erano ripreso in questo studio.

Glicani Imaging in embrioni di zebrafish con marcatura metabolica e Chimica Clicca Bioorthogonal

L'imaging dei glicani in vivo è stato recentemente reso possibile attraverso l'impiego di una strategia di reporter chimico bioortogonale, trattando cellule o organismi con azide o...

La recente dimostrazione dell'imaging in vivo di glicani utilizza una strategia di reportage chimico bioortogonale, che prevede il trattamento di cellule o organismi con monosaccaridi marcati con alchini o azidi. I monosaccaridi modificati, elaborati dal macchinario biosintetico dei glicani, vengono incorporati nei glicoconjugati della superficie cellulare, contenenti marcatori bioortogonali alchini o azidi. Questi permettono quindi la coniugazione covalente con sonde fluorescenti per la visualizzazione o con sonde di affinità per l'arricchimento e l'analisi glicoproteomica.Questo metodo basato sulla chimica click consente un'etichettatura rapida, non invasiva e robusta di glicani alchini o azidi negli embrioni di pesce zebra e può essere facilmente esteso alla visualizzazione di altre classi di glicani in organismi in via di sviluppo. Il principale vantaggio di questa tecnica rispetto ai metodi esistenti, come il rilevamento di glicani mediante lectine o anticorpi, è che può essere applicata all'imaging dinamico in vivo. I metodi di imaging basati su lectine o anticorpi forniscono soltanto un'istantanea dei glicani in un determinato momento.Sono difficili da implementare nel conte

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Riportiamo lo sviluppo di un sistema automatizzato per l'imaging e l'analisi di zebrafish embrioni transgenici in piastre a pozzetti multipli. Questo dimostra la capacità di misurare gli effetti dose-dipendente di una piccola molecola, BCI, sull'espressione del gene del fattore di crescita dei fibroblasti giornalista e fornire tecnologia per stabilire high-throughput schermi chimici zebrafish.

Sviluppo di imaging automatizzati e analisi chimiche per gli schermi zebrafish.

Chiave per comprendere i processi morfogenetici che forma l'embrione precoce è la capacità di celle di immagine ad alta risoluzione. Descriviamo qui una tecnica per l'etichettatura di singole cellule o piccoli gruppi di cellule in embrioni di zebrafish intero con membrana mirati proteina verde fluorescente.

Etichettatura e cellule Imaging nel romboencefalo Zebrafish

Questo video mostra un test di captazione degli anticorpi per visualizzare la segnalazione Notch/DeltaD nei progenitori della glia radiale del pesce zebra. Prevede il montaggio di embrioni di pesce zebra dechorionati inclusi in agarosio, l'iniezione di una soluzione colorante mirata ai ligandi DeltaD sugli RGP e l'imaging al microscopio a fluorescenza per la divisione cellulare asimmetrica che conferma l'attivazione della segnalazione Notch/DeltaD.

Un saggio di captazione degli anticorpi per l'imaging della segnalazione Notch/DeltaD nei progenitori della glia radiale del pesce zebra

L'embrione zebrafish è un ottimo modello per la ricerca biologia dello sviluppo. Durante l'embriogenesi, zebrafish sviluppare con una massa tuorlo, che presenta sfide tridimensionali per l'osservazione e l'analisi del campione. Questo protocollo descrive come creare bidimensionali montaggio preparazioni semplici di tutto il monte in situ (WISH) colorati esemplari embrioni di zebrafish.

Preparazione di montaggio schermo per l&#39;osservazione e l&#39;analisi di zebrafish campioni macchiato da Whole Monte<em&gt; In situ</em&gt; Ibridazione

L'imaging del comportamento dinamico degli organelli e di altre strutture subcellulari in vivo può far luce sulla loro funzione in condizioni fisiologiche e patologiche. Qui, presentiamo metodi per marcare geneticamente due organelli, centrosomi e mitocondri, e per l'imaging delle loro dinamiche in embrioni di zebrafish viventi utilizzando la microscopia a campo largo e confocale.

Imaging strutture subcellulari nell&#39;embrione Living Zebrafish

Viene descritta una nuova tecnica per la rilevazione dei recettori endogeni a bassa abbondanza presenti negli embrioni di zebrafish. L'abbiamo chiamato AFLIP perché consiste nell'etichettatura di affinità del recettore da parte del suo ligando legato all'immunoprecipitazione.

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Questo lavoro descrive metodi per stabilire modelli iperglicemia acuta e cronica in zebrafish. L'obiettivo è quello di indagare l'impatto dell'iperglicemia sui processi fisiologici, come la neurogenesi costitutiva e indotta da lesioni. Il lavoro evidenzia anche l'uso di zebrafish per seguire molecole radiomarcate (qui, [ 18 F] -FDG) usando PET / CT.

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Visualizzazione della sialilazione intracellulare con la chimica a scatto e la microscopia ad espansione

Qui, presentiamo un protocollo per marcare le proteine con un tag proteico di fluorescenza nelle larve di zebrafish, un sistema in vivo recentemente sviluppato e modificato particolarmente utile per visualizzare le proteine a bassa abbondanza nel zebrafish.

Marcatura a fluorescenza per visualizzare le proteine a bassa espressione nel pesce zebra

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Due fotoni assotomia e time-lapse confocale in embrioni di zebrafish vivo

Scopri l'imaging dei glicani negli embrioni di zebrafish con marcatura metabolica e chimica click bioortogonale. Questo metodo consente la visualizzazione dinamica in vivo dei glicani fucosilati durante lo sviluppo.

Glicani Imaging in embrioni di zebrafish con marcatura metabolica e Chimica Clicca Bioorthogonal

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