Proteine ​​saggezza: un banco di lavoro per In silico De novo Progettazione di biomolecole

L'obiettivo generale del seguente esperimento è quello di progettare proteine o peptidi per migliorare il ripiegamento, il legame o le proprietà funzionali. Ciò si ottiene caricando la proteina o la struttura complessa e definendo la mutazione e i vincoli biologici Per definire l'obiettivo di progettazione come seconda fase, viene eseguita l'ottimizzazione della selezione della sequenza, che produce un gran numero di possibili sequenze proteiche o peptidiche con proprietà di stabilità e interazione migliorate. Piega successiva.

I calcoli della specificità e/o dell'affinità di legame approssimata vengono eseguiti sulla sequenza progettata al fine di convalidare le proteine o i peptidi progettati per le proprietà migliorate desiderate. Si ottengono risultati che mostrano proprietà migliorate delle sequenze progettate sulla base dell'analisi computazionale delle strutture prodotte attraverso la procedura. Questo protocollo è stato sviluppato nel laboratorio del professor Chris Doles, flautista dell'Università di Princeton.