Introduzione al pesce zebra: Danio rerio

An Introduction to the Zebrafish: <i>Danio rerio</i>
JoVE Science Education
Biology II: Mouse, Zebrafish, and Chick
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JoVE Science Education Biology II: Mouse, Zebrafish, and Chick
An Introduction to the Zebrafish: Danio rerio

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08:31 min
April 30, 2023

Overview

I pesci zebra (Danio rerio) sono piccoli pesci d’acqua dolce che vengono utilizzati come organismi modello per la ricerca biomedica. I molti punti di forza di questi pesci includono il loro alto grado di conservazione genetica con gli esseri umani e la loro manutenzione semplice ed economica. Inoltre, l’espressione genica può essere facilmente manipolata negli embrioni di zebrafish e la loro trasparenza consente l’osservazione dei processi di sviluppo.

Questo video introduttivo introduce innanzitutto la biologia di base del pesce zebra, compresa la loro filogenesi, il ciclo di vita e l’ambiente naturale, prima di presentare le caratteristiche che li rendono così utili in laboratorio. Una breve storia della ricerca sul pesce zebra è fornita anche attraverso una rassegna delle principali scoperte fatte nel pesce, che vanno dalla rapida istituzione di metodi per uno screening genetico efficiente alla scoperta di nuove terapie per malattie umane come il cancro. Infine, vengono discusse alcune delle molte strade di sperimentazione eseguite nel pesce zebra, compresi gli studi immunologici e di sviluppo.

Procedure

Danio rerio, o zebrafish, sono piccoli pesci che stanno facendo un grande tuffo nella ricerca biomedica. Il pesce zebra depone centinaia di uova che si sviluppano esternamente, consentendo agli scienziati di eseguire manipolazioni genetiche e monitorare i primi fenotipi in un organismo complesso. Dal momento che condividono gran parte del loro genoma con gli esseri umani, la ricerca sui pesci zebra ci sta aiutando nel nostro modo di comprendere e curare le malattie umane. Questo video fornirà una panoramica del pesce zebra, le caratteristiche che li rendono ottimi modelli e alcuni dei modi in cui vengono utilizzati nei laboratori di oggi.

Prima di parlare di tutta quella scienza pescosa, conosciamo il pesce zebra. Come i topi e gli esseri umani, i pesci zebra sono vertebrati, il che significa che possiedono una spina dorsale.

Nello specifico, i pesci zebra sono pesci ossei della classe Actinopterygii, caratterizzati dalla presenza di raggi ossei nelle pinne. Più precisamente, i pesci zebra appartengono alla più grande famiglia di vertebrati: Cyprinidae, che contiene oltre 2.400 specie, tra cui l’amabile pesce rosso.

Danio rerio sono tra i membri più piccoli di questa famiglia, con adulti che misurano 30 – 40 millimetri, o circa 1,5 pollici, di lunghezza. I pesci zebra ottengono il loro nome perché assomigliano alle zebre. No, non proprio così. Il nome deriva dalle strisce che corrono per tutta la lunghezza dei loro corpi a forma di siluro.

I pesci zebra provengono dalla regione himalayana, dove si trovano in corpi d’acqua dolce che si muovono lentamente. Tuttavia, non è necessario viaggiare molto lontano per trovarli, poiché i Danios sono pesci resistenti che sono punti fermi degli acquari domestici.

Il ciclo di vita del pesce zebra avanza attraverso 4 principali fasi di sviluppo: embrione, larva, giovane e adulto. Il ciclo inizia quando le uova e lo sperma vengono rilasciati da una coppia di accoppiamento. Dopo la fecondazione, le fasi iniziali dello sviluppo progrediscono rapidamente, con embrioni che si schiudono in larve entro 3 giorni dalla fecondazione, o dpf. Da questo punto, la progressione in un adulto sessualmente maturo richiede altri due o tre mesi.

Ora che sappiamo un po ‘di zebrafish in natura, esaminiamo perché sono così preziosi in laboratorio. In primo luogo, i pesci zebra possono essere alloggiati ad alta densità e sono semplici da curare, rendendoli meno costosi da mantenere rispetto ad altri modelli di vertebrati.

Successivamente, i pesci zebra sono estremamente fertili. Le femmine mature possono deiunare centinaia di uova su base settimanale.

Lo sviluppo esterno di embrioni di zebrafish è estremamente conveniente, a causa della facilità con cui l’espressione genica può essere manipolata con tecniche di microiniezione. Inoltre, poiché gli embrioni sono trasparenti, i primi processi di sviluppo possono essere osservati all’interno dell’organismo vivente.

È importante sottolineare che i pesci zebra possiedono anche un alto grado di conservazione genetica con vertebrati più elevati, compresi gli esseri umani. Il genoma del pesce zebra contiene 25 cromosomi e 1,5 miliardi di coppie di basi, che è circa la metà delle dimensioni del genoma umano. Tuttavia, circa il 70% di tutti i geni umani e l’80% di tutti i geni noti correlati alle malattie umane hanno almeno una controparte zebrafish.

Ora che sai perché i pesci zebra sono grandi organismi modello, diamo un’occhiata a come hanno guadagnato le loro strisce in laboratorio. Nel 1970, George Streisinger ha aperto la strada alla creazione del modello zebrafish. A quel tempo, diversi gruppi stavano studiando le basi genetiche dello sviluppo di mosche e vermi. Come appassionato di pesci, Streisinger riconobbe il potenziale del pesce zebra come modello di sviluppo dei vertebrati. Streisinger sviluppò tecniche per la realizzazione di embrioni “ginogenetici”, il cui materiale genetico deriva interamente dalla madre, riducendo così il tempo di generazione necessario per ottenere mutanti omozigoti.

Fu solo nel 1995 che Charles Kimmel e colleghi contribuirono con una caratterizzazione approfondita del normale sviluppo del pesce zebra sul campo.

Un anno dopo, Christiane Nusslein-Volhard, Mark Fishman e Wolfgang Driever hanno pubblicato i risultati del primo screening genetico dei vertebrati su larga scala, condotto a Boston, Massachusetts e Tubingen, in Germania. Modellato sul lavoro di Nusslein-Volhard in Drosophila, questo schermo zebrafish è stato progettato per identificare i geni necessari per lo sviluppo embrionale. I risultati includevano un catalogo di oltre 2.000 pesci zebra mutanti. L’analisi di questi mutanti da allora ci ha insegnato molto sulla nostra biologia.

Nel 2005, Keith Cheng e colleghi hanno clonato slc24a5: il gene responsabile della pigmentazione anomala nel mutante zebrafish dorato. Il fenotipo dorato ha ispirato la scoperta di Cheng che questo particolare gene è richiesto nei pesci e nelle cellule della pelle umana per la sintesi del pigmento melanina e che le modifiche nella proteina sono strettamente legate alle variazioni naturali nel colore della pelle umana.

Nel 2011, i ricercatori del laboratorio di Leonard Zon hanno utilizzato embrioni di zebrafish per identificare una nuova terapia per il melanoma. In uno screening chimico, hanno scoperto una classe di farmaci, tra cui Leflunomide, che ha rallentato la crescita delle cellule che contribuiscono al melanoma. Ora negli studi clinici, Leflunomide è solo un esempio delle nuove terapie che potrebbero essere scoperte in schermi zebrafish ad alto rendimento.

Ora che hai un’idea del valore del modello zebrafish, diamo un’occhiata ad alcuni dei modi in cui i pesci vengono utilizzati nei laboratori di oggi.

Per iniziare, i pesci zebra sono molto utili per modellare le malattie umane ereditarie. Gli stati patologici possono essere facilmente riprodotti mediante microiniezione di embrioni precoci per alterare l’espressione proteica. Questo può essere ottenuto anche da mutanti genetici, come questo modello di distrofia muscolare di Duchenne, che mostra una risposta anormale al tatto.

Poiché il loro sistema immunitario innato si sviluppa durante i primi giorni dopo la fecondazione, gli embrioni di zebrafish sono utili anche per la ricerca sulle malattie infettive. In questo studio, i batteri sono stati iniettati nel flusso sanguigno e la risposta dell’ospite è stata visualizzata in tempo reale utilizzando linee transgeniche con macrofagi fluorescenti.

Grazie alla loro trasparenza, gli embrioni di zebrafish sono anche suscettibili di una tecnica neuroscientifica all’avanguardia chiamata optogenetica. Questi ricercatori hanno progettato un embrione che esprime una proteina in neuroni isolati, che consente loro di attivare otticamente la cellula e determinare la sua funzione specifica in un circuito neurale.

Hai appena visto l’introduzione di JoVE al pesce zebra, Danio rerio. In questo video, abbiamo dimostrato che i pesci zebra sono un organismo modello di vertebrato unico con molti dei vantaggi dei sistemi di invertebrati. In futuro, è probabile che i pesci zebra svolgano un ruolo significativo nel migliorare la nostra comprensione delle malattie umane e la nostra scoperta di terapie clinicamente utili. Grazie per l’attenzione!

Transcript

Danio rerio, or zebrafish, are small fish that are making a big splash in biomedical research. Zebrafish lay hundreds of eggs that develop externally, allowing scientists to perform genetic manipulations and monitor early phenotypes in a complex organism. Since they share much of their genome with humans, zebrafish research is helping us on our way to understanding and treating human disease. This video will provide an overview of the zebrafish, the features that make them great models, and some of the ways in which they are used in labs today.

Before we talk about all that fishy science, let’s get to know the zebrafish. Like mice and humans, zebrafish are vertebrates, meaning they possess a backbone.

Specifically, zebrafish are bony fish in the class Actinopterygii, characterized by the presence of bony rays in their fins. More precisely, zebrafish belong to the single largest vertebrate family: Cyprinidae, which contains over 2,400 species, including the loveable goldfish.

Danio rerio are among the smallest members of this family, with adults measuring 30 – 40 millimeters, or about 1.5 inches, long. Zebrafish get their name because they resemble zebras. No, not quite like that. The name derives from the stripes running the length of their torpedo-shaped bodies.

Zebrafish originate from the Himalayan region, where they are found in slow-moving bodies of fresh water. However, you don’t need to travel very far to find them, as Danios are hardy fish that are staples of home aquariums.

The zebrafish life cycle advances through 4 major developmental stages: Embryo, larva, juvenile and adult. The cycle begins when eggs and sperm are released by a mating pair. After fertilization, the initial stages of development progress rapidly, with embryos hatching into larvae by 3 days post fertilization, or dpf. From this point, progression into a sexually mature adult requires an additional two to three months.

Now that we know a little bit about zebrafish in the wild, let’s review why they are so valuable in the lab. First, zebrafish can be housed at high density and are simple to care for, making them less expensive to maintain than other vertebrate models.

Next, zebrafish are extremely fertile. Mature females can lay hundreds of eggs on a weekly basis.

The external development of zebrafish embryos is extremely convenient, because of the ease with which gene expression can be manipulated by microinjection techniques. Additionally, since embryos are transparent, early developmental processes can be observed within the living organism.

Importantly, zebrafish also possess a high degree of genetic conservation with higher vertebrates, including humans. The zebrafish genome contains 25 chromosomes and 1.5 billion base pairs, which is about half the size of the human genome. Nevertheless, approximately 70% of all human genes, and 80% of all known human disease related genes have at least one zebrafish counterpart.

Now that you know why zebrafish make great model organisms, let’s take a look at how they’ve earned their stripes in the lab. In the 1970s, George Streisinger pioneered the establishment of the zebrafish model. At the time, several groups were investigating the genetic basis of development in flies and worms. As a fish hobbyist, Streisinger recognized the potential of zebrafish as a vertebrate model of development. Streisinger developed techniques for making “gynogenetic” embryos, whose genetic material derives entirely from the mother, thus reducing the generation time required to obtain homozygous mutants.

It wasn’t until 1995 that Charles Kimmel and colleagues contributed a thorough characterization of normal zebrafish development to the field.

One year later, Christiane Nusslein-Volhard, Mark Fishman and Wolfgang Driever published the results of the first large-scale vertebrate genetic screen, which was conducted in Boston, Massachusetts and Tubingen, Germany. Modeled after Nusslein-Volhard’s work in Drosophila, this zebrafish screen was designed to identify genes required for embryonic development. The results included a catalog of more than 2,000 mutant zebrafish. Analysis of these mutants has since taught us a great deal about our own biology.

In 2005, Keith Cheng and colleagues cloned slc24a5: the gene responsible for abnormal pigmentation in the golden zebrafish mutant. The golden phenotype inspired Cheng’s discovery that this particular gene is required in fish and human skin cells for synthesis of the pigment melanin, and that modifications in the protein are tightly linked to natural variations in human skin color.

In 2011, researchers in Leonard Zon’s lab used zebrafish embryos to identify a novel therapeutic for melanoma. In a chemical screen, they discovered a class of drugs, including Leflunomide, that slowed the growth of cells that contribute to melanoma. Now in clinical trials, Leflunomide is but one example of the novel therapeutics likely to be discovered in high-throughput zebrafish screens.

Now that you have a feel for the value of the zebrafish model, let’s look at some of the ways in which fish are used in labs today.

To begin, zebrafish are very useful for modeling heritable human diseases. Disease states can be easily reproduced by microinjection of early embryos to alter protein expression. This can also be achieved by genetic mutants, such as this model of Duchenne muscular dystrophy, which exhibits an abnormal response to touch.

Since their innate immune system develops during the first few days post fertilization, zebrafish embryos are also useful for infectious disease research. In this study, bacteria were injected into the bloodstream, and the host response was visualized in real time using transgenic lines with fluorescent macrophages.

Thanks to their transparency, zebrafish embryos are also amenable to a cutting edge neuroscience technique called optogenetics. These researchers engineered an embryo that expresses a protein in isolated neurons, which allows them to optically activate the cell and determine its specific function in a neural circuit.

You’ve just watched JoVE’s introduction to the zebrafish, Danio rerio. In this video, we’ve demonstrated that zebrafish are a unique vertebrate model organism with many of the advantages of invertebrate systems. In the future, zebrafish are likely to play a significant role in improving our understanding of human disease and our discovery of clinically useful therapeutics. Thanks for watching!