Name: Preparazione di Synaptic membrana plasmatica e Proteine densità postsinaptica Utilizzo di un gradiente di saccarosio discontinuo (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-09-03T15:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 6 s
Description: Impara la frazionamento subcellulare del tessuto cerebrale per arricchire proteine delle membrane sinaptiche e densità postsinaptiche utilizzando un gradiente di saccarosio discontinuo. Questo metodo consolidato supporta l'analisi proteica in neuroscienza.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Gli autori ringraziano il Dr. Mike Ehlers e i membri del suo laboratorio per aver dimostrato originariamente il protocollo per il frazionamento subcellulare delle membrane plasmatiche sinaptiche. Ringraziamo anche Wendy Horsfall per la gestione delle colonie di topi. Questo lavoro è stato sostenuto da sovvenzioni di funzionamento del CIHR (AJR e AS).

Il seguente protocollo è conforme alle linee guida del Consiglio canadese della cura degli animali ed è stato approvato dalla Facoltà di Medicina e Farmacia Comitato cura degli animali presso l&#39;Università di Toronto. 1 Preparare Obbligatorio reagenti come descritto nella Tabella 1 <ol><li> Aggiungi proteasi e fosfatasi (se necessario) inibitori a tutte le soluzioni di saccarosio, tamponi e DDH 2 O a concentrazioni indicate nella tabella 1. Importante: eseguire tutte le operazioni a 4 ° C e pre-raffreddare tutti i reagenti e apparecchiature prima dell&#39;inizio dell&#39;esperimento. Etichettare tutte le provette, compresi i tubi ultracentrifuga, con pennarello indelebile. </li></ol> 2 Dissezione della regione del cervello appropriata <ol><li> Sacrifica l&#39;animale da dislocazione cervicale o decapitazione. Casa e eutanasia degli animali in conformità con le politiche istituzionali e governativi sulla cura degli animali. </li><li> Rapidamente rimuovere the cervello dal cranio e posto su un blocco dissezione refrigerata. </li><li> Sezionare la regione del cervello appropriata dal tessuto fresco e procedere al passaggio 3. </li></ol> 3 Tissue omogeneizzazione con Motor Driven vetro-teflon Omogeneizzatore <ol><li> Posizionare 50-100 mg (per SPM), o 100-200 mg (per PSD) del tessuto sezionato in una etichetta 13 ml tubo di polipropilene contenente 4 ml di soluzione di saccarosio 0.32 M HEPES-buffered. Trasferire il campione in un 15 ml conica fibra di vetro-teflon smerigliatrice / omogeneizzatore, impostare l&#39;unità motore a 900 giri (impostazione 7) e omogeneizzare il campione con 12 colpi in un periodo di 30 sec. Utilizzare un diverso omogeneizzatore vetro-teflon tra i campioni, o sciacquare la omogeneizzatore con acqua distillata fredda tra i campioni e asciugare con un Kimwipe. NOTA: Fino a 4 g di tessuto può essere omogeneizzato in 4 ml di soluzione di saccarosio 0.32 M HEPES-buffered, tuttavia è consigliabile utilizzare meno tessuto per garantire il corretto frazionamento. </li><li> Trasferire il campione omogeneizzato posteriore to lo stesso tubo di polipropilene 13 ml. Riserva 100 ml di omogenato e conservare a -80 ° C per la successiva quantificazione di proteine ​​e analisi western blot della frazione totale di proteine. </li></ol> 4. bassa velocità di centrifugazione per eliminare completamente le frazioni nucleare (rendimenti supernatante S1) <ol><li> Centrifugare l&#39;omogeneizzato in un rotore ad angolo fisso a 900 xg per 10 min a 4 ° C. Trasferire il surnatante (S1) per un nuovo, marcato 13 ml di tubo e risospendere il pellet frazione nucleare (P1) in 500 ml di saccarosio 0,32 M HEPES-buffered. NOTA: La (P1) frazione può essere conservato a -80 ° C ed utilizzato per l&#39;analisi western blot della frazione nucleare. </li></ol> 5. arricchimento della Frazione Crude sinaptosomale (rendimenti a pellet P2) <ol><li> Centrifugare il surnatante (S1) a 10.000 xg per 15 min a 4 ° C. Rimuovere il surnatante (S2) e riserva 500 ml in una provetta per conservare a -80 ° C per la successiva proteina quantificazione e analisi western blot della frazione citosolica membrana / luce. Risospendere il pellet rimanente frazione sinaptosomale greggio (P2) in 1 ml di soluzione di saccarosio 0.32 M HEPES-buffered e poi aggiungere un&#39;altra soluzione di saccarosio 3 ml di 0,32 M HEPES-buffered. </li><li> Centrifugare a 10.000 x g per 15 min a 4 ° C. Rimuovere il surnatante (S2 &#39;) e riserva 500 ml in una provetta per conservare a -80 ° C per la successiva quantificazione di proteine ​​e analisi western blot della frazione citosolica membrana / luce. Salvare il lavato sinaptosomale greggio pellet (P2 &#39;) nel tubo di polipropilene. </li></ol> 6. lisi (ipoosmotico Shock) della Frazione Crude sinaptosomale <ol><li> Lyse il pellet sinaptosomale grezzo (P2 &#39;) nel tubo di polipropilene da risospendere in 1 ml di DDH 2 O. Aggiungi un altro 3 ml di DDH 2 O, trasferimento in un omogeneizzatore tessuto di vetro-teflon, e omogeneizzare a mano con 3 colpi. NOTA: E &#39;importanteper eseguire questo passaggio il più rapidamente possibile e rapidamente passare al punto 6.2. </li><li> Campioni di trasferimento dalla omogeneizzatore nuovamente dentro lo stesso tubo di polipropilene 13 ml e regolare rapidamente il campione torna a HEPES 4 mm con 16 ml di soluzione 1 M HEPES, miscelarlo. </li><li> Ruotare i campioni a 4 ° C per 30 minuti per garantire la completa lisi. </li></ol> 7 Arricchimento della Frazione sinaptosomale membrana (P3) <ol><li> Centrifugare a 25.000 x g per 20 minuti a 4 ° C. Rimuovere il surnatante grezzo frazione vescicolare (S3) e prenotare in una provetta 5 ml di conservare a -80 ° C per la successiva quantificazione delle proteine ​​e western blot. Risospendere la frazione di membrana sinaptosomale (P3) in 1 ml di soluzione di saccarosio 0.32 M HEPES-buffered. </li></ol> 8 Preparazione del Discontinuo gradiente di saccarosio <ol><li> Dispensare esattamente 3.5 ml di soluzione di saccarosio 1,2 M HEPES-buffered ed esattamente 3.0 ml di 1,0 M e 0,8 M HEPESoluzione di saccarosio S-buffered in separati 6 ml provette con tappo a scatto. NOTA: Questo viene fatto per pre-misurare i volumi dei buffer che vengono utilizzati per rendere il gradiente di saccarosio. Misurazione esatta dei volumi è importante per garantire che i gradienti risultanti saranno bilanciati per ultracentrifugazione. </li><li> Usando una pipetta Pasteur e bulbo di vetro, trasferire 1,2 M HEPES-buffered soluzione di saccarosio a 12 ml tubo ultracentrifuge polyallomer. Strato con attenzione la soluzione di saccarosio 1.0 M HEPES-tampone sulla parte superiore della soluzione di saccarosio 1.2 M HEPES-buffered. Infine, lo strato di soluzione di saccarosio 0,8 M HEPES-tampone sulla parte superiore della soluzione di saccarosio 1.0 M HEPES-buffered. Utilizzare una pipetta Pasteur fresco per ogni soluzione di saccarosio e fare attenzione a non disturbare il gradiente di saccarosio. Vibrazioni da un vortice panchina o microcentrifuga disturberà l&#39;integrità del gradiente. </li><li> Usando una pipetta Pasteur, sovrapporre la frazione di membrana sinaptosomale risospeso (P3) sulla parte superiore del preparato discontinuo gradiente di saccarosio.Assicurarsi che i gradienti sono bilanciate tramite pesatura all&#39;interno del secchio del rotore oscillante. Se i secchi non sono equilibrati, utilizzare una pipetta P200 aggiungere attentamente saccarosio 0,32 M HEPES-buffered all&#39;inizio della sfumatura e bilanciare i secchi rotore. </li></ol> 9 Frazionamento del Synaptic membrana plasmatica (SPM) <ol><li> Ultracentrifuge in un rotore oscillante secchio a 150.000 xg per 2 ore a 4 ° C. Rimuovere con attenzione i gradienti di saccarosio dai secchi ultracentrifuga. Utilizzando un ago da 18 G e una siringa da 1 ml, forare il tubo sul fondo della soluzione 1,0 M / 1,2 M HEPES-buffered saccarosio interfase e ritirare lo strato di membrana plasmatica sinaptica (SPM). </li><li> Prendere nota del volume che ogni campione SPM occupa nella siringa da 1 ml. Posizionare lo strato SPM raccolti in 3,5 ml tubi ultracentrifuga spessa parete, aggiungere esattamente 2,5 volumi di HEPES 4 mM per regolare la concentrazione di saccarosio da 1,2 M a 0.32 M. Dopo ogni campione è stato regolareed al 0,32 M saccarosio, bilanciare i tubi con soluzione di saccarosio 0,32 M HEPES-buffered. </li><li> Ultracentrifuga in un rotore ad angolo fisso a 200.000 xg per 30 min a 4 ° C. Rimuovere e scartare il surnatante. Risospendere il pellet sinaptica membrana plasmatica (SPM) in 300 ml di soluzione di 50 mM EDTA HEPES / 2 mm. Conservare i campioni a -80 ° C fino a quando utilizzati per western blotting. </li></ol> 10 Preparazione della Frazione Postsynaptic Density (PSD) <ol><li> Scongelare i campioni SPM sul ghiaccio. </li><li> Fare una soluzione di 0,54% di Triton X-100 in 50 mM EDTA soluzione HEPES / 2 mM. </li><li> In una provetta da 5 ml polistirene, combinare 2,7 ml di Triton X-100 / soluzione / EDTA e 300 microlitri frazione SPM HEPES e ruotare il campione per 15 minuti a 4 ° C </li><li> Campioni Trasferire 3,5 ml tubi ultracentrifuga spessore-parete e Centrifugare i campioni a 32.000 xg per 20 min a 4 ° C. </li><li> Prenotate il surnatante (Triton X-100 frazione solubile [TS]) e conservare a -80; ° C. NOTA: In questa fase, il pellet rappresenta la frazione &quot;PSD-1T&quot;. Un secondo trattamento con detergente produrrà una frazione &quot;PSD-2T&quot;. Se una frazione PSD-1T si desidera, passare al punto 10.6. <ol><li> Per produrre una frazione PSD-2T, risospendere il pellet in 3 ml di 0,5% Triton X-100 in 50 mM HEPES / 2 soluzione mM EDTA. Ruotare i campioni per 15 minuti a 4 ° C. Centrifugare i campioni a 32.000 xg per 20 min a 4 ° C e passare al punto 10.6. </li></ol></li><li> Eliminare il supernatante e risospendere il pellet postsinaptica (PSD) in 50 / soluzione EDTA mM mM HEPES 2. NOTA: Il volume risospensione può dipendere dalle dimensioni del pellet; Si raccomanda un volume di 50-75 ml. Poiché la frazione PSD è una frazione detergente-insolubili, è spesso necessario aggiungere 1-2 ml di 0,5% SDS per consentire completa risospensione delle proteine. Conservare i campioni a -80 ° C fino a quando utilizzati per western blotting. </li></ol>

<ol><li>Delint-Ramirez, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vivo+composition+of+NMDA+receptor+signaling+complexes+differs+between+membrane+subdomains+and+is+modulated+by+PSD-95+and+PSD-93%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Neuroscience+%3A+the+Official+Journal+of+the+Society+for+Neuroscience%22%5BJournal%5D)">In vivo composition of NMDA receptor signaling complexes differs between membrane subdomains and is modulated by PSD-95 and PSD-93.</a> The Journal of Neuroscience : the Official Journal of the Society for Neuroscience. 30, 8162-8170 (2010).</li>
<li>Wang, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+psychiatric+disease+risk+factors+DISC1+and+TNIK+interact+to+regulate+synapse+composition+and+function%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Psychiatry%22%5BJournal%5D)">The psychiatric disease risk factors DISC1 and TNIK interact to regulate synapse composition and function.</a> Mol Psychiatry. 16, (2010).</li>
<li>Ehlers, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reinsertion+or+degradation+of+AMPA+receptors+determined+by+activity-dependent+endocytic+sorting%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">Reinsertion or degradation of AMPA receptors determined by activity-dependent endocytic sorting.</a> Neuron. 28, 511-525 (2000).</li>
<li>Tomita, S., Fukata, M., Nicoll, R. A., Bredt, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamic+interaction+of+stargazin-like+TARPs+with+cycling+AMPA+receptors+at+synapses%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Dynamic interaction of stargazin-like TARPs with cycling AMPA receptors at synapses.</a> Science. 303, 1508-1511 (2004).</li>
<li>Ehlers, M. D., Heine, M., Groc, L., Lee, M. C., Choquet, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diffusional+trapping+of+GluR1+AMPA+receptors+by+input-specific+synaptic+activity%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">Diffusional trapping of GluR1 AMPA receptors by input-specific synaptic activity.</a> Neuron. 54, 447-460 (2007).</li>
<li>Bats, C., Groc, L., Choquet, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+interaction+between+Stargazin+and+PSD-95+regulates+AMPA+receptor+surface+trafficking%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">The interaction between Stargazin and PSD-95 regulates AMPA receptor surface trafficking.</a> Neuron. 53, 719-734 (2007).</li>
<li>Ehlers, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Activity+level+controls+postsynaptic+composition+and+signaling+via+the+ubiquitin-proteasome+system%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Activity level controls postsynaptic composition and signaling via the ubiquitin-proteasome system.</a> Nat Neurosci. 6, 231-242 (2003).</li>
<li>Cartier, E. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+biochemical+and+functional+protein+complex+involving+dopamine+synthesis+and+transport+into+synaptic+vesicles%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">A biochemical and functional protein complex involving dopamine synthesis and transport into synaptic vesicles.</a> J Biol Chem. 285, 1957-1966 (2010).</li>
<li>Rodriguez de Lores, A., Alberici, M., De Robertis, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ultrastructural+and+enzymic+studies+of+cholinergic+and+non-cholinergic+synaptic+membranes+isolated+from+brain+cortex%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Neurochemistry%22%5BJournal%5D)">Ultrastructural and enzymic studies of cholinergic and non-cholinergic synaptic membranes isolated from brain cortex.</a> Journal of Neurochemistry. 14, 215-225 (1967).</li>
<li>Gray, E. G., Whittaker, V. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+isolation+of+nerve+endings+from+brain%3A+an+electron-microscopic+study+of+cell+fragments+derived+by+homogenization+and+centrifugation%5BTitle%5D)+AND+%22J+Anat%22%5BJournal%5D)">The isolation of nerve endings from brain: an electron-microscopic study of cell fragments derived by homogenization and centrifugation.</a> J Anat. 96, 79-88 (1962).</li>
<li>Cotman, C. W., Taylor, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+and+structural+studies+on+synaptic+complexes+from+rat+brain%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Isolation and structural studies on synaptic complexes from rat brain.</a> J Cell Biol. 55, 696-711 (1972).</li>
<li>Cotman, C. W., Banker, G., Churchill, L., Taylor, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+of+postsynaptic+densities+from+rat+brain%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Isolation of postsynaptic densities from rat brain.</a> The Journal of Cell Biology. 63, 441-455 (1974).</li>
<li>Carlin, R. K., Grab, D. J., Cohen, R. S., Siekevitz, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+and+characterization+of+postsynaptic+densities+from+various+brain+regions%3A+enrichment+of+different+types+of+postsynaptic+densities%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Isolation and characterization of postsynaptic densities from various brain regions: enrichment of different types of postsynaptic densities.</a> The Journal of Cell Biology. 86, 831-845 (1980).</li>
<li>Jones, D. H., Matus, A. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+of+synaptic+plasma+membrane+from+brain+by+combined+flotation-sedimentation+density+gradient+centrifugation%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim+Biophys+Acta%22%5BJournal%5D)">Isolation of synaptic plasma membrane from brain by combined flotation-sedimentation density gradient centrifugation.</a> Biochim Biophys Acta. 356, 276-287 (1974).</li>
<li>Kennedy, M. B., Bennett, M. K., Erondu, N. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biochemical+and+immunochemical+evidence+that+the+%22major+postsynaptic+density+protein%22+is+a+subunit+of+a+calmodulin-dependent+protein+kinase%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Biochemical and immunochemical evidence that the "major postsynaptic density protein" is a subunit of a calmodulin-dependent protein kinase.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 80, 7357-7361 (1983).</li>
<li>Moon, I. S., Apperson, M. L., Kennedy, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+major+tyrosine-phosphorylated+protein+in+the+postsynaptic+density+fraction+is+N-methyl-D-aspartate+receptor+subunit+2B%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">The major tyrosine-phosphorylated protein in the postsynaptic density fraction is N-methyl-D-aspartate receptor subunit 2B.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 91, 3954-3958 (1994).</li>
<li>Cho, K. O., Hunt, C. A., Kennedy, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+rat+brain+postsynaptic+density+fraction+contains+a+homolog+of+the+Drosophila+discs-large+tumor+suppressor+protein%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">The rat brain postsynaptic density fraction contains a homolog of the Drosophila discs-large tumor suppressor protein.</a> Neuron. 9, 929-942 (1992).</li>
<li>Salahpour, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Increased+amphetamine-induced+hyperactivity+and+reward+in+mice+overexpressing+the+dopamine+transporter%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Increased amphetamine-induced hyperactivity and reward in mice overexpressing the dopamine transporter.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 105, 4405-4410 (2008).</li>
<li>Ma, D. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Neuronal+activity-induced+Gadd45b+promotes+epigenetic+DNA+demethylation+and+adult+neurogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Neuronal activity-induced Gadd45b promotes epigenetic DNA demethylation and adult neurogenesis.</a> Science. 323, 1074-1077 (2009).</li>
<li>Budreck, E. C., Scheiffele, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Neuroligin-3+is+a+neuronal+adhesion+protein+at+GABAergic+and+glutamatergic+synapses%5BTitle%5D)+AND+%22The+European+Journal+of+Neuroscience%22%5BJournal%5D)">Neuroligin-3 is a neuronal adhesion protein at GABAergic and glutamatergic synapses.</a> The European Journal of Neuroscience. 26, 1738-1748 (2007).</li>
<li>Wu, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Arc%2FArg3.1+regulates+an+endosomal+pathway+essential+for+activity-dependent+beta-amyloid+generation%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Arc/Arg3.1 regulates an endosomal pathway essential for activity-dependent beta-amyloid generation.</a> Cell. 147, 615-628 (2011).</li>
<li>Huttner, W. B., Schiebler, W., Greengard, P., De Camilli, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synapsin+I+%28protein+I%29%2C+a+nerve+terminal-specific+phosphoprotein.+III.+Its+association+with+synaptic+vesicles+studied+in+a+highly+purified+synaptic+vesicle+preparation%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Synapsin I (protein I), a nerve terminal-specific phosphoprotein. III. Its association with synaptic vesicles studied in a highly purified synaptic vesicle preparation.</a> J Cell Biol. 96, 1374-1388 (1983).</li>
<li>Nagy, A., Baker, R. R., Morris, S. J., Whittaker, V. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+preparation+and+characterization+of+synaptic+vesicles+of+high+purity%5BTitle%5D)+AND+%22Brain+Res%22%5BJournal%5D)">The preparation and characterization of synaptic vesicles of high purity.</a> Brain Res. 109, 285-309 (1976).</li>
<li>Cheng, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Relative+and+absolute+quantification+of+postsynaptic+density+proteome+isolated+from+rat+forebrain+and+cerebellum%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+%26+Cellular+Proteomics+%3A+MCP%22%5BJournal%5D)">Relative and absolute quantification of postsynaptic density proteome isolated from rat forebrain and cerebellum.</a> Molecular & Cellular Proteomics : MCP. 5, 1158-1170 (2006).</li>
<li>Sheng, M., Hoogenraad, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+postsynaptic+architecture+of+excitatory+synapses%3A+a+more+quantitative+view%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Biochem%22%5BJournal%5D)">The postsynaptic architecture of excitatory synapses: a more quantitative view.</a> Annu Rev Biochem. 76, 823-847 (2007).</li>
<li>Sambrook, J., Fritsch, E. F., Maniatis, T. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSambrook%2C+J+%22Molecular+cloning+%3A+a+Laboratory+Manual%22">Molecular cloning : a Laboratory Manual</a>. , 2nd ed, Cold Spring Harbor Laboratory Press. (1989).</li>
<li>Eggena, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+histone+H1+as+a+cognate+antigen+of+the+ulcerative+colitis-associated+marker+antibody+pANCA%5BTitle%5D)+AND+%22J+Autoimmun%22%5BJournal%5D)">Identification of histone H1 as a cognate antigen of the ulcerative colitis-associated marker antibody pANCA.</a> J Autoimmun. 14, 83-97 (2000).</li>
<li>Salahpour, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Homodimerization+of+the+beta2-adrenergic+receptor+as+a+prerequisite+for+cell+surface+targeting%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Homodimerization of the beta2-adrenergic receptor as a prerequisite for cell surface targeting.</a> J Biol Chem. 279, 33390-33397 (2004).</li>
<li>Bernocco, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sequential+detergent+fractionation+of+primary+neurons+for+proteomics+studies%5BTitle%5D)+AND+%22Proteomics%22%5BJournal%5D)">Sequential detergent fractionation of primary neurons for proteomics studies.</a> Proteomics. 8, 930-938 (2008).</li>
<li>Grunewald, T. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nuclear+localization+and+cytosolic+overexpression+of+LASP-1+correlates+with+tumor+size+and+nodal-positivity+of+human+breast+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Cancer%22%5BJournal%5D)">Nuclear localization and cytosolic overexpression of LASP-1 correlates with tumor size and nodal-positivity of human breast carcinoma.</a> BMC Cancer. 7, 198(2007).</li>
<li>Heimann, K., Percival, J. M., Weinberger, R., Gunning, P., Stow, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Specific+isoforms+of+actin-binding+proteins+on+distinct+populations+of+Golgi-derived+vesicles%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Specific isoforms of actin-binding proteins on distinct populations of Golgi-derived vesicles.</a> J Biol Chem. 274, 10743-10750 (1999).</li>
<li>Neff, R. A. 3rd, Gomez-Varela, D., Fernandes, C. C., Berg, D. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Postsynaptic+scaffolds+for+nicotinic+receptors+on+neurons%5BTitle%5D)+AND+%22Acta+Pharmacol+Sin%22%5BJournal%5D)">Postsynaptic scaffolds for nicotinic receptors on neurons.</a> Acta Pharmacol Sin. 30, 694-701 (2009).</li>
<li>Cella, N., Cornejo-Uribe, R. R., Montes, G. S., Hynes, N. E., Chammas, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+lysosomal-associated+membrane+protein+LAMP-1+is+a+novel+differentiation+marker+for+HC11+mouse+mammary+epithelial+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Differentiation%22%5BJournal%5D)">The lysosomal-associated membrane protein LAMP-1 is a novel differentiation marker for HC11 mouse mammary epithelial cells.</a> Differentiation. 61, 113-120 (1996).</li>
<li>Otera, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Peroxisomal+targeting+signal+receptor+Pex5p+interacts+with+cargoes+and+import+machinery+components+in+a+spatiotemporally+differentiated+manner%3A+conserved+Pex5p+WXXXF%2FY+motifs+are+critical+for+matrix+protein+import%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Peroxisomal targeting signal receptor Pex5p interacts with cargoes and import machinery components in a spatiotemporally differentiated manner: conserved Pex5p WXXXF/Y motifs are critical for matrix protein import.</a> Mol Cell Biol. 22, 1639-1655 (2002).</li>
<li>Goubaeva, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cardiac+mitochondrial+connexin+43+regulates+apoptosis%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem+Biophys+Res+Commun%22%5BJournal%5D)">Cardiac mitochondrial connexin 43 regulates apoptosis.</a> Biochem Biophys Res Commun. 352, 97-103 (2007).</li>
<li>Lamers, K. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+S-100B%2C+neuron-specific+enolase+%28NSE%29%2C+myelin+basic+protein+%28MBP%29+and+glial+fibrillary+acidic+protein+%28GFAP%29+in+cerebrospinal+fluid+%28CSF%29+and+blood+of+neurological+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Brain+Res+Bull%22%5BJournal%5D)">Protein S-100B, neuron-specific enolase (NSE), myelin basic protein (MBP) and glial fibrillary acidic protein (GFAP) in cerebrospinal fluid (CSF) and blood of neurological patients.</a> Brain Res Bull. 61, 261-264 (2003).</li>
<li>Arunachalam, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Munc18-1+is+critical+for+plasma+membrane+localization+of+syntaxin1+but+not+of+SNAP-25+in+PC12+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">Munc18-1 is critical for plasma membrane localization of syntaxin1 but not of SNAP-25 in PC12 cells.</a> Mol Biol Cell. 19, 722-734 (2008).</li>
<li>Brandstatter, J. H., Fletcher, E. L., Garner, C. C., Gundelfinger, E. D., Wassle, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Differential+expression+of+the+presynaptic+cytomatrix+protein+bassoon+among+ribbon+synapses+in+the+mammalian+retina%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+J+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Differential expression of the presynaptic cytomatrix protein bassoon among ribbon synapses in the mammalian retina.</a> Eur J Neurosci. 11, 3683-3693 (1999).</li>
</ol>

Gli autori non hanno conflitti di interesse da rivelare.

Ci sono diversi passaggi della procedura che sono fondamentali per un esito positivo. Nel passaggio 3, è importante che un grado costante di omogeneizzazione è ottenuta per ogni campione. Quando omogeneizzando tessuto con l&#39;omogeneizzatore a motore, una velocità costante viene utilizzata non solo per la rotazione del pestello, ma anche con il numero di colpi. Il tempo di incubazione durante lo shock osmotico deve essere preciso, dal momento omogeneizzazione estesa o incubazione nella soluzione ipotonica si lisare mi...

I neuroni comunicano attraverso le sinapsi, e la qualità di questa comunicazione è regolata in gran parte da alterazioni nella composizione delle proteine ​​alla sinapsi. In particolare, le proteine ​​ubicata nella densità postsinaptica partecipa nella comunicazione neuronale recettori dei neurotrasmettitori intimamente ponteggi con i loro sistemi di trasduzione del segnale 1. Inoltre, durevoli cambiamenti nella forza di efficacia sinaptica sono controllate mediante l&#39;aggiunta o la rimozione di recettori alla densità post-sinaptica 1-6. Pertanto, l&#39;isolamento e la quantificazione delle proteine ​​sinaptiche è una tecnica necessaria ed utile al fine di conoscere i modi in cui i neuroni rispondono a stimoli e alterare l&#39;efficacia sinaptica 7. Questo articolo descrive una tecnica comune per isolare le proteine ​​sinaptiche da tessuto cerebrale dei roditori da ultracentrifugazione su gradiente discontinuo di saccarosio. La frazione di membrana plasmatica sinaptica può essere arricchita e isolato basa susua densità di saccarosio, che è stato determinato empiricamente essere simile a 1,2 M saccarosio. A seconda della domanda biologica, frazioni subcellulari possono essere separati da gradienti continui o discontinui di entrambi saccarosio o Percoll. Gradienti continui consentono la separazione di proteine ​​in più frazioni; questo può essere particolarmente utile per dimostrare la co-localizzazione delle proteine ​​all&#39;interno di una data frazione 8. Tuttavia, la preparazione di gradienti continui è più laborioso e non è necessaria per molte applicazioni. Gradienti discontinui sono relativamente facili da preparare e possono essere usate per separare le proteine ​​in poche frazioni, generalmente definiti. Gradienti discontinui che sono costituiti da tre strati di saccarosio degli crescente molarità sono stati ampiamente utilizzati per isolare le proteine ​​associate alla membrana plasmatica sinaptica (SPM). Questa frazione membrana plasmatica sinaptica può essere ulteriormente elaborato per la fractio densità post-sinaptican (PSD) per trattamento detergente e l&#39;isolamento della frazione detergente-insolubili. Quando questo processo è stato descritto nel 1960 del 9,10, microscopia elettronica è stato utilizzato per dimostrare gli organelli e membrane che circa definiscono la membrana plasmatica sinaptica e frazioni di densità post-sinaptici 9-14. Questi studi hanno dimostrato l&#39;inclusione delle membrane pre e post-sinaptici e vescicole sinaptiche nella frazione SPM; dopo il trattamento detergente principalmente l&#39;elettrone-densi, densità post-sinaptica erano visibili. Nella procedura, uno shock ipotonico viene utilizzato per pizzicare fuori i processi sinaptici dal corpo cellulare 10. Questo passaggio sfrutta il fatto che i mitocondri sono più resistenti agli shock osmotico e rimangono intatte, e quindi sedimentare sul fondo del gradiente di saccarosio (Figura 1). Usando la stessa tecnica di arricchimento, le frazioni SPM e PSD erano di prima biochimicamentedefinito mediante elettroforesi su gel di poliacrilammide e sequenziamento dei principali componenti proteiche 15-17. Blot Successivamente occidentale è stato utilizzato per rilevare e quantificare i livelli di proteine ​​sinaptiche e definire ulteriormente queste frazioni (Figura 2). Abbiamo utilizzato questa tecnica nei nostri laboratori di quantificare i cambiamenti nei livelli sinaptici del trasportatore della dopamina che si verificano quando il locus Slc6a3 viene duplicato nei topi 18. Abbiamo anche usato questa tecnica in recettori NMDA topi deficienti per scoprire riduzioni specifiche per sinapsi in proteine ​​che fanno parte della DISC1 interattoma 19. E &#39;evidente da analisi western blot che le frazioni SPM contengono proteine ​​di membrana delle vescicole sinaptiche, marcatori degli endosomi, proteine ​​mitocondriali, membrana associata enzimi sintetici e molecole di trasduzione del segnale, così come componenti integrali della densità post-sinaptica e membrane plasmatiche sinaptiche 20-23. Efrazioni PSD Ven possono avere contaminazione con abbondanti proteine ​​mitocondriali e può essere necessario eseguire una seconda sedimentazione sfumatura o fasi di purificazione aggiuntivi per rimuoverli 13. Recentemente, spettrometria di massa quantitativa ha fornito un elenco di oltre 100 proteine ​​nei soli densità post-sinaptica, così come un&#39;indicazione della relativa abbondanza di questi componenti 24,25.

<table><tbody><tr><td>1 M HEPES, pH 7,4</td><td>BioShop</td><td>HEP003.100</td><td></td></tr><tr><td>HEPES</td><td>BioShop</td><td>HEP001.500&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>Saccarosio&nbsp;</td><td>BioShop</td><td>SUC507.1</td><td></td></tr><tr><td>EDTA</td><td>BioBasic</td><td>EB0185</td><td></td></tr><tr><td>PMSF</td><td>BioShop</td><td>PMS123.5</td><td></td></tr><tr><td>Aprotinina</td><td>BioShop</td><td>APR600.1</td><td></td></tr><tr><td>Leupeptin</td><td></td><td>BioShop LEU001.1</td><td></td></tr><tr><td>Pepstatin</td><td>BioShop</td><td>PEP605.5</td><td></td></tr><tr><td>Benzamidina</td><td>BioShop</td><td>BEN601.25</td><td></td></tr><tr><td>Fluoruro di sodio</td><td>BioShop</td><td>SFL001.100</td><td></td></tr><tr><td>Pirofosfato di sodio</td><td>BioShop</td><td>SPP310.100</td><td></td></tr><tr><td>Ortovanadato di sodio</td><td>BioShop</td><td>SOV664.10</td><td></td></tr><tr><td>&beta;-glicerofosfato</td><td>BioShop</td><td>GYP001.10</td><td></td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>BioShop</td><td>TRX506.500</td><td></td></tr><tr><td>18 G x 1 &frac12; &rdquo; ago</td><td>BD</td><td>305196</td><td></td></tr><tr><td>siringa da 1 cc</td><td>BD</td><td>309659</td><td></td></tr><tr><td>Omogeneizzatore in teflon in vetro Kontes Duall 23</td><td>VWR</td><td>KT885450-0023</td><td></td></tr><tr><td>IKA Modello RW 16 agitatore base</td><td>IKA Works</td><td>2572100</td><td></td></tr><tr><td>Rotore ad angolo fisso Sorvall SM-24</td><td>ThermoScientific</td><td>29017</td><td></td></tr><tr><td>Centrifuga Sorvall RC 6 Plus</td><td>ThermoScientific</td><td>46910</td><td></td></tr><tr><td>Provette in poliallomero a parete sottile (13,2 ml)</td><td>Beckman Coulter</td><td>331372</td><td></td></tr><tr><td>SW 41 Ti rotore oscillante Secchio oscillante</td><td>Beckman Coulter</td><td>331362</td><td></td></tr><tr><td>Beckman L-80 ultracentrifuga da pavimento</td><td>Beckman Coulter</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Provette in policarbonato a parete spessa (3,5 ml)</td><td>Beckman Coulter</td><td>349622</td><td></td></tr><tr><td>rotore ad angolo fisso TLA-100.3</td><td>Beckman Coulter</td><td>349481</td><td></td></tr><tr><td>Beckman TL-100 ultracentrifuga da tavolo</td><td>Beckman Coulter</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

preparazione di synaptic membrana plasmatica e proteine ​​densità postsinaptica utilizzo di un gradiente di saccarosio discontinuo

Preparation of Synaptic Plasma Membrane and Postsynaptic Density Proteins Using a Discontinuous Sucrose Gradient

Neuronali tecniche di frazionamento subcellulare consentono la quantificazione di proteine ​​che sono vittime della tratta da e per la sinapsi. Come originariamente descritto nel tardo 1960, proteine ​​associate alla membrana plasmatica sinaptica possono essere isolati da ultracentrifugazione su gradiente di densità di saccarosio. Una volta membrane sinaptiche sono isolati, il complesso macromolecolare nota come la densità post-sinaptica può essere successivamente isolato per la sua insolubilità detersivo. Le tecniche utilizzate per isolare le membrane plasmatiche sinaptiche e proteine ​​densità post-sinaptica rimane essenzialmente la stessa dopo 40 anni, e sono ampiamente utilizzati nella ricerca neuroscientifica attuale. Questo articolo descrive il frazionamento delle proteine ​​associate alla membrana plasmatica sinaptica e la densità post-sinaptica utilizzando un gradiente di saccarosio discontinuo. Risultanti preparati proteici sono adatti per western blotting o l&#39;analisi 2D DIGE.

La preparazione del gradiente di densità di saccarosio dovrebbe tradursi in una netta separazione delle tre soluzioni molari di saccarosio (0.8, 1.0, e 1.2 M saccarosio). Vedere Figura 3A per un esempio del gradiente prima di aggiungere il campione di proteine. Se il gradiente è preparato troppo in anticipo, o se è disposta su una superficie panchina con vibrazioni da altri apparecchi, il gradiente sarà compromessa e separazione corretta non sarà raggiunto. Se una netta separazione delle tre soluzioni n...

Questo articolo descrive l&#39;arricchimento di proteine ​​associate con la membrana plasmatica sinaptica da ultracentrifugazione su gradiente di saccarosio discontinuo. La successiva preparazione di proteine ​​di densità post-sinaptica è anche descritto. Preparati proteici sono adatti per western blotting o l&#39;analisi 2D DIGE.

Preparazione di Synaptic membrana plasmatica e Proteine ​​densità postsinaptica Utilizzo di un gradiente di saccarosio discontinuo

Neuronal subcellular fractionation techniques allow the quantification of proteins that are trafficked to and from the synapse. As originally described in ...

L'obiettivo generale di questa procedura è dimostrare il frazionamento subcellulare del tessuto cerebrale utilizzando un gradiente discontinuo di saccarosio per arricchire le proteine dalle membrane sinaptiche e dalle densità postsinaptiche. Ciò si ottiene omogeneizzando prima il tessuto cerebrale con un omogeneizzatore potenziatore. Successivamente ci sono una serie di fasi di centrifugazione per preparare estratti di proteine grezze di membrana.Gli estratti di membrana vengono poi stratificati su un gradiente discontinuo di saccarosio per l'ultracentrifugazione. Il passaggio finale consiste nel raccogliere le proteine dal gradiente. In definitiva, i risultati possono mostrare cambiamenti nei livelli di proteina sinaptica attraverso l'analisi Western blot.Questa è una tecnica ben consolidata che è stata utilizzata dai neuroscienziati per oltre 40 anni. Lo usiamo nel nostro laboratorio per capire come cambia la composizione proteica della sinapsi quando perturbiamo diversi sistemi di neurotrasmettitori. Il vantaggio principale di questa tecnica rispetto ad altri metodi, come i gradienti per chiamata o i gradienti continui di saccarosio, è che i gradienti discontinui di saccarosio s

preparation-synaptic-plasma-membrane-postsynaptic-density-proteins

Research

Ricerca

JoVE Journal

Neuroscience

Neuroscienze

Un metodo per preparare traduzionali attivo, synaptoneurosomes intatto (SN) da topo corteccia cerebrale è descritto. Il metodo utilizza un discontinuo di Percoll-saccarosio gradiente di densità che permette per la preparazione veloce di SN attivo.

Preparazione di Synaptoneurosomes da mouse Cortex con un discontinuo di Percoll-Saccarosio gradiente di densità

Le tecniche di microscopia ottica abbinate a saggi biochimici chiariscono il coinvolgimento dell'esocitosi mediata da SNARE nella ramificazione degli assoni netrina-dipendente. Questa combinazione di tecniche consente l'identificazione dei meccanismi molecolari che controllano la ramificazione degli assoni e il cambiamento della forma cellulare.

Utilizzando metodologie combinati per definire il ruolo della membrana plasmatica di consegna Durante Axon ramificazione e neuronale morfogenesi

Questo protocollo descrive un metodo semplice per estrarre e frazionare i trascritti dai tessuti vegetali sulla base del numero di ribosomi legati. Permette una stima globale dell'attività traduttiva e la determinazione dello stato traduzionale di specifici mRNA.

Un metodo facile per piante polysome Profiling

L'identificazione di molecole e percorsi che controllano la plasticità sinaptica e la memoria è ancora una grande sfida nelle neuroscienze. Qui, viene descritto un flusso di lavoro che affronta la quantificazione relativa delle proteine sinaptiche presumibilmente coinvolte nella riorganizzazione molecolare delle sinapsi durante l'apprendimento e nel consolidamento della memoria in un paradigma di apprendimento uditivo.

Alta risoluzione Quantitative Synaptic Proteome profiling di cervello di topo Regioni Dopo uditiva discriminazione Learning

Qui presentiamo un protocollo di frazionamento della membrana cerebrale che rappresenta una procedura robusta per isolare le proteine ​​appartenenti a diversi compartimenti sinaptici.

Frazione di membrana del cervello: An<em&gt; Ex Vivo</em&gt; Approccio per valutare la localizzazione della proteina subsynaptica

Regolazione traduzionale svolge un ruolo importante nel controllo dell'abbondanza di proteine. Qui, descriviamo un metodo di alto-rendimento per analisi quantitativa di traduzione nel lievito Saccharomyces cerevisiae.

Genome-wide quantificazione della traduzione nel lievito gemmante mediante profilatura, ribosoma

Questo documento mira a presentare un protocollo per la preparazione del riciclaggio di endosomi da cellule di mammifero utilizzando l'ultracentrifugazione del gradiente di densità del saccarosio.

Ultracentrifugazione a gradiente di densità per lo studio del riciclaggio endocitico nelle cellule di mammifero

Presentiamo una tecnica per stabilizzare rapidamente complessi traslazionali (biosintesi proteica) con reticolazione di formaldeide in cellule di lievito vivo e di mammifero. L'approccio consente di sezionare intermedi transitori e interazioni dinamiche RNA:proteina. I complessi reticolati possono essere utilizzati in molteplici applicazioni a valle come nei metodi di profilazione basati sul sequenziamento profondo, nella microscopia e nella spettrometria di massa.

Rapida fissazione in vivo e isolamento dei complessi traslazionali dalle cellule eucariotiche

Questo protocollo descrive come generare un profilo polisomico senza utilizzare generatori di gradienti automatizzati o sistemi di frazionamento del gradiente.

Profilazione dei polisomi senza generatori di gradienti o sistemi di frazionamento

Questo protocollo presenta un metodo robusto e dettagliato per ottenere sinaptosomi altamente puri, vescicole sinaptiche e altre frazioni sinaptiche dal cervello del topo. Questo metodo consente la valutazione dei processi sinaptici, compresa l'analisi biochimica della localizzazione e della funzione delle proteine con risoluzione compartimentale.

Frazionamento subcellulare per l'isolamento di componenti sinaptici dal cervello murino

I siti di contatto mitocondriali sono complessi proteici che interagiscono con le proteine della membrana interna ed esterna mitocondriale. Questi siti sono essenziali per la comunicazione tra le membrane mitocondriali e, quindi, tra il citosol e la matrice mitocondriale. In questo articolo, descriviamo un metodo per identificare i candidati che si qualificano per questa specifica classe di proteine.

Un metodo migliorato per isolare i siti di contatto mitocondriali

Impara la frazionamento subcellulare del tessuto cerebrale per arricchire proteine delle membrane sinaptiche e densità postsinaptiche utilizzando un gradiente di saccarosio discontinuo. Questo metodo consolidato supporta l'analisi proteica in neuroscienza.

Preparazione di Synaptic membrana plasmatica e Proteine ​​densità postsinaptica Utilizzo di un gradiente di saccarosio discontinuo (Video) | JoVE Journal

Preparazione di Synaptic membrana plasmatica e Proteine ​​densità postsinaptica Utilizzo di un gradiente di saccarosio discontinuo

Esplora altri video

Preparazione di Synaptic membrana plasmatica e Proteine densità postsinaptica Utilizzo di un gradiente di saccarosio discontinuo