DamID-seq: Genome-wide Mappatura delle interazioni proteina-DNA da High Throughput Sequencing di Adenina-metilato frammenti di DNA

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27 gennaio 2016

10.3791/53620-v

27 gennaio 2016

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Descriviamo qui un test con l'accoppiamento di identificazione del DNA adenina metiltransferasi (DamID) ad alto rendimento sequenziamento (DamID-ss). Questo metodo fornisce una migliore risoluzione più elevata e una gamma dinamica più ampia, e permette di analizzare i dati DamID-Seq in combinazione con altri dati di sequenziamento ad alto rendimento, come ChIP-seq, RNA-Seq, etc.

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Interazioni della lamina nucleare

Chapters in this video

0:05

Titolo

0:58

Generazione ed espressione di proteine di fusione e proteine Dam libere

3:12

Preparazione della libreria: frammentazione

5:29

Preparazione della libreria: selezione della dimensione

7:26

Risultati: rilevamento delle regioni di legame della Lamina B1 sul cromosoma uno del topo

8:20

Conclusioni

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