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Systems Biology di regolazione metabolica da Estrogen Receptor Signaling nel cancro al seno
Systems Biology di regolazione metabolica da Estrogen Receptor Signaling nel cancro al seno
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Systems Biology of Metabolic Regulation by Estrogen Receptor Signaling in Breast Cancer

Systems Biology di regolazione metabolica da Estrogen Receptor Signaling nel cancro al seno

Full Text
10,960 Views
10:36 min
March 17, 2016

DOI: 10.3791/53832-v

Yiru Chen Zhao1, Zeynep Madak Erdogan1

1Department of Food Sciences and Human Nutrition,University of Illinois, Urbana-Champaign

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

L'integrazione dei dati provenienti da esperimenti di sequenziamento dell'intero genoma ed esperimenti di metabolomica è una sfida. In questo articolo riportiamo, per la prima volta, la generazione, l'analisi e l'integrazione di dati di trascrittoma, cistroma e metaboloma da cellule di cancro al seno trattate con estradiolo.

L'obiettivo generale di questo esperimento è comprendere la regolazione metabolica diretta dell'ER Alpha nel carcinoma mammario, utilizzando i dati del trascrittoma, del sistema e del metaboloma dell'intero genoma. Questo metodo può aiutare a rispondere a domande chiave nel campo dei nucleorecettori e della biologia del cancro, come il ruolo di alcuni fattori di trascrizione nella regolazione del metabolismo per contribuire all'aggressività cellulare. Il vantaggio principale di questa tecnica è che fornisce un quadro globale del gene e delle conseguenti sfumature di regolazione metabolica.

A dimostrare la procedura sarà Yiru Chen, un borsista post-dottorato del mio laboratorio. Dopo aver coltivato le cellule MCF7 secondo il protocollo di testo, raccogliere le cellule aggiungendo un millilitro di reagente di isolamento dell'RNA a ciascun pozzetto e incubare a temperatura ambiente per cinque minuti. Utilizzare una pipetta per raccogliere il lisato cellulare e trasferirlo in provette da 1,5 millilitri.

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