Name: Spin saturazione Transfer Difference NMR (SSTD NMR): Un nuovo strumento per ottenere Kinetic parametri di processi a scambio chimico (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-11-12T13:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 44 s
Description: Scopri il metodo SSTD NMR per ottenere parametri cinetici di scambio chimico in molecole organiche e organometalliche. Questa tecnica innovativa misura costanti di velocità e tempi di rilassamento simultaneamente.

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Il finanziamento da parte dell'Università dell'East Anglia, dell'EPSRC (EP/L012855/1) e dell'UE (H2020-MSCA-IF-2014-EF-ST-658172) è riconosciuto con gratitudine (MTQ).

Attenzione: Si prega di consultare tutte le schede di sicurezza materiale pertinente (MSDS) prima dell&#39;uso. 1. Preparazione del campione NMR <ol><li> Pesare 5 mg di N, N -dimethylacetamide, aggiungere ad un tubo NMR appropriato per basse temperature e sciogliere in 0,6 ml di toluene d 8. </li></ol> Setup 2. NMR sperimentale 25 <ol><li> NOE Spectra Acquisizione <ol><li> Eseguire un dimensionale NOE (Nuclear Overhauser Effect) esperimento di uno. 26 NOTA: Gli effetti NOE possono accadere a qualsiasi temperatura. A uno spettro dimensionale NOE irradiando il segnale che sarà irradiato nell&#39;esperimento SSTD NMR, è stata registrata a -40 ° C per assicurarsi che il trasferimento di rotazione e la magnetizzazione del campione utilizzato qui è stato minimizzato, e quindi il NOE, se esistente, sarebbe predominano ed essere misurata in questo esperimento. Idealmente, gli effetti NOE tra i due nuclei si scambiano ShoulNon d essere presente per evitare interferenze con il metodo SSTD. </li></ol></li><li> SSTD NMR esperimenti Setup <ol><li> Inserire il campione nel magnete da prima ej a digitare nella riga di comando del software per attivare il flusso d&#39;aria. Poi, mettere il campione sulla parte superiore del magnete e quindi digitare ij. Attendere fino a quando il campione è all&#39;interno del magnete. </li><li> Una volta che il campione è nel magnete, tipo edte nella linea di comando. Cambiare la temperatura alla prima temperatura selezionata per condurre l&#39;esperimento (295,5 K in questo caso). Sia il campione stabilizzi alla temperatura prescelta per almeno 20 min. </li><li> Eseguire 1D 1 esperimento H-NMR sul campione. <ol><li> Creare un nuovo set di dati di un esperimento 1 H-NMR. Per questo fare clic su File / Nuovo e assegnare un nome al nuovo esperimento. </li><li> Digitare in sequenza e in attesa del comando precedente alla fine: serratura, Atma, topshim, getprosol e RGA. </li><li> Tipo &lt;em&gt; zg di acquisire l&#39;esperimento protone. Una volta che è finito tipo EFP e apk a trasformata di Fourier e regolare la fase. </li></ol></li><li> Creare un nuovo set di dati, ad esempio, un esperimento 1 H NMR. Per questo fare clic su File / Nuovo e assegnare un nome al nuovo esperimento. </li><li> In questo nuovo set di dati, digitare rpar nella riga di comando. Selezionare uno dei &quot;STDDIFF&quot; set di parametri dalla lista, ad esempio STDDIFFESGP, e fare clic su &quot;leggere&quot; e poi &quot;leggere tutti&quot; (Figura 1). In alternativa, farlo digitando STDDIFFESGP rpar tutti. NOTA: L&#39;esperimento può essere eseguita con la sequenza di impulsi. Tuttavia, il programma di impulso utilizzato nel nostro esperimento è stato STDDIFF. </li><li> Per selezionare la sequenza di impulsi STDDIFF, fare clic sul pulsante con i tre puntini nella linea PULPROG (figure 2 e 3). </li><li> Prima di effettuare l&#39;esperimento SSTD NMR, calibrare il 1 H 90 ° puls durie (p1). A tale scopo, assicurare che il campione è nel magnete alla temperatura desiderata (Fase 2.2.2). Inserire pulsecal nella linea di comando e copiare il valore dell&#39;impulso di 90 ° al maggiore potenza (pl1 = -1 dB in questo caso), cioè, quella che dà l&#39;impulso breve (Figura 4). </li><li> Introdurre i valori per l&#39;impulso rigido calibrato nell&#39;esperimento. Tipo getprosol 1H (rapporto qualità-p1 ottenuto nel passaggio 2.2.7) (rapporto qualità-PL1) (Figura 5). </li><li> Impostare la lunghezza dell&#39;impulso sagomato. Tipo p13 ed introdurre un valore di 50.000 msec (Figura 6). </li><li> Impostare la forma dell&#39;impulso selettivo. Per fare questo, andare al potere e fare clic sul pulsante &quot;Modifica ...&quot; accanto alla forma (Figura 7). Vai a forma di impulsi 13 e scegliere: Gaus 1.1000 (Figura 8). </li><li> Impostare la potenza dell&#39;impulso selettivo (SP13). Impostare a qualcosa di appropriato, vale a dire </em&gt;, Su questo sistema tra 40-60 dB (corrispondente ad un&#39;intensità di campo di circa 120 Hz) (Figura 8). Intensità di campo eccessivi possono portare ad effetti di saturazione inaccettabili. 27-29 NOTA: 50 dB era ottimale nel nostro caso. Tener conto che questa è una scala di attenuazione, quindi minore è il valore maggiore è la potenza della radiofrequenza. Come corrisponde alla saturazione cascade gaussiana, che viene applicata per lungo tempo (alcuni secondi), SP13 non deve scendere al di sotto di 40 dB (se necessario, consultare le specifiche dello strumento, purché impulsi ad alta potenza potrebbero danneggiare il probehead). Nella nostra esperienza 41-61 dB al di sopra della attenuazione del disco 1 H 90 ° impulso (-1 dB in questo lavoro) funziona bene. Provare a selezionare sempre la massima attenuazione possibile portando a simile livello di saturazione. </li><li> Digitare ns e impostarlo a 8 e digitare il ds e impostarlo su 4. </li></ol></li></ol> 3. Acquisizione dati NMR und Processing 25 <ol><li> SSTD NMR Esperimento di acquisizione <ol><li> Aprire l&#39;esperimento 1 H NMR eseguita in fase 2.2.3 per controllare dove il segnale che verrà irradiato è. Per questo, cercare l&#39;esperimento nel browser software, fare clic destro nel set di dati e fare clic su &quot;Visualizza in una nuova finestra&quot;. </li><li> Spostare la linea cursore al centro del segnale di irradiare e scrivere il chemical shift in ppm. Selezionare la larghezza spettrale che verrà utilizzato nell&#39;esperimento. NOTA: In questo caso, il segnale che viene irradiata è a 2.17 ppm, e la larghezza spettrale utilizzato era 1,46 ppm. Assicurarsi che nessuna correzione spostamento chimico viene utilizzato o la frequenza di irradiazione può essere impostata in modo non corretto. </li><li> Vai esperimento SSTD NMR precedentemente creato con la messa a punto di cui al punto 2.2. </li><li> Creare un elenco con le frequenze di irradiazione. Per questo, digitare fq2list nella riga di comando e selezionare un elenco esistente. </li><li> Modificare l&#39;elencodi frequenze irradiazione inclusi i seguenti dati nelle prime 3 righe (Figura 9): Row 1. P (indica che i seguenti dati è in ppm); Row 2 frequenza del segnale da irradiare in ppm, come misurato in 3.1.. 1; Row 3.40 ppm (una frequenza che è lontano dalle 1 segnali H del composto così l&#39;irradiazione in quella frequenza non influisce spettri). </li><li> Salvare la lista con un nuovo nome e quindi digitare fq2list nella riga di comando e selezionare l&#39;elenco appena creato. </li><li> Per centrare l&#39;esperimento sui segnali in fase di studio, tipo O1P e selezionare come centro dell&#39;esperimento chemical shift del segnale che sarà irradiato. </li><li> Tipo sw per selezionare la larghezza spettrale (1.46 ppm in questo caso, ma qualsiasi altra larghezza spettrale può essere scelto). NOTA: Se il tempo di acquisizione ottenuto dopo aver cambiato la larghezza spettrale è troppo lungo (che introdurrà più rumore negli spettri) è can essere regolata digitando AQ per fornire la risoluzione desiderata Induction Decay libero (FID) (FIDRES, 0.25 Hz in questo caso). </li><li> Scegliere il valore per il InterScan D1 ritardo relax. Assicurarsi che è almeno 1 a 5 volte il valore della T 1 del più lento rilassante protone. NOTA: Abbiamo impostato fino a 40 sec, che è il tempo di saturazione più lungo (D20) nell&#39;esperimento. In questo modo tutti gli esperimenti non mancherà di tenere lo stesso tempo totale &quot;per scansione&quot; (ritardo + saturazione tempo + impulsi + tempo di acquisizione). </li><li> Tipo D1 e impostarlo a 40 sec. </li><li> Impostare il primo valore per il tempo di saturazione digitando D20 e impostarla a 40 sec. Determinare il guadagno del ricevitore (RG) automaticamente digitando RGA. </li><li> Creare il prossimo esperimento digitando iexpno. Tipo D20 e selezionare il tempo di saturazione di 20 sec in questo esperimento. Digitare RGA per determinare automaticamente rg. </li> &lt;li&gt; Ripetere l&#39;ultimo passaggio per D20 = 10, 5, 2.5, 1.25, 0.625, 0,3 sec. </li><li> Una volta creati tutti gli esperimenti, aprire il primo e nel tipo multizg riga di comando e specificare il numero di esperimenti, 8 in questo caso (cioè, multizg 8). </li></ol></li><li> SSTD NMR Experiment Processing <ol><li> Aprire il PROCNO 1 (numero di processo) da EXPNO 1 (Numero Experiment) del set (quello con il tempo di saturazione più elevata). </li><li> Nel tipo lb riga di comando e impostare il valore a 1,5. NOTA: per gli spettri con rapporti molto elevati segnale-rumore di questo valore potrebbe essere diminuita; inversamente, potrebbe essere aumentata per esperimenti rumorosi, se la risoluzione spettrale non è interessato gravemente. </li><li> Nel tipo CEAF linea di comando e processo FID # = 1 (spettro &quot;a risonanza&quot;) nel PROCNO = 2 (Figura 10). </li><li> Correggere la fase dell&#39;esperimento facendo clic sulla correzione di fase b Interactiveutton e salvarlo come un esperimento 2D. Salvare e uscire (Figura 11). </li><li> Tipo rep 1 nella riga di comando per andare al PROCNO 1. </li><li> Nel tipo CEAF linea di comando e processo FID # = 2 (spettro &quot;off-risonanza&quot;) al PROCNO = 3 (Figura 12). </li><li> Nel comando tipo di linea .md quindi rep 2 per mostrare una finestra di visualizzazione multipla con entrambi gli spettri trasformati: 2 (quello con il segnale nel mezzo saturo) e 3 (quello in cui il treno di impulsi di saturazione è stato applicato a 40 ppm ) (Figura 13). </li><li> Fare clic sul pulsante con un segno delta (Figura 13) per calcolare gli spettri differenza e salvarlo in PROCNO 4. Uscire dalla finestra di visualizzazione multipla. </li><li> Selezionare un intervallo di integrazione del segnale sulla sinistra (il segnale in cui si osserverà il trasferimento di saturazione dovuta al processo di scambio chimico). integrare sempre la stessa regione in PROCNO 3 e 4 PROCNO. <br/&gt; Nota: L&#39;intervallo di integrazione utilizzato in questo esperimento è stato 2,55-2,67 ppm. </li><li> Una volta integrato, vai alla scheda &quot;integrali&quot; in ciascuna delle sperimentazioni e copiare il valore di &quot;Integrale [abs]&quot; (Figura 14). </li><li> Dividere l&#39;integrale in PROCNO 4 dall&#39;integrale in PROCNO 3. Che è il valore di η SSTD per un tempo di saturazione di 40 sec (η SSTD = Spin Saturazione trasferimento dei parametri Difference). 21 </li><li> Ripetere la procedura per il resto degli esperimenti con diversi tempi di saturazione. </li></ol></li></ol> 4. Analisi dei dati 30 <ol><li> L&#39;analisi dei dati per ottenere i parametri cinetici <ol><li> Tracciare i valori SSTD η ottenuti rispetto al tempo di saturazione. 21 </li><li> Eseguire una misura esponenziale per regolare le curve ottenute all&#39;equazione <img alt="Equazione 1" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq1.jpg" /> <img alt = &quot;Equazione 2&quot; src = &quot;/ files / ftp_upload / 54499 / 54499eq2.jpg&quot; /&gt; <img alt="Equazione 3" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq3.jpg" /> = <img alt="Equazione 4" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq4.jpg" /> in fase di saturazione molto lungo t = tempo </li><li> Calcolare i valori di η SSTD MAX e δ e utilizzarli per calcolare i valori delle costanti di velocità (k) e tempi di rilassamento T (1A) secondo le seguenti equazioni: <img alt="Equazione 5" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq5.jpg" /> T 1A = longitudinale costante di tempo di rilassamento spin A k = reciproco loco costante il tasso di cambio cinetica <ol><li> Ottenere la costante di velocità cinetica da: <img alt="equazione 6" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq6.jpg" /></li></ol></li></ol></li><li> Eyring Plot per ottenere i parametri termodinamici <ol><li> Ln Plot (k / T) rispetto a 1 / T (T = temperatura assoluta), utilizzando i valori di vacche<html> tassi di tic a temperature diverse. </li><li> Eseguire una misura lineare, per regolare i dati ottenuti per l&#39;equazione Eyring: <img alt="equazione 7" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq7.jpg" /> <img alt="equazione 8" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq8.jpg" /> <img alt="equazione 9" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq9.jpg" /> <img alt="equazione 10" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq10.jpg" /> R = costante dei gas k B = costante di Boltzmann T = temperatura assoluta </li><li> Calcolare i parametri termodinamici d H ≠ e ΔS ≠. </li><li> Calcolare i valori di E A (298) e DeltaG ≠ (298) con le seguenti equazioni: <img alt="equazione 11" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq11.jpg" /> <img alt="equazione 12" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq12.jpg" /> s / ftp_upload / 54499 / 54499eq13.jpg &quot;/&gt; <img alt="equazione 14" src="/files/ftp_upload/54499/54499eq14.jpg" /> </li></ol></li></ol>

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<li>Antanasijevic, A., Ramirez, B., Caffrey, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+the+Sensitivities+of+WaterLOGSY+and+Saturation+Transfer+Difference+NMR+Experiments%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biomol.+NMR%22%5BJournal%5D)">Comparison of the Sensitivities of WaterLOGSY and Saturation Transfer Difference NMR Experiments.</a> J. Biomol. NMR. 60 (1), 37-44 (2014).</li>
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</ol>

Gli autori dichiarano di non avere interessi finanziari concorrenti.

Uno dei vantaggi più evidenti di questa metodologia è che le costanti di velocità e il tempo di rilassamento per una data temperatura possono essere ottenuti con un singolo set di esperimenti, con una robusta sequenza di impulsi (la stessa utilizzata per gli esperimenti STD per studiare le interazioni proteina-ligando, che si trova tipicamente all'interno del set di esperimenti disponibile dal produttore dello spettrometro). Ciò semplifica la configurazione sperimentale poiché non è necessario misurare T1 o raggiungere la saturazione in stato stazionario. Inoltre, è notevole che questo metodo non dipenda dalla forza del magnete, come i metodi a coalescenza. D'altra parte, il limite principale è che questa tecnica non può essere applicata a processi di scambio chimico troppo veloci o troppo lenti, che dipenderebbero dall'intervallo di temperatura della macchina NMR o dai solventi utilizzati.
Questa nuova tecnica per il calcolo dei parametri cinetici può essere applicata a una grande varietà di substrati e la sua applicabilità è già stata dimostrata con alcune interessanti molecole. 21 I parametri cinetici del 4-N,N-dimetilammido[2.2]paraciclofano, un substrato impegnativo in cui il segnale di uno dei gruppi metilici di interesse è sovrapposto ad altri segnali provenienti dalla molecola, sono stati calcolati con successo utilizzando SSTD NMR. È interessante notare che questa metodologia può essere applicata purché uno dei segnali di studio sia isolato. SSTD NMR è anche un protocollo utile per il calcolo dei parametri cinetici in molecole in cui la temperatura di coalescenza è così alta che la molecola si decompone prima di raggiungerla. Questo è il caso del PtCl2(dimetilallene)(piridina), in cui la metodologia è stata applicata con successo senza la necessità di raggiungere la coalescenza. La scelta dei solventi e delle temperature è fondamentale per ottenere buoni risultati, poiché i tassi di scambio chimico possono variare notevolmente con questi parametri. Inoltre, oltre ai criteri di un normale esperimento NMR, i passaggi chiave in un esperimento NMR SSTD sono la selettività dell'irradiazione e il controllo della temperatura. Entrambi i fattori devono essere precisi per garantire il successo dell'esperimento.
I risultati rappresentativi qui presentati riguardano la cinetica dello scambio chimico intramolecolare, ma la tecnica può essere applicata anche per studiare la cinetica dello scambio chimico intermolecolare e anche lo scambio di ligandi, processi comuni nel comportamento dinamico dei complessi di metalli di transizione. 
Infine, a condizione che venga apportata un'adeguata modifica delle equazioni,32 questo metodo potrebbe essere esteso per trattare lo scambio multi-sito e le popolazioni diseguali, come è stato fatto in precedenti esperimenti di doppia risonanza,8-9 aumentando l'utilità di questa tecnica per lo studio dei processi di scambio chimico in composti difficili.

scambio Chemical si riferisce comunemente a qualsiasi processo intermolecolare o intramolecolare in cui un nucleo si muove da un ambiente ad un altro, in cui i parametri NMR (chemical shift, accoppiamento scalare, accoppiamento dipolare, indice di rilassamento) differiscono. Ci sono numerosi esempi di scambio chimico di molecole organiche e organometallici (ad esempio, le barriere rotazionali in biaryls, anello di barriere flipping e l&#39;equilibrio conformazionale, inversione di azoto, ligando, degenerata scambio ligando e tautomerizzazione). 1-3 Il tasso di cambio è legato alla chimica la termodinamica della barriera del processo di scambio, e quindi il suo studio è di importanza cruciale per comprendere le dinamiche molecolari di questi sistemi. Il classico segno di scambio dinamico in NMR è un drastico cambiamento nella line-forma dei segnali NMR al variare della temperatura. A basse temperature, il processo è lento e due distinte spostamenti chimici sono osserved. A temperature elevate, i due segnali si fondono in un unico segnale, che è conosciuto come &quot;coalescenza&quot;. A temperature intermedie, i segnali diventano molto ampio. Questa sensibilità dello spettro NMR di scambio chimico rende NMR un metodo molto potente per studiare la dinamica di molecole in soluzione. Due metodi sono stati impiegati principalmente nello studio dei processi dinamici in soluzione:. Analisi forma di linea, 4-7 e saturazione centrifuga esperimenti di trasferimento 8-9 Inoltre, è anche opportuno ricordare il metodo 10 e la CIFIT trasferimento di inversione programma 11 per l&#39;estrazione diretta di costanti di velocità, che sono un approccio relativamente efficiente per le misure di scambio in sistemi semplici. Sebbene questi metodi forniscono risultati molto buoni nella maggior parte dei casi, tuttavia, presentano numerosi inconvenienti. Lo svantaggio principale dell&#39;analisi forma linea è le alte temperature necessarie per raggiungere coalescenza in alcuni campioni. 12 I principali problemi da considerare quando carrying out di spin esperimenti di trasferimento di saturazione sono: i tempi di saturazione molto lunghi necessari per raggiungere il trasferimento di saturazione stato stazionario tra i siti scambio, e la necessità di determinare il tempo di rilassamento longitudinale costante, T 1, che può essere difficile se non vi è sovrapposizione di diversa segnali nella regione di studio. 13 Come parte delle nostre indagini nei meccanismi organometallici, 14-16 il nostro gruppo sta studiando il comportamento fluxional di complessi di platino-Allene in soluzione. Questo è un compito complesso che coinvolge almeno tre processi diversi, uno dei quali è lo scambio π faccia o rotazione del metallo intorno uno dell&#39;asse Allene. Abbiamo incontrato che normale esperimenti VT e tecniche di analisi a forma di linea che sono state impiegate prima in sistemi simili, 17-19 non erano adatti nel nostro studio, grazie ad una rotazione molto lenta nel nostro complesso platino allene che ha reso la temperatura della coalescenza signali di interesse superiore alla temperatura di decomposizione del complesso. Per superare questa limitazione, abbiamo sviluppato e recentemente riportato un nuovo protocollo NMR (SSTD NMR) per studiare i processi di reciproco loco scambio chimico. 20 Come suggerisce il nome questo metodo combina il metodo di Spin saturazione di trasferimento utilizzato per piccole molecole, con la Saturation transfer Difference metodo NMR impiegato per lo studio di interazioni proteina-ligando, 21-24 misurando transitoria centrifuga trasferimento di saturazione lungo aumentando i tempi di saturazione (curve build-up) in piccole molecole in fase di scambio chimico. Con questo nuovo metodo (SSTD NMR) abbiamo dimostrato che siamo in grado di ottenere i parametri cinetici di scambio chimico intramolecolare in piccole molecole organiche e organometallici con alcuni ulteriori vantaggi rispetto agli approcci tradizionali: coalescenza dei segnali non è necessario, quindi un intervallo di temperatura più flessibile può essere utilizzatanello studio; segnale di sovrapposizione non interferisce, anche se almeno una delle risonanze scambio devono essere isolati; non vi è alcuna necessità di misurare T 1 o raggiungere la saturazione stato stazionario; tassi valori costanti vengono misurati direttamente e valori T 1 sono ottenuti nello stesso esperimento, utilizzando un solo set di esperimenti. Un altro notevole vantaggio della metodologia SSTD NMR è che, a differenza LineShape analisi, la determinazione delle costanti cinetiche tasso non è limitata dall&#39;aumento delle temperature coalescenza associati con alti campi magnetici. Così, la nostra metodologia è quindi molto ben appropriato per entrambi i campi magnetici a bassa e alta. Questo articolo ha lo scopo di aiutare i nuovi utenti di applicare questo nuovo metodo per i propri sistemi in fase di scambio chimico, e descrive la preparazione del campione, insieme sperimentale su, l&#39;acquisizione dei dati, e un esempio di elaborazione e l&#39;analisi dei dati in una semplice molecola organica.

<table><tbody><tr><td>N,N-dimetilacetammide</td><td>Aldrich</td><td>38840</td><td>Tossicità acuta</td></tr><tr><td>Toluene-d8</td><td>Fluorochem</td><td>D-005</td><td>Infiammabile e tossico</td></tr><tr><td>500 MHz 7" Select Series NMR Tubes</td><td>GPE LTD</td><td>S-5-500-7</td><td></td></tr><tr><td>TopSpin 2.1</td><td>Programma TopSpin, Bruker Corp., http://www.bruker.com/products/mr/nmr/nmr-software/software/topspin/ (2015).</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Origine 6.0</td><td>Software Origin 6.0, OriginLab Corp., http://originlab.com.</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Bruker Avance III 500 MHz dotato di sonda SmartProbeTM a gradiente Z BBFOplus a banda larga da 5 mm</td><td>&nbsp; Bruker Corp., http://www.bruker.com</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Spettrometro NMR a tripla risonanza inversa Bruker Avance I da 500 MHz dotato di una sonda a gradiente Z TXI da 5 mm</td><td>. Bruker Corp., http://www.bruker.com</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Sistemi di spessori standard per spinner ceramici (5 mm)</td><td>&nbsp; Bruker Corp., http://www.bruker.com</td><td>H00804</td><td></td></tr></tbody></table>

spin saturazione transfer difference nmr (sstd nmr): un nuovo strumento per ottenere kinetic parametri di processi a scambio chimico

Spin Saturation Transfer Difference NMR (SSTD NMR): A New Tool to Obtain Kinetic Parameters of Chemical Exchange Processes

Questo protocollo dettagliato descrive la nuova rotazione di saturazione Transfer Difference magnetica nucleare protocollo Resonance (SSTD NMR), recentemente messo a punto nel nostro gruppo per studiare i processi di reciproco loco scambio chimico che sono difficili da analizzare con i metodi tradizionali. Come suggerisce il nome, questo metodo combina il metodo Spin Saturation Transfer utilizzato per piccole molecole, con la saturazione Transfer Difference metodo (STD) NMR impiegato per lo studio di interazioni proteina-ligando, misurando transitoria trasferimento centrifuga saturazione lungo aumentando i tempi di saturazione (generazione curve -up) in piccole molecole organiche e organometallici sottoposti a scambio chimico. I vantaggi di questo metodo rispetto quelli esistenti sono: non c&#39;è necessità di raggiungere coalescenza dei segnali scambio; il metodo può essere applicato finché un segnale dei siti scambio è isolato; non vi è alcuna necessità di misurare T 1 o raggiungere la saturazione stato stazionario; tasso va costantelues vengono misurati direttamente, e valori T 1 sono ottenuti nello stesso esperimento, utilizzando un solo set di esperimenti. Per testare il metodo, abbiamo studiato la dinamica della rotazione ostacolata di N, N -dimethylamides, per il quale è disponibile più dati per il confronto. I parametri termodinamici ottenuti usando SSTD sono molto simili a quelli riportati (tecniche di trasferimento spin-saturazione e analisi-linea figura). Il metodo può essere applicato a substrati più difficili che non possono essere studiati con metodi precedenti. Prevediamo che il semplice set up sperimentale e l&#39;ampia applicabilità del metodo per una grande varietà di substrati renderemo questa una tecnica comune tra i chimici organici ed organometallici senza una vasta esperienza in NMR.

La tecnica SSTD NMR è stata applicata per il calcolo dei parametri cinetici nella rotazione dell&#39;ammide legame di N, N -dimethylacetamide. 21 Questo è un semplice esempio di cui numerosi dati di confronto possono essere trovati in letteratura. 31 La rotazione ostacolato intorno al legame ammidico, a causa del carattere doppio legame parziale in forma di risonanza, distingue due gruppi metilici in due segnali in 1 H-NMR (2,61 e 2,17 ppm a 22,5 ° C). Saturazione Spin del segnale del gruppo metilico a 2.17 ppm (Me B) porta alla scomparsa del suo segnale in 1 H NMR. Dopo saturazione Me B, trasferimento di saturazione per l&#39;altro gruppo metilico (Me A) a causa del processo di rotazione interna può essere osservato da una diminuzione dell&#39;intensità 1 H nel segnale a 2.61 ppm. il magnitude di questa diminuzione dipende dal tempo di saturazione. La Figura 15 mostra l&#39;spettri 1 H NMR del -dimethylacetamide N, N a 22,5 ° C, e le espansioni visualizza spettri colpo (a) e (b) la saturazione del metil gruppo a 2.17 ppm, così come lo spettro differenza (c), utilizzato per calcolare i valori di η SSTD. Il fattore η SSTD è calcolato dividendo il valore dell&#39;integrale di Me A nello spettro SSTD NMR (c) per il valore dell&#39;integrale del Me A in spettri (a), come spiegato nel protocollo. I valori ottenuti di η SSTD per ciascun tempo di saturazione a diverse temperature sono raccolti nella tabella 1. La trama dei valori ottenuti di η SSTD rispetto al tempo di saturazione ha dato curve esponenziali in cui un altopiano è stato raggiunto in tempi di saturazione superiori. Per una certa temperatura, la misura esponenziale della curva permette il calcolo del tassocostante (k) ed il tempo di rilassamento del 1 H del segnale misurato (T 1A) (Figura 16). Figura 17 mostra le curve ottenute con il k e valori 1A T ottenute negli attacchi. Infine, la trama di ln (k / T) rispetto a 1 / T e l&#39;adattamento all&#39;equazione Eyring (Figura 18) sono stati usati per calcolare l&#39;entalpia e l&#39;entropia di attivazione. I parametri di attivazione rilevati vengono mostrati nella Tabella 2, unitamente ai parametri precedentemente segnalati, calcolate utilizzando diverse metodologie. Come si può osservare nella Tabella 2, i valori dei parametri di attivazione ottenuti con la tecnica Spin Saturation Transfer Difference (SSTD NMR) sono in eccellente accordo con i dati riportati in precedenza con altre tecniche, come SST NMR oanalisi forma di linea. L&#39;ampia gamma di valori riportati per ΔS ‡ è dovuto alla difficoltà nella misurazione di questo parametro con tecniche NMR. 31 Per quanto riguarda il resto dei parametri di attivazione, i valori ottenuti con il nostro metodo non solo sono molto simili a quelle già presentate ma anche più precisi, dal momento che i nostri errori (SD) sono più piccoli in tutti i casi. <img alt="Figura 1" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig1.jpg" /> Figura 1: Elenco degli esperimenti dopo aver digitato rpar. La figura mostra i diversi set di parametri tra i quali deve essere selezionata STDDIFFESGP. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig1large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="figura 2" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig2.jpg" /><br/&gt; Figura 2:.. Parametri di acquisizione il pulsante evidenziato in un quadrato rosso porta ad un elenco dei diversi programmi di impulso <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig2large.jpg" target="_blank">Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 3" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig3.jpg" /> Figura 3:.. Elenco dei programmi di impulsi La figura mostra il programma selezionato impulso nell&#39;esperimento (STDDIFF) <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig3large.jpg" target="_blank">Si prega di cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 4" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig4.jpg" /> Figura 4: Pop-up finestra è apparso dopo la calibrazione 90 ° impulsi La figura mostra i valori della calibrato 90 &amp;.<html> # 176; impulso a diversi livelli di potenza. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig4large.jpg" target="_blank">Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 5" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig5.jpg" /> Figura 5:.. Schermata della riga di comando La figura mostra come introdurre il valore per l&#39;impulso dura calibrata <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig5large.jpg" target="_blank">prega di cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 6" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig6.jpg" /> Figura 6:. Valore per la lunghezza dell&#39;impulso sagomato La figura mostra come introdurre il valore per la durata dell&#39;impulso sagomato.<html> g6large.jpg &quot;target =&quot; _ blank &quot;&gt; Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura. <img alt="Figura 7" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig7.jpg" /> Figura 7:.. Parametri di acquisizione La figura mostra i parametri di potenza <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig7large.jpg" target="_blank">Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 8" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig8.jpg" /> Figura 8:. Parametri per il polso a forma di I valori per il polso a forma di saranno introdotti in linea 13. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig8large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <html> PLOAD / 54499 / 54499fig9.jpg &quot;/&gt; . Figura 9: Elenco delle frequenze di irradiazione La figura comprende i seguenti dati nelle prime 3 righe: riga 1. P (indica che i seguenti dati è in ppm); Row 2 frequenza del segnale da irradiare in ppm, come misurato. in 3.1.1; Row 3,40 ppm (una frequenza che è lontano dalle 1 segnali H del composto così l&#39;irradiazione in quella frequenza non influenza gli spettri). <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig9large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 10" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig10.jpg" /> Figura 10:. L&#39;elaborazione del primo FID La figura mostra la finestra pop-up che compare dopo aver digitato EFP.<html> nk &quot;&gt; Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura. <img alt="Figura 11" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig11.jpg" /> Figura 11:.. Correzione di fase Schermata mostra la finestra per la correzione di fase manuale <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig11large.jpg" target="_blank">Si prega di cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 12" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig12.jpg" /> Figura 12:. L&#39;elaborazione del secondo FID La figura mostra la finestra pop-up che compare dopo aver digitato EFP. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig12large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> Figura 13 &quot;src =&quot; / files / ftp_upload / 54499 / 54499fig13.jpg &quot;/&gt; Figura 13: visualizzazione multipla di spettri 2 e 3. Il pulsante evidenziato in un quadrato rosso è quello di calcolare gli spettri differenza. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig13large.jpg" target="_blank">Si prega di cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 14" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig14.jpg" /> Figura 14:. Tab. Integrali La figura mostra i valori degli integrali assoluti e relativi <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig14large.jpg" target="_blank">prega di cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 15" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig15.jpg" /> Figura 15: Struttura e 1 </stron<html> g&gt; H NMR di N, N -dimethylacetamide a 22,5 ° C in toluene-d 8 (a) 1 H NMR espansione della regione dal 2.13 al 2.66 ppm prima dell&#39;irraggiamento. (B) di espansione della stessa regione dopo irradiazione del gruppo metilico a 2.17 ppm. (C) spettro Differenza [(a) - (b)]. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig15large.jpg" target="_blank">Si prega di cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 16" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig16.jpg" /> Figura 16: Esempio della trama di SSTD η e la sua forma esponenziale a 278 K. Riprodotto dalle informazioni di supporto di riferimento 21 con il permesso della Royal Society of Chemistry.http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig16large.jpg &quot;target =&quot; _ blank &quot;&gt; Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura. <img alt="Figura 17" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig17.jpg" /> Figura 17: Piazzole di η SSTD vs. tempo di saturazione a diverse temperature. La figura mostra la trama di N, N -dimethylacetamide e la tabella con i tassi costanti ottenuti e tempi di rilassamento. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig17large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 18" src="/files/ftp_upload/54499/54499fig18.jpg" /> Figura 18:. Trama Eyring La figura mostra la trama di N, N -dimethylacetamide. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54499/54499fig18large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody><tr><td rowspan="2"> t Sat (sec) </td><td> η SSTD </td><td> η SSTD </td><td> η SSTD </td><td> η SSTD </td><td> η SSTD </td><td> η SSTD </td><td> η SSTD </td></tr><tr><td> (T = 278 K) </td><td> (T = 283 K) </td><td> (T = 285.5 K) </td><td> (T = 288 K) </td><td> (T = 290.5 K) </td><td> (T = 293 K) </td><td> (T = 295.5 K) </td></tr><tr><td> 40 </td><td> 0,2526 </td><td> 0,3957 </td><td> 0,4671 </td><td> 0,5461 </td><td> 0,626 </td><td> 0,6969 </td><td> 0,7535 </td></tr><tr><td> 20 </td><td> 0,2526 </td><td> 0,3957 </td><td> 0,4671 </td><td> 0,5461 </td><td> 0,626 </td><td> 0,6969 </td><td> 0,7535 </td></tr><tr><td> 10 </td><td> 0,2383 </td><td> 0,3806 </td><td> 0,4537 </td><td> 0,5355 </td><td> 0,6199 </td><td> 0,6969 </td><td> 0,7535 </td></tr><tr><td> 5 </td><td> 0,1904 </td><td> 0,3193 </td><td> 0,3919 </td><td> 0.481 </td><td> 0,5734 </td><td> 0,6638 </td><td> 0,7318 </td></tr><tr><td> 2.5 </td><td> 0,1263 </td><td> 0,2204 </td><td> 0,2812 </td><td> 0,3589 </td><td> 0,4449 </td><td> 0,5461 </td><td> 0,626 </td></tr><tr><td> 1.25 </td><td> 0,0761 </td><td> 0,1353 </td><td> 0,171 </td><td> 0,2247 </td><td> 0,2868 </td><td> 0,3732 </td> &lt;td&gt; 0,4449 </td></tr><tr><td> 0,625 </td><td> 0,0467 </td><td> 0,0739 </td><td> 0,099 </td><td> 0,1327 </td><td> 0,171 </td><td> 0,2291 </td><td> 0,2758 </td></tr><tr><td> 0.3 </td><td> 0,0238 </td><td> 0.044 </td><td> 0,0472 </td><td> 0,0644 </td><td> 0,0847 </td><td> 0,1169 </td><td> 0,1463 </td></tr></tbody></table> Tabella 1:. I valori di η SSTD La tabella mostra i valori ottenuti in diversi momenti di saturazione per la N, N -dimethylacetamide nella gamma di temperature 278-295.5 K. <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="585"><colgroup><col /><col span="5" /></colgroup><tbody><tr height="34"><td height="34" style="height:34px;width:145px;"> metodo </td><td style="width:88px;"> SSTD NMR </td><td rowspan="2" style="width:88px;"> SST NMR 31 </<html> td&gt; <td style="width:88px;"> Analisi line-forma </td><td style="width:88px;"> Analisi line-forma </td><td style="width:88px;"> Analisi line-forma </td></tr><tr height="22"><td height="22" style="height:22px;width:145px;"> Parametro </td><td style="width:88px;"> (Questo lavoro) </td><td style="width:88px;"> (1 H NMR) 4 </td><td style="width:88px;"> (1 H NMR) 5 </td><td style="width:88px;"> (13 C NMR) 6 </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;width:145px;"> E bis (mol KJ -1) 298 </td><td style="width:88px;"> 79,7 ± 0,1 </td><td style="width:88px;"> 73.1 ± 1.4 </td><td style="width:88px;"> 70.5 ± 1.7 </td><td style="width:88px;"> 82.0 ± 1.3 </td><td style="width:88px;"> 79.5 ± 0.4 </td></tr><tr height="21">21px; width: 145px; &quot;&gt; d H ‡ (KJ mol -1) </td><td style="width:88px;"> 77.2 ± 0.1 </td><td style="width:88px;"> 70.6 ± 1.4 </td><td style="width:88px;"> 68 </td><td style="width:88px;"> 79.5 ± 0.4 </td><td style="width:88px;"> 76.6 ± 0.4 </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;width:145px;"> ΔS ‡ (J mol -1 K -1) </td><td style="width:88px;"> 11.5 ± 0.4 </td><td style="width:88px;"> -10.5 ± 5.0 </td><td style="width:88px;"> -15.0 ± 5.1 </td><td style="width:88px;"> 13 ± 8 </td><td style="width:88px;"> 3 ± 4 </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;width:145px;"> DeltaG ‡ 298 (KJ mol -1) </td><td style="width:88px;"> 73.8 ± 0.1 </td><td style="width:88px;"> 73.7 ± 2.0 </td><td style="width:88px;"> 72.5 </td><td style="width:88px;"> 75.3 ± 0.4 </td><td style="width:88px;"> 75.7 ± 0.4 </td></tr><tr height="21"><td height="21" style="height:21px;width:145px;"> Solvente </td><td style="width:88px;"> Tol- d 8 </td><td style="width:88px;"> Tol- d 8 </td><td style="width:88px;"> CCl 4 </td><td style="width:88px;"> Acetone- d 6 </td><td style="width:88px;"> pulito </td></tr></tbody></table> Tabella 2:. Parametri di attivazione La tabella riporta i parametri di attivazione per la rotazione interna N, N -dimethylacetamide ottenuti con il metodo SSTD NMR rispetto agli stessi parametri ottenuti utilizzando diversi metodi NMR per analisi 4,5,6 Errori in questa tabella. fare riferimento a errori di deviazione standard (SD). (Tratto da riferimento 21 con il permesso dal Royal Society di Chimica).

Un protocollo dettagliato che descrive il metodo SSTD NMR è presentato qui per aiutare i nuovi utenti ad applicare questo nuovo metodo per ottenere i parametri cinetici dei propri sistemi sottoposti a scambio chimico.

Spin saturazione Transfer Difference NMR (SSTD NMR): Un nuovo strumento per ottenere Kinetic parametri di processi a scambio chimico

This detailed protocol describes the new Spin Saturation Transfer Difference Nuclear Magnetic Resonance protocol (SSTD NMR), recently developed in our ...

L'obiettivo generale di questo esperimento è ottenere i parametri cinetici e i processi di scambio chimico reciproco in piccole molecole organiche e organometalliche che risultano difficili da misurare con metodi tradizionali. Questo metodo può contribuire a comprendere la dinamica molecolare di molecole organiche e organometalliche soggette a scambio chimico, ad esempio la varianza rotazionale, l'equilibrio conformazionale, l'inversione dell'azoto, lo scambio della lignina e la tautomerizzazione.I principali vantaggi di questa tecnica sono che non è necessaria la coalescenza dei segnali in scambio e che la costante di velocità e il tempo di rilassamento vengono ottenuti nello stesso esperimento. Abbiamo avuto per la prima volta l'idea di questo metodo durante lo studio del comportamento funzionale di complessi di ioni di platino in soluzione, rendendoci conto che le tecniche di analisi della variazione della temperatura di allineamento non erano adatte. Grazie alla nostra esperienza nello studio delle interazioni proteina-lignina mediante NMR, abbiamo capito che in effetti approcci NMR simili potevano essere applicati per studiare i processi di scambio in molecole organiche, e ciò si è rivelato vero.Aggiungere cinque milligrammi di nn-dimetilacidoammide in un tubo NMR adatto a basse temperature e sciogliere in zero virgola sei millilitri di toluene deuterato. Per configurare gli esperimenti NMR con SSTD, inserire prima il campione nel magnete. Uno dei passaggi chiave per facilitare l'esperimento NMR è il controllo della temperatura, quindi assicurarsi che il campione si stabilizzi alla temperatura selezionata per almeno 20 minuti.Una volta inserito il campione nel magnete, digitare EDTE nella riga di comando. Impostare la temperatura al primo valore selezionato per eseguire l'esperimento. Lasciare stabilizzare il campione alla temperatura scelta per almeno 20 minuti.Eseguire un esperimento di NMR protonica monodimensionale sul campione come descritto nel protocollo del testo, quindi creare un nuovo set di dati di un esperimento di NMR protonica facendo clic su File, nuovo e assegnare un nome al nuovo esperimento. Nel nuovo set di dati, digitare RPAR nella riga di comando. Selezionare uno dei set di parametri STDDIFF dall'elenco.Per selezionare la sequenza impulsistica STDDIFF, fare clic sul pulsante con i tre puntini nella riga del programma impulsistico. Prima di eseguire l'esperimento NMR SSTD, calibrare l'impulso duro protonico di 90 gradi P1. Digitare pulsecal nella riga di comando e copiare il valore dell'impulso di 90 gradi alla potenza più elevata, ovvero quello che fornisce l'impulso più breve.Introdurre i valori per l'impulso rigido calibrato nell'esperimento mediante il comando getprosol. Successivamente impostare la durata dell'impulso, digitare P13 e inserire un valore di 50.000 microsecondi. Impostare la forma dell'impulso selettivo andando su power e facendo clic sul pulsante modifica accanto a shape, quindi selezionare la forma dell'impulso 13 e scegliere l'impulso gaussiano.Impostare la potenza dell'impulso selettivo SP13 a 50 decibel. Digitare NS e impostarlo a otto, quindi digitare DS e impostarlo a quattro. Per acquisire l'esperimento SSTD NMR, aprire l'esperimento NMR del protone per verificare la posizione del segnale che verrà irradiato.Per farlo, cercare l'esperimento nel browser del software, fare clic con il tasto destro sul set di dati e selezionare "visualizza in una nuova finestra". La selettività dell'irradiazione deve essere precisa per garantire il successo dell'esperimento. Assicurarsi che non vengano utilizzati prodotti chimici di correzione o che la frequenza di irradiazione possa essere impostata in modo errato.Spostare la linea del cursore al centro del segnale da irradiare e annotare lo spostamento chimico in parti per milione. Selezionare la larghezza spettrale che verrà utilizzata nell'esperimento. In questo caso, il segnale da irradiare si trova a 2.17 parti per milione e la larghezza spettrale utilizzata è di 1.46 parti per milione.Successivamente, passare all'esperimento NMR SSTD precedentemente creato, creare un elenco con le frequenze di irradiazione digitando FQ2LIST nella riga di comando e selezionando un elenco esistente. Modificare l'elenco delle frequenze di irradiazione come descritto nel protocollo testuale. Salvare l'elenco con un nuovo nome.Quindi digitare FQ2LIST nella riga di comando e selezionare la lista appena creata. Per centrare l'esperimento sul segnale in esame, digitare O1P e selezionare lo spostamento chimico del segnale che verrà irradiato come centro dell'esperimento. Digitare SW per selezionare l'ampiezza spettrale.Scegliere il valore per il tempo di rilassamento inter-scan D1. Assicurarsi che sia almeno da uno a cinque volte il valore del T1 del protone con rilassamento più lento. Digitare D1 e impostarlo a 40 secondi. Impostare il primo valore per il tempo di saturazione digitando D20 e impostandolo a 40 secondi.Determinare automaticamente il guadagno del ricevitore digitando RGA. Creare il prossimo esperimento digitando IEXPNO. Digitare D20 e selezionare un tempo di saturazione di 20 secondi.Quindi digitare RGA per determinare automaticamente RG. Ripetere l'ultimo passaggio per D20 pari a 10, 5, 2,5, 1,25, 0,625 e 0,3 secondi. Una volta create tutte le esperienze, aprire la prima e nella riga di comando digitare multizg specificando il numero di esperienze. Per elaborare i dati, aprire l'elaborazione numero uno dal set di esperienze con il tempo di saturazione più elevato.Nella riga di comando digitare LB e impostare il valore a 1,5. Nella riga di comando digitare EFP e impostare il numero di FID uguale a uno e il numero in elaborazione uguale a due. Correggere la fase dell'esperimento cliccando sul pulsante interattivo di correzione di fase e salvarlo come esperimento 2G, quindi salvare ed uscire.Digitare REP 1 nella riga di comando per passare al processo numero uno. Nella riga di comando digitare EFP e numero FID del processo uguale a due, numero di processo uguale a tre. Successivamente, nella riga di comando digitare punto MD e quindi REP 2 per mostrare una finestra di visualizzazione multipla con gli spettri dei processi due e tre.Fare clic sul pulsante con il simbolo delta per calcolare gli spettri di differenza e salvarli nel processo numero quattro. Quindi uscire dalla finestra di visualizzazione multipla. Selezionare un intervallo di integrazione dal segnale a sinistra.Integrare sempre la stessa regione nel processo numero tre e nel processo numero quattro. Una volta effettuata l'integrazione, passare alla scheda integrali in ciascun esperimento e copiare il valore assoluto dell'integrale. Ripetere la procedura per il resto degli esperimenti con diversi tipi di saturazione.Per ottenere i parametri cinetici, estrarre innanzitutto i valori dei parametri SSTD ottenuti in funzione del tempo di saturazione. Proseguire con l'analisi dei dati come descritto nel protocollo testuale. La rotazione impedita attorno al legame ammidico differenzia i due gruppi metilici in due segnali negli spettri di risonanza magnetica protonica.La saturazione rotazionale del gruppo metilico a 2,17 parti per milione porta alla scomparsa del suo segnale nella risonanza magnetica protonica (NMR). Saturando il gruppo metilico B a 2,17 parti per milione, il trasferimento della saturazione al gruppo metilico A a 2,16 parti per milione, dovuto alla rotazione interna, può essere osservato come diminuzione dell'intensità protonica nel segnale a 2,61 parti per milione. Il fattore parametro SSTD viene calcolato dividendo il valore dell'integrale del gruppo metilico A nello spettro di differenza per il valore dell'integrale del gruppo metilico A nello spettro originale.Per una determinata temperatura, il grafico dei valori del parametro SSTD in funzione del tempo di saturazione ha prodotto curve esponenziali. L'analisi delle curve fornisce la costante di velocità e il tempo di rilassamento del protone del segnale misurato. I grafici del parametro SSTD in funzione del tempo di saturazione a diverse temperature hanno fornito le corrispondenti costanti di velocità e i tempi di rilassamento.L'equazione di Eyring è stata utilizzata per calcolare i parametri termodinamici. I valori ottenuti con la NMR SSTD sono in ottimo accordo con i dati riportati mediante altre tecniche. Una volta acquisita padronanza, un insieme di esperimenti a una temperatura data per ottenere un valore della costante di velocità e del tempo di rilassamento può essere completato in circa tre ore, se eseguito correttamente.Nel tentativo di eseguire questa procedura, è importante ricordare che la scelta dei solventi e delle temperature è fondamentale per ottenere buoni risultati, poiché le velocità di scambio chimico possono variare notevolmente in funzione di questi parametri. Seguendo questo procedimento, è possibile studiare anche altri processi come lo scambio chimico intermolecolare lento dal punto di vista cinetico e lo scambio della lignina; inoltre, questo metodo potrebbe essere esteso per trattare scambi multi-sito e popolazioni non equivalenti, a condizione che si apporti una modifica adeguata all'equazione.Dopo aver visto questo video, si dovrebbe avere una buona comprensione di come eseguire esperimenti di differenza nel trasferimento di saturazione rotazionale e di come utilizzare il trasferimento di magnetizzazione per ottenere parametri cinetici e termodinamici in molecole che subiscono scambio chimico. Non dimenticare che lavorare con sostanze chimiche può essere estremamente pericoloso e che precauzioni come l'uso di occhiali di sicurezza e guanti devono essere sempre adottate durante la preparazione del campione in questa procedura.

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