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Genetics
Indagine di assunzione di proteine per lesioni del DNA utilizzando 405 Nm Laser Micro-irradiazione
Indagine di assunzione di proteine per lesioni del DNA utilizzando 405 Nm Laser Micro-irradiazione
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Genetics
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JoVE Journal Genetics
Investigation of Protein Recruitment to DNA Lesions Using 405 Nm Laser Micro-irradiation

Indagine di assunzione di proteine per lesioni del DNA utilizzando 405 Nm Laser Micro-irradiazione

Full Text
10,014 Views
12:29 min
March 20, 2018

DOI: 10.3791/57410-v

Antoine Gaudreau-Lapierre*1, Daniel Garneau*1, Billel Djerir*1, Frédéric Coulombe1, Théo Morin1, Alexandre Marechal1

1Department of Biology,Université de Sherbrooke

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This article describes a method for creating localized DNA double-stranded breaks using a 405 nm laser scanning confocal microscope. It also outlines automated procedures to quantify the dynamics of DNA repair factors at these lesions.

Key Study Components

Area of Science

  • DNA damage repair
  • Cellular response to DNA lesions
  • Microscopy techniques

Background

  • Localized DNA damage is crucial for studying repair mechanisms.
  • Confocal microscopy is widely available in research labs.
  • Understanding protein recruitment to DNA breaks is essential for elucidating repair pathways.
  • This method allows for real-time observation of repair dynamics.

Purpose of Study

  • To develop a method for inducing localized DNA damage.
  • To automate the quantification of repair factor dynamics.
  • To facilitate the study of protein recruitment to DNA lesions.

Methods Used

  • Utilization of a 405 nm laser scanning confocal microscope.
  • Transient transfection or stable cell line selection for fluorescent protein expression.
  • Seeding of U2OS cells in culture slides for micro-irradiation experiments.
  • Monitoring of live recruitment of fluorescently-labeled proteins.

Main Results

  • Successful induction of localized double-stranded breaks.
  • Automated procedures effectively quantified repair factor dynamics.
  • Demonstrated recruitment of proteins to DNA lesions.
  • Provided insights into signaling pathways regulating protein accumulation.

Conclusions

  • The method is accessible for various laboratories.
  • It enhances understanding of DNA damage response kinetics.
  • Future studies can leverage this technique for deeper insights into DNA repair mechanisms.

Frequently Asked Questions

What is the main goal of this study?
The main goal is to create localized DNA double-stranded breaks and quantify the dynamics of DNA repair factors.
What equipment is used in this method?
A 405 nm laser scanning confocal microscope is used to induce DNA damage.
How are cells prepared for the experiment?
U2OS cells are seeded in culture slides 24 hours prior to the micro-irradiation experiment.
What can this method help researchers understand?
It helps in understanding the kinetics of the DNA damage response and protein recruitment to DNA lesions.
Is this method accessible for all laboratories?
Yes, it utilizes commonly available confocal microscope systems.
What type of proteins can be studied using this method?
Fluorescently-labeled proteins that are involved in DNA repair can be studied.

Studiare la cinetica di riparazione danni del DNA richiede un sistema di indurre lesioni alle regioni definite sub-nucleare. Descriviamo un metodo per creare interruzioni di double-stranded localizzate utilizzando un microscopio confocale a scansione laser, dotato di un laser di 405 nm e forniscono procedure automatizzate per quantificare la dinamica di fattori di riparazione a queste lesioni.

L'obiettivo generale di questa procedura è quello di creare rotture localizzate del DNA a doppio filamento utilizzando un microscopio confocale a scansione laser a 405 nanometri ampiamente disponibile e fornire procedure automatizzate per quantificare la dinamica dei fattori di riparazione del DNA in queste lesioni. Questo metodo può essere utilizzato per determinare se una data proteina viene reclutata per le rotture del DNA a doppio filamento e delineare le vie di segnalazione che regolano il suo accumulo nelle lesioni del DNA. La tecnica utilizza un sistema di microscopio confocale comunemente disponibile per indurre localmente il danno al DNA.

Ciò consente praticamente a qualsiasi laboratorio di studiare la cinetica della risposta al danno al DNA. Se si monitora il reclutamento in tempo reale di una proteina marcata in fluorescenza, eseguire la trasfezione transitoria o la selezione di linee cellulari stabili che esprimono la proteina di interesse, fuse con un reporter fluorescente. 24 ore prima dell'esperimento di micro-irradiazione, seminare 40.000 cellule U2OS per pozzetto in DMEM 1X contenente il 10% di FBS, in vetrini di coltura a otto pozzetti, con fondi in polimero di vetro simili a vetrini spessi 170 micron.

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