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Ottimizzazione di Laser Capture Microdissection per l'isolamento dei gangli enterici dal tessuto ...
Ottimizzazione di Laser Capture Microdissection per l'isolamento dei gangli enterici dal tessuto ...
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JoVE Journal Neuroscience
Optimization of Laser-Capture Microdissection for the Isolation of Enteric Ganglia from Fresh-Frozen Human Tissue

Ottimizzazione di Laser Capture Microdissection per l'isolamento dei gangli enterici dal tessuto umano fresco congelato

Full Text
9,103 Views
08:28 min
June 14, 2018

DOI: 10.3791/57762-v

Aaron A. May-Zhang1, Karen K Deal1, E. Michelle Southard-Smith1

1Vanderbilt University Medical Center

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study outlines a protocol for extracting high-integrity RNA from enteric ganglia isolated from freshly-resected human intestinal tissue using laser capture microdissection (LCM). The method aims to investigate the expression profiles of the enteric nervous system in human intestines, enhancing our understanding of neural functions within the gastrointestinal tract.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Molecular Biology
  • Gastroenterology

Background

  • The enteric nervous system plays a critical role in gastrointestinal function.
  • High-quality RNA is essential for studying gene expression profiles.
  • Laser capture microdissection allows for precise isolation of cellular structures.
  • This technique facilitates detailed molecular analyses from intact tissue.

Purpose of Study

  • To obtain high yields of RNA from human enteric ganglia.
  • To preserve RNA quality while minimizing tissue damage.
  • To assess gene expression profiles in the human enteric nervous system.

Methods Used

  • Laser capture microdissection (LCM) of enteric ganglia from human tissue samples.
  • Freshly-resected intestinal tissue was processed to isolate ganglia.
  • Critical steps included cryosectioning, staining, and dehydration.
  • RNA extraction followed the LCM techniques to achieve high RNA integrity.

Main Results

  • The protocol yielded over 1 nanogram of high-quality RNA for sequencing.
  • RNA integrity numbers indicated excellent RNA quality suitable for RNA-Seq.
  • More than 95% of samples were sufficient for sequencing analyses.

Conclusions

  • This study demonstrates an effective method for isolating RNA from human enteric ganglia.
  • The results enable deeper insights into the molecular mechanisms of the enteric nervous system.
  • This method has implications for research on gastrointestinal disorders and neural function.

Frequently Asked Questions

What are the advantages of using LCM for RNA extraction?
Laser capture microdissection allows for precise targeting and isolation of specific cell types, minimizing contamination and maximizing RNA quality.
How is the enteric ganglia model implemented in this study?
Enteric ganglia are isolated from freshly-resected human intestinal tissue processed through cryosectioning and LCM to study their gene expression.
What types of data can be obtained using this RNA extraction protocol?
This method enables high-quality RNA for transcriptomic analyses, facilitating the investigation of gene expression dynamics in the enteric nervous system.
How can this method be applied in future research?
The protocol can be adapted to study other tissues or cell types, broadening its applications in neuroscience and molecular biology.
What are some limitations of this approach?
Sample quality, proper handling, and swift processing are crucial to obtaining high integrity RNA; any deviation may affect results.

L'obiettivo del presente protocollo è quello di ottenere campioni di RNA ad alta integrità dai gangli enterici isolati dal tessuto intestinale umano non fissato, appena resecato mediante microdissezione laser (LCM). Questo protocollo prevede preparazione flash-congelati campioni di tessuto intestinale umano, cryosectioning, colorazione etanolica e disidratazione, LCM e l'estrazione di RNA.

Questo metodo può aiutare a rispondere a domande chiave sul sistema nervoso enterico, come il profilo di espressione dei gangli enterici nell'intestino degli esseri umani adulti. Il vantaggio principale di questa tecnica è che può essere utilizzata per ottenere alte rese di RNA dai gangli enterici umani, preservando al massimo la qualità dell'RNA. Iniziare con il tessuto intestinale tagliato in lunghezze di 20 centimetri.

Per prima cosa, taglia via il tessuto adiposo e connettivo. Evitare di intaccare la sierosa, che può portare a danni strutturali al plesso mienterico. Successivamente, praticare un'incisione longitudinale lungo l'intera lunghezza del campione tagliato, preferibilmente nel sito di attacco mesenterico.

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