Identificazione di High-throughput di sequenze regolatorie del Gene mediante sequenziamento di nuova generazione di cromosoma circolare conformazione catturare (4C-seq)

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5 ottobre 2018

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L'identificazione delle interazioni fisiche tra geni ed elementi regolatori è impegnativo ma è stata facilitata dai metodi di cattura conformazione del cromosoma. Questa modifica del protocollo 4C-seq mitiga bias PCR riducendo al minimo eccessiva amplificazione dei modelli di PCR e massimizza la mappability di letture incorporando un passo di digest di aggiunta degli enzimi di limitazione.

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Protocollo 4C-seq

Chapters in this video

0:04

Titolo

0:45

Cross-linking con formaldeide e lisi cellulare

1:59

Prima digestione con enzimi di restrizione e prima ligazione

5:07

Reversione del cross-linking, isolamento della cromatina e analisi successive

7:42

Risultati: Tracciato genomico rappresentativo della copertura dei read 4C-seq

8:29

Conclusione

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