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DOI: 10.3791/58100-v
Antonio E. Chambers*1, Adam E. Richardson*1, David F. Read2, Thomas J. Waller3, Douglas A. Bernstein1, Philip J. Smaldino1
1Department of Biology,Ball State University, 2Department of Genome Sciences,University of Washington, 3Department of Molecular, Cellular, and Developmental Biology,University of Michigan
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Qui, descriviamo un protocollo per la caratterizzazione biochimica dell'enzima modificante la RNA lievito, Mod5 e discutere come questo protocollo potrebbe essere applicato ad altri enzimi modificanti la RNA.
L'obiettivo generale di questo protocollo è quello di caratterizzare biochimicamente l'attività tRNA-Isopentenil Transferasi in vitro. Questo metodo è utile per il rilevamento e la caratterizzazione in vitro dell'attività tRNA-isopentenil transferasi degli enzimi ricombinanti purificati. Il vantaggio principale di questa tecnica è che è un saggio semplice e diretto usato per rilevare una modifica covalente dell'RNA.
Sebbene questo metodo fornisca informazioni sull'attività tRNA-isopentenil transferasi, è potenzialmente adattabile per la caratterizzazione biochimica di enzimi di modifica a vasta gamma o RNA. Il primo passo di questa procedura è pulire accuratamente le lastre di vetro che verranno utilizzate per la fusione del gel. Lavare i piatti con acqua e sapone, risciacquare bene con acqua deionizzata, quindi pulire i piatti con isopropanolo e salviette senza pelucchi.
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