Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems

Karel &#352;imek; Dagmara Sirova

doi:10.3791/59903

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Fluorescently etichettato batteri come un tracciante per rivelare nuovi percorsi di flusso organico di carbonio negli ecosistemi acquatici

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Ambiente

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Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems

Fluorescently etichettato batteri come un tracciante per rivelare nuovi percorsi di flusso organico di carbonio negli ecosistemi acquatici

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09:35 min

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September 13, 2019

DOI:

10.3791/59903-v

DOI:

10.3791/59903-v

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09:35 min

September 13, 2019

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Karel Šimek¹, Dagmara Sirova¹

¹Department of Aquatic Microbial Ecology, Institute of Hydrobiology,Biology Centre CAS

Trascrizione

Questo approccio è significativo perché ci permette di visualizzare e stimare i flussi di carbonio ed energia dai procarioti a livelli trotrofi più elevati nelle reti alimentari microbiche ad altissima risoluzione. Questa è l’unica tecnica attualmente disponibile per determinare quali specie protist consumano batteri in situ e allo stesso tempo quantificare il tasso di questo processo a livello di una singola cellula. Poiché i batteri sono gli unici microbi significativi che cambiano il carbonio organico disciolto in carbonio organico particolato, la conoscenza degli attori coinvolti e dei tassi a cui ciò accade costituisce la base per comprendere gli ecosistemi acquatici in generale. Consigliamo vivamente ai ricercatori di familiarizzare con il loro sistema di studio prima di condurre qualsiasi esperimento di pascolo. Ciò comporta la luce e l’epifluorescenza dell’ispezione microscopia dei campioni, e la conoscenza del principale taxon presente e delle loro dinamiche stagionali. A dimostrare la procedura sarà Jitka Jezberov

Summary

Presentato qui è un protocollo per una tecnica a singola cellula, basata sulla microscopia a epifluorescenza per quantificare i tassi di pascolo negli eucarioti predatori acquatici con alta precisione e risoluzione tassonomica.