Name: Immagini 3D di campioni di tessuti molli utilizzando un metodo di colorazione specifico a raggi X e tomografia computerizzata nanoscopica (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-10-24T14:45:00.000+00:00
Duration: 7 min 1 s
Description: Impara la tomografia computerizzata a raggi X con colorazione all'eosina per visualizzare strutture cellulari in 3D nei tessuti molli. Questo metodo non distruttivo migliora la ricerca medica e l'anatomia patologica.

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Ringraziamo il Dr. Enken Drecoll per le discussioni istologiche e il team estremamente disponibile di Excillum AB, Svezia. Riconosciamo il sostegno finanziario attraverso il DFG Cluster of Excellence Munich Center for Advanced Photonics (MAP) e il DFG Gottfried Wilhelm Leibniz Program. Inoltre, questo progetto di ricerca ha ricevuto finanziamenti dal programma europeo di ricerca e innovazione dell'Unione Orizzonte 2020 nell'ambito dell'accordo di sovvenzione Marie Skàodowska-Curie n. H2020-MSCA-IF-2015-703745-CONSALT.

Attenzione: si prega di consultare tutte le schede tecniche di sicurezza dei materiali pertinenti (MSDS) prima dell'uso. Molte delle sostanze chimiche utilizzate nel protocollo sono acutamente tossiche e cancerogene. Si prega di utilizzare tutte le pratiche di sicurezza appropriate quando si esegue il protocollo di colorazione compreso l'uso di controlli di ingegneria (cappuccio di ghiaccio, scatola portaoggetti) e dispositivi di protezione personale (occhiali di sicurezza, guanti, cappotto da laboratorio, pantaloni a lunghezza intera, scarpe chiuse).
Animali utilizzati: L'edilizia animale è stata effettuata presso i rechts der Isar di Klinikum, Università Tecnica di Monaco in conformità con le linee guida dell'Unione europea 2010/63. L'espianto degli organi è stato approvato da un comitato interno per la protezione degli animali di Klinikum rechts der Isar, Monaco di Baviera, Germania (numero di riferimento interno 4-005-09). Tutte le procedure erano conformi alle linee guida e ai regolamenti pertinenti. Tutti i laboratori sono ispezionati per verificare la conformità con i principi dell'OCSE delle buone pratiche di laboratorio.
1. Protocollo di colorazione Eosin
<ol><li>Per fissare campioni di tessuti molli, riempire un tubo di centrifugadi da 50 mL con una soluzione fissativa contenente 9,5 mL del 4% (v/v) di soluzione di formaldeide (FA) e 0,5 mL di acido acetico glaciale (AA). NOTA: Preparare la soluzione FA da una soluzione FA priva di acido del 37% stabilizzata con circa il 10% di metanolo. Diluire ulteriormente la soluzione FA con la salina tamponata da fosfato di Dulbecco (DPBS). Scegli DPBS senza calcio e magnesio. Mantenere la soluzione FA diluito non più di un mese. Durante l'acidificazione il pH della soluzione fissativa sta cambiando da neutro a circa 3. AVVISO: Poiché la FA è tossica, corrosiva e cancerogena per gli organi acuti, l'uso di una cappa di fumi è obbligatorio e devono essere utilizzate attrezzature personali protettive adeguate.<ol>
<li>Aggiungere il campione di tessuto molle appena rimosso a un tubo di centrifuga di 50 mL e refrigerare il tubo di centrifuga 50 mL per 24-72h. NOTA: il protocollo può essere messo in pausa qui.</li>
		<li>Lavare il campione di tessuto molle con soluzione DPBS per 1h.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Per macchiare il campione di tessuto molle fissato (ad esempio, un intero rene di topo), posizionare il tessuto molle in 2 mL di soluzione di colorazione Y eosina e incubare il campione per 24 h. Mantenere il campione su una piastra di agitazione orizzontale per una donazione liscia (ca. 60 rpm) durante l'incubazione processo. NOTA: la soluzione di colorazione Y eosin a eosina ha una concentrazione del 30% (w/v) in acqua distillata. Scegliere il volume della soluzione di colorazione in modo che il campione sia completamente coperto dalla soluzione di colorazione e consentire al campione di muoversi liberamente all'interno del contenitore del campione. Il tempo di incubazione può differire per altri campioni e deve essere regolato di conseguenza.</li>
	<li>Dopo la colorazione, rimuovere attentamente il campione di tessuto molle dal contenitore del campione.<ol>
<li>Rimuovere con attenzione l'eccesso di agente di colorazione con carta velina di cellulosa.</li>
		<li>Collocare il campione di tessuto molle in un contenitore campione conico sopra una fase di vapore di etanolo per lo stoccaggio e un ulteriore utilizzo. NOTA: Il contenitore del campione conico deve sempre contenere alcune gocce di 70% (v/v) di etanolo nella parte inferiore del tubo per mantenere il campione di tessuto molle umido e prevenire artefatti.</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. Immagini microCT a raggi X
NOTA: le misurazioni microCT a raggi X sono state eseguite con uno scanner microCT, che offre misurazioni panoramiche tC (la capacità di immaginare l'intero campione nel campo visivo (FOV)) e le prestazioni delle misurazioni CT ad alta risoluzione (la capacità di su un volume di interesse desiderato (VOI) dello stesso campione) fino a 1 m.
<ol><li>Montare il campione di tessuto molle su un supporto di campione appropriato. Assicurarsi una vestibilità rigorosa del campione sul supporto del campione per evitare che il campione si muova durante le misurazioni tC a raggi X.<ol>
<li>In caso di rene di topo colorato: Preparare un supporto campione con due tubi di centrifuga, per cui il fondo di un tubo è tagliato. Incollare i due tubi di centrifuga insieme utilizzando l'adesivo a due componenti. Assicurare un allineamento diritto dei tubi di centrifuga attorno all'asse di rotazione. Attendere che l'adesivo si indurisci.</li>
		<li>Una volta che il supporto del campione è pronto per l'uso, trasferire il rene di topo nel tubo di centrifuga intatto, che contiene alcune gocce di 70% (v/v) etanolo nella parte inferiore del tubo. NOTA: la stabilità del campione è fondamentale. Prendetevi del tempo per preparare il campione per le misurazioni TC a raggi X. Il campione di tessuto molle viene mantenuto durante una fase di vapore etanolo per mantenere il campione umido durante le misurazioni della TAC a raggi X e prevenire il restringimento del campione di tessuto molle e altri artefatti. Il campione di tessuto molle non deve essere in contatto con il solvente per eliminare l'accumulo del solvente intorno al campione durante la misurazione della TAC a raggi X, che potrebbe portare al movimento del campione durante la misurazione o potrebbe causare problemi durante la ricostruzione. Se il supporto del campione non consente di tenere il solvente sul fondo, nel supporto del campione può essere inserita una carta di cellulosa inumidita con 70% (v/v) di etanolo. Va notato che gli artefatti di restringimento a causa dell'etanolo solvente non sono stati osservati. NOTA: il protocollo può essere messo in pausa qui.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Dopo un attento allineamento del campione, scegliere i parametri di acquisizione per la migliore qualità dell'immagine. Nel caso dei dati microCT presentati, acquisire la scansione ad una tensione di picco di 50 kV, una corrente di 3,5 W utilizzando 1601 proiezioni equamente distribuite su 360. NOTA: i parametri di acquisizione per la scansione CT di panoramica sono stati scelti per la migliore qualità dell'immagine. Come tale, l'obiettivo della telecamera 0.39x è stato scelto per coprire l'intero campione nel campo visivo (FOV). Ciò ha portato a una dimensione effettiva dei pixel di 12 m. Il tempo di esposizione di 2 s per proiezione ha fornito un buon rapporto segnale/rumore. Il ROI per la TAC ad alta risoluzione è stato identificato utilizzando i dati microCT della scansione panoramica. Gli scanner MicroCT spesso incorporano uno strumento software integrato, che consente la selezione precisa del ROI determinato. Per i dati CT ad alta risoluzione, l'obiettivo della telecamera 4x è stato scelto, con una dimensione effettiva in pixel di 3,3 m. Qui, era necessario un tempo di esposizione di 15 s per proiezione. NOTA: il protocollo può essere messo in pausa qui.</li>
	<li>Dopo l'acquisizione dei dati CT a raggi X, elaborare le proiezioni di conseguenza per la ricostruzione del volume 3D. Nel caso dei dati microCT presentati: ricostruire i dati CT a raggi X con il software integrato. NOTA: i rendering del volume dei dati microCT illustrati nella Figura 1 e nella Figura 2 sono stati generati utilizzando un software di visualizzazione. NOTA: il protocollo può essere messo in pausa qui.</li>
</ol>3. Imaging nanoCT a raggi X
NOTA: lo scanner nanoCT a raggi X è stato sviluppato internamente. Lo strumento senza lenti è dotato di una sorgente di raggi X nanofocale e di un rilevatore di conteggio a singolo fotone. I dati 3D con risoluzioni fino a 100 nm possono essere generati10. In generale, i sistemi nanoCT, compresi quelli con ottica a raggi X, sono disponibili in commercio e non si limitano allo scanner nanoCT descritto.
<ol><li>Preparazione del campione NanoCT<ol>
<li>Preparare le COVe del campione dei tessuti molli. Tagliare il tessuto molle in pezzi molto piccoli di circa 0,5 mm di lunghezza del bordo utilizzando un bisturi e uno stereomicroscopio. In caso di rene di topo: Tagliare il rene di topo in due metà lungo l'asse più lungo. Prendere metà del rene di topo e preparare diverse regioni anatomiche come corteccia renale e medulla renale. NOTA: L'altra metà del rene del topo è stata trasferita all'istopatologia, dove il campione è stato incorporato in paraffina ed elaborato di conseguenza per produrre le tipiche sezioni istologiche come si vede in Figura 3c e Figura 3d .</li>
		<li>Trasferire i piccoli pezzi prima del primo passo di disidratazione in un nuovo piatto Petri, dove rimangono per tutti i passaggi successivi.</li>
		<li>Disidratare i campioni utilizzando concentrazioni (tutte v/v) in %: 50, 60, 70, 80, 90, 96 e 100 etanolo bilanciato con acqua distillata. Eseguire ogni fase di disidratazione per 1 h ciascuno. NOTA: il protocollo può essere messo in pausa qui. Mantenere i piccoli pezzi di tessuto in etanolo al 100% durante la notte.</li>
		<li>Punto critico asciutto (CPD) i piccoli pezzi di tessuto. NOTA: l'applicazione di CPD consente la completa disidratazione del campione di tessuto scambiando il solvente (qui l'etanolo) con l'agente di essiccazione (qui CO2). Ciò è stato necessario per garantire che il campione possa essere montato sui portacampioni della nanoSCARICA, non si muova durante la misurazione e possa essere posizionato molto vicino alla sorgente di raggi X per consentire il miglior ingrandimento geometrico. La configurazione nanoCT si basa su un semplice ingrandimento geometrico, con il fattore di ingrandimento definito come la distanza da fonte a rilevatore sulla distanza da fonte a campione. La tecnica di essiccazione è stata introdotta per la prima volta da Anderson per preservare la struttura 3D dei campioni biologici per la microscopia elettronica28. Una panoramica della tecnica è fornita da Bray29.<ol>
<li>Precompilare la camera a vuoto con 100% di etanolo. Trasferire i piccoli pezzi di tessuto in una capsula micro-porosa e posizionarlo nella camera a vuoto del CPD. Chiudere il sistema. NOTA: poiché l'alta pressione è coinvolta nel processo CPD, assicurarsi che tutte le parti del CPD, in particolare i raccordi, siano intatte e che il sistema sia correttamente chiuso.</li>
			<li>Raffreddare la camera a 6- 8 gradi centigradi e riempire con CO2liquido.</li>
			<li>Durante la mescolatura, attendere 3 min per consentire una corretta miscelazione dei due componenti. Scolare con cura la camera. Assicurarsi che il supporto del campione sia ancora coperto di solvente. Ripetere questo passaggio dieci volte per consentire la sostituzione completa dell'etanolo con CO2 all'interno del campione.</li>
			<li>Dopo il riempimento finale della camera con CO2, riscaldare la macchina fino al punto critico di CO2 (31 o 73,8bar) seguito da un rilascio molto lento del COgassoso 2 in un tempo di 30 min. NOTA: Il rilascio del gas deve essere effettuato molto lentamente in quanto altrimenti l'acqua condensata può formarsi sul campione. Assicurarsi che la temperatura non scchi al di sotto del punto critico di CO2. Aprire la macchina CPD solo quando tutta la pressione è stata rilasciata dal sistema.</li>
			<li>Rimuovere rapidamente i pezzi di tessuto CPD dalla macchina e tenerli in una nuova teglia Petri conservata in un desiccatore prima di un ulteriore utilizzo. NOTA: il protocollo può essere messo in pausa qui.</li>
		</ol>
</li>
	</ol></li>
	<li>Montare i pezzi di tessuto CPD su un supporto campione appropriato. Assicurarsi una vestibilità rigorosa del campione sul supporto del campione per evitare che il campione si muova durante le misurazioni TC. Nel caso dei pezzi di tessuto renale del topo CPD: incollare i pezzi di tessuto con supercolla a un supporto campione. NOTA: qualsiasi movimento indesiderato del campione durante le misurazioni TC può causare problemi durante la ricostruzione del volume, specialmente quando si acquisisce un set di dati con dimensioni voxel nanometriche. NOTA: il protocollo può essere messo in pausa qui.</li>
	<li>Dopo un attento allineamento del campione, scegliere i parametri di acquisizione per la migliore qualità dell'immagine. Nel caso dei dati nanoCT presentati: Acquisire proiezioni ad una tensione di picco di 60 kV con proiezioni 1599 equamente distribuite su 360 e una dimensione voxel di circa 400 nm. NOTA: Una singola misura TC acquisita a 400 nm di dimensione voxel ha un FOV di 75 m nella direzione dell'asse di rotazione (verticale) e di circa 560 m nella direzione perpendicolare all'asse di rotazione (orizzontale). Per analizzare volumi più grandi, è possibile ottenere un'estensione del FOV lungo l'asse di rotazione combinando più scansioni in diverse posizioni verticali. Inoltre, è possibile eseguire scansioni tomografiche locali per misurare campioni con un diametro del campione più grande perpendicolare all'asse di rotazione rispetto al FOV di una TAC globale. I dati delle nanoCT sono stati acquisiti con un tempo di esposizione di 4 s per proiezione. Di conseguenza, il tempo totale di acquisizione per set di dati è stato di circa 3,5 orh. NOTA: il protocollo può essere messo in pausa qui.</li>
	<li>Dopo l'acquisizione dei dati CT, elaborare le proiezioni di conseguenza per la ricostruzione del volume 3D.<ol>
<li>Nel caso dei dati nanoCT presentati, normalizzare le proiezioni acquisite con immagini flatfield. Migliorare la nitidezza delle proiezioni utilizzando un algoritmo di deconvoluzione Richardson-Lucy30,31. Utilizzare una funzione gaussiana simmetrica a rotazione con una deviazione standard di un pixel come kernel di deconvoluzione.</li>
		<li>Applica l'algoritmo di recupero di fase di Paganin alle immagini affilate per aumentare il contrasto dei tessuti molli. Impostare i parametri dell'algoritmo per ottimizzare la qualità dell'immagine32. Ricostruisci le proiezioni pre-elaborate con un algoritmo di retroproiezione filtrata all'avanguardia. NOTA: La figura 3 valuta i dati nanoCT ottenuti con le sezioni istologiche corrispondenti, che erano spesse circa 7 m. Pertanto, sono state generate sezioni di proiezione di intensità minima di 18 fette di nanoCT adiacenti con uno spessore virtuale di circa 7 m calcolando il valore minimo per ogni pixel nelle sezioni pertinenti. È stato utilizzato un software di visualizzazione per eseguire il rendering del volume dei dati nanoCT, che viene visualizzato nella Figura 4.</li>
	</ol></li>
</ol>

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</ol>

Gli autori non hanno nulla da rivelare.

Attualmente, l'eosina è usata come protocollo istologico standard per etichettare il citoplasma cellulare. L'agente di colorazione viene applicato come soluzione acquosa dello 0,1% (w/v) a fette microscopiche di tessuto molle (generalmente tagliate con uno spessore di 2-10 m)33. L'applicazione di questo protocollo istologico standardizzato a campioni di tessuto 3D come un intero rene di topo non si traducono in un contrasto di attenuazione migliorato immagine TC. Da un lato, questo può essere attribuito alle basse proprietà intrinseche di attenuazione dei tessuti molli per le energie a raggi X tipicamente utilizzate di sistemi microCT basati in laboratorio. Di solito, i tessuti molli sono composti principalmente da carbonio, idrogeno, ossigeno e azoto34, e quindi non si traducono in un miglioramento del contrasto. D'altra parte, la bassa concentrazione di eosina utilizzata per la colorazione è stato il fattore limitante. Anche se una molecola di eosina contiene quattro atomi di bromuro (bromo elemento numero atomico alto con 3534), i livelli di sensibilità richiesti per l'imaging CT a raggi X non sono stati soddisfatti.
Per superare questa sfida di basso contrasto di attenuazione, sono state studiate diverse concentrazioni di eosina. Una limitazione è qui la massima solubilità dell'eosina in acqua, che è il 30% (w/v) in una soluzione acquosa. Miglior miglioramento del contrasto di attenuazione all'interno del tessuto molle è stato osservato con la più alta concentrazione di eosina, che era previsto secondo la legge Lambert-Beer. Pertanto, il protocollo di colorazione finale è stato effettuato con la massima concentrazione.
La domanda su come preparare il tessuto molle in modo ottimale a livello molecolare per la procedura di colorazione per migliorare ulteriormente il miglioramento del contrasto è stata risolta mediante regolazione del pH. In questo caso, l'acidificazione del campione di tessuto molle durante la fissazione o prima della colorazione è risultata cruciale. Ciò è stato dimostrato anche da Hong et al.35. Il maggiore accumulo di agente di colorazione all'interno del citoplasma cellulare da parte dell'acido è stato raggiunto attraverso interazioni ioniche migliorate, che sono state il risultato della protonazione delle catene laterali degli amminoacidi di proteine e peptidi presenti all'interno del citoplasma cellulare. Un risultato rappresentativo che evidenzia il miglioramento del contrasto rispetto a un campione di tessuti molli non macchiato è illustrato nella Figura 1a,b. Qui, è stata ottenuta una panoramica strutturale di un intero rene di topo che visualizza regioni anatomiche cruciali come corteccia, medulla, papilla e bacino renale.
Il protocollo di colorazione presentato è semplice da applicare e contiene solo tre passaggi. I reagenti necessari sono facilmente accessibili. Il tempo di colorazione complessivo di 24 ore è veloce per una colorazione dell'intero organo, che consente la visualizzazione 3D di campioni di tessuti molli (Figura 1c, Figura 2b e Figura 4b) in un ambiente di laboratorio a più scale verso il basso a livello cellulare. Va notato che il tempo di colorazione complessivo e il volume della soluzione di colorazione necessaria potrebbero richiedere alcuni adattamenti a seconda della natura del campione. Tuttavia, il protocollo di colorazione basato sull'eosina è adatto per la colorazione di interi organi, che consente quindi l'imaging microCT ad alta risoluzione di organi interi. Non sono stati osservati artefatti di restringimento dovuti all'etanolo solvente, che è stato utilizzato per mantenere il campione umido durante le misurazioni microCT. Sono necessari ulteriori passaggi di preparazione per l'imaging nanoCT, che consente di sforare pezzi di tessuto più piccoli recuperati dal campione originale. Per quanto riguarda le future applicazioni istopatologiche, le scansioni generali forniranno preziose informazioni sulle regioni e le strutture anatomiche alterate, che consentono la determinazione dei ROI come illustrato nella Figura 2a. Questi possono essere studiati in 3D da microCT (Figura 1c e Figura 2b) o nanoCT (Figura 4b) e valutati in 2D con istologia ( Figura3).
Un'altra forza del protocollo è vista nella piena compatibilità con l'istopatologia rispetto alla procedura di colorazione H&E. L'applicazione della procedura di colorazione basata sull'eosina ai campioni sfusi non impedisce ulteriori indagini istologiche (Figura 3), anche se la concentrazione di eosina applicata è molto più elevata rispetto alla soluzione di colorazione istologica. La sezione nanoCT con uno spessore virtuale di circa 400 nm (Figura 3a) confronta già molto bene con la sezione istologica (Figura 3c), derivata dal campione di tessuto molle corrispondente. Considerando lo spessore approssimativo di una sezione istologica con 7-10 m, la generazione di sezioni di proiezione di intensità minima dei dati nanoCT(Figura 3b),che corrispondono ad uno spessore virtuale di circa 7 m, consente un migliore confronto con la sezione istologica (Figura 3c). Qui, i nuclei cellulari sono chiaramente rivelati come area non-attenuazione come eosina specificamente macchie proteine e peptidi nel citoplasma cellulare33.
L'applicazione di un'ulteriore controcolorazione con metodi istologici standard è possibile, anche se l'ordine della colorazione rispetto alla procedura di colorazione istologica standard è stato invertito. A partire dal protocollo di colorazione basato sull'eosina sviluppato per la TC, seguito dalla controcolorazione di quelle sezioni istologiche basate sull'eosina con ematossia, consente la piena compatibilità e si traduce in una colorazione di alta qualità che mostra la forma prevista di aspetto. La colorazione cellulare dei nuclei con l'ematossina acida di Mayer è stata applicata alla sezione istologica evidenziando i nuclei cellulari in viola (Figura 3d). L'applicazione della colorazione antistologica è attualmente limitata alla macchia H. Devono essere valutate altre controcolorazioni istologiche standard come la base dell'acido periodico Schiff, elastica van Gieson o argento Gomori, nonché la compatibilità con le tecniche immunoistologiche.
Il protocollo di colorazione basato sull'eosina consente di (i) il targeting specifico del citoplasma cellulare, (ii) la colorazione omogenea e completa, (iii) facile implementazione, (iv) la penetrazione rapida del tessuto senza creare artefatti come anelli di diffusione, (v) la colorazione grandi e densi campioni di tessuti molli, e (vi) piena compatibilità con l'istopatologia per quanto riguarda la macchia H&E. Questi requisiti sono importanti per consentire la visualizzazione TC a raggi X ad alta risoluzione dei tessuti molli fino al livello cellulare. In combinazione con i dispositivi nanoCT sviluppati di recente12,36,37, generazione non distruttiva di fette istologiche virtuali che sono comparabili in contrasto e risoluzione ai dati istologici convenzionali è reso possibile. Questo approccio combinato consentirà la creazione della TAC a raggi X come strumento prezioso per la visualizzazione 3D di strutture microscopiche dei tessuti.

La completa caratterizzazione degli esemplari di tessuto molle richiede informazioni sulla microstruttura dei tessuti 3D. L'attuale gold standard per l'analisi dei campioni di tessuti molli è l'istopatologia. La morfologia tissutale e cellulare del campione viene esplorata in 2D all'interno di regioni di interesse selezionate (ROI) utilizzando la microscopia ottica1. Questo metodo, tuttavia, presenta diversi svantaggi. La preparazione del campione richiede molto tempo, complicato, distruttivo e incline agli artefatti. I vetrini microscopici prodotti forniscono solo informazioni 2D parallele al piano di sezionamento. Spesso il numero di sezioni istologiche, che vengono studiate, è limitato a causa dei vincoli di tempo2,3.
Negli ultimi anni, il campo dell'istologia 3D si è evoluto. Qui, le fette di tessuto virtuale da qualsiasi piano spaziale desiderato sono accessibili. Ciò consente il monitoraggio delle strutture in tutto il campione, che porta a una comprensione più profonda dell'architettura dei tessuti 3D e dei cambiamenti strutturali associati a diverse patologie. Sono stati sviluppati vari metodi per ottenere la generazione di dati di volume 3D. Si va da approcci basati sulla sezione seriale, che utilizzano microscopia leggera o elettronica4,5,6,7,8, a metodi di imaging a blocchi, come l'imaging 3D episcopico o microscopia elettronica a scansione a faccia blocco7,8,9. Tutti i metodi menzionati, tuttavia, comportano la sezionamento o la distruzione completa del campione, il che non consente ulteriori indagini. La risoluzione ottenuta dipende fortemente dal processo di sezionamento che è incline agli artefatti come descritto nell'istologia convenzionale. Questi metodi soffrono anche di artefatti di allineamento.
Tecniche di imaging a raggi X 3D come la tomografia computerizzata microscopica e nanoscopica (microCT e nanoCT) aspirano a generare dati 3D ad alta risoluzione senza distruzione del campione di tessuto. Finora, il debole contrasto di attenuazione dei raggi X dei tessuti molli e il limitato accesso ad alte risoluzioni in un ambiente di laboratorio ne hanno compromesso l'uso per la visualizzazione 3D di strutture microscopiche dei tessuti. I recenti progressi verso la TAC a raggi X ad alta risoluzionee di laboratorio consentono risoluzioni ben al di sotto di 1 ,11,12,13.
La mancanza di contrasto nei tessuti molli nell'imaging a raggi X convenzionale basato sull'attenuazione è compensata da agenti di colorazione, che migliorano il contrasto dell'attenuazione dei raggi X. Gli agenti di colorazione noti da altre tecniche di imaging come il tetrossido di osmio (OsO4), lo iodio di iodio di iodio di iodio di iodio (IKI) o l'acido fosfotungstico (PTA) sono spesso utilizzati14,15,16,17, 18,19,20,21,22,23,24,25. Agenti di colorazione che consentono (i) targeting biologico specifico, (ii) colorazione omogenea e completa, (iii) facile maneggevolezza, (iv) penetrazione rapida del tessuto senza creare artefatti come anelli di diffusione, (v) colorazione dei tessuti grandi e densi e (vi) la piena compatibilità con l'istopatologia è necessaria per stabilire la TC a raggi X come strumento per la visualizzazione 3D di strutture microscopiche del tessuto. In questo lavoro, mostriamo come i campioni di tessuti molli sono preparati per l'imaging CT a raggi X con una macchia a raggi X specifica per il citoplasma basato sull'eosina che soddisfa i requisiti sopra26.
L'approccio di imaging multiscala garantisce la valutazione della qualità della colorazione attraverso una misurazione generale delle microCT e la selezione dei volumi di interesse (VOI) per ulteriori indagini ad alta risoluzione. La qualità della colorazione viene analizzata concentrandosi su parametri di colorazione come (i) completezza, (ii) aspetto degli anelli di diffusione, (iii) miglioramento del contrasto, (iv) aspetto di artefatti Ct come striature e (v) omogeneità. La configurazione nanoCT basata sul laboratorio, che utilizza l'ingrandimento geometrico per raggiungere risoluzioni fino a 100 nm, visualizza la morfologia dei tessuti molli al livello (sub)-cellulare10,27. Un'analisi comparativa delle fette nanoCT con le corrispondenti immagini di microscopia a luce istologica conferma la riproduzione dell'architettura tissutale con dettagli simili a livello microscopico in 2D, consentendo la caratterizzazione istopatologica del tessuto campione. Questo protocollo video dettagliato ha lo scopo di aumentare la consapevolezza e di evidenziare il potenziale di questa metodologia come strumento di imaging dei tessuti molli 3D non distruttivo di interesse per un'ampia comunità scientifica come zoologi, biologi e salute Professionisti.

<table><tbody><tr><td>Provetta da centrifuga da 50 ml di Falcon</td><td>VWR</td><td>734-0453</td><td></td></tr><tr><td>Soluzione di formaldeide, 37%</td> <td>Carl Roth</td><td>CP10.2</td><td>priva di acidi, stabilizzata con ~10% di MeOH</td></tr><tr><td>Acido acetico glaciale</td><td>Alfa Aesar</td><td>36289.AP</td><td></td></tr><tr><td>Sale disodico Eosin Y</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>E4382</td><td>certificato da Biological Stain Commission</td></tr><tr><td>Soluzione salina tamponata con fosfato (PBS)</td><td>Merck</td><td>L1825</td><td>Formualizzazione di Dulbecco, senza calcio e magnesio</td></tr><tr><td>Provette per campioni di Nalgene</td><td>Carl Roth</td><td>ATK5.1</td><td></td></tr><tr><td>Agitatore a dondolo ST5</td><td>CAT</td><td>60281-0000</td><td></td></tr><tr><td>Carta velina di cellulosa</td><td>VWR</td><td>115-0600</td><td></td></tr><tr><td>Pinze, di USBECK Laborger&auml; te</td><td>VWR</td><td>232-0096</td><td></td></tr><tr><td>Provette per microcentrifuga di Eppendorf</td><td>VWR</td><td>211-2120</td><td>safe-lock, 2,0 ml</td></tr><tr><td>Etanolo assoluto di Baker Analizzato</td><td>VWR</td><td>80252500</td><td></td></tr><tr><td>Bisturi di sicurezza monouso di Aesculap</td><td>VWR</td><td></td><td></td>AESCBA210</tr><tr><td>Piastra Petri di Sterilin</td><td>VWR</td><td>391-2019</td><td></td></tr><tr><td>Pipetta pasteur in plastica</td><td>Carl Roth</td><td>EA68.1</td><td>graduata, 1 ml</td></tr><tr><td>Essiccatore di Duran</td><td>VWR</td><td>SCOT247826954</td><td></td></tr><tr><td>Grasso siliconico di Bayer</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>85404</td><td></td></tr><tr><td>bombola di anidride carbonica ad alto vuoto con tubo di livello</td><td>Linde</td><td>3700113</td><td>10 kg, corto</td></tr><tr><td>capsula per trattamento microporosa</td><td>PLANO GmbH</td><td>4614</td><td>pori 78 &; micro; m (B)</td></tr><tr><td>Bal-Tec CPD 030</td><td>Bal-Tec AG</td><td></td><td>CO2 come agente essiccante</td></tr><tr><td>Stereomicroscopio Stemi 2000-C con KL 1500 LCD</td><td>Zeiss</td><td></td><td>questo stereomicroscopio è stato aggiornato(1)</td></tr><tr><td>Zeiss Xradia Versa 500</td><td>Zeiss</td><td></td><td>questo scanner microCT è stato aggiornato(2)</td></tr><tr><td>Avizo Fire 8.1</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Rivelatore PILATUS come parte dello scanner nanoCT</td><td>Dectris</td><td></td><td>rivelatore per il conteggio di singoli fotoni(4,5); sono disponibili in commercio sistemi nanoCT (6,7)</td></tr><tr><td>nanofocus X-ray source come parte dello scanner nanoCT</td><td>Excillum</td><td></td><td>tubo di trasmissione di raggi X nanofocus ad alto flusso(3); sono disponibili in commercio sistemi nanoCT(6,7)</td></tr><tr><td>(1) Germania, Z. Informazioni sul prodotto ZEISS: Stereomicroscopi ZEISS https://www.micro-shop.zeiss.com/de/de/system/Stereomikroskope/1006> (06 settembre 2019).</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>(2) Germania, Z. ZEISS informazioni sul prodotto: ZEISS Xradia 510 Versa https://www.zeiss.com/microscopy/int/products/x-ray-microscopy/zeiss-xradia-510-versa.html> (10 aprile 2019).</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>(3) Nachtrab, F. et al. Sviluppo di un rivelatore basato su Timepix per il progetto NanoXCT. Giornale di strumentazione 10 (11), C11009, (2015).</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>(4) Kraft, P. et al. Prestazioni dei moduli rivelatori PILATUS a conteggio di singolo fotone. Giornale della radiazione di sincrotrone 16 (3), 368-375, (2009).</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>(5) Kraft, P. et al. Caratterizzazione e calibrazione dei rivelatori PILATUS. Transazioni IEEE sulla scienza nucleare 56 (3), 758-764, (2009).</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>(6) Germania, Z. Informazioni sul prodotto ZEISS: ZEISS Xradia 810 Ultra https://www.zeiss.com/microscopy/int/products/x-ray-microscopy/xradia-810-ultra.html> (9 aprile 2019).</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>(7) Azienda, G. E. GE informazioni sul prodotto: Phoenix nanotom m, https://www.gemeasurement.com/sites/gemc.dev/files/geit-31344en_nanotom_m_0517.pdf> (10 aprile 2019).</td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

immagini 3d di campioni di tessuti molli utilizzando un metodo di colorazione specifico a raggi x e tomografia computerizzata nanoscopica

3D Imaging of Soft-Tissue Samples using an X-ray Specific Staining Method and Nanoscopic Computed Tomography

Dimostriamo un metodo basato su laboratorio che combina microCT a raggi X e nanoCT con una macchia a raggi X specifica, che prende di mira il citoplasma cellulare. Il protocollo descritto è facile da applicare, veloce e adatto per campioni di tessuti molli più grandi. La metodologia presentata consente la caratterizzazione delle strutture tissutali cruciali in tre dimensioni ed è dimostrata su un intero rene di topo. L'approccio multiscala permette di immaginare l'intero rene di topo e supporta la selezione di ulteriori volumi di interesse, che vengono acquisiti con risoluzioni più elevate che vanno nella gamma nanometrica. Di conseguenza, viene riprodotta la morfologia dei tessuti molli con un livello di dettaglio simile a quello delle corrispondenti immagini di microscopia immutata della luce. Approfondimenti sulla configurazione 3D delle strutture tissutali sono ottenuti senza ostacolare ulteriori indagini attraverso metodi istologici.

Figura 1 Mostra le sezioni tC e il rendering del volume di dati microCT a bassa risoluzione evidenziando il miglioramento del contrasto dopo la colorazione. La figura 2 mostra le sezioni TC e il rendering del volume dei dati microCT ad alta risoluzione derivati da una tomografia locale dell'intero rene di topo. La figura 3 mostra sezioni tC di dati nanoCT rispetto alle sezioni istologiche corrispondenti. La figura 4 mostra il rendering tramite sezione TC e volume dei dati nanoCT che evidenziano i dettagli strutturali a livello cellulare. La misurazione delle microCT a bassa risoluzione consente una panoramica dell'intero organo e aiuta a identificare i volumi di interesse (VOI) per la misurazione delle microCT ad alta risoluzione. Attraverso questo approccio multiscala, viene determinato il VOI per la nanoCT. La nanoCT consente una visione molto dettagliata del campione di tessuti molli a livello cellulare. Lo studio comparativo con la corrispondente sezione istologica evidenzia la piena compatibilità con l'istopatologia. In questo caso, l'approccio dell'imaging multimodale conferma i risultati ottenuti con entrambe le modalità.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60251/60251fig1a.jpg"> come illustrato nella Figura 1. Sezioni TC e rendering del volume dei dati microCT a bassa risoluzione. (a,b) Panoramica delle immagini dello stesso rene di topo prima e dopo la colorazione, rispettivamente, evidenziando il miglioramento del contrasto ottenuto dopo l'applicazione del protocollo di colorazione basato sull'eosina. Entrambi i set di dati microCT sono stati acquisiti utilizzando parametri di acquisizione identici. La dimensione del voxel in entrambi i set di dati è di 12 m. Il miglioramento del contrasto ottenuto in (b) consente l'identificazione delle seguenti regioni strutturali anatomiche: Cortex (I), medulla esterna (II) con ulteriore distinzione nelle strisce esterne di medulla esterna (IIa) e strisce interne di medulla esterna (IIb), medulla interna (III), papilla (IV) e bacino renale (V). (c) Rendering del volume dei dati microCT che mostra una sezione sagittale virtuale attraverso l'intero rene del topo. Questa cifra è stata modificata da Busse e M'ller et al.26<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60251/60251fig1alarge.jpg" target="_blank">Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60251/60251fig2a.jpg"> come illustrato nella Figura 2. La sezione T e il rendering del volume di dati microCT ad alta risoluzione derivati dallo stesso rene di topo dopo l'applicazione del protocollo di colorazione basato sull'eosina sviluppato. (a) L'angolo sinistro mostra l'immagine microCT panoramica evidenziando il ROI (casella blu) per l'immagine ad alta risoluzione visualizzata. Le seguenti regioni strutturali anatomiche sono identificabili: Corteccia (I), medulla esterna (II) con ulteriore distinzione nelle strisce esterne di medulla esterna (IIa) e strisce interne di medulla esterna (IIb), medulla interna (III), cilitini minori (IV) e vasi (V e VI). (b) Rendering del volume di interesse dei dati microCT ad alta risoluzione acquisiti con una dimensione voxel di 3,3 m. Viene mostrata la regione medulla e una sezione virtuale attraverso un vaso derivato da una tomografia locale dell'intero rene. Questa cifra è stata modificata da Busse e M'ller et al.26. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60251/60251fig2alarge.jpg" target="_blank">Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60251/60251fig3a.jpg"> come illustrato nella figura 3. Sezioni di NanoCT (a,b) rispetto alle sezioni istologiche (c,d) derivate dallo stesso rene di topo dopo l'applicazione del protocollo di colorazione basato sull'eosina sviluppato. (a) L'immagine nanoCT dello stesso campione di rene di topo dopo la colorazione, la dissezione e la CPD mostra strutture dettagliate della regione (IIb) mostrate nella figura 1 e nella figura 2. Questi sono noti come spessi arti ascendenti del ciclo di Henle. (b) La sezione di proiezione di intensità minima derivata dallo stesso set di dati nanoCT mostrato in (a) con uno spessore di fetta virtuale di circa 7 m, che consente una chiara visualizzazione dei nuclei cellulari. (c) Sezione istologica rappresentativa con spessi arti ascendenti del ciclo di Henle con una chiara visualizzazione dei nuclei cellulari e del bordo del pennello. La sezione istologica ha uno spessore approssimativo di 7 m ed è stata ottenuta dallo stesso campione di rene di topo dopo la colorazione e l'incorporamento a base di eosina applicata in un blocco di paraffina. (d) Sezione istologica rappresentativa con applicazione di contromacchia ematossilina evidenziando i nuclei cellulari in viola. Preparazione della sezione istologica vicino alla sezione mostrata nella (c) con spessore approssimativo di 7 m. Questa cifra è stata modificata da Busse e M'ller et al.26<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60251/60251fig3alarge.jpg" target="_blank">Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60251/60251fig4a.jpg"> come illustrato nella Figura 4. Sezione TC e rendering del volume dei dati nanoCT. (a) L'immagine nanoCT dello stesso campione di rene di topo che mostra le strutture note come spessi arti ascendenti del ciclo di Henle. Questa è una visione dettagliata della regione (IIb) visto Figura 1 e Figura 2 acquisita da un piccolo pezzo del rene con una dimensione voxel di circa 400 nm. La preparazione del campione ha comportato la colorazione, la dissezione e la CPD. (b) Rendering volume di dati nanoCT che visualizzano la struttura 3D degli arti ascendenti spessi dei loop di Henle. Questa cifra è stata modificata da Busse e M'ller et al.26<a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60251/60251fig4alarge.jpg" target="_blank">Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>

Viene presentato un protocollo per la visualizzazione 3D di strutture microscopiche del tessuto utilizzando un metodo di colorazione specifico a raggi X progettato per la tomografia computerizzata a raggi X.

Immagini 3D di campioni di tessuti molli utilizzando un metodo di colorazione specifico a raggi X e tomografia computerizzata nanoscopica

We demonstrate a laboratory-based method combining X-ray microCT and nanoCT with a specific X-ray stain, which targets the cell cytoplasm. The described ...

Il nostro nuovo protocollo ci permette di visualizzare le strutture cellulari in 3D usando la tomografia computerizzata a raggi X. E lo facciamo macchiando il tessuto con eosina e in questo modo rendere visibile il citoplasma. Oltre alle applicazioni mediche e alla ricerca, pensiamo anche che il nostro metodo possa essere applicato in biologia come, ad esempio, la ricerca zoologia o la biologia dello sviluppo.La tecnica è relativamente semplice, molto veloce e adatta anche per campioni di tessuto più grandi. Pensiamo che il nostro approccio combinato con la microtografia a raggi X possa essere integrato nel flusso di lavoro clinico e quindi aiutare i patologi a prendere decisioni migliori. Inizia fissando i campioni di tessuti molli.Riempire un tubo di centrifuga da 50 millilitri con una soluzione fissante contenente 9,5 millilitri di formaldeide al 4% e 0,5 millilitri di acido acetico glaciale. Aggiungere il campione di tessuto molle al tubo di centrifuga e refrigera per 24-72 ore. Dopo la refrigerazione lavare il campione di tessuto molle con soluzione DPBS per un'ora.Quindi macchiare il campione posizionandolo in due millilitri di soluzione di colorazione Eosin Y e incubarlo su una piastra tremante orizzontale per 24 ore. Il giorno successivo eseguire con cura il campione di tessuti molli dal contenitore del campione e rimuovere l'agente di colorazione in eccesso con carta velina di cellulosa. Posizionarlo in un contenitore conico sopra una fase di vapore di etanolo per lo stoccaggio e l'ulteriore utilizzo.Preparare un portacampioni appropriato per montare il campione di tessuti molli secondo le indicazioni manoscritte e garantire una vestibilità aderente per evitare che il campione si muova durante le misurazioni della TC a raggi X. Una volta che l'adesivo si è indurito e il portacampioni è pronto per l'uso, trasferire il rene del topo nel tubo di centrifuga intatto che contiene alcune gocce di 70% di etanolo nella parte inferiore. Posizionare il campione montato nello scanner CT a raggi X.Dopo aver allineato attentamente il campione, scegliere i parametri di acquisizione per la migliore qualità dell'immagine. Per i dati micro CT presentati, acquisire la scansione ad una tensione di picco di 50 kilovolt e una corrente di 3,5 watt utilizzando proiezioni 1601 equamente distribuite su 360 gradi. Quindi utilizzare i dati micro CT della scansione panoramica per selezionare l'area di interesse per la TAC ad alta risoluzione.Preparare volumi di interesse del campione di tessuto molle tagliarlo in pezzi molto piccoli di circa 0,5 millimetri di lunghezza del bordo utilizzando un bisturi e un microscopio stereo. Se si utilizza un rene di topo, tagliarlo a due metà lungo l'asse più lungo. Prendi la metà e prepara diverse regioni anatomiche come una corteccia renale e un midollo renale.Trasferire i piccoli pezzi in una nuova piastra di Petri per la disidratazione. Disidratare i campioni utilizzando una serie di soluzioni di etanolo secondo le indicazioni manoscritte, eseguendo ogni fase di disidratazione per un'ora. Trasferire i campioni disidratati nella capsula microporosa e chiuderli.Tenere i campioni a contatto con il 100% di etanolo in ogni momento. Quindi punto critico asciugare i piccoli pezzi di tessuto. Una volta preparati i campioni di tessuto, conservarli in una nuova piastra di Petri conservata in un essiccatore prima di un ulteriore utilizzo.Montare i pezzi di tessuto su un supporto campione appropriato garantendo una vestibilità aderente. Per una supercolla renale del topo i pezzi a un portacampioni utilizzando un microscopio stereo. Dopo un attento allineamento del campione, scegliere i parametri di acquisizione per la migliore qualità di imaging.Per i dati nano-CT presentati, acquisire proiezioni ad una tensione di picco di 60 kilovolt con proiezioni 1599 equamente distribuite su 360 gradi e una dimensione voxel di circa 400 nanometri. Questo protocollo è stato utilizzato per la visualizzazione 3D delle strutture microscopiche dei tessuti di un rene di topo. Le misurazioni microTC a bassa risoluzione hanno permesso una panoramica dell'intero organo e hanno contribuito a identificare i volumi di interesse per le misurazioni ad alta risoluzione.Lo stesso rene del topo è stato utilizzato per ottenere dati micro CT ad alta risoluzione. Si ottiene una visione più dettagliata delle strutture anatomiche come la corteccia, il midollo esterno e il midollo interno, tra gli altri. Un volume di rendering di interesse mostra la regione del midollo e una sezione virtuale attraverso la nave.La nano-TC è stata utilizzata per ottenere una visione dettagliata del campione di rene a livello cellulare. Un piccolo pezzo di tessuto ottenuto dall'intero rene del topo è stato usato per immaginire gli arti ascendenti spessi dell'anello di Henle con una dimensione voxel di circa 400 nanometri. È stato condotto uno studio comparativo per garantire che la nano-TC sia pienamente compatibile con l'istopatologia.L'approccio di imaging multimodale ha confermato i risultati ottenuti con entrambi i metodi. Durante la fase di incubazione è fondamentale che il campione sia completamente circondato dalla soluzione di colorazione. Anche quando si esegue l'imaging a raggi X CT, il fatto più importante è garantire la stabilità del campione durante l'acquisizione dei dati.I campioni di tessuti molli che sono stati analizzati con il nostro protocollo possono essere ulteriormente analizzati utilizzando la tecnica istologica standard come la controsottenimento dell'ematossilina. Il nostro protocollo di colorazione contribuirà in modo sostanziale a far avanzare l'istologia dei raggi X 3D. La ricerca medica trarrà particolare beneficio da questa tecnica di imaging 3D non distruttiva.

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Alta risoluzione x-ray tomografia computerizzata (HRCT) è una tecnica non distruttiva imaging diagnostico che può essere utilizzata per studiare la struttura e la funzione della vascolarizzazione dell'impianto in 3D. Dimostriamo come HRCT facilita l'esplorazione di reti xilematici in una vasta gamma di tessuti e specie vegetali.

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Immagini 3D di campioni di tessuti molli utilizzando un metodo di colorazione specifico a raggi X e tomografia computerizzata nanoscopica (Video) | JoVE Journal

Immagini 3D di campioni di tessuti molli utilizzando un metodo di colorazione specifico a raggi X e tomografia computerizzata nanoscopica

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