Name: Misurazione della confluenza di iPSC utilizzando un sistema di imaging automatizzato. (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2020-06-10T13:30:00.000+00:00
Duration: 11 min 39 s
Description: Scopri come misurare la confluenza di iPSC utilizzando un sistema di imaging automatizzato. Questo metodo valuta gli effetti di diversi rivestimenti ECM sulle velocità di crescita cellulare senza perturbare le colture.

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Lo studio è stato sostenuto da sovvenzioni della Fondazione Bambino Gesù e Ricerca Corrente a C.C.  Si ringraziano il Dott. Enrico Bertini (Dipartimento di Neuroscienze, Unità di Malattie Neuromuscolari e Neurodegenerative, Laboratorio di Medicina Molecolare, Ospedale Pediatrico Bambino Gesù), la Dott.ssa Stefania Petrini (Centro di Microscopia Confocale, Laboratori di Ricerca, Ospedale Pediatrico Bambino Gesù), Giulia Pericoli (Dipartimento di Oncoematologia, Terapia Genica e Cellulare, Ospedale di Ricerca Pediatrica Bambino Gesù) e Roberta Ferretti (Dipartimento di Oncoematologia, Terapia Genica e Cellulare, Ospedale Pediatrico Bambino Gesù) per le discussioni scientifiche e l'assistenza tecnica. Maria Vinci è destinataria di una borsa di studio "Children with Cancer UK".

1. Rivestimento di 96 piastre di pozzetto
NOTA: Diversi rivestimenti sono stati testati nella stessa piastra ma pozzetti separati (vedere File supplementare).
<ol><li>Diluire il Matrigel 1:100 in DMEM. Aggiungere 100 μL per pozzetto alle piastre da 96 pozzetti e incubare per 1 ora a temperatura ambiente. Successivamente, rimuovere la soluzione e lavare i pozzetti con 100 μL di DMEM due volte.</li>
	<li>Laminina diluita (20 μg/mL, LN-521) in PBS (con calcio e magnesio). Aggiungere 100 μL nel pozzetto e incubare a 4 °C durante la notte. Il giorno seguente eseguire due lavaggi con DMEM prima di seminare le cellule.</li>
	<li>Vitronectina diluita (10 μg/ml) in tampone di diluizione. Aggiungere 100 μL per pozzetto alla piastra a 96 pozzetti e incubare per 1 ora a temperatura ambiente. Lavare i pozzetti con PBS (senza calcio e magnesio) prima di placcare le cellule.</li>
	<li>Diluire HU-Fibronectina (30 μg/ml) in ddH2O. Aggiungere 100 μL ai pozzetti e incubare a temperatura ambiente per 45 minuti. Successivamente, lavare i pozzetti con il mezzo prima di seminare le cellule.</li>
</ol>2. Mantenimento delle iPSC in coltura
NOTA: le iPSC sono state acquistate commercialmente. Le iPSC sono state derivate da fibroblasti umani sani e riprogrammate utilizzando la tecnologia episomiale.
<ol><li>Dal congelatore a -80 °C o dall'azoto liquido, scongelare le iPSC crioconservate in un bagno d'acqua a 37 °C. Pulire il flaconcino contenente le cellule con etanolo al 70% prima di spostarlo nell'armadio di sicurezza biologica.</li>
	<li>Aggiungere la sospensione cellulare a 5 mL di terreno di coltura cellulare preriscaldato (ad es. mTeSR1) goccia a goccia con una pipetta da 1000 μL in un tubo conico sterile da 15 ml.</li>
	<li>Centrifugare le celle a 304 x g per 5 minuti a temperatura ambiente (RT).</li>
	<li>Rimuovere il terreno e risospendere il pellet cellulare in 4 ml di terreno di coltura cellulare.</li>
	<li>Placcare la sospensione cellulare in due pozzetti delle 6 piastre del pozzetto (105 iPSC per piatto di coltura cellulare a 6 pozzetti), dove i fibroblasti embrionali di topo (MEF) sono stati placcati in precedenza. MEF di semi due giorni prima della placcatura delle iPSC ad una densità di 2,4 x 104/cm2 in DMEM (contenente il 10% di siero bovino fetale, l'1% di L-glutammina e l'1% di penicillina-streptomicina).</li>
	<li>Dopo la semina, integrare il terreno cellulare con 10 μM di inibitore ROCK Y-27632.</li>
	<li>Far crescere le iPSC sui MEF per le prime 4-5 settimane e poi in condizioni di feeder free (MEF free condition), utilizzando uno dei rivestimenti di interesse (vedi step 1 e Tabella 1) in mTeSR1.</li>
	<li>Quando le iPSC sono confluenti al 70-80%, passare 1:4 usando il trattamento EDTA da 0,5 mM per 3-5 minuti a RT. Aggiungere 1 mL di 0,5 mM EDTA per una piastra a 6 pozzetti (o quantità proporzionali per altri tipi di piastre). Trasferimento in nuovi pozzi in condizioni di assenza di alimentazione e incubazione a 37 °C, 5% CO2, 20% O2.</li>
	<li>Cambiare il supporto con mTeSR1 fresco ogni giorno e dividere le celle ogni 2 giorni.</li>
</ol>3. Caratterizzazione della confluenza cellulare
<ol><li>Utilizzare 96 piastre per pozzetti per gli esperimenti.</li>
	<li>Seminare 10.000 cellule per pozzetto dopo almeno 1 mese di coltura in condizioni di feeder free per essere sicuri che i MEF non siano stati passati. Utilizzare vetrini di conteggio usa e getta per contare le cellule con il microscopio ottico.</li>
	<li>Eseguire gli esperimenti in triplice copia. Pertanto, testare ogni condizione di semina in tre pozzi.</li>
	<li>Eseguire l'acquisizione automatica delle immagini dal giorno 1 successivo alla semina utilizzando un citometro in modalità campo chiaro. Esegui l'acquisizione automatica delle immagini ogni 24 ore per 5 giorni. Per informazioni dettagliate sui parametri sperimentali, fare riferimento al file supplementare.</li>
	<li>Usa il contrasto automatico e l'esposizione automatica per visualizzare meglio le celle.</li>
	<li>Impostare l'impostazione di analisi (vedere File supplementare) per l'analisi di confluenza per applicare una maschera del 60%, 80% e 100% per pozzetto, al fine di valutare i cambiamenti di messa a fuoco dovuti alla rifrazione della luce al bordo dei pozzi. Utilizzare la diversa impostazione di analisi della maschera menzionata sopra per analizzare la confluenza della cella in ogni punto temporale.</li>
</ol>4. Analisi statistiche
<ol><li>Riportare i risultati quantitativi come mezzi ± errore standard della media (SEM).</li>
	<li>Per confrontare le differenze complessive delle diverse condizioni di rivestimento, ottenere dati utilizzando gli stessi campioni ed eseguire il test t del campione accoppiato dello studente. I valori di p inferiori a 0,05 sono considerati statisticamente significativi e tutti i valori p riportati sono a due facce.</li>
</ol>5. Caratterizzazione dei microfilamenti citoscheletrici
<ol><li>Fissare le cellule con paraformaldeide al 4% (4% PFA) in PBS per 10 minuti a RT, seguito da due lavaggi in PBS (10 minuti totali).</li>
	<li>Aggiungere 100 μL di soluzione bloccante (composta da 5% BSA, 0,1% Triton in PBS) a ciascun pozzetto per 1 ora a RT.</li>
	<li>Rimuovere la soluzione bloccante e lavare i campioni due volte con PBS per 10 minuti.</li>
	<li>Aggiungere 100 μL della soluzione di lavoro coniugata alla falloidina per campione e incubare per 1 ora a RT.</li>
	<li>Lavare le celle due volte con PBS (10 minuti a RT).</li>
	<li>Nuclei di colorazione con Hoechst 33342 diluito 1:10000 in PBS per 10 minuti a RT.</li>
	<li>Rimuovere la soluzione di Hoechst e lavare le celle due volte con PBS per 10 minuti ogni volta.</li>
	<li>Lavare il campione con H2O e lasciare asciugare sotto un cappuccio chimico.</li>
	<li>Aggiungere 100 μL di mezzi di montaggio (cioè PBS:glicerolo, 1:1) per coprire le cellule e preservare la fluorescenza dei campioni.</li>
	<li>Osservare la cella a Ex/Em 493/517 nm su un microscopio confocale a scansione laser dotato di una sorgente laser a luce bianca (WLL) e di un laser a diodi da 405 nm. Acquisisci immagini confocali sequenziali utilizzando un obiettivo HC PLAPO 40x ad immersione in olio. Utilizzare la stessa potenza laser, gli stessi beam splitter, le impostazioni del filtro, i diametri stenopeici e la modalità di scansione per tutti i campioni esaminati.</li>
</ol>

<ol><li>Masotti, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Aged+iPSCs+display+an+uncommon+mitochondrial+appearance+and+fail+to+undergo+in+vitro+neurogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Aging+%28Albany+NY%29%22%5BJournal%5D)">Aged iPSCs display an uncommon mitochondrial appearance and fail to undergo in vitro neurogenesis.</a> Aging (Albany NY). 6 (12), 1094-1108 (2014).</li>
<li>Xu, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Feeder-free+growth+of+undifferentiated+human+embryonic+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Feeder-free growth of undifferentiated human embryonic stem cells.</a> Nature Biotechnology. 19, 971-974 (2001).</li>
<li>Kleinman, H. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+and+characterization+of+type+IV+procollagen%2C+laminin%2C+and+heparan+sulfate+proteoglycan+from+the+EHS+sarcoma%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Isolation and characterization of type IV procollagen, laminin, and heparan sulfate proteoglycan from the EHS sarcoma.</a> Biochemistry. 21 (24), 6188-6193 (1982).</li>
<li>Rodin, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clonal+culturing+of+human+embryonic+stem+cells+on+laminin-521%2FE-cadherin+matrix+in+defined+and+xeno-free+environment%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Clonal culturing of human embryonic stem cells on laminin-521/E-cadherin matrix in defined and xeno-free environment.</a> Nature Communications. 5, 3195(2014).</li>
<li>Rodin, S., Antonsson, L., Hovatta, O., Tryggvason, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Monolayer+culturing+and+cloning+of+human+pluripotent+stem+cells+on+laminin-521+based+matrices+under+xeno-free+and+chemically+defined+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Protocols%22%5BJournal%5D)">Monolayer culturing and cloning of human pluripotent stem cells on laminin-521 based matrices under xeno-free and chemically defined conditions.</a> Nature Protocols. 9 (10), 2354-2368 (2014).</li>
<li>Laperle, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((%CE%B1-5+Laminin+Synthesized+by+Human+Pluripotent+Stem+Cells+Promotes+Self-Renewal%5BTitle%5D)+AND+%22Stem+Cell+Reports%22%5BJournal%5D)">α-5 Laminin Synthesized by Human Pluripotent Stem Cells Promotes Self-Renewal.</a> Stem Cell Reports. 5 (2), 195-206 (2015).</li>
<li>Albalushi, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laminin+521+stabilizes+the+pluripotency+expression+pattern+of+human+embryonic+stem+cells+initially+derived+on+feeder+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Stem+Cell+International%22%5BJournal%5D)">Laminin 521 stabilizes the pluripotency expression pattern of human embryonic stem cells initially derived on feeder cells.</a> Stem Cell International. 2018, 7127042(2018).</li>
<li>Zhang, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Niche-derived+laminin-511+promotes+midbrain+dopaminergic+neuron+survival+and+differentiation+through+YAP%5BTitle%5D)+AND+%22Science+Signaling%22%5BJournal%5D)">Niche-derived laminin-511 promotes midbrain dopaminergic neuron survival and differentiation through YAP.</a> Science Signaling. 10 (493), (2017).</li>
<li>Lu, H. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+defined+xeno-free+and+feeder-free+culture+system+for+the+derivation%2C+expansion+and+direct+differentiation+of+transgene-free+patient-specific+induced+pluripotent+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Biomaterials%22%5BJournal%5D)">A defined xeno-free and feeder-free culture system for the derivation, expansion and direct differentiation of transgene-free patient-specific induced pluripotent stem cells.</a> Biomaterials. 35 (9), 2816-2826 (2015).</li>
<li>Miyazaki, T., Nakatsuji, N., Suemori, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimization+of+slow+cooling+cryopreservation+for+human+pluripotent+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Genesis%22%5BJournal%5D)">Optimization of slow cooling cryopreservation for human pluripotent stem cells.</a> Genesis. 52 (1), 49-55 (2014).</li>
<li>Bergström, R., Ström, S., Holm, F., Feki, A., Hovatta, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Xeno-free+culture+of+human+pluripotent+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+in+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">Xeno-free culture of human pluripotent stem cells.</a> Methods in Molecular Biology. 767, 125-136 (2011).</li>
<li>Braam, S. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recombinant+vitronectin+is+a+functionally+defined+substrate+that+supports+human+embryonic+stem+cell+self-renewal+via+alphavbeta5+integrin%5BTitle%5D)+AND+%22Stem+Cells%22%5BJournal%5D)">Recombinant vitronectin is a functionally defined substrate that supports human embryonic stem cell self-renewal via alphavbeta5 integrin.</a> Stem Cells. 26 (9), 2257-2265 (2008).</li>
<li>Chen, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemically+defined+conditions+for+human+iPSC+derivation+and+culture%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Chemically defined conditions for human iPSC derivation and culture.</a> Nature Methods. 8 (5), 424-429 (2008).</li>
<li>Li, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+vitronectin+concentration+and+surface+properties+on+the+stable+propagation+of+human+embryonic+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Biointerphases%22%5BJournal%5D)">Impact of vitronectin concentration and surface properties on the stable propagation of human embryonic stem cells.</a> Biointerphases. 5 (3), 132-142 (2010).</li>
<li>Prowse, A. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Long-term+culture+of+human+embryonic+stem+cells+on+recombinant+vitronectin+in+ascorbate+free+media%5BTitle%5D)+AND+%22Biomaterials%22%5BJournal%5D)">Long-term culture of human embryonic stem cells on recombinant vitronectin in ascorbate free media.</a> Biomaterials. 31 (32), 8281-8288 (2010).</li>
<li>Rowland, T. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Roles+of+integrins+in+human+induced+pluripotent+stem+cell+growth+on+Matrigel+and+vitronectin%5BTitle%5D)+AND+%22Stem+Cells+and+Development%22%5BJournal%5D)">Roles of integrins in human induced pluripotent stem cell growth on Matrigel and vitronectin.</a> Stem Cells and Development. 19 (8), 1231-1240 (2010).</li>
<li>Ruoslahti, E., Engvall, E., Hayman, E. G., Spiro, R. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+studies+on+amniotic+fluid+and+plasma+fibronectins%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Comparative studies on amniotic fluid and plasma fibronectins.</a> Biochemistry. 193 (1), 295-299 (1981).</li>
<li>Ni, H., Li, A., Simonsen, N., Wilkins, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrin+activation+by+dithiothreitol+or+Mn2%2B+induces+a+ligand-occupied+conformation+and+exposure+of+a+novel+NH2-terminal+regulatory+site+on+the+beta1+integrin+chain%5BTitle%5D)+AND+%22Biological+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Integrin activation by dithiothreitol or Mn2+ induces a ligand-occupied conformation and exposure of a novel NH2-terminal regulatory site on the beta1 integrin chain.</a> Biological Chemistry. 273 (14), 7981-7987 (1998).</li>
<li>Seltana, A., Basora, N., Beaulieu, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intestinal+epithelial+wound+healing+assay+in+an+epithelial-mesenchymal+co-culture+system%5BTitle%5D)+AND+%22Wound+Repair+%26+Regeneration%22%5BJournal%5D)">Intestinal epithelial wound healing assay in an epithelial-mesenchymal co-culture system.</a> Wound Repair & Regeneration. 18 (1), 114-122 (2010).</li>
<li>Amit, M., Shariki, C., Margulets, V., Itskovitz-Eldor, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Feeder+layer-and+serum-free+culture+of+human+embryonic+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Biology+of+Reproduction%22%5BJournal%5D)">Feeder layer-and serum-free culture of human embryonic stem cells.</a> Biology of Reproduction. 70 (3), 837-845 (2004).</li>
<li>Vaheri, A., Mosher, D. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+molecular+weight%2C+cell+surface-associated+glyco-protein+%28fibronectin%29+lost+in+malignant+transformation%5BTitle%5D)+AND+%22Biochimica+et+Biophysica+Acta%22%5BJournal%5D)">High molecular weight, cell surface-associated glyco-protein (fibronectin) lost in malignant transformation.</a> Biochimica et Biophysica Acta. 516 (1), 1-25 (1978).</li>
<li>Mao, Y., Schwarzbauer, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fibronectin+fibrillogenesis%2C+a+cell-mediated+matrix+assembly+process%5BTitle%5D)+AND+%22Matrix+Biology%22%5BJournal%5D)">Fibronectin fibrillogenesis, a cell-mediated matrix assembly process.</a> Matrix Biology. 24 (6), 389-399 (2005).</li>
<li>Polyak, K., Weinberg, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transitions+between+epithelial+and+mesenchymal+states%3A+acquisition+of+malignant+and+stem+cell+traits%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Reviews+Cancer%22%5BJournal%5D)">Transitions between epithelial and mesenchymal states: acquisition of malignant and stem cell traits.</a> Nature Reviews Cancer. 9 (4), 265-273 (2009).</li>
<li>Kadler, K. E., Hill, A., Canty-Laird, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Collagen+fibrillogenesis%3A+fibronectin%2C+integrins%2C+and+minor+collagens+as+organizers+and+nucleators%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Opinion+in+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Collagen fibrillogenesis: fibronectin, integrins, and minor collagens as organizers and nucleators.</a> Current Opinion in Cell Biology. 20 (5), 495-501 (2008).</li>
<li>Hunt, G. C., Schwarzbauer, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tightening+the+connections+between+cadherins+and+fibronectin+matrix%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Cell%22%5BJournal%5D)">Tightening the connections between cadherins and fibronectin matrix.</a> Developmental Cell. 16 (3), 327-328 (2009).</li>
<li>Villa-Diaz, L. G., Ross, A. M., Lahann, J., Krebsbach, P. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Concise+review%3A+The+evolution+of+human+pluripotent+stem+cell+culture%3A+from+feeder+cells+to+synthetic+coatings%5BTitle%5D)+AND+%22Stem+Cells%22%5BJournal%5D)">Concise review: The evolution of human pluripotent stem cell culture: from feeder cells to synthetic coatings.</a> Stem Cells. 31 (1), 1-7 (2013).</li>
<li>Engler, A. J., Sen, S., Sweeney, H. L., Discher, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Matrix+elasticity+directs+stem+cell+lineage+specification%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Matrix elasticity directs stem cell lineage specification.</a> Cell. 126 (4), 677-689 (2006).</li>
<li>Vigilante, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identifying+Extrinsic+versus+Intrinsic+Drivers+of+Variation+in+Cell+Behavior+in+Human+iPSC+Lines+from+Healthy+Donors%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Reports%22%5BJournal%5D)">Identifying Extrinsic versus Intrinsic Drivers of Variation in Cell Behavior in Human iPSC Lines from Healthy Donors.</a> Cell Reports. 26 (8), 2078-2087 (2019).</li>
</ol>

Gli autori non hanno nulla da rivelare.

L'utilizzo delle iPSC per la modellizzazione delle malattie e il futuro screening farmacologico insieme alla loro possibile applicazione in medicina di precisione la rende una tecnologia di grande rilevanza e per questo motivo riteniamo che sia necessario comprendere chiaramente la condizione di coltura in vitro che meglio assomiglia alla situazione fisiologica delle cellule staminali embrionali. In questo contesto, abbiamo testato diversi rivestimenti ECM utilizzando iPSC wild type al fine di comprendere le condizioni c...

Le cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC) sono ottenute da cellule somatiche e possono essere differenziate in diversi tipi di cellule. Sono spesso utilizzati come sistema per modellare la patogenesi della malattia o eseguire lo screening dei farmaci e offrono anche il potenziale per essere utilizzati nel contesto della medicina personalizzata. Poiché le iPSC hanno un grande potenziale, è importante caratterizzarle completamente per l'uso come sistema modello affidabile. In precedenza abbiamo dimostrato l'importanza della crescita di iPSC in un ambiente ipossico poiché queste cellule si basano sulla glicolisi e un ambiente aerobico può causare uno squilibrio redox1. Le iPSC sono anche vulnerabili ad altre condizioni di coltura, in particolare all'ambiente extracellulare. L'ottimizzazione delle condizioni colturali è una questione chiave per mantenerle sane e proliferanti. Una coltura iPSC sana porterà a cellule differenziate sane che generalmente sono l'endpoint del modello utilizzato per comprendere le caratteristiche molecolari, cellulari e funzionali di specifici disturbi umani o processi cellulari.
In questo studio, è stato utilizzato un semplice protocollo per testare la confluenza di iPSC utilizzando diverse condizioni di rivestimento in pozzetti separati. Le iPSC richiedono uno strato di alimentazione di fibroblasti embrionali murini (MEF) per attaccarsi correttamente, ma la coesistenza di iPSC e MEF rende difficile eseguire analisi come l'estrazione di RNA o proteine poiché sono presenti due popolazioni di cellule. Al fine di evitare lo strato di alimentazione, diverse proteine appartenenti alla matrice extracellulare (ECM) sono state utilizzate per ricreare la nicchia cellulare naturale e per avere una coltura di iPSC priva di alimentatore. In particolare, Matrigel è un preparato di membrana basale solubilizzato estratto dal sarcoma di topo Engelbreth-Holm-Swarm (EHS), arricchito in proteine della matrice extracellulare (laminina, collagene IV, eparan solfato proteoglicani, entactin/nidogeno e fattori di crescita)2,3. Le altre condizioni di rivestimento utilizzate sono invece proteine purificate con rilevanza nota nella costruzione delle ECM: la laminina-521 è nota per essere secreta dalle cellule staminali pluripotenti umane (hPSC) nella massa cellulare interna dell'embrione ed è una delle laminine più comuni nell'organismo dopo la nascita 4,5,6,7,8,9, 10,11; la vitronectina è una matrice di coltura cellulare xeno-free nota per supportare la crescita e la differenziazione di hPSC 12,13,14,15,16; la fibronectina è una proteina ECM importante per lo sviluppo dei vertebrati e l'attaccamento e il mantenimento delle cellule staminali embrionali in uno stato pluripotente 17,18,19,20,21,22,23,24,25. Poiché sono disponibili diverse condizioni di rivestimento, le confrontiamo in termini di effetto sulla confluenza delle iPSC.

<table><tbody><tr><td>Pipette sierologiche Stripette da 10 mL, polistirene, incartate singolarmente in carta/plastica, sterili</td><td>Corning</td><td>4488</td><td>Tool</td></tr><tr><td>15 mL di provette da centrifuga coniche in polipropilene (PP) ad alta trasparenza</td><td>Strumento Falcon</td><td>352097</td><td></td></tr><tr><td>1x PBS (con Ca2+; Mg2+)</td><td>Thermofisher</td><td>14040133</td><td>Medium</td></tr><tr><td>1x PBS (senza Ca2+; Mg2+)</td><td>Euroclone</td><td>ECB4004L</td><td>Medium</td></tr><tr><td>5 mL Stripette Pipette sierologiche, polistirene, incartate singolarmente in carta/plastica, sterili</td><td>Corning</td><td>4487</td><td>Tool</td></tr><tr><td>Micropiastra per colture cellulari, 96 pozzetti, PS, supporto F-Bottom</td><td>Greiner Bio One</td><td>655090</td><td></td></tr><tr><td>Piastra per colture cellulari,</td><td>supporto</td><td></td><td></td></tr> <tr><td>Costar 3516 a 6 pozzettiDMEM (Dulbecco's Modified Eagle's Medium-high glycise)</td><td>Sigma</td><td>D5671</td><td></td></tr><tr><td>Medium EDTA</td><td>Sigma</td><td>ED4SS-500g</td><td>Reagente</td></tr><tr><td>Epi Episomal iPSC Reprogramming</td><td>Invitrogen</td><td>A15960</td><td>Reagente</td></tr><tr><td>FAST - READ 102</td><td>Biosigma</td><td>BVS100</td><td>Tool</td></tr><tr><td>Siero fetale bovino (FBS)</td><td>Gibco</td><td>10270106</td><td>Medium</td></tr><tr><td>Fibronectina</td><td>Merck</td><td>FC010</td><td>Rivestimento</td></tr><tr><td>Glicerolo</td><td>Sigma</td><td>G5516</td><td>Reagente</td></tr><tr><td>H2O</td><td></td><td>MILLIQ</td><td></td></tr><tr><td>Hoechst</td><td>Thermofisher</td><td>33342</td><td>Reagente</td></tr><tr><td>Laminina 521</td><td>Tecnologie delle cellule staminali</td><td>77003</td><td>Rivestimento</td></tr><tr><td>L-glutammina (200 mM)</td><td>Gibco</td><td></td><td>LS25030081 Reagente</td></tr><tr><td>Matrigel</td><td>Corning Matrigel hESC Certified Matrix</td><td>354277</td><td>Coating</td></tr><tr><td>Fibroblasti embrionali di topo (MEF)</td><td>Life Technologies</td><td>A24903</td><td>Coating</td></tr><tr><td>MTESR1 Medium</td><td>Stem Cell Technologies</td><td>85851</td><td></td></tr><tr><td>Medium MTESR1 Supplement</td><td>Stem Cell Technologies</td><td>85852</td><td></td></tr><tr><td>Medium Penicillina-Streptomycin (10.000 U/mL)</td><td>Gibco</td><td>15140122</td><td>Reagente</td></tr><tr><td>Falloidina</td><td>Sigma</td><td>P1951</td><td>Reagente</td></tr><tr><td>Vitronectina</td><td>Stem Cell Technologies</td><td>7180</td><td>Rivestimento</td></tr><tr><td>Y-27632</td><td>Sigma</td><td>Y0503</td><td>Reagente</td></tr></tbody></table>

misurazione della confluenza di ipsc utilizzando un sistema di imaging automatizzato.

Measuring the Confluence of iPSCs Using an Automated Imaging System

Questo studio si concentra sulla comprensione di come la crescita di iPSC su diversi substrati di rivestimento ECM può influenzare la confluenza cellulare. È stato stabilito un protocollo per valutare la confluenza di iPSC in tempo reale senza la necessità di contare le cellule in sospensione monocellulare per evitare qualsiasi perturbazione della crescita. Un sistema di analisi delle immagini ad alto contenuto è stato utilizzato per valutare la confluenza di iPCS su 4 diversi ECM nel tempo in modo automatizzato. Sono state utilizzate diverse impostazioni di analisi per valutare la confluenza cellulare di iPSC aderenti e solo una leggera differenza (a 24 e 48 ore con laminina) è stata osservata se è stata applicata una maschera al 60, 80 o 100%. Mostriamo anche che la laminina porta alla migliore confluenza rispetto a Matrigel, vitronectin e fibronectina.

In questo studio, abbiamo studiato la confluenza delle iPSC quando coltivate in diverse condizioni di rivestimento. Utilizzando un citometro, siamo stati in grado di ottenere risultati prontamente informativi in triplice copia in 5 giorni. Poiché le iPSC difficilmente si attaccano ai vasi di plastica ed è necessario un rivestimento per supportare la loro proliferazione, abbiamo deciso di monitorare la confluenza delle iPSC umane in quanto è indicativa della salute della coltura cellulare e potrebbe riflettersi sul loro p...

L'obiettivo del protocollo è confrontare diverse condizioni di rivestimento della matrice extracellulare (ECM) per valutare in che modo il rivestimento differenziale influisce sul tasso di crescita delle cellule staminali pluripotenti indotte (iPSC). In particolare, miriamo a creare le condizioni per ottenere una crescita ottimale delle colture iPSC.

Misurazione della confluenza di iPSC utilizzando un sistema di imaging automatizzato.

This study focuses on understanding how growing iPSCs on different ECM coating substrates can affect cell confluence. A protocol to assess iPSC confluence ...

Questo protocollo è significativo perché consente una rapida valutazione della confluenza indotta di cellule staminali pluripotenti su diversi substrati di rivestimento di matrice extracellulare in tempo reale. Il vantaggio principale di questo protocollo è che non richiede il conteggio delle sospensioni a singola cellula, prevenendo così la perturbazione della crescita delle iPSC, che sono sensibili al passaggio. A dimostrare la procedura sarà Valentina Magliocca, una postdoc del mio laboratorio.Per impostare le piastre rivestite di matrice a membrana basale, diluire la matrice a membrana basale, impostare un rapporto da 1 a 100 in DMEM e aggiungere 100 microlitri della soluzione risultante a ciascun pozzetto di una piastra a 96 pozzetti. Quando tutti i pozzetti sono stati codificati, posizionare la piastra nell'incubatore per colture cellulari per un'ora. Al termine dell'incubazione, scartare la soluzione della matrice della membrana basale e lavare ogni pozzetto due volte con 100 microlitri di DMEM fresco per pozzetto.Per allestire piastre rivestite di laminina, diluire 20 microgrammi per millilitro di laminina in PBS con calcio e magnesio e aggiungere 100 microlitri della soluzione di laminina a ciascun pozzetto di una nuova piastra a 96 pozzetti. Quindi incubare la piastra a quattro gradi Celsius per una notte prima di lavare i pozzetti due volte con DMEM fresco, come dimostrato. Per impostare piastre rivestite di Vitronectina, diluire 10 microgrammi per millilitro di Vitronectina in tampone di diluizione e aggiungere 100 microlitri di tampone a ciascun pozzetto di una nuova piastra a 96 pozzetti.Dopo un'ora di incubazione a temperatura ambiente, lavare i pozzetti con 100 microlitri di PBS senza calcio e magnesio per pozzetto. Per preparare piastre rivestite di fibronectina umana, diluire 30 microgrammi per millilitro di fibronectina in acqua a doppia distillazione e aggiungere 100 microlitri della soluzione di fibronectina a ciascun pozzetto di una nuova piastra a 96 pozzetti. Dopo un'incubazione di 45 minuti a temperatura ambiente, lavare i pozzetti con DMEM fresco come dimostrato.Due giorni prima di allestire una coltura iPSC, seminare fibroblasti embrionali di topo a una densità da 2,4 per 10 a un quarto per centimetro quadrato in un terreno di coltura cellulare completo in ciascuno dei due pozzetti di piastre per colture cellulari a sei pozzetti e posizionare le piastre nell'incubatore per colture cellulari. Per impostare una coltura di iPSC, riscaldare una soluzione madre di iPSC crioconservate in un bagno d'acqua a 37 gradi Celsius. Quando le cellule si sono appena scongelate, pulire la fiala con etanolo al 70% e posizionare le cellule in una cabina di sicurezza biologica.Utilizzando una pipetta da 1000 microlitri, trasferire le cellule goccia a goccia in una provetta conica sterile da 15 millilitri contenente cinque millilitri di terreno di coltura cellulare preriscaldato. Raccogliere le cellule mediante centrifugazione e risospendere il pellet in quattro millilitri di terreno di coltura cellulare fresco. Quindi piastra 1 per 10 fino alla quinta cellula in ciascuno dei due pozzetti delle piastre a sei pozzetti seminate con fibroblasti embrionali di topo.Dopo la semina, integrare le colture cellulari con 10 micromolari dell'inibitore ROCK Y-27632 e posizionare le piastre nell'incubatore di coltura cellulare per quattro o cinque settimane. Quando le cellule raggiungono il 70-80% di confluenza, trattare ogni coltura con un millilitro di EDTA 0,5 millimolare per tre-cinque minuti a temperatura ambiente. Quando le cellule si sono staccate, dividere le cellule in un rapporto di uno a quattro in un terreno di coltura cellulare fresco e placcare le cellule in ciascuno dei quattro pozzetti rimanenti della piastra a sei pozzetti in condizioni di assenza di alimentatore.Quindi rimettere le piastre nell'incubatore per colture cellulari. Per valutare gli effetti dei diversi rivestimenti sulla confluenza cellulare dopo almeno un mese di coltura in condizioni di assenza di alimentatore, utilizzare vetrini di conteggio monouso per contare le cellule di ciascuna coltura utilizzando una camera di conteggio. Diluire le cellule a una per 10 fino alle quarte cellule per 200 microlitri di media concentrazione e seminare le cellule in triplicato in ciascuno dei tre pozzetti di una piastra da 96 pozzetti rivestita di copertura per condizione.Quando tutte le cellule sono state piastre, posizionare le piastre nell'incubatore per colture cellulari per 24 ore. Il giorno successivo e ogni giorno per i successivi cinque giorni, eseguire l'imaging automatico delle cellule utilizzando le impostazioni di contrasto automatico ed esposizione automatica per una visualizzazione ottimale. Per valutare i cambiamenti di messa a fuoco dovuti alla rifrazione della luce al bordo dei pozzetti, impostare le impostazioni di analisi sull'analisi della confluenza per applicare una maschera del 60, 80 o 100% per pozzetto e utilizzare le diverse impostazioni di analisi della maschera per analizzare la confluenza della cella in ogni punto temporale.Per confrontare le differenze complessive delle diverse condizioni di codifica, utilizzare i dati del campione per eseguire il test T a campione accoppiato dello studente, riportando i risultati quantitativi come le variazioni medie della confluenza, più o meno l'errore standard della media. Per la caratterizzazione dei microfilamenti del citoscheletro, in primo luogo, fissare le cellule con 100 microlitri di paraformaldeide al 4% in PBS per pozzetto per 10 minuti a temperatura ambiente, seguiti da due lavaggi di 10 minuti in 200 microlitri di PBS per lavaggio. Trasferire il vetrino coprioggetto precedentemente posizionato dalla lastra al vetrino del microscopio.Aggiungere 100 microlitri di siero bovino al 5% e tritone allo 0,1% in PBS a ciascun pozzetto per un'ora a temperatura ambiente per bloccare qualsiasi legame non specifico e lavare i campioni con due lavaggi PBS di 10 minuti come dimostrato. Dopo il secondo lavaggio, aggiungere 100 microlitri di soluzione di lavoro coniugato di falloidina per campione per un'incubazione di un'ora a temperatura ambiente, seguita da due lavaggi di 10 minuti in PBS. Successivamente, colorare i nuclei con Hoechst 33342 diluito a una concentrazione da uno a 10.000 in PBS per 10 minuti a temperatura ambiente seguiti da due lavaggi PBS.Dopo il secondo lavaggio, sciacquare le celle con acqua e lasciare asciugare le piastre sotto una cappa chimica. Quando il vetrino coprioggetto si è asciugato, coprire le cellule con 100 microlitri di un mezzo di montaggio appropriato per pozzetto e localizzare le cellule su un microscopio confocale a scansione laser dotato di una sorgente laser a luce bianca e di un laser a diodi da 405 nanometri alle lunghezze d'onda di eccitazione ed emissione appropriate. Quindi selezionare l'obiettivo a immersione in olio 63x e acquisire immagini confocali sequenziali delle cellule.La colorazione con falloidina consente di visualizzare il grado di adesione cellulare alla superficie di un vaso e, in particolare, il rivestimento utilizzato per il vaso. Le cellule che aderiscono a un rivestimento mostrano microfilamenti citoscheletrici chiaramente visibili invece di microfilamenti collassati. L'imaging in campo chiaro consente inoltre di visualizzare il livello di adesione delle iPSC alle superfici rivestite.Le iPSC seminate sulla laminina dimostrano un alto tasso di proliferazione cellulare in modo lineare nel tempo rispetto ad altri rivestimenti. Le cellule seminate sulla matrice della membrana basale, la vitronectina e la fibronectina umana, al contrario, mostrano un tasso di proliferazione lineare nelle prime 96 ore con una pendenza aumentata nella curva di confluenza durante le ultime 24 ore indipendentemente dalla maschera utilizzata. Poiché la differenza iniziale a 24 ore per i diversi rivestimenti può essere dovuta a differenze nell'attacco cellulare, la crescita cellulare può essere normalizzata ai dati delle 24 ore per i punti temporali successivi.Come osservato, non esistono differenze in termini di confluenza tra i diversi rivestimenti, suggerendo che le differenze osservate all'interno delle colture rivestite di laminina sono molto probabilmente dovute a una maggiore capacità delle iPSC di aderire a questo rivestimento quando vengono attraversate. Questo studio può contribuire allo sviluppo di metodologie standardizzate per la coltura di iPSC e può aiutare nel loro futuro possibile utilizzo in clinica. Attualmente stiamo studiando la biologia dei principali recettori di superficie cellulare che mediano i contatti cellula-ECM e che potrebbero essere responsabili del mantenimento della loro capacità di auto-rinnovamento.

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Questo protocollo dettagli come quantificare il numero delle sinapsi sia dissociato cultura neuronale e nelle sezioni cerebrali con immunocitochimica. Utilizzando vano anticorpi specifici, abbiamo etichetta terminali presinaptici così come i luoghi di specializzazione post-sinaptici. Si definiscono sinapsi come punti di colocalizzazione tra i segnali generati da questi marcatori.

Sinapsi quantificare: un Immunocitochimica basato su analisi per quantificare Numero Synapse

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Un chip microfluidico per ICPMS introduzione del campione

Per studiare le velocità di flusso e la direzionalità dell'actina filamentosa nella sinapsi immunologica delle cellule T, l'imaging a super-risoluzione su cellule vive è combinato con la fluorescenza a riflessione interna totale e quantificato con la spettroscopia di correlazione delle immagini spazio-temporali.

Corticale actina di flusso in cellule T quantificati da spazio-temporale Correlazione Immagine Spettroscopia di Structured Illuminazione Microscopia dati

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