Segmentazione e misurazione lineare per l'analisi della composizione corporea mediante Slice-O-Matic e Horos

La degenerazione muscolare del nastro su una sarcopenia ha dimostrato di essere un fattore prognostico per la sopravvivenza del cancro e il successo del trattamento. L'analisi della composizione della terza regione lombare è interessante in quanto fornisce la caratterizzazione quantitativa del muscolo scheletrico e all'interno delle tac fornisce informazioni qualitative sul tessuto adiposo. Le procedure seguenti forniscono protocollo e verticale segmentato nel software sliceOmatic, nonché i protocolli di misurazione per l'analisi della composizione nelle immagini CT e MRI.

La selezione del protocollo delle vertebre L3 è completata all'interno della centralità GE. Tenere presente che se si utilizza un software diverso, gli strumenti possono variare. Aprire le immagini CT o MRI del paziente fatte entro il periodo di interesse.

Selezionare le aree del monitor, la visualizzazione finestra 2V. Selezionare la vista coronale o sagittale sullo schermo sinistro passando alla serie, quindi selezionando le immagini coronali o sagittali. Selezionare la vista assiale sullo schermo destro passando alla serie, quindi selezionando le immagini assiali.

Fare clic su conn, riferimento incrociato per collegare le due immagini, quindi scorrere le immagini sulla vista coronale o sagittale per assicurarsi che le vertebre della colonna vertebrale siano facilmente visibili. Quindi, scorrere le immagini della vista assiale per trovare le vertebre L1. L'L1 è la prima vertebra a non avere un attacco di costola.

Conta dall'L1 fino alle vertebre L3. Assicurarsi di utilizzare la vista sagittale o coronale come riferimento per individuare il centro delle vertebre L3. Esportare l'immagine L3 passando al menu dell'esame, selezionare esporta immagini, immagini selezionate.

Verificare che il formato sia DICOM. Quindi seleziona la posizione in cui salvare l'immagine. Fate doppio clic sul file DICOM per aprire sliceOmatic.

Una volta caricato il programma, trascinare l'immagine DICOM in qualsiasi punto dello schermo sliceOmatic. Vai alle modalità, area in crescita per iniziare la segmentazione. Selezionare strumenti, blocco tag.

Questa funzione verrà utilizzata nei passaggi successivi. Clicca su quello rosso sotto regione in crescita per impostare i limiti H.U.per i muscoli. Quindi fai clic sul pulsante off accanto al limite inferiore.

Questo lo farà su. Regolare il limite con il dispositivo di scorrimento in modo che sia il più vicino possibile a -29. Quindi usa la rotellina del mouse per impostarla esattamente su -29.

Quindi, fai clic sul pulsante off accanto al limite superiore su cui impostarlo. Utilizzare il dispositivo di scorrimento e la rotellina del mouse per impostare il limite H.U.a. su positivo 150 Avanti, fare clic sui due verdi per impostare i limiti H.U.per I.M.A.T. e impostare i limiti inferiore e superiore nello stesso modo, ma impostando il limite inferiore su -190 e il limite superiore su -30. Clicca sul cinque giallo per impostare i limiti per V.A.T.questa volta impostati nel limite inferiore a -150 e il limite superiore a -50.

Infine, fare clic sul ciano sette per impostare i limiti H.U.per S.A.T. impostando il limite inferiore su -190 e il limite superiore su -30. Premere i tasti più e meno sulla tastiera per ingrandire l'immagine in base alle esigenze. Regola lo zoom in base alle esigenze durante il processo di segmentazione.

Selezionare quello rosso e assicurarsi che l'opzione pennello sia impostata per la vernice. Usa la dimensione del pennello più efficiente per l'immagine e inizia a dipingere facendo clic sul tessuto muscolare. Dipingere sopra le psoas, i gruppi muscolari paraspinali e i gruppi muscolari obliqui.

Fai attenzione ai bordi del muscolo che sono vicini alla colonna vertebrale, agli organi interni o ai fluidi, per essere sicuri che questi non siano etichettati come muscoli. Se qualcosa è taggato falsamente, selezionane nessuno e cancella l'errore. Una volta che tutti i muscoli sono stati taggati, selezionarne uno nel menu di blocco dei tag.

Ciò garantirà che nessun muscolo sia cancellato o ri-taggato accidentalmente man mano che la segmentazione procede. Seleziona i due verdi e dipingi sopra il tessuto I.M.A.T. all'interno della fascia muscolare. Nota, la maggior parte degli spazi all'interno del muscolo stesso sarà I.M.A.T.Nota che i bordi della fascia muscolare sono spesso più leggeri nell'aspetto rispetto al tessuto circostante.

Questa può essere una guida utile, in particolare nelle regioni in cui i gruppi muscolari obliqui incontrano i gruppi muscolari paraspinali e nella regione sotto le spinae dell'eretore ma sopra la linea fasciale. Una volta che .M.A.T. è stato taggato, selezionare i due sotto il menu di blocco tag. Quindi seleziona i cinque gialli dal menu di crescita della regione per iniziare a segmentare V.A.T.One può ancora usare l'opzione pennello, ma per molte immagini, può essere più facile e veloce usare invece l'opzione grow to D.

Se si utilizza grow to D, assicurarsi di selezionare la dimensione del pennello più piccola, quindi fare clic sul tessuto V.A.T.all'interno dell'immagine per taggarlo. Assicurarsi che i tessuti o i grassi all'interno del limite dell'intestino o di altri organi non siano etichettati come V.A.T.Una volta etichettati tutti i V.A.T.is, selezionarne cinque dal menu di blocco dell'etichetta. Infine, selezionare il cian seven dal menu di coltivazione della regione per etichettare il tessuto S.A.T..

Ancora una volta, a seconda dell'immagine, il tessuto S.A.T.è spesso più facile da taggare con l'opzione grow to D. Una volta che il tessuto S.A.T.è taggato, controllare i bordi, in particolare intorno alla pelle, per essere sicuri che solo il grasso sottocutaneo sia contrassegnato come S.A.T.Una volta che tutti i tessuti sono stati taggati, guardare l'immagine per essere sicuri che non ci siano errori o tessuto marcato male. Al termine, gli strumenti di accesso, taggare il volume della superficie.

Fare clic sul pulsante dei valori della finestra e registrare la superficie di ciascun tessuto e i valori medi di U.U. Infine, vai al file, salva i file dei tag. In questo modo verrà salvato un file di tag in cui si trova l'immagine DICOM.

Per iniziare la segmentazione della risonanza prima di valutazione, vai alle modalità, alla crescita della regione. Guardando nella finestra di anteprima, possiamo vedere un istogramma di valori H.U., dove il primo picco è l'aria, il prossimo è il muscolo scheletrico, e se i seguenti picchi sono percepibili, saranno ossa seguite da tessuto adiposo. Nota, quando si utilizzano immagini di risonanza prima della risonanza, di solito solo il muscolo scheletrico può essere segmentato con sicurezza a causa della scarsa discriminazione del tessuto adiposo.

Selezionare quello rosso e ruotare il limite inferiore lasciandolo impostato su zero. Quindi attivare il limite superiore e modificare l'opzione della rotellina del mouse in limite superiore. Quindi, selezionare la vernice e un'opzione pennello di grandi dimensioni, quindi spostare il cursore sul muscolo psoas in modo che la regione del cursore includa sia il muscolo che l'osso.

Per essere sicuri che l'osso non sia etichettato come muscolo, impostare il limite superiore in modo conservativo spostando la rotellina del mouse fino a quando il limite superiore non include nessuno dei tessuti ossei esterni. Quindi segmentare il tessuto muscolare immediatamente adiacente alla colonna vertebrale. Quindi, spostare il cursore sulla linea alba o in qualsiasi altro punto della scansione in cui il tessuto adiposo e il muscolo sono facili da differenziare.

Aumentare il limite superiore il più alto possibile senza includere alcun tessuto adiposo. Da qui, si può procedere segmentando tutto il muscolo scheletrico rimanente. Nota, per alcune immagini, potrebbe essere necessario regolare continuamente il limite superiore.

Nota, mentre l'impostazione del limite superiore con questa procedura in due fase è conservativa, ottimizzerà la quantità di muscolo scheletrico da taggare senza doversi preoccupare di un significativo taggamento errato dell'osso o del tessuto adiposo. Al termine, gli strumenti di riferimento, taggare il volume della superficie e selezionare i valori della finestra per registrare l'area della superficie e i valori medi di U.H. del muscolo scheletrico. La misurazione lineare della regione delle vertebre L3 ha dimostrato di essere strettamente correlata con la massa muscolare totale.

Il vantaggio della misurazione lineare è la sua facilità e velocità, nonché il fatto che può essere fatto su qualsiasi software con uno strumento righello o uno strumento scatola. Questo protocollo è dimostrato utilizzando l'app Horace Medical Imaging. Se si utilizza un software diverso, tenere presente che gli strumenti specifici potrebbero essere molto.

Importare l'immagine nel visualizzatore facendo clic su importa, quindi passando alla posizione dell'immagine e selezionando apri. Una volta importato, fai clic sull'immagine o sul nome del paziente per visualizzare l'immagine in basso. Fare doppio clic sull'immagine per ingrandirla, che aprirà anche le opzioni dello strumento.

Identificare i psoa e i gruppi muscolari paraspinali. Si noti che il quadratus lumborum non deve essere considerato quando si determinano i bordi dei gruppi muscolari paraspinali. Selezionare lo strumento righello.

Disegnare una linea verticale dai punti più alti del gruppo muscolare al fondo del gruppo muscolare. Quindi disegnare una linea orizzontale dal bordo più largo del gruppo muscolare all'altro bordo più largo del gruppo muscolare. Ripetere questo processo sia per i psoa destro che sinistro e per i gruppi paraspinali destro e sinistro.

Si noti che le linee disegnate devono intersecarsi a 90 gradi. Si noti che, se i bordi delle linee disegnate dovevano essere collegati, tale connessione dovrebbe creare una scatola che comprenda l'intero gruppo muscolare. Nel Visualizzatore medico di Orazio, è difficile utilizzare lo strumento righello per assicurarsi che le linee si intersechino a 90 gradi.

Per questo motivo, è necessario utilizzare lo strumento di disegno delle scatola. Selezionare lo strumento rettangolo. Disegna una scatola intorno a ogni gruppo muscolare, ora prendendo nota che i bordi della scatola toccano le parti più alte e più basse del muscolo e le parti più larghe del muscolo.

Finché lo strumento scatola visualizza le sue dimensioni verticali e orizzontali, può essere preferibile rispetto allo strumento righello, poiché consente una facile visualizzazione dei confini muscolari. Un'immagine TC o RISONANZA CUTANEA correttamente segmentata non dovrebbe avere taggazioni muscolari oltre le linee fasciali e, per le immagini CT, non dovrebbe esserci tagging adiposo all'interno della fascia muscolare o sulla pelle. Registrare la superficie muscolare insieme all'altezza del paziente per calcolare l'indice muscolare scheletrico.

Per le TAC, le superfici del tessuto adiposo possono essere registrate in base alla ricerca specifica o alle domande cliniche di interesse. Inoltre, i valori medi di H.U. possono essere registrati per il controllo di qualità La misurazione lineare L3 dovrebbe avere le misurazioni del righello o della scatola che comprendono l'intero muscolo. Registrare le larghezze orizzontali e le altezze verticali di ogni muscolo, nonché l'altezza del paziente.

Moltiplicare le larghezze e le altezze per ogni muscolo, piuttosto che sommare quelle aree per ottenere l'area muscolare totale. Calcola l'indice di misura lineare dividendo l'area totale per l'altezza del paziente al quadrato. Il protocollo dimostrato consente a medici e ricercatori di utilizzare scansioni L3 CT o MRI per ottenere informazioni quantitative rapide e affidabili per la valutazione della sarcopenia.