Una procedura standardizzata per il monitoraggio delle fioriture algali dannose in Cile mediante analisi metabarcodifica

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26 agosto 2021

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26 agosto 2021

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Kyoko Yarimizu¹ , So Fujiyoshi¹ , Mikihiko Kawai² , Jacquelinne J. Acuña³ , Joaquin-Ignacio Rilling³ , Marco Campos³ , Jonnathan Vilugrón⁴ , Henry Cameron⁵ , Karen Vergara⁶ , Gonzalo Gajardo⁶ , Oscar Espinoza-González⁴ , Leonardo Guzmán⁴ , Satoshi Nagai⁷ , Carlos Riquelme⁵ , Milko A. Jorquera³ , Fumito Maruyama¹

¹Office of Research and Academia-Government-Community Collaboration, Hiroshima University, ²Graduate School of Human and Environmental Studies, Kyoto University, ³Scientific and Biotechnological Bioresource Nucleus, Universidad de La Frontera, ⁴Centro de Estudios de Algas Nocivas, Instituto de Fomento Pesquero, ⁵Ciencias del Mar y Recursos Biologicos, Universidad de Antofagasta, ⁶Departamento de Ciencias Biológicas y Biodiversidad, Universidad de Los Lagos, ⁷Japan Fisheries Research and Education Agency, Fisheries Resources Institute

Questo protocollo introduce fasi di analisi metabarcodifica, mirate ai geni rRNA 16S e rRNA 18S, per monitorare le fioriture algali dannose e il microbioma associato nei campioni di acqua di mare. È un potente strumento basato su molecole, ma richiede diverse procedure, che sono spiegate visivamente qui passo dopo passo.