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Un test cellulare basato su reporter per il monitoraggio dell'efficienza di giunzione
Un test cellulare basato su reporter per il monitoraggio dell'efficienza di giunzione
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JoVE Journal Biochemistry
A Reporter Based Cellular Assay for Monitoring Splicing Efficiency

Un test cellulare basato su reporter per il monitoraggio dell'efficienza di giunzione

Full Text
3,272 Views
08:53 min
September 15, 2021

DOI: 10.3791/63014-v

Jason Wong1, William Martelly1, Shalini Sharma1

1Department of Basic Medical Sciences,College of Medicine-Phoenix, University of Arizona

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Questo protocollo descrive un minigene reporter assay per monitorare l'impatto delle mutazioni del sito di giunzione 5'-splicing sullo splicing e sviluppa snRNA U1 soppressore per il salvataggio dell'inibizione dello splicing indotta da mutazioni. I costrutti di snRNA U1 reporter e soppressore sono espressi in cellule HeLa e lo splicing viene analizzato mediante estensione di primer o RT-PCR.

Questo protocollo descrive un test cellulare per il monitoraggio dell'efficienza di splicing, utilizzando un reporter di gestione adattabile. Questo reporter Assay può essere utilizzato per studiare gli effetti delle mutazioni associate alla malattia nei siti Exxon o di giunzione e per progettare la terapia, in particolare una particella, per migliorare il riconoscimento dei siti di giunzione mutanti a cinque punti. Il passaggio nelle cellule Hela aspira il mezzo esaurito e incuba le cellule con tre millilitri di 0,2 viaggi del 5% in contenenti un EDTA millimolare, a 37 gradi Celsius per tre minuti.

Dopo l'incubazione a sette millilitri di DMEM fresco e trasferire la sospensione cellulare in un tubo da 10 millilitri. Centrifugare le cellule. Quindi risospendere il pellet cellulare in 10 millilitri di DMEM fresco e placcare le cellule su un nuovo piatto di coltura tissutale al 20% di confluenza, per la trasfezione transitoria.

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