Name: Il test basato sulla microscopia per studiare e analizzare gli endosomi di riciclaggio utilizzando il traffico di SNARE (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2022-02-12T15:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 51 s
Description: Scopri l'assaggio a microscopia per analizzare gli endosomi di riciclaggio nel traffico SNARE utilizzando melanociti murini. Questo metodo aiuta a studiare la biogenesi dei melanosomi e i meccanismi della pigmentazione cutanea.

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Questo lavoro è stato sostenuto dal Dipartimento di Biotecnologie (BT/PR32489/BRB/10/1786/2019 a SRGS); Consiglio di ricerca scientifica e ingegneristica (CRG/2019/000281 alla SRGS); DBT-NBACD (BT/HRD-NBA-NWB/38/2019-20 a SRGS) e programma di partnership IISc-DBT (a SRGS). L'infrastruttura del dipartimento era supportata da DST-FIST, DBT e UGC. AMB è stato supportato da DBT-JRF (DBT/2015/IISc/NJ-02).

Il protocollo prevede la semina dei melanociti seguita dalla trasfezione dei plasmidi. Ulteriori passaggi includono la fissazione, l'immunocolorazione, l'imaging e l'analisi delle cellule per misurare la lunghezza e il numero di RE. La descrizione dettagliata del protocollo è riportata di seguito.
1. Semina di melanociti di topo su coverslip pretrattati
<ol><li>Rivestire le coperture di vetro in una capsula di Petri (cioè 4 - 5 in una parabola da 35 mm) con mezzo a matrice di membrana basale (1:20 in mezzo RPMI completo: RPMI + FBS inattivato al calore 10% + 1x glutammina + 1x miscela antibiotica) e asciugarlo nella cappa di coltura tissutale per 15 min. Lavare le coverslip una volta con 1x PBS prima dell'uso.</li>
	<li>Mantenere i melanociti di topo wild type (melan-Ink4a-Arf-1 da C57BL/6J, a/a, Topi Ink4a-Arf-/- , descritti in20 e disponibili presso The Welcome Trust Functional Genomics Cell Bank) in una capsula di Petri (cioè una capsula da 35 o 60 mm) integrata con un mezzo RPMI completo.<ol>
<li>Lavare le cellule due volte con 1x PBS e aggiungere 0,5 o 1 mL di soluzione di tripsina-EDTA (0,25%) per le cellule tripsinizzanti. Incubare le cellule a 37 °C per 2 - 5 minuti per il distacco dalla capsula di Petri.</li>
		<li>Aggiungere 1 - 2 ml di mezzo RPMI completo, sospendere e quindi trasferire le celle in un tubo centrifugo.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Centrifugare la sospensione cellulare a 4 °C, 376 x g per 5 minuti e quindi risospesere il pellet in 1x PBS.</li>
	<li>Ripetere la fase di centrifugazione e risospescere le celle in 1 mL di supporto RPMI completo.</li>
	<li>Seminare le cellule sulla membrana basale con coperture medie al 50-60% di confluenza (circa 6 x 105 cellule su una parabola di coltura cellulare di 35 mm contenente 4 - 5 coverslips). Aggiungere sempre 200 nM di PMA (aggiungere 5 μL di stock di lavoro 40 μM phorbol 12-myristate 13-acetato) alla sospensione cellulare placcata in mezzo RPMI completo.</li>
	<li>Dopo la semina, incubare la piastra a 37 °C per 12-24 ore.</li>
</ol>2. Trasfezione di cellule con i plasmidi STX13
<ol><li>Utilizzare i seguenti reagenti: pEGFP-C1-STX13WT e pEGFP-C1-STX13Δ129 (descritto in12). mCherry-Rab11, è stato un gentile dono di Graça Raposo, Institut Curie, Parigi (descritto nel riferimento19). Anticorpo Anti-TYRP1 di ATCC (TA99).</li>
	<li>Dopo 12 - 24 ore di semina, trasfettare le cellule con plasmidi utilizzando un reagente di trasfezione a base lipidica. Per un piatto da 35 mm, prelevare 5 μL del reagente di trasfezione in 250 μL di mezzo OPTI-MEM in un tubo microcentrifuga e prelevare circa 200 ng di ciascun plasmide in 250 μL di OPTI-MEM.</li>
	<li>Incubare le provette contenenti DNA e il reagente di trasfezione per 5 min. Miscelare senza pipettaggio ripetuto (il volume totale sarà di circa 500 μL). Incubare per 30 minuti a temperatura ambiente. Eseguire la picchiettatura manuale del tubo ogni 10 minuti per 30 minuti a RT.</li>
	<li>Durante l'incubazione, lavare le cellule due volte con 1x PBS, una volta con OPTI-MEM e quindi aggiungere 1 mL di OPTI-MEM alle cellule.</li>
	<li>Dopo 30 minuti di incubazione, aggiungere la miscela reagente-DNA di trasfezione alle cellule in modo goccioso coprendo il piatto.</li>
	<li>Incubare le cellule a 37 °C per 6 ore. Aspirare il mezzo OPTI-MEM con reagente di trasfezione e aggiungere un mezzo RPMI completo integrato con 200 nM di PMA.</li>
	<li>Incubare le cellule a 37 °C per 48 ore.</li>
</ol>3. Fissazione delle cellule
NOTA: La seguente procedura viene eseguita al di fuori del cappuccio di coltura del tessuto.
<ol><li>Dopo 48 ore di trasfezione, lavare le cellule due volte con 1x PBS e quindi fissare le cellule con il 3% di formaldeide (preparata al momento in 1x PBS) per 30 min.</li>
	<li>Dopo la fissazione, lavare le celle due volte con 1x PBS e conservare le coverslip in 1x PBS fino a nuovo utilizzo. In alternativa, le celle possono essere montate su vetrini (vedi sotto) o conservate a 4 °C.</li>
</ol>4. Immunocolorazione delle cellule
<ol><li>Preparare una camera umida: posizionare il pezzo tagliato con pellicola di paraffina su carta da filtro umida in una capsula di Petri, coperta con un foglio di alluminio.</li>
	<li>Preparare 25 μL di soluzione anticorpale primaria (0,2% di saponina in 1x PBS, 0,1% BSA in 1x PBS e 0,02% di sodio azide in 1x PBS). Aggiungere l'anticorpo ad una diluizione di 1:200. Aggiungere questa soluzione come goccia su un film di paraffina nella camera umida.</li>
	<li>Sollevare con attenzione il coperchio con una pinza, capovolgerlo su questa goccia di soluzione di colorazione anticorpale primaria e quindi coprire il coperchio della camera umida. Incubare a temperatura ambiente per 30 min.</li>
	<li>Allo stesso modo, preparare la soluzione anticorpale secondaria ad una diluizione di 1:500 e posizionarla su un film di paraffina accanto al coperchio nella camera umida. Per colorare il nucleo, aggiungere DAPI (da 1:20.000 a 1:30.000) alla soluzione.</li>
	<li>Usando una pinza, raccogliere con attenzione il coverslip dalla soluzione anticorpale primaria e immergerlo tre volte in 1x PBS (in un becher di vetro).</li>
	<li>Toccare il coperchio su carta velina per rimuovere il PBS in eccesso sul coperchio. Posizionarlo su una soluzione di colorazione anticorpale secondaria nella camera umida e non esporlo alla luce a causa della presenza di anticorpi marcati fluorescentemente nella soluzione.</li>
	<li>Incubare nuovamente il coverslip per 30 minuti a temperatura ambiente. Si prega di tenere sempre una nota sul lato del coverslip che ha le celle in questi passaggi.</li>
	<li>Dopo l'incubazione, prelevare con cura il coverslip dalla soluzione anticorpale secondaria e quindi immergerlo tre volte in 1x PBS. Inoltre, toccare il coperchio su carta velina per rimuovere il PBS in eccesso sul coperchio.</li>
	<li>Posizionare 12 μL di reagente di montaggio Fluoromount-G su un vetrino e posizionare con attenzione il coperchio colorato (rivolto verso il vetro) sul reagente di montaggio. Capovolgere il vetrino su carta velina e quindi premere delicatamente.</li>
</ol>5. Microscopia a fluorescenza delle cellule
<ol><li>Immagina le cellule colorate sotto i filtri a campo luminoso (BF) e a fluorescenza (IF) utilizzando un microscopio a fluorescenza invertita dotato di una telecamera CCD che utilizza un obiettivo apocromatico 60x (olio) o qualsiasi altro microscopio con una configurazione simile.</li>
</ol>6. Quantificazione della sovrapposizione tra le proteine localizzate RE e i melanosomi:
NOTA: Per la quantificazione del coefficiente di sovrapposizione di Mander tra le proteine si seguono i seguenti passaggi (scaricabili gratuitamente dal link: https://imagej.net/software/fiji/). Utilizzare l'immagine TIFF con più canali.
<ol><li>
Aprite l'immagine raw. Vai all'opzione Immagine, seleziona Colore | Dividere i canali e utilizzare i due canali per l'analisi.</li>
	<li>Apri il plugin JACoP nell'opzione Plugin.</li>
	<li>Impostare la soglia per entrambi i canali in modo che tutti i punti luminosi siano selezionati e lo sfondo venga eliminato.</li>
	<li>Vai all'opzione Analisi, seleziona i coefficienti M1 e M2 per ottenere il coefficiente di sovrapposizione di Mander.</li>
	<li>Premi l'opzione Analizza nel plugin JACoP e vedi il risultato che visualizza il coefficiente di sovrapposizione di Mander.</li>
</ol>7. Quantificazione del numero tubolare e della lunghezza degli endosomi riciclati:
NOTA: I seguenti passaggi sono seguiti per la quantificazione del numero e della lunghezza dei tubuli utilizzando il software Fiji.
<ol><li>Apri l'opzione Vai all'immagine raw, seleziona Colore | Dividere i canali e utilizzare il canale desiderato per l'analisi.</li>
	<li>Vai di nuovo a Immagine , seleziona Tipo | Converti in immagine a 8 bit.</li>
	<li>Quindi vai su Plugin, seleziona Analizza | Tubosità. Impostare il valore sigma su 0,1075 . Premere OK.</li>
	<li>Vai di nuovo a Immagine , seleziona Tipo | Converti in immagine a 8 bit.</li>
	<li>Vai a | immagine Regolare | Soglia (Utilizzare gli stessi valori di soglia per tutte le immagini. Le immagini dovrebbero avere un'intensità approssimativamente uguale).</li>
	<li>Vai a | processo | binario Converti in maschera.</li>
	<li>Vai a Processo, seleziona Binario e quindi seleziona Scheletra.</li>
	<li>Andare su Analizza, selezionare Ossatura e scegliere Analizza ossatura. Nel risultato e nell'output | selezionare (a) Calcola il percorso più corto più grande | (b) mostra informazioni dettagliate | (c) visualizza lo scheletro etichettato. Premere OK. NOTA: il risultato verrà aperto nel formato tabulato. La colonna di Lunghezza media del ramo mostra la lunghezza di tutti i diversi tubuli nella cella selezionata (scala impostata per ottenere valori in micrometri).</li>
	<li>Per ottenere il numero di tubuli nella cella, andare su Analizza e selezionare l'opzione Analizza particella . Premere OK. NOTA: nei risultati ottenuti, la colonna conteggio mostra il numero di tubuli in quella particolare cella.</li>
	<li>Salva i dati e analizzali.</li>
</ol>

<ol><li>Dell'Angelica, E. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+building+BLOC%28k%29s+of+lysosomes+and+related+organelles%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Opinion+in+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">The building BLOC(k)s of lysosomes and related organelles.</a> Current Opinion in Cell Biology. 16 (4), 458-464 (2004).</li>
<li>Raposo, G., Marks, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Melanosomes--dark+organelles+enlighten+endosomal+membrane+transport%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Reviews+in+Molecular+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Melanosomes--dark organelles enlighten endosomal membrane transport.</a> Nature Reviews in Molecular Cell Biology. 8 (10), 786-797 (2007).</li>
<li>Ohbayashi, N., Fukuda, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recent+advances+in+understanding+the+molecular+basis+of+melanogenesis+in+melanocytes%5BTitle%5D)+AND+%22F1000Research%22%5BJournal%5D)">Recent advances in understanding the molecular basis of melanogenesis in melanocytes.</a> F1000Research. 9, F1000 Faculty Rev-608 (2020).</li>
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<li>Shakya, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rab22A+recruits+BLOC-1+and+BLOC-2+to+promote+the+biogenesis+of+recycling+endosomes%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+Reports%22%5BJournal%5D)">Rab22A recruits BLOC-1 and BLOC-2 to promote the biogenesis of recycling endosomes.</a> EMBO Reports. 19 (12), 45918(2018).</li>
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</ol>

Gli autori dichiarano di non avere alcun conflitto di interessi.

Gli endosomi di riciclaggio sono una coorte di organelli endocitici e mediano il riciclaggio del carico sulla superficie cellulare in tutti i tipi di cellule21,22,23,24,25. In tipi di cellule specializzate come i melanociti, questi organelli deviano in parte la loro rotta di traffico verso i melanosomi per la loro biogenesi3,16,26....

La biosintesi dei pigmenti di melanina si verifica nei melanosomi, un organello correlato al lisosoma specifico per i melanociti (LRO) che coesiste con i lisosomi convenzionali. Il sistema endocitico svolge un ruolo chiave nella biogenesi dei melanosomi, necessari per il colore della pelle e la fotoprotezione contro le radiazioni ionizzanti1,2,3. Durante questo processo, gli enzimi di sintesi della melanina vengono smistati su endosomi precoci / di selezione e quindi trasportati a melanosomi prematuri attraverso endosomi tubulari o vescicolari chiamati endosomi di riciclaggio (RE)4,5,6,7,8,9,10. Il targeting e la fusione di questi organelli regolano la maturazione dei melanosomi pigmentati completamente funzionali7,11,12,13,14. Difetti nella formazione di questi organelli o nella selezione del carico a questi organelli causano albinismo oculocutaneo e altri fenotipi clinici, osservati nella sindrome di Hermansky-Pudlak15,16.
Qui descriviamo una semplice tecnica basata sulla microscopia per studiare e analizzare i RE. In questo metodo, abbiamo sfruttato una proteina transmembrana, Qa-SNARE Syntaxin (STX)13 che risiede sul riciclaggio degli endosomi17 e cicli tra endosomi di selezione e melanosomi nei melanociti12,18. Inoltre, la delezione del dominio normativo non strutturato N-terminale (vale a dire SynN o STX13Δ129) consente allo SNARE di rimanere bloccato nei melanosomi, che misura la via di traffico in avanti verso il melanosoma12. Abbiamo utilizzato un noto marcatore endosomiale di riciclaggio Rab GTPasi (Rab)11 nei nostri studi14,19. L'imaging a fluorescenza delle proteine GFP-STX13WT, GFP-STX13Δ129, mCherry-Rab11 e TYRP1 nei melanociti wild type seguito dalla quantificazione della loro localizzazione relativa fornirà la natura e la dinamica delle RE oltre al loro targeting ai melanosomi. Pertanto, questa è una tecnica semplice che può essere utilizzata per visualizzare e misurare la dinamica delle RE nei melanociti.

<table><tbody><tr><td>anticorpo anti-TYRP1 (TA99)</td><td>ATCC</td><td>HB-8704</td><td></td></tr><tr><td>Fluoromount-G</td><td>Southern Biotech</td><td>0100-01</td><td></td></tr><tr><td>Lipofectamine 2000</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>11668-500</td><td></td></tr><tr><td>Matrice Matrigel</td><td>BD Biosciences</td><td>356231</td><td></td></tr><tr><td>OPTI-MEM</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>022600-050</td><td></td></tr><tr><td>Phorbol 12- miristato 13-acetato</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P8139</td><td></td></tr><tr><td>RPMI Medium 1640</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>31800-022</td><td></td></tr></tbody></table>

il test basato sulla microscopia per studiare e analizzare gli endosomi di riciclaggio utilizzando il traffico di snare

The Microscopy-Based Assay to Study and Analyze the Recycling Endosomes using SNARE Trafficking

Gli endosomi di riciclaggio (RE) sono organelli tubolari-vescicolari generati da endosomi precoci / di selezione in tutti i tipi di cellule. Questi organelli svolgono un ruolo chiave nella biogenesi dei melanosomi, un organello correlato al lisosoma prodotto dai melanociti. Le RE trasportano il carico specifico dei melanociti ai melanosomi prematuri durante la loro formazione. Il blocco nella generazione di RE, osservato in diversi mutanti della sindrome di Hermansky-Pudlak, provoca ipopigmentazione di pelle, capelli e occhi. Pertanto, studiare la dinamica (riferirsi a numero e lunghezza) delle RE è utile per comprendere la funzione di questi organelli in condizioni normali e di malattia. In questo studio, miriamo a misurare la dinamica RE utilizzando uno SNARE STX13 residente.

Quantificazione della localizzazione mutante STX13Δ129 ai melanosomi La microscopia a immunofluorescenza di STX13 in melanociti wild type di topo ha mostrato GFP-STX13WT localizzato come strutture vescicolari e tubulari e GFP-STX13Δ129 localizzato come strutture ad anello oltre alla superficie cellulare (Figura 1A). Inoltre, il GFP-STX13Δ129 ad anello intracellulare ha mostrato colocalizzazione ...

Gli endosomi di riciclaggio fanno parte della rete tubulare endosomiale. Qui presentiamo un metodo per quantificare le dinamiche del riciclaggio degli endosomi utilizzando GFP-STX13 come marcatore di organelli.

Il test basato sulla microscopia per studiare e analizzare gli endosomi di riciclaggio utilizzando il traffico di SNARE

Recycling endosomes (REs) are tubular-vesicular organelles generated from early/sorting endosomes in all cell types. These organelles play a key role in ...

Il test basato sulla microscopia per studiare e analizzare gli endosomi di riciclaggio utilizzando il traffico SNARE. Questi sono melanociti della pelle. Gli organelli di colore nero che si vedono all'interno delle cellule sono chiamati melanosomi.I melanosomi sono noti come una classe di organelli chiamati organelli correlati al lisozoma o LRO. Gli endosomi di riciclaggio sono organelli vescicolari tubolari da endosomi precoci o di smistamento in tutti i tipi di cellule. Questi organelli svolgono un ruolo chiave nella biogenesi dei melanosomi, un organello correlato al lisozoma prodotto dai melanociti.Gli endosomi riciclati trasportano il carico specifico dei melanociti ai melanosomi prematuri durante la loro formazione. la generazione di endosomi riciclati osservata in diverse sindromi è cellule in iperpigmentazione di pelle, capelli e occhi. Pertanto, studiare le dinamiche del riciclaggio degli endosomi è utile per comprendere la funzione di questi organelli in condizioni normali e di malattia.Questo studio mira a misurare le dinamiche degli endosomi di riciclaggio utilizzando la sintassi SNARE di arresto in-13. Il primo passo è la semina di melanociti di topo su coverslip pre-t

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Abbiamo sviluppato un saggio fusione cellulare che quantifica SNARE mediati eventi di fusione della membrana mediante espressione di β-attivato galattosidasi.

Analisi delle SNARE-mediata fusione della membrana L&#39;utilizzo di un test enzimatico fusione cellulare

Il traffico di membrana comporta il trasporto di proteine dalla membrana plasmatica all'interno della cellula (cioè endocitosi) seguito dal traffico ai lisosomi per la degradazione o alla membrana plasmatica per il riciclaggio. I metodi descritti in questo articolo sono progettati per studiare l'endocitosi e il riciclaggio delle proteine della membrana plasmatica.

La base di Cell-L-Glutatione Protezione saggi per studiare endocitosi e riciclo dei Plasma proteine ​​di membrana

Traffico Receptor modula la segnalazione e la cellula di risposta ai ligandi ed è, a sua volta, sensibile alle condizioni di cellulari, tra cui la segnalazione ligando-indotta. Qui, descriviamo una tecnica potente e flessibile per la valutazione quantitativa farmaco-indotta traffico recettoriale utilizzando immunomarcatura e analisi colocalizational.

Rilevamento delle modifiche droga indotte recettore post-internalizzazione Tratta di Analisi Colocalizational

L'indagine sul traffico di membrana è fondamentale per la comprensione delle funzioni neuronali. Qui introduciamo un metodo per quantificare la motilità della vescicola nei neuroni. Questo è un metodo conveniente che può essere adattato alla quantificazione del traffico di membrana nel sistema nervoso.

Quantificazione delle endosomi e dei motivi di lisosomi nei neuroni coltivati ​​utilizzando sonde fluorescenti

Endocitosi delle vescicole sinaptiche sono rilevato da microscopia chiara di pHluorin fuso con proteine delle vescicole sinaptiche e da microscopia elettronica dell'assorbimento della vescicola.

Endocitosi delle vescicole sinaptiche in colture di neuroni ippocampali di misura

Questo protocollo descrive un nuovo metodo che consente la visualizzazione quantitativa della formazione di complessi di proteine SNARE, basato sul trasferimento di energia per risonanza e la durata di fluorescenza imaging microscopia.

Visualizing intracellulare rullante traffico da fluorescenza Lifetime Imaging microscopia

Descriviamo un test ottico per vescicole sinaptiche (SV) riciclaggio in colture di neuroni. Combinando questo protocollo con doppia transfezione di esprimere un marcatore presinaptica e la proteina di interesse ci permette di individuare siti presinaptici, loro delle vescicole sinaptiche capacità di riciclaggio e di determinare il ruolo della proteina di interesse.

Un test ottico per riciclo delle vescicole sinaptiche in colture di neuroni che Overexpressing proteine presinaptiche

Fagosoma, la rimozione fagocitica delle cellule apoptotiche, è necessaria per mantenere l'omeostasi ed è facilitata dalla recettori e vie di segnalazione che consentono il riconoscimento, il engulfment e interiorizzazione delle cellule apoptotiche. Qui, presentiamo un protocollo di microscopia di fluorescenza per la quantificazione del fagosoma e l'attività delle vie di segnalazione efferocytic.

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Eccitabilità di un neurone può essere modulata attraverso un processo dinamico di endo - ed esocitosi dei ricevitori ionotropici eccitanti del glutammato. Descritto qui è un test accessibile, ad alto contenuto per la quantificazione del recettore di superficie e interno popolazione piscine.

Un'analisi ad alto contenuto per monitoraggio AMPA traffico recettoriale

Il trasporto endocitico e retrogrado delle proteine dalla membrana plasmatica alla rete trans-Golgi è essenziale per mantenere l'omeostasi della membrana e regolare la segnalazione. Qui, descriviamo un metodo per visualizzare e quantificare il trasporto endocitico di proteine cargo transmembrana mediante microscopia su cellule vive utilizzando nanocorpi anti-GFP derivatizzati in cellule HeLa.

Imaging con cellule vive del trasporto endocitico utilizzando nanocorpi funzionalizzati in cellule in coltura

Scopri l'assaggio a microscopia per analizzare gli endosomi di riciclaggio nel traffico SNARE utilizzando melanociti murini. Questo metodo aiuta a studiare la biogenesi dei melanosomi e i meccanismi della pigmentazione cutanea.

Il test basato sulla microscopia per studiare e analizzare gli endosomi di riciclaggio utilizzando il traffico di SNARE

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