Name: Approcci di fenotipizzazione su più fronti per caratterizzare gli apparati radicali della canna da zucchero (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2022-08-17T13:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 21 s
Description: Esplora approcci di fenotipizzazione multipli per caratterizzare gli apparati radicali della canna da zucchero. Questo metodo integra tecniche di estrazione e imaging digitale per migliorare le strategie di coltivazione e selezione.

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1. Scavo in campo mediante campionamento di trincee
<ol>
	<li>Allevare ibridi di canna da zucchero commerciali (di seguito chiamati "varietà") sul campo da due germogli piantati a una distanza tra le file di 120 cm, con 90 cm all'interno delle file, seguendo il pacchetto di pratiche raccomandate (POP) per garantire un buon insediamento e una buona crescita delle colture.</li>
	<li>Al termine della fase di maturazione della coltura, impiegare un escavatore per scavare una trincea (profonda 1,5 m e larga 1,0 m) in campo. Attraverso un getto d'acqua continuo, assicurarsi che i terreni dalle zone delle radici vengano ripuliti senza danneggiare le radici (Figura 1).</li>
	<li>Quando il terreno aderente si allenta, sradica la canna insieme all'apparato radicale e portala in laboratorio per la misurazione manuale del numero di radici, della lunghezza, del volume e del peso delle radici.</li>
</ol>
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig01.jpg"> 
Figura 1: Metodo di campionamento della trincea per lo scavo sul campo delle radici. (A) Trincea scavata lateralmente lungo il campo, (B) getto d'acqua e (C) vista interna che mostra la profondità della trincea. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig01large.jpg" target="_blank">Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
2. Campionatore di carote di radice per ridurre gli errori di campionamento
<ol>
	<li>Utilizzare un campionatore cilindrico di carote di radice di 61 cm di altezza e 16 cm di diametro del peso di 8 kg, fabbricato utilizzando materiale in acciaio dolce (MS) per il campionamento delle radici di canna da zucchero sul campo. Fornire un bordo affilato sul bordo inferiore del campionatore per facilitare la penetrazione durante l'inserimento nel terreno. Dotare la parte superiore di collari di 3 cm di diametro per sollevare il campionatore (Figura 2).</li>
	<li>Alleva varietà di canna da zucchero sul campo da due germogli piantati a una distanza tra le file di 120 cm, con 90 cm all'interno delle file, seguendo il POP raccomandato per garantire un buon insediamento e crescita delle colture.</li>
	<li>Nella fase di maturità della coltura, fissare il bordo superiore del campionatore al germoglio primario/canna e martellare continuamente per raggiungere la profondità di terreno desiderata (45 cm). Sollevare l'intera massa di terreno nel campionatore e lavarla accuratamente sotto l'acqua corrente per separare le radici aderenti.</li>
	<li>Dopo un accurato lavaggio delle radici, registrare il volume, la superficie, la lunghezza e il peso mediante misurazione manuale, nonché stendendo le radici su vassoi trasparenti per scansionare e analizzare le immagini digitalizzate corrispondenti utilizzando il software di riferimento (vedere la Tabella dei materiali).</li>
</ol>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig02.jpg"> 
Figura 2: Campionatore del nucleo radice. (A) Dimensioni, (B) vista dall'alto e (C) sito di campionamento. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig02large.jpg" target="_blank">Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
3. Struttura di fenotipizzazione radicale per facilitare il campionamento in diverse fasi fenodinamiche
<ol>
	<li>Costruire una struttura di fenotipizzazione radicale comprendente tre compartimenti adiacenti di dimensioni 4,5 m x 10,1 m per il campionamento delle radici della canna da zucchero, con disposizioni per lo smantellamento manuale delle pareti laterali per rivelare l'apparato radicale sotterraneo (fino a una profondità di 80-100 cm) (Figura 3). Costruire le pareti laterali con lastre prefabbricate di dimensioni 1,8 m di lunghezza, 30 cm di larghezza e 4 cm di spessore.</li>
	<li>Riempire e compattare la struttura con terra di campo, lasciando uno spazio di testa di ~20 cm, con adeguati fori di drenaggio per facilitare l'aerazione del terreno.</li>
	<li>Semina i frammenti di gemme di cloni di germoplasma comprendenti Saccharum officinarum L., Saccharum spontaneum L., Saccharum barberi Jesw., Saccharum sinense Roxb. e Saccharum robustum Brandes e Jeswiet ex Grassl. (di seguito denominati "cloni di Saccharum spp.") e lasciarli germogliare per 30 giorni in protray costituiti da mezzi di radicazione (terra rossa: letame da cortile: sabbia = 2:2:1). Trapiantare sedimenti uniformi e sani nella struttura a una distanza tra le file di 90 cm, con 60 cm all'interno delle file, seguendo il POP raccomandato per garantire un buon insediamento e crescita delle colture.</li>
	<li>Durante le fasi di formazione (60-120 giorni dopo l'impianto [DAP]) e di grande crescita (120-150 DAP), rimuovere manualmente le pareti laterali costituite dalle lastre prefabbricate, seguita da una spruzzatura continua del getto d'acqua per esporre le radici.</li>
	<li>Sradicare l'intero apparato radicale e portarlo in laboratorio per la misurazione manuale della lunghezza, del volume e del peso, e stendere le radici su vassoi trasparenti per scansionare e analizzare le immagini digitalizzate corrispondenti nel software di riferimento (vedere la Tabella dei materiali).</li>
	<li>Imporre lo stress da siccità trattenendo l'irrigazione in uno dei compartimenti e tappare i fori di drenaggio nel secondo scomparto per mantenere la saturazione del suolo per simulare lo stress da ristagno idrico. Irrigare il terzo scomparto secondo il POP consigliato per mantenere la capacità del campo e fungere da controllo.</li>
</ol>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig03.jpg"> 
Figura 3: Struttura della fenotipizzazione radice. (A) Dimensioni, (B) panoramica dei tre compartimenti e (C) vista di un compartimento. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig03large.jpg" target="_blank">Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
4. Coltura idroponica delle piante per studiare la biologia della rizosfera
<ol>
	<li>Fabbricare un sistema idroponico interno in una serra a ambiente controllato favorevole alla coltivazione della canna da zucchero per studiare i dettagli più fini della biologia delle radici. Aggiungere ~15 L di soluzione nutritiva di Hoagland modificata (Tabella 1) a vasche di vetro di dimensioni 20 cm x 20 cm x 50 cm, con aerazione fornita da pompe per acquari (Figura 4).</li>
	<li>Semina i trucioli di gemme delle varietà di canna da zucchero e dei cloni di Saccharum spp. e lasciali germogliare per 30 giorni in protray costituiti da midollo di cocco compostato. Trapiantare sedimentazioni uniformi e sane in vasche idroponiche con la frequenza di tre sedimentazioni per vasca, avendo cura di posizionare l'intera radice nella soluzione nutritiva. Coprire i serbatoi con un panno nero per assicurarsi che le radici non siano esposte alla luce. Usa una rete di plastica (20 cm x 20 cm) sull'orlo dei serbatoi di vetro per sostenere le piante in posizione verticale.</li>
	<li>Al termine della fase di germinazione (60 giorni), raccogliere gli essudati radicali immergendo le radici delle piante intatte in 50 mL di soluzione trappola (acqua sterile a doppia distillazione) per 4 ore (da 0800 h a 1200 h) durante il periodo di picco dell'attività fotosintetica. Filtrare la soluzione raccolta con carta da filtro Whatman, quindi farla passare attraverso colonne di vetro riempite con resine a scambio anionico seguite da resine a scambio cationico12. Far evaporare le frazioni eluite a secco e conservare a -20 °C fino a nuova lavorazione.</li>
	<li>Analizzare i campioni di essudato radicale trattati mediante HPLC per la determinazione degli acidi organici12 e mediante spettrofotometria per la stima dei fenoli totali13, delle proteine14, degli zuccheri15 e degli amminoacidi16 secondo il protocollo standard.</li>
	<li>Monitora la crescita delle radici a intervalli settimanali per registrare la pigmentazione della punta della radice e la densità dei peli delle radici. Valutare l'attività degli enzimi, perossidasi17 e superossido dismutasi18, e il contenuto fenolico totale19 al 3° mese secondo il protocollo standard.</li>
	<li>Valutare la risposta alla lesione radicolare infliggendo una fetta longitudinale nella radice primaria fino alla punta della radice utilizzando una lama chirurgica sterile e monitorare periodicamente i cambiamenti.</li>
</ol>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Chimico</td>
			<td>Concentrazione finale</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nitrato di potassio</td>
			<td>0,608 grammi· L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nitrato di calcio</td>
			<td>1.415 grammi· L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Diidrogeno fosfato di potassio</td>
			<td>0,164 grammi· L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Solfato di magnesio</td>
			<td>0,560 grammi· L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>EDTA-sale monosodico ferrico</td>
			<td>6,00 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acido borico</td>
			<td>1,43 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cloruro di manganese tetraidrato</td>
			<td>0,91 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Solfato di zinco</td>
			<td>0,11 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Supfato rameico</td>
			<td>0,04 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acido molibdico</td>
			<td>0,01 g250L-1</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>
Tabella 1: Composizione della soluzione nutritiva modificata per la coltura idroponica della canna da zucchero.
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig04.jpg"> 
Figura 4: Impianto idroponico. La configurazione (A) personalizzata per la coltivazione di canna da zucchero e (B) per il raccolto di 5 mesi (panno nero rimosso solo a scopo fotografico). Questa cifra è stata modificata da Hari et al.9. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig04large.jpg" target="_blank">Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>

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<li>Arruda, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biological+and+morphological+traits+of+sugarcane+roots+in+relation+to+phosphorus+uptake%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Soil+Science+and+Plant+Nutrition%22%5BJournal%5D)">Biological and morphological traits of sugarcane roots in relation to phosphorus uptake.</a> Journal of Soil Science and Plant Nutrition. 16 (4), 901-915 (2016).</li>
<li>Sharma, S., Borah, P., Meena, M. K., Bindraban, P., Pandey, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+genotypic+variation+for+growth+of+rice+seedlings+under+optimized+hydroponics+medium%5BTitle%5D)+AND+%22Indian+Journal+of+Genetics+and+Plant+Breeding%22%5BJournal%5D)">Evaluation of genotypic variation for growth of rice seedlings under optimized hydroponics medium.</a> Indian Journal of Genetics and Plant Breeding. 78 (3), 292-301 (2018).</li>
<li>Soumya, P. R., Singh, D., Sharma, S., Singh, A. M., Pandey, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+diverse+wheat+%28Triticum+aestivum%29+and+triticale+%28%C3%97+Triticosecale%29+genotypes+for+low+phosphorus+stress+tolerance+in+soil+and+hydroponic+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Soil+Science%22%5BJournal%5D)">Evaluation of diverse wheat (Triticum aestivum) and triticale (× Triticosecale) genotypes for low phosphorus stress tolerance in soil and hydroponic conditions.</a> Journal of Soil Science. 21, 1236-1251 (2021).</li>
<li>Ganie, A. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metabolite+profiling+and+network+analysis+reveal+coordinated+changes+in+low-N+tolerant+and+low-N+sensitive+maize+genotypes+under+nitrogen+deficiency+and+restoration+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Plants%22%5BJournal%5D)">Metabolite profiling and network analysis reveal coordinated changes in low-N tolerant and low-N sensitive maize genotypes under nitrogen deficiency and restoration conditions.</a> Plants. 9 (11), 1459(2020).</li>
<li>Venkatraman, T. S., Thomas, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simple+contrivances+for+studying+root+development+in+agricultural+crops%5BTitle%5D)+AND+%22Agricultural+Journal+of+India%22%5BJournal%5D)">Simple contrivances for studying root development in agricultural crops.</a> Agricultural Journal of India. 18, 509-514 (1923).</li>
<li>Clark, R. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+two-dimensional+root+system+phenotyping+platform+facilitates+genetic+analysis+of+root+growth+and+development%5BTitle%5D)+AND+%22Plant%2C+Cell+and+Environment%22%5BJournal%5D)">High-throughput two-dimensional root system phenotyping platform facilitates genetic analysis of root growth and development.</a> Plant, Cell and Environment. 36 (2), 454-466 (2013).</li>
<li>Chopart, J. L., Rodrigues, S. R., Azevedo, M. C. B., Medina, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Estimating+sugarcane+root+length+density+through+root+mapping+and+orientation+modelling%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+and+Soil%22%5BJournal%5D)">Estimating sugarcane root length density through root mapping and orientation modelling.</a> Plant and Soil. 313, 101-112 (2008).</li>
<li>Chopart, J. L., Azevedo, M. C. B., Le Mezo, L., Marion, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Functional+relationship+between+sugarcane+root+biomass+and+length+for+cropping+system+applications%5BTitle%5D)+AND+%22Sugar+Tech%22%5BJournal%5D)">Functional relationship between sugarcane root biomass and length for cropping system applications.</a> Sugar Tech. 12 (3-4), 317-321 (2010).</li>
<li>De Silva, A. L. C., De Costa, W. A. J. M., Bandara, D. M. U. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Growth+of+root+system+and+the+patterns+of+soil+moisture+utilization+in+sugarcane+under+rain-fed+and+irrigated+conditions+in+Sri+Lanka%5BTitle%5D)+AND+%22Sugar+Tech%22%5BJournal%5D)">Growth of root system and the patterns of soil moisture utilization in sugarcane under rain-fed and irrigated conditions in Sri Lanka.</a> Sugar Tech. 13 (3), 198-205 (2011).</li>
<li>Otto, R., Silva, A. P., Franco, H. C. J., Oliveira, E. C. A., Trivelin, P. C. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+soil+penetration+resistance+reduces+sugarcane+root+system+development%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+and+Tillage+Research%22%5BJournal%5D)">High soil penetration resistance reduces sugarcane root system development.</a> Soil and Tillage Research. 117, 201-210 (2011).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Pompa di aerazione con accessori per tubazioni</td><td>Acquistato da fonti locali</td><td>NA</td><td>Utilizzato per la coltura idroponica della canna da zucchero</td></tr><tr><td>Acido borico</td><td>Laboratori di ricerca Sisco, India</td><td>80266</td><td>Preparazione della soluzione di Hoagland modificata</td></tr><tr><td>Nitrato di calcio</td><td>Casa Centrale della Droga, India</td><td>27606</td><td>Preparazione della soluzione di Hoagland modificata</td></tr><tr><td>midollo di cocco compostato</td><td>Acquistato da fonti locali</td><td>NA</td><td>Utilizzato per la germinazione di cubetti di canna da zucchero</td></tr><tr><td>Solfato rameico</td><td>Laboratori di ricerca Sisco, India</td><td>38869</td><td>Preparazione della soluzione di Hoagland modificata</td></tr><tr><td>DEAE-cellulosa</td><td>Laboratori di ricerca Sisco, India</td><td>10529</td><td>Resina a scambio anionico per la lavorazione degli essudati radicali</td></tr><tr><td>EDTA-sale monosodico ferrico</td><td>Laboratori di ricerca Sisco, India</td><td>59389</td><td>Preparazione della soluzione di Hoagland modificata</td></tr><tr><td>Letame da cortile</td><td>Acquistato da fonti locali</td><td>NA</td><td>Utilizzato per la germinazione di cubetti di canna da zucchero</td></tr><tr><td>Serbatoi in vetro</td><td>Fabbricato internamente</td><td>NA</td><td>Utilizzato per la coltura idroponica della canna da zucchero</td></tr><tr><td>per HPLC</td><td>Tecnologie Agilent</td><td>1200 Infinito</td><td>Quantificazione degli acidi organici negli essudati radicali</td></tr><tr><td>Solfato di magnesio</td><td>Laboratori di ricerca Sisco, India</td><td>29117</td><td>Preparazione della soluzione di Hoagland modificata</td></tr><tr><td>Cloruro di manganese</td><td>Laboratori di ricerca Sisco, India</td><td>75113</td><td>Preparazione della soluzione di Hoagland modificata</td></tr><tr><td>Acido molibdico</td><td>Laboratori di ricerca Sisco, India</td><td>49664</td><td>Preparazione della soluzione di Hoagland modificata</td></tr><tr><td>Diidrogeno fosfato di potassio</td><td>Casa Centrale della Droga, India</td><td>29608</td><td>Preparazione della soluzione di Hoagland modificata</td></tr><tr><td>Nitrato di potassio</td><td>Casa Centrale della Droga, India</td><td>29638</td><td>Preparazione della soluzione di Hoagland modificata</td></tr><tr><td>Protrays</td><td>Fabbricato internamente</td><td>NA</td><td>Utilizzato per la germinazione di cubetti di canna da zucchero</td></tr><tr><td>Terra rossa</td><td>Acquistato da fonti locali</td><td>NA</td><td>Utilizzato per la germinazione di cubetti di canna da zucchero</td></tr><tr><td>Campionatore di carote di radice</td><td>Fabbricato internamente</td><td>NA</td><td>Utilizzato per il campionamento radicolare in situ</td></tr><tr><td>Sabbia</td><td>Acquistato da fonti locali</td><td>NA</td><td>Utilizzato per la germinazione di cubetti di canna da zucchero</td></tr><tr><td>Seralite-120</td><td>Laboratori di ricerca Sisco, India</td><td>14891</td><td>resina a scambio cationico per la lavorazione degli essudati radicali</td></tr><tr><td>Telaio di supporto</td><td>Acquistato da fonti locali</td><td>NA</td><td>Utilizzato per la coltura idroponica della canna da zucchero</td></tr><tr><td>Motopompa dell'acqua</td><td>Acquistato da fonti locali</td><td>NA</td><td>Utilizzato per la coltura idroponica della canna da zucchero</td></tr><tr><td>Carta da filtro Whatman grado 1</td><td>Universale Scientifico</td><td>1001090</td><td>Trattamento degli essudati radicali</td></tr><tr><td>WinRhizo PRO (software)</td><td>Regent Instruments Inc., Canada</td><td>STD4800</td><td>Root scanner bidimensionale con software per l'analisi delle radici</td></tr><tr><td>Solfato di zinco</td><td>Laboratori di ricerca Sisco, India</td><td>76455</td><td>Preparazione della soluzione di Hoagland modificata</td></tr></tbody></table>

approcci di fenotipizzazione su più fronti per caratterizzare gli apparati radicali della canna da zucchero

Multipronged Phenotyping Approaches to Characterize Sugarcane Root Systems

Variazione dei caratteri morfologici radicali delle varietà di canna da zucchero Immagini rappresentative dell'apparato radicale in Co 62175, scavato dal campo mediante campionamento in trincea e coltivato in una configurazione idroponica, sono presentate nella Figura 5A, B. Radici lunghe (~100 cm) sono state osservate nelle varietà Co 62175 e Co 99006, mentre Co 99006 ha registrato il peso radicale più elevato (127 g·ciuffo-1). I tratti radico...

Approcci di fenotipizzazione su più fronti per caratterizzare gli apparati radicali della canna da zucchero

Roots are the primary conductors of water and nutrients and play a vital role in sustaining growth and yield under stressful environments. The study of ...

multipronged-phenotyping-approaches-to-characterize-sugarcane-root

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Questo protocollo descrive un procedimento per la rapida raccolta di immagini di piantine di Arabidopsis rispondono ad uno stimolo gravità utilizzando commercialmente disponibili scanner piani. Il metodo consente di poco costoso, ad alto volume cattura di immagini ad alta risoluzione possono essere sindacate per algoritmi di analisi a valle.

Utilizzo di Scanner Flatbed per la raccolta ad alta risoluzione e ritardi Immagini della Arabidopsis Root gravitropica risposta

In questo articolo viene illustrato come Arabidopsis thaliana semenzali in una piattaforma di due-strato microfluidici che limita la radice principale e peli radicali per un singolo piano ottico della coltura. Questa piattaforma può essere utilizzata per imaging ottico in tempo reale della morfologia di radice bene anche per quanto riguarda imaging ad alta risoluzione con altri mezzi.

La morfologia dei capelli di radice di semenzali di Arabidopsis in una piattaforma di Microfluidic di due-strato di imaging

Un protocollo sperimentale è presentato per la valutazione del terreno coltivato pianta radice sistemi con RGB e l'imaging iperspettrale. Combinazione di tempo di immagine RGB serie con chemiometrica informazioni da iperspettrale scansioni ottimizza intuizioni nelle dinamiche di radice di pianta.

RGB e Imaging spettrale radice per pianta Phenotyping e ricerca fisiologica: messa a punto sperimentale e protocolli di Imaging

Un sistema di analisi di immagine basata su software fornisce un metodo alternativo per studiare la morfologia delle specie stolonifere o rizomatosa. Questo protocollo permette la misurazione della lunghezza e del diametro di stoloni e rizomi e può essere applicato a campioni con una grande quantità di biomassa e di un'ampia varietà di specie.

Misurazione di stoloni e rizomi di agrotecniche utilizza un sistema di analisi di immagine digitale

Mettiamo a disposizione un nuovo metodo per migliorare il contrasto di assorbimento di raggi x del mais tessuto adatto per l'esame di tomografia microtomografia ordinaria. Basato sulle immagini di CT, introduciamo una serie di flussi di lavoro di elaborazione delle immagini per diversi materiali mais per estrarre efficacemente microscopici fenotipi dei fasci vascolari del mais.

Micron-scala Phenotyping tecniche di mais fasci vascolari basato su x-Ray Microcomputed Tomography

Visualizzazione e misurazione radice crescita in situ è estremamente impegnativo. Presentiamo un metodo rhizobox personalizzabile per tracciare lo sviluppo delle radici e la proliferazione nel tempo in risposta all'arricchimento in nutrienti. Questo metodo viene utilizzato per analizzare le differenze genotipiche mais nella plasticità di radice in risposta a una fonte di azoto organico.

Un protocollo di Rhizobox ottimizzato per visualizzare la crescita delle radici e tempi di risposta alle sostanze nutrienti localizzate

Parasponia andersonii è un albero tropicale in rapida crescita che appartiene alla famiglia Cannabis (Cannabaceae) e può formare noduli di radice che fissano l'azoto in associazione con il rizobium. Qui, descriviamo un protocollo dettagliato per le analisi genetiche inverse in P. andersonii basato su Agrobacterium tumefaciens- mediato trasformazione stabile e modifica del genoma CRISPR/Cas9.

Trasformazione, editing del genoma e fenotipizzazione dell'azoto-fixing Tropical Cannabaceae Tree Parasponia andersonii

Il protocollo qui descrive i metodi per la valutazione dei modelli di colonizzazione micorrizica arbuscolare e la strategia nelle radici per due specie: Zea mays e Festuca rubra. L'uso del metodo MycoPatt consente il calcolo dei parametri, la conversione delle strutture micorriziche in dati digitali e la mappatura della loro posizione reale nelle radici.

Mappe micorriziche come strumento per esplorare i modelli di colonizzazione e le strategie fungine nelle radici di Festuca rubra e Zea mays

Utilizziamo semplici strumenti di laboratorio per esaminare l'architettura del sistema di root (RSA) di Arabidopsis e Medicago. Le piantine vengono coltivate idroponicamente su rete e distribuite usando un pennello artistico per rivelare la RSA. Le immagini vengono scattate utilizzando la scansione o una fotocamera ad alta risoluzione, quindi analizzate con ImageJ per mappare i tratti.

Un semplice protocollo per mappare i tratti dell'architettura del sistema di root delle piante

Abbiamo progettato un protocollo di fenotipizzazione basato su immagini per determinare le risposte morfologiche e fisiologiche a trattamenti singoli e combinati di calore, siccità e ristagno idrico. Questo approccio ha permesso di identificare le risposte precoci, tardive e di recupero a livello di intero impianto, in particolare le parti fuori terra, e ha evidenziato la necessità di utilizzare più sensori di imaging.

Fenotipizzazione basata su immagini ad alta produttività per determinare le risposte morfologiche e fisiologiche a stress singoli e combinati nella patata

Esplora approcci di fenotipizzazione multipli per caratterizzare gli apparati radicali della canna da zucchero. Questo metodo integra tecniche di estrazione e imaging digitale per migliorare le strategie di coltivazione e selezione.

Approcci di fenotipizzazione su più fronti per caratterizzare gli apparati radicali della canna da zucchero

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