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DOI: 10.3791/64200-v
Jonathan T. Specker1, Alexander B. Smith2, Orlaith Keenan2, Joseph P. Zackular2,3, Boone M. Prentice1
1Department of Chemistry,University of Florida, 2Division of Protective Immunity,Children’s Hospital of Philadelphia, 3Department of Pathology and Laboratory Medicine, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Viene dimostrato un nuovo metodo di preparazione del campione per l'analisi di macrocolonie batteriche a base di agar mediante spettrometria di massa con desorbimento/ionizzazione laser assistita da matrice.
Il nostro protocollo consente la visualizzazione del metabolismo spaziale delle interazioni microbiche che si verificano durante l'infezione. Abbiamo sviluppato questo flusso di lavoro di spettrometria di massa per immagini per co-colture batteriche coltivate su modelli di agar e tessuti. L'analisi di substrati non tradizionali come le colture batteriche coltivate su agar presenta molte sfide.
Utilizzando il nostro protocollo, i campioni batterici possono essere opportunamente essiccati per facilitare l'applicazione della matrice MALDI nelle successive analisi di spettrometria di massa per immagini. Questo metodo è ampiamente applicabile a una varietà di metaboliti, patogeni microbici o malattie e tipi di campioni in cui è richiesta una misura spaziale della biochimica cellulare o tissutale, in particolare quando si studiano tipi di campioni che richiedono disidratazione prima dell'analisi. Dopo aver preparato le macrocolonie di coltura batterica, rimuovere le colonie batteriche di agarosio montate su vetrini da microscopio rivestiti con ITO dal materiale di imballaggio.
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