23 giugno 2023
Qui, presentiamo un protocollo per utilizzare il software di visione artificiale per stabilizzare i processi dinamici durante l'imaging TEM, indicizzando contemporaneamente più flussi di metadati per ogni immagine in una timeline navigabile. Dimostriamo come questa piattaforma consenta la calibrazione e la mappatura automatizzate della dose di elettroni nel corso di un esperimento.
Questa tecnologia è stata sviluppata per rendere gli studi TEM ad alte prestazioni accessibili agli utenti di tutti i livelli di abilità. Inoltre, i progressi scientifici richiedono gli sforzi collaborativi di più ricercatori, quindi una piattaforma efficiente per condividere e analizzare grandi e complessi set di dati è essenziale per una ricerca di successo Gli studi Operando e in situ trasformano un TEM in un nanolaboratorio in tempo reale, consentendo ai ricercatori di esplorare i processi dinamici su scala nanometrica che controllano le proprietà di crescita dei materiali. Una delle maggiori sfide per gli studi TEM in situ è isolare gli effetti dell'irradiazione del fascio dal comportamento intrinseco del campione.
La misurazione e il monitoraggio accurati della dose elettronica sono essenziali, ma senza un software di gestione della dose, è possibile misurare solo il tasso di dose elettronica piuttosto che la dose totale o critica I flussi di lavoro TEM complessi generano grandi set di dati che devono essere allineati manualmente e indicizzati alle rispettive immagini. In questo processo dispendioso in termini di tempo, le informazioni chiave, come le regolazioni delle condizioni di imaging o dell'ambiente dei campioni, possono andare perse, complicando l'analisi e la riproducibilità. Abbiamo sviluppato un flusso di lavoro di visione artificiale per raccogliere e indicizzare le immagini e i metadati prodotti durante un esperimento in una sequenza temporale ricca di dati e ricercabile.
Gli algoritmi computazionali e di analisi delle immagini possono calcolare le variabili tra le immagini, applicare correzioni e identificare tendenze nascoste. Calcolando, sincronizzando e indicizzando nuovi metadati in ogni immagine, l'analisi multimodale è improvvisamente una nuova possibilità. Ad esempio, informazioni accurate sulla dose accumulata e sull'intensità di dose nelle immagini di zeolite consentono una valutazione quantitativa del danno del campione su migliaia di immagini.
Continueremo a spingere le capacità del TEM in situ rendendo i risultati accessibili e interpretabili e migliorando la riproducibilità sperimentale. Questo software è una piattaforma per sviluppare moduli basati sul flusso di lavoro destinati ad applicazioni specifiche e storicamente difficili per rendere gli esperimenti TEM in situ più semplici e più ricchi di informazioni.
Questo studio presenta un nuovo protocollo software basato sulla visione artificiale per stabilizzare i processi dinamici durante l'acquisizione di immagini in microscopia elettronica a trasmissione (TEM), gestendo contemporaneamente l'indicizzazione dei metadati all'interno di una sequenza temporale navigabile. L'approccio migliora in modo significativo la capacità di eseguire la calibrazione automatica e la mappatura della dose di elettroni attraverso esperimenti, consentendo un'analisi più efficiente di dataset complessi.
I flussi di lavoro ad alta produttività di microscopia elettronica a trasmissione (TEM) generano dataset vasti e complessi che mettono alla prova la riproducibilità, l'integrità dei dati e l'analisi collaborativa nel settore biofarmaceutico&D. La sincronizzazione basata sulla visione artificiale e la gestione automatizzata dei metadati consentono una quantificazione precisa dell'esposizione del campione e delle variazioni strutturali, supportando una valida conferma del bersaglio e la riduzione dei rischi meccanicistici. Queste capacità ottimizzano i flussi di lavoro della fase iniziale di scoperta e preclinica, migliorando l'affidabilità predittiva e il processo decisionale sul portafoglio.
Questo flusso di lavoro TEM abilitato dalla visione artificiale integra le fasi iniziali della scoperta fino alla ricerca preclinica, supportando la verifica delle ipotesi, lo sviluppo di saggi e studi traslazionali.