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DOI: 10.3791/65718-v
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Qui descriviamo i protocolli per la caratterizzazione biofisica della formazione di complessi ternari indotti da chimere mirate alla proteolisi (PROTACS) che coinvolgono le ubiquitina ligasi Von Hippel-Lindau E3 ligasi (VHL) e Cereblon (CRBN). I metodi biofisici qui illustrati includono la risonanza plasmonica di superficie (SPR), l'interferometria del biostrato (BLI) e la calorimetria di titolazione isotermica (ITC).
La nostra ricerca si concentra sulla replica di sistemi modello consolidati, sulla loro validazione attraverso saggi aggiuntivi e sull'adattamento di queste metodologie per adattarsi al nostro specifico contesto di ricerca. Il nostro obiettivo è quello di dimostrare un approccio versatile che può essere applicato a vari progetti. L'attuale sfida sperimentale, la selezione strategica delle licenze del formato e delle condizioni di analisi appropriate in base ai requisiti specifici del progetto e alle lacune di conoscenza esistenti.
Questo è essenziale per ottenere risposte efficienti e accurate nei nostri esperimenti. Il nostro protocollo fornisce un approccio semplificato per un adattamento senza soluzione di continuità ai vari sistemi ProTech. Inoltre, conduciamo una valutazione approfondita di ogni metodo, evidenziandone i rispettivi pro e contro.
Offriamo istruzioni informate sulla scelta del formato più adatto in base alle condizioni specifiche.
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