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Biochemistry
Cristallizzazione ABCG5/G8 in ambiente bicellare lipidico per cristallografia a raggi X
Cristallizzazione ABCG5/G8 in ambiente bicellare lipidico per cristallografia a raggi X
JoVE Journal
Biochemistry
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JoVE Journal Biochemistry
ABCG5/G8 Crystallization in a Lipidic Bicelle Environment for X-Ray Crystallography

Cristallizzazione ABCG5/G8 in ambiente bicellare lipidico per cristallografia a raggi X

Full Text
1,852 Views
06:47 min
August 25, 2023

DOI: 10.3791/65828-v

Sarah Wazir1, Danny Farhat1, Mahalashmi Srinivasan1,2, Jyh-Yeuan Lee1

1Department of Biochemistry, Microbiology and Immunology, Faculty of Medicine,University of Ottawa, 2Department of Biochemistry, Faculty of Medicine and Dentistry,University of Alberta

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Questo protocollo descrive una configurazione per la cristallizzazione del trasportatore di steroli ABCG5/G8. ABCG5/G8 viene ricostituito in bicelle per la cristallizzazione a goccia sospesa. Il protocollo non richiede materiali o substrati specializzati, il che lo rende accessibile e facile da adattare in qualsiasi laboratorio per determinare la struttura della proteina attraverso la cristallografia a raggi X.

Ciao, il mio team studia il tipo di perdita di proteine attraverso la membrana cellulare e stiamo esaminando la relazione con la medicina e la biologia. In particolare, stiamo esaminando una particolare proteina che richiederebbe ATP per guidare la sua funzione, e quindi, il nome è chiamato ATP binding cassette transporter. In particolare, stiamo esaminando la loro relazione struttura-funzione fondamentale, e quindi la usiamo per comprendere molte malattie croniche, in particolare le malattie cardiovascolari.

A causa della complessità della purificazione delle proteine di membrana e della loro stabilità a temperature native, l'ottenimento di cristalli proteici 3D è la sfida principale nel campo e limita anche le applicazioni di scoperta di farmaci. Il nostro team ha stabilito metodi in crio-EM e cristallografia a raggi X per gli studi strutturali delle proteine trasportatrici di membrana. E in precedenza il nostro laboratorio ha anche risolto la struttura cristallina del primo eterodimero obbligato umano ABCG5/G8, sia negli stati apo che in quelli legati al colesterolo.

I nostri risultati possono fornire una svolta nella scoperta di farmaci a piccole molecole o nel riposizionamento di farmaci. L'ottenimento di cristalli proteici 3D può anche consentire esperimenti di ammollo per la cocristallizzazione di complessi proteici e ligandi. Il nostro laboratorio si propone di determinare le basi molecolari del riconoscimento e della traslocazione dei lipidi da parte di proteine trasportatrici lipidiche ATP dipendenti.

E miriamo anche a stabilire nuovi metodi nello sviluppo di farmaci per studiare la dinamica molecolare e gli aspetti strutturali dei trasportatori ABC.

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ABCG5/G8 Bicelle lipidiche Cristallografia a raggi X Proteine di membrana Doppio strato lipidico Detergenti Stabilità Uniformità Caratterizzazione strutturale Bicelle Fosfolipidi Cristalli di diffrazione di alta qualità Struttura ad alta risoluzione Conformazione nativa Funzionalità Cristalli tridimensionali Eterodimerico solubilizzato in detergente ABCG5/G8 Bicelle DMPC/CHAPSO Colesterolo Diffusione del vapore Cristallizzazione delle proteine

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