Utilizzo del test Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag) nella ricerca sui mioblasti di topo

La ricerca del nostro gruppo si concentra su come la struttura del genoma e la trascrizione nelle cellule staminali del muscolo scheletrico adulto sono regolate e mantenute, in particolare durante i cambiamenti del solfato, come l'impegno, la differenziazione e la tinasi delle cellule staminali. Le cellule staminali muscolari scheletriche adulte, che comprendono solo l'1% delle cellule mononucleate nel tessuto muscolare, rappresentano una sfida per gli studi sulle caratteristiche della cromatina che utilizzano High-C, ChIPs e ATAC seq, a causa della loro scarsità di sospensioni a singola cellula ottenute dalla digestione muscolare. L'immunoprecipitazione della cromatina, ChIP, è stata uno strumento chiave per profilare le caratteristiche del genoma.

Una tecnica di taglio e tag più semplice ed efficiente, sviluppata dal Dr. Steven Henikoff, spesso supera la ChIP, soprattutto nello studio dell'epigenetica nelle popolazioni cellulari rare. La sua facilità d'uso amplia l'accessibilità per i ricercatori, compresi gli esperti non epigenetici.