Predizione computazionale delle preferenze amminoacidiche di domini di legame peptidico potenzialmente multispecifici coinvolti nelle interazioni proteina-proteina

Proponiamo un protocollo per la predizione computazionale delle preferenze amminoacidiche in interazioni proteina-proteina più specifiche. Questo protocollo può essere considerato come un primo passo nella progettazione di mediatori di queste interazioni. Siamo interessati ad utilizzare questi mediatori come potenziali inibitori di specifiche interazioni, in tecnologi immunologici.

Il nostro implementatore utilizzato per caratterizzare le preferenze di amminoacidi tra i siti di legame specifici è costoso e ingombrante. Il nostro protocollo è una tecnologia bio-supportata basata sull'efficienza e sulle operazioni in serie. Questa strategia ha il potenziale per elaborare un numero elevato di sequenze di linee, fornendo una differenza completa e coerente delle preferenze degli amminoacidi.